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Biology版 - 请教如何计算一段随机序列在基因组中出现的次数
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相关话题的讨论汇总
话题: 序列话题: 随机话题: 5000000话题: 出现话题: 长度
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c***y
发帖数: 615
1
假设genome scaffold 长度 5 million bases, 一段 长度为20 的特定序列理论上可
以出现多少次?
Thanks a lot!
a****g
发帖数: 8131
2
如果是完全随机的,这是个combination的probability
如果是特定的序列,可以重复出现几千次都有可能
c***y
发帖数: 615
3
如果序列完全随机,如何计算这个理论上的combination probability?
谢谢了!

【在 a****g 的大作中提到】
: 如果是完全随机的,这是个combination的probability
: 如果是特定的序列,可以重复出现几千次都有可能

h*****x
发帖数: 147
4
0
5000000 * 4^(-20)

【在 c***y 的大作中提到】
: 假设genome scaffold 长度 5 million bases, 一段 长度为20 的特定序列理论上可
: 以出现多少次?
: Thanks a lot!

j****n
发帖数: 3370
5
偷偷说一下 这个不是初中数学?

【在 c***y 的大作中提到】
: 如果序列完全随机,如何计算这个理论上的combination probability?
: 谢谢了!

c***y
发帖数: 615
6
谢谢回复!

【在 h*****x 的大作中提到】
: 0
: 5000000 * 4^(-20)

c***y
发帖数: 615
7
还真没有自信应付初中数学了呢...

【在 j****n 的大作中提到】
: 偷偷说一下 这个不是初中数学?
e*******o
发帖数: 4654
8
貌似有问题
想想总base 是20的情况 或者21的情况

【在 h*****x 的大作中提到】
: 0
: 5000000 * 4^(-20)

e*******o
发帖数: 4654
9
那你解解看?看看能否做对

【在 j****n 的大作中提到】
: 偷偷说一下 这个不是初中数学?
k****l
发帖数: 279
10
如果DNA是线性的,更准确一点是: (5000000-19)/(4^20)

【在 h*****x 的大作中提到】
: 0
: 5000000 * 4^(-20)

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