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Biology版 - Medical genomics未来职业方向选择
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话题: md话题: phd话题: 思维话题: postdoc话题: 老板
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1 (共1页)
r**********e
发帖数: 587
1
PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当
然对于一般zero 计算经验的同学我还是要强的多,至少有很多分析NGS数据的经验。还
比如,我做实验的skill肯定就不如很多专注bench的同学。同时,因为涉及的东西多,
所以我强烈被两种不同的思维拉扯着,一种是MD的医学思维,一种PHD的科学思维。很
煎熬。
简单来说,MD的思维就是治病,效果是第一位,不会纠结很多科学细节。而PHD的科学
思维就是非常严格的搞清楚很多molecular mechanism。比如MD拥有大量的病人样本,
往往测序找到几个mutation,简单做点后续试验,哪怕可信度不高,但也可以发一些医
学杂志比如Neurology,这让我觉得自己俨然像个骗子。。。而PHD就一定要把这个
mutation可能引起的各种分子机制各种pathway都搞清楚,非常严谨,追求Nature,
Science;可生物思维的往往会陷入自我娱乐的怪圈过于追求分子机制而不是医疗本身。
所以关于选择未来方向的时候,我就非常纠结。当然如果你是超级牛人,你可以兼顾上
述所有的东西,但我精力有限。
博士毕业后我心目中的选择:
1. Postdoc也找个MD大牛或者做疾病的大牛,提供很多疾病样本,funding;而且我真
心很喜欢disease research。另外,我目前的老板应该会有很多相关的MD的connection
,推荐的时候或许有优势。但坏处是:science方面我觉得MD实在是比较差。我都非常
真心羡慕那些纯PHD老板lab出来的做gene regulation的人,他们受到很严格的科学训
练。而我没有。另外,和MD在一起,你永远会觉得医学院里地位最高的是医生,自己总
是从属位置,一个跟班。
2. Postdoc找个PHD大牛,也具体做神经基因组学相关的,但是肯定是比较偏science的
,比如类似Michael Greenberg做的研究,neuron-specific的基因调控的enhancer。
3. Postdoc直接去搞完全的计算,informatics。但我觉得自己的水平应该不够。
4. Industry。这也是我很喜欢medical genomics的原因,因为NGS发展快应用前景广。
纵然不做academia或许industry or business也会有个后路。
我自己做了好些个project,应该会有2-3篇paper,但估计是偏临床的比如类似
neurology或者小paper(虽然我从来都是更偏向science的思维!),因为老板MD的关
系,不可能像做基础科学那样有大量严谨data然后以CNS为目标。总让我觉得自己是在
搞忽悠。
我个人还是真心希望能把样本,测序,疾病遗传和基础的分子机制结合的。因为对于疾
病genetics的研究,核心难点还是分子机制,或者说致病基因的功能,或者基因组学
noncoding区域的功能。这些science的东西在MD老板那里就很难得到不错的指导。但找
个PHD老板,又觉得跟disease相隔远了,而且过于基础反而不好找工作发展。所以最好
的还是能找到合作,不过合作又会牵扯一大串利益分配问题,另外自己的精力也有限。
洋洋洒洒这么多,希望没把看官说晕。希望听听大家的想法。
非常感谢!
m********o
发帖数: 98
2
考MCAT,利用你MD老板的connection,申医学院,做residency,出来做医生,赚钱,
对科研有兴趣随时可以去基础的实验室学,funding也好拿
z*t
发帖数: 863
3
建议来Baylor来看看,这里的lab有很多neurology很多basic genetics

【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
: 我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
: neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
: disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
: 所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
: genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
: 基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
: 主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
: 所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
: 精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当

s******r
发帖数: 1245
4
尽量往bioinfo靠吧,往bench方向就是跳坑

【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
: 我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
: neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
: disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
: 所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
: genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
: 基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
: 主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
: 所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
: 精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当

T*G
发帖数: 600
5
做NGS下游分析不错,已经应用在临床检测了,今后几年技术一革新,还会有发展。你
说的mechaism找个合作的wet lab做吧,这年头很容易的,一头扎进bench, 对你风险太
大了

【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
: 我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
: neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
: disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
: 所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
: genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
: 基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
: 主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
: 所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
: 精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当

F******p
发帖数: 2099
6
你就在一个巨大的烂坑里,利用自己会NGS分析赶紧往工业界跳。
所谓的variants, complex disease, mechanism就是最典型的超级大烂坑,骗funding
不治病的。
k***a
发帖数: 636
7
楼主和我的背景和接近啊,加油!
建议工业界吧。。找机会做实习

funding

【在 F******p 的大作中提到】
: 你就在一个巨大的烂坑里,利用自己会NGS分析赶紧往工业界跳。
: 所谓的variants, complex disease, mechanism就是最典型的超级大烂坑,骗funding
: 不治病的。

t*******r
发帖数: 364
8
目测人生是惨谈的,要么深入做算法写程序,要么好好学习生统+流病,要么老老实实
做实验。什么都会就是什么都不会。
c****l
发帖数: 53
9
我跟lz背景很像,什么都懂(生物,统计,编程,机器学习),但什么都不会(不精通). 忽悠
人可以,但是做科研还是觉得需要深入.曾经尝试实验和数据分析两手抓,后来发现根本
没时间和精力两方面都做,问了几个干湿都能做的大牛老板,他们给我的建议是:1.精通
一个方面,比如实验,同时懂另外一个反面,比如能理解数据分析基本原理. 2. 不要同一
段时间两个都做,一段时间只集中精力做一个事情,比如一段时间就专注做实验,后一段
时间专注分析数据. 我个人体会是, 搞清楚以后自己想侧重哪个方面,生物?还是统计?,
然后集中精力做那个方向,其他方向懂就可以了
y*****3
发帖数: 961
10
我建议如果你自己对学术上的方向不够明确,还是先去工业界吧。
相关主题
To those who are looking for a nice boss求审稿机会(基因组学,生物信息学)
拿到WGS data,鉴定出一堆SNP后做什么呢?求审稿(植物学,进化生物学,比较基因组学等)
Current Topics in Genome Analysis 2012review needed(求审稿)
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s******a
发帖数: 252
11
Doing a good postdoc would possibly find your own academic niche, and vision
. Without the "niche", you don't have a bright future in academia.
One should focus on selective few things, and you can do applied
bioinformatics too. I have many collaboration requests in bioinformatics, so
that I turned down many of them. Such collaborations eat into my own
research, but you can see how many people can make an academic career just
through collaborations.
r**********e
发帖数: 587
12
谢谢各位回复
但其实我有一个核心问题貌似没人给意见,就是:大家觉得postdoc如果找个MD大牛老
板混,如何呢?
我觉得跟着MD就是在忽悠。。。但或许日子会好过点。。但是不是职业规划就毁掉了

【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
: 我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
: neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
: disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
: 所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
: genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
: 基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
: 主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
: 所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
: 精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当

S****v
发帖数: 478
T*G
发帖数: 600
14
看你你以后要干什么,申请medical school 或者 match residency, 榜上越大的MD老
板越好,申请公司看你老板的业内名声和他组里以前人的去向,申请教职都是看你
paper和忽悠钱的能力,不会因为你老板MD就降低要求了,要是就涂日子舒服点,干什
么不必薄厚easy回报大呢。

【在 r**********e 的大作中提到】
: 谢谢各位回复
: 但其实我有一个核心问题貌似没人给意见,就是:大家觉得postdoc如果找个MD大牛老
: 板混,如何呢?
: 我觉得跟着MD就是在忽悠。。。但或许日子会好过点。。但是不是职业规划就毁掉了

a*******a
发帖数: 4233
15
上面已经说了,找md老板考mcat

【在 r**********e 的大作中提到】
: 谢谢各位回复
: 但其实我有一个核心问题貌似没人给意见,就是:大家觉得postdoc如果找个MD大牛老
: 板混,如何呢?
: 我觉得跟着MD就是在忽悠。。。但或许日子会好过点。。但是不是职业规划就毁掉了

r******g
发帖数: 600
16
看了你的帖子感触非常深
我觉得自己很多时候也在强烈的 MD 和 PhD 思维 中间struggling~
自己现在也面临想开始找Postdoc的位置... 跟你有完全相同的困惑
我见过的大牛不多
但是 MD大牛们 也是受过非常严谨的science training
PhD的相当多的大牛们 也有非常好的big picture,对于疾病的pathogenesis和疾病的
治疗一点不输MD,只是没有处方权罢了~
由于我现在跟你处于同样的困惑,我觉得 你应该行动起来,找自己感兴趣的实验室,
能去面试的话,就跟老板多聊聊,应该能够更深入的了解!
c********e
发帖数: 598
17

你没有医学院训练,不会有全面的MD思维的。你可能理解你老板的思维而已。但这不重
要,社会
规则更重要。有执照能有个挣钱的能力, MD不如PhD,没啥大不了的。你可能不是因为
思维问题,
是不知道将来干啥。多接触学术界以外的人,否则你还是跳不出来。

【在 r******g 的大作中提到】
: 看了你的帖子感触非常深
: 我觉得自己很多时候也在强烈的 MD 和 PhD 思维 中间struggling~
: 自己现在也面临想开始找Postdoc的位置... 跟你有完全相同的困惑
: 我见过的大牛不多
: 但是 MD大牛们 也是受过非常严谨的science training
: PhD的相当多的大牛们 也有非常好的big picture,对于疾病的pathogenesis和疾病的
: 治疗一点不输MD,只是没有处方权罢了~
: 由于我现在跟你处于同样的困惑,我觉得 你应该行动起来,找自己感兴趣的实验室,
: 能去面试的话,就跟老板多聊聊,应该能够更深入的了解!

c********e
发帖数: 598
18

你先试试找个程序员工作。何必在坑里死掉。

【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
: 我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
: neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
: disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
: 所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
: genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
: 基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
: 主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
: 所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
: 精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当

h****n
发帖数: 333
19
lz可以试一下申请ABMG clinical molecular genetics program

【在 r**********e 的大作中提到】
: PhD第五年了要张罗毕业考虑未来了,所以来请教下各位前途选择问题。
: 我研究方向以及未来的兴趣倒是蛮确定的,就是medical genomics。 我具体是在
: neurology系做神经疾病的基因组学,生物信息;简单来说就是寻找neurological
: disorder的致病相关的genetic variants;以及找到的variants的深层的分子机制。
: 所以我具体的training,一方面是bioinformatics相关的计算机的东西以及human
: genetics/genome science; 另外一方面则是由此引申出的epigenetics, splicing等等
: 基因调控的基础生物的东西,所以也做了很多传统的实验。当然了,老板是MD,实验室
: 主题是neurology,所以自然也了解一些神经相关的东西。
: 所以我的优势是方向比较热,而且我涉及的范围挺广的。但优势也是劣势,那就是我不
: 精通某个小方向,比如,相对于专业的bioinformatician我算半路出家远不如他们,当

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关于genomics/bioinformatics/systems biology再发问tools to open GFF3 or GVF files
请教Bioinformatics职业规划~~~To those who are looking for a nice boss
搞下一代基因组测序怎么样? 有一个老板在招千老,请教各位高人。拿到WGS data,鉴定出一堆SNP后做什么呢?
美华人女科学家重大研究突破:基因影响大脑记忆Current Topics in Genome Analysis 2012
生物信息phd 研究方向求意见求审稿机会(基因组学,生物信息学)
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