e********r
发帖数: 147 | 1 我们有一个跨膜受体激酶，已经挂到脂质体里，加入小分子ligand后激酶活性会上升。
现在特别想分析ligand结合后这个跨膜激酶的构象变化如何，从而来推测可能的结构变
化机制，请问这该如何是好？圆二色谱之类能测proteoliposome这种纳米级颗粒物的构
象吗？谢谢！ | e****s
发帖数: 1125 | 2 CD只能检测显著的二级结构变化，
ligand binding 是不大会造成二级结构水平的变化的。CD是不可能Work的。
蛋白的Conformational change仍然是个比较难的课题，膜蛋白就更不容易了。
通常做蛋白构象的方法主要是萤光(FRET, Quenching等),EPR/DEER，NMR，晶体，MS等
方法。
还有一个可以考虑的就是limited proteolysis，这个大部分实验室可以自己做，不像
上述一些方法，从头摸索都很难。 | e********r
发帖数: 147 | 3 非常感谢啊，我们也在考虑是否用limited trypsinolysis来试一试，毕竟对做生化的
来说这个还容易一点。
但就怕就算做出来，证据还不够强，如果能有相应的方法从另一个角度再验证一下就更
好了。
【在 e****s 的大作中提到】
: CD只能检测显著的二级结构变化，
: ligand binding 是不大会造成二级结构水平的变化的。CD是不可能Work的。
: 蛋白的Conformational change仍然是个比较难的课题，膜蛋白就更不容易了。
: 通常做蛋白构象的方法主要是萤光(FRET, Quenching等),EPR/DEER，NMR，晶体，MS等
: 方法。
: 还有一个可以考虑的就是limited proteolysis，这个大部分实验室可以自己做，不像
: 上述一些方法，从头摸索都很难。
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