S***6
发帖数: 431 | 1 最近老板让我从rat和mouse中分离克隆一个近5kb的基因，姑且称A基因。
这个A基因25年前在human里面就已经克隆出来的，PubMed上关于这个A基因的相关文章
有8000篇之多，但是奇怪的是这个基因在rat和mouse中的同源基因还没有被克隆出来，
和human的A基因有90%的蛋白同源性，而且也没有一个lab发表过这个rat或mouse的A基
因的克隆及功能分析文章，甚至所有研究rat或mouse的该基因上下游相关文章的实验设
计中，都是用human的A基因代入进行分析。
有没有人遇到过类似的情况？感觉面对一个很深的坑。 |
T****u
发帖数: 424 | 2 不太可能。
你要相信有无数小lab爱干这种找同源蛋白，blast，做个cloning的paper。
很大的可能性是叫另外一个名字，你miss了。
【在 S***6 的大作中提到】
: 最近老板让我从rat和mouse中分离克隆一个近5kb的基因，姑且称A基因。
: 这个A基因25年前在human里面就已经克隆出来的，PubMed上关于这个A基因的相关文章
: 有8000篇之多，但是奇怪的是这个基因在rat和mouse中的同源基因还没有被克隆出来，
: 和human的A基因有90%的蛋白同源性，而且也没有一个lab发表过这个rat或mouse的A基
: 因的克隆及功能分析文章，甚至所有研究rat或mouse的该基因上下游相关文章的实验设
: 计中，都是用human的A基因代入进行分析。
: 有没有人遇到过类似的情况？感觉面对一个很深的坑。
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i*********0
发帖数: 915 | |
M*****n
发帖数: 16729 | 4 check its alias.
many proteins have several different names.
on the other hand, i think this is a deep ken,
you may take it as a side-project, but should take another more
straightforward project as your main direction. |
S***6
发帖数: 431 | 5 谢谢大家！这个基因很有名，几乎不会有另一个名字。不过你们提醒的也对，我再进一
步检索看看，不过已经准备自己克隆了，挺有意思的一个side-project. |
a****c
发帖数: 339 | 6 好奇的问，90%的同源性，克隆出来真的有意义么？ |
S***6
发帖数: 431 | 7 是没有啥意义。但是如果在rat和mouse中研究上下游相互作用蛋白的话，你放个human
的同源蛋白做诱饵不是很奇怪吗？Reviewer那里肯定遭质疑对吧。
【在 a****c 的大作中提到】
: 好奇的问，90%的同源性，克隆出来真的有意义么？
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t******k
发帖数: 5617 | 8 不奇怪，这种情况下放人的反而比较有意义，因为在mouse和rat上的研究主要也是为了
解决人身上的问题。
human
【在 S***6 的大作中提到】
: 是没有啥意义。但是如果在rat和mouse中研究上下游相互作用蛋白的话，你放个human
: 的同源蛋白做诱饵不是很奇怪吗？Reviewer那里肯定遭质疑对吧。
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m******5
发帖数: 1383 | 9 同意，另外为什么要自己克隆？买不到么？另外我觉得十之八九克隆过了但是mice
code表达差不好用，手头很多蛋白是这个情况
【在 t******k 的大作中提到】
: 不奇怪，这种情况下放人的反而比较有意义，因为在mouse和rat上的研究主要也是为了
: 解决人身上的问题。
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: human
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