由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 菜菜鸟求教关于Lentivirus transduction
相关主题
问个RNAi的问题Why lenti can package large pro-virus DNA
Re: 请问用什么方法证明蛋白与蛋白的直接作用?哪位牛人给推荐一下做Reviewer
mouse dendritic cell用retrovirus 还是lentivirus搞啥实验,哪个方向钱最多?
怎么提高lentivirus transduction 效率?遇到一个奇怪的overexpression结果,大家有没有经验?
Lentivirus 中残留的293 细胞求助lentivirus infection
问 一个lentivirus的问题【求助】PCR为什么目的基因有,但S16基因就几乎看不到?
怎么优化Lentivirus transduce T cell的过程siRNA做后用Trizol提取RNA
CAR-T cell的疑问一个细胞是不是一般只被一个病毒感染?
相关话题的讨论汇总
话题: lentivirus话题: virus话题: 细胞话题: 菜鸟
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
w*****a
发帖数: 437
1
刚接触Lentivirus,啥都不懂,求大拿指点。
是这样,老板想看一个基因A在Smooth muscle cell differentiation里面的作用。手
上有个神经干细胞的cell line,加Tgfb后5-6天会变成SMC。
然后有前人留下来的overexpression A的lentivirus,和knockdown A的ShRNA
lentivirus,冻在-80,都大概有10多管15ml的virus。
老板想用virus overexpress 或 knockdown 基因A, 然后看differentiation pattern
有啥变化。可能用qPCR,RNA-seq啥的做readout。
本来想随便测个titer,把现有的virus加1ml到正differentiate的细胞里面(24 well)
,然后提个RNA就得了。后来一想,问题来了:
1)这神经干细胞特金贵,要特殊的medium养才成,我这virus supernatant加进去搞个
几天,还能活吗?更不提按正常程序differentiate了。那做出来的东西,不是非常的
artificial么?
2)要细胞长得好是不是得做inducible 的stable line,只需用doxycycline加在medium
里就行了。但做这个估计得1-2个月吧。
啰啰嗦嗦,其实就是怎么加virus会比较不影响细胞正常生长分化,又保证
transduction效率。。
谢谢~
m****e
发帖数: 173
2
lenti -80放多久了,超过两三个月,建议你重做一批。
你担心virus体积太大, 下次自己做的时候用超速离心机离下来,一个T75做的virus用
100ul MEM重悬,一个24 well加10ul virus足矣。
w*****a
发帖数: 437
3
谢谢!超速离心是个好办法,一般要多快离多久啊。
估计差不多2-3个月了,重做是要从养293和加各式各样的plasmid开始是吧?那不是得
好一阵子养了。。
一个双黄包聊表谢意~

【在 m****e 的大作中提到】
: lenti -80放多久了,超过两三个月,建议你重做一批。
: 你担心virus体积太大, 下次自己做的时候用超速离心机离下来,一个T75做的virus用
: 100ul MEM重悬,一个24 well加10ul virus足矣。

a*******a
发帖数: 4233
4
可能需要浓缩然后换被感染细胞的培养基重悬
不然stem cell可能会分化

pattern
well)

【在 w*****a 的大作中提到】
: 刚接触Lentivirus,啥都不懂,求大拿指点。
: 是这样,老板想看一个基因A在Smooth muscle cell differentiation里面的作用。手
: 上有个神经干细胞的cell line,加Tgfb后5-6天会变成SMC。
: 然后有前人留下来的overexpression A的lentivirus,和knockdown A的ShRNA
: lentivirus,冻在-80,都大概有10多管15ml的virus。
: 老板想用virus overexpress 或 knockdown 基因A, 然后看differentiation pattern
: 有啥变化。可能用qPCR,RNA-seq啥的做readout。
: 本来想随便测个titer,把现有的virus加1ml到正differentiate的细胞里面(24 well)
: ,然后提个RNA就得了。后来一想,问题来了:
: 1)这神经干细胞特金贵,要特殊的medium养才成,我这virus supernatant加进去搞个

d*****r
发帖数: 45
5
浓缩病毒可以用 PEG Virus Precipitation Kit,损失更小些
293T准备好了以后,做完transfection两三天就可以收病毒了,不用太久

【在 w*****a 的大作中提到】
: 谢谢!超速离心是个好办法,一般要多快离多久啊。
: 估计差不多2-3个月了,重做是要从养293和加各式各样的plasmid开始是吧?那不是得
: 好一阵子养了。。
: 一个双黄包聊表谢意~

m****e
发帖数: 173
6
49,000 x g for 90 min
拿到hek,周一分细胞,周二transfection,周四离心,周五分装。然后就可以用了

【在 w*****a 的大作中提到】
: 谢谢!超速离心是个好办法,一般要多快离多久啊。
: 估计差不多2-3个月了,重做是要从养293和加各式各样的plasmid开始是吧?那不是得
: 好一阵子养了。。
: 一个双黄包聊表谢意~

w*****a
发帖数: 437
7
谢谢楼上各位的回复!每人一个小笼包鼓励:-)
看来大家都觉得要重新做virus,那是不是要买lentiviral packaging kit来包装?哪
家的比较好用啊~
-80的virus,是不是可以浓缩以后试试,clontech有个浓缩病毒的kit不知好用不?
j****x
发帖数: 1704
8
更简单的办法是超滤浓缩,millipore的100K Ultra Centrifugal Filter,可以直接浓
缩100-200倍。
4质粒共转染293T/293FT细胞,隔天换液,3天后收上清,然后超滤浓缩,浓缩后的病毒
直接感染靶细胞,效果会比冻融之后的好几倍到一个数量级。

【在 w*****a 的大作中提到】
: 谢谢!超速离心是个好办法,一般要多快离多久啊。
: 估计差不多2-3个月了,重做是要从养293和加各式各样的plasmid开始是吧?那不是得
: 好一阵子养了。。
: 一个双黄包聊表谢意~

w*****a
发帖数: 437
9
谢谢!

【在 j****x 的大作中提到】
: 更简单的办法是超滤浓缩,millipore的100K Ultra Centrifugal Filter,可以直接浓
: 缩100-200倍。
: 4质粒共转染293T/293FT细胞,隔天换液,3天后收上清,然后超滤浓缩,浓缩后的病毒
: 直接感染靶细胞,效果会比冻融之后的好几倍到一个数量级。

f*******a
发帖数: 671
10
我们都放了好几年的还用呢。不过要重新做titer

【在 m****e 的大作中提到】
: lenti -80放多久了,超过两三个月,建议你重做一批。
: 你担心virus体积太大, 下次自己做的时候用超速离心机离下来,一个T75做的virus用
: 100ul MEM重悬,一个24 well加10ul virus足矣。

w*****a
发帖数: 437
11
谢谢!请问用哪个titer kit做titer啊?

【在 f*******a 的大作中提到】
: 我们都放了好几年的还用呢。不过要重新做titer
1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
一个细胞是不是一般只被一个病毒感染?Lentivirus 中残留的293 细胞
lentivirus 表达250KD的蛋白,是不是很难?问 一个lentivirus的问题
tRNA基因可以放在表达蛋白的质粒(如pET系列)里面去表达吗?怎么优化Lentivirus transduce T cell的过程
除了蔗糖梯度有什么办法可以isolate polysome assocaited RNA么?CAR-T cell的疑问
问个RNAi的问题Why lenti can package large pro-virus DNA
Re: 请问用什么方法证明蛋白与蛋白的直接作用?哪位牛人给推荐一下做Reviewer
mouse dendritic cell用retrovirus 还是lentivirus搞啥实验,哪个方向钱最多?
怎么提高lentivirus transduction 效率?遇到一个奇怪的overexpression结果,大家有没有经验?
相关话题的讨论汇总
话题: lentivirus话题: virus话题: 细胞话题: 菜鸟