PDB里怎么看disulfide连接？ - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - PDB里怎么看disulfide连接？

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w***c 发帖数: 116	1 http://www.rcsb.org/pdb/explore/remediatedSequence.do?structure 上面这个protein，怎么知道它的几个Cys分别是谁和谁练成的disulfide bonds?多谢！
w****6 发帖数: 169	2 可以用pymol把这个结构打开，然后show disulfides就能看见了. 这个protein里第一条链：c22-c92， c195-c140。第二条链：c23-c88，c133-c193 【在 w***c 的大作中提到】 : http://www.rcsb.org/pdb/explore/remediatedSequence.do?structure : 上面这个protein，怎么知道它的几个Cys分别是谁和谁练成的disulfide bonds?多谢！
j****x 发帖数: 1704	3 在mmCIF文件格式的注释里可以看到相关信息，如下： http://www.rcsb.org/pdb/files/2IPT.cif 【在 w***c 的大作中提到】 : http://www.rcsb.org/pdb/explore/remediatedSequence.do?structure : 上面这个protein，怎么知道它的几个Cys分别是谁和谁练成的disulfide bonds?多谢！
s*****g 发帖数: 87	4 那请问怎样看非极性相互作用 (non-polar interaction or van der Waals interaction)？
r**e 发帖数: 20	5 http://pic.mbu.iisc.ernet.in/job.html 放入PDB,可以看各种interaction. 【在 s*****g 的大作中提到】 : 那请问怎样看非极性相互作用 (non-polar interaction or van der Waals : interaction)？
w***c 发帖数: 116	6 这个很赞！【在 r**e 的大作中提到】 : http://pic.mbu.iisc.ernet.in/job.html : 放入PDB,可以看各种interaction.
l******a 发帖数: 3339	7 为啥连不进去？【在 r**e 的大作中提到】 : http://pic.mbu.iisc.ernet.in/job.html : 放入PDB,可以看各种interaction.

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