由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 做gene full assembly 有什么实际用途?
相关主题
包子求一个database (clinical gene isoforms)Postdoctoral Research fellow in standford
招人denovo assemblyA statistical genetics journal
Re: Northern vs RT-PCR请教:Research Fellowship Award对申请绿卡的影响 (转载)
What is advantage and disadvantage of intronless genesresearch associate
问个UCSC Genes 的小白问题Postdoctoral Position available at Veterans Medical Research Foundation in San Diego, CA
microarray 分析 问题求教!还有两个位置:Sr. Scientist and Sr. Research Associate
弱问:ABO gene 上的一个SNP G703A, 怎么样知道它的rs号是什么?The not-quite-stated, awful truth
BGI Hunts for Genetic Links to High IQPostdoctoral Researcher position open (博后招聘)
相关话题的讨论汇总
话题: gene话题: isoforms话题: assembly话题: pacbio
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
h*********r
发帖数: 2844
1
向这里的生物大牛讨教一下:
股票班上有人看好pacbio, 有人bash。看了一圈,觉得PacBio 技术很多拿来做gene
full assembly, 很多和ilumina 测序hybrid。 这种科研除了发paper,养活postdoc
外,有多少实际用处? 如果第一人做出来,还算有点创新,后人跟上,各种gene 都去
重做一遍,不是炒冷饭浪费钱吗?NIH一砍钱,不就砍这种项目吗?
当然要找科研意义,都说能挖出来的。funding 总是写的天花乱坠,我想问的是大方向
上的用途,尤其是能用于商业开发的价值。
h*********r
发帖数: 2844
2
没人理我的帖子,看来pacbio 技术真的没啥用。继续看跌他家股票。

postdoc

【在 h*********r 的大作中提到】
: 向这里的生物大牛讨教一下:
: 股票班上有人看好pacbio, 有人bash。看了一圈,觉得PacBio 技术很多拿来做gene
: full assembly, 很多和ilumina 测序hybrid。 这种科研除了发paper,养活postdoc
: 外,有多少实际用处? 如果第一人做出来,还算有点创新,后人跟上,各种gene 都去
: 重做一遍,不是炒冷饭浪费钱吗?NIH一砍钱,不就砍这种项目吗?
: 当然要找科研意义,都说能挖出来的。funding 总是写的天花乱坠,我想问的是大方向
: 上的用途,尤其是能用于商业开发的价值。

s******y
发帖数: 28562
3
你说对了。没有什么用。
但是,不排除某些无良医生用personal medicine的名义忽悠患者去测这个。

【在 h*********r 的大作中提到】
: 没人理我的帖子,看来pacbio 技术真的没啥用。继续看跌他家股票。
:
: postdoc

h*********r
发帖数: 2844
4
真要测,也要FDA批准吧。Illumina好像已经有所行动了。PACBIO的技术看来只能做些
纯科研的niche Project。谢谢回答。

【在 s******y 的大作中提到】
: 你说对了。没有什么用。
: 但是,不排除某些无良医生用personal medicine的名义忽悠患者去测这个。

t*d
发帖数: 1290
5
Don't know about PacBio. But denovo full gene assembly, which is related to
alternative splicing, may be very useful.

postdoc

【在 h*********r 的大作中提到】
: 向这里的生物大牛讨教一下:
: 股票班上有人看好pacbio, 有人bash。看了一圈,觉得PacBio 技术很多拿来做gene
: full assembly, 很多和ilumina 测序hybrid。 这种科研除了发paper,养活postdoc
: 外,有多少实际用处? 如果第一人做出来,还算有点创新,后人跟上,各种gene 都去
: 重做一遍,不是炒冷饭浪费钱吗?NIH一砍钱,不就砍这种项目吗?
: 当然要找科研意义,都说能挖出来的。funding 总是写的天花乱坠,我想问的是大方向
: 上的用途,尤其是能用于商业开发的价值。

h*********r
发帖数: 2844
6
Can you elaborate on it? thx.

to

【在 t*d 的大作中提到】
: Don't know about PacBio. But denovo full gene assembly, which is related to
: alternative splicing, may be very useful.
:
: postdoc

t*d
发帖数: 1290
7
each gene in human may have a few different isoforms. Usage of different
isoforms may be associated with human disease. Currently, there is no
reliable tech to call these isoforms with high accuracy. Illumia's reads are
too short, which makes it difficult to reliably assembly isoforms. If the
read can be longer enough, then each read could be a isoform and the problem
solved.

【在 h*********r 的大作中提到】
: Can you elaborate on it? thx.
:
: to

d******1
发帖数: 709
8
现在病理学研究正逐渐从看片子,染染色体转向sequencing. 一个exome sequencing
去年不到1000,现在应该更低了,也许过几年就降到200一个人。最大的瓶颈就在于序
列分析。。。。

【在 s******y 的大作中提到】
: 你说对了。没有什么用。
: 但是,不排除某些无良医生用personal medicine的名义忽悠患者去测这个。

l**********1
发帖数: 5204
9
Bingo
as similar as below dry NGS PD job description:
>JOB: Postdoctoral Researchers in Statistical Genetics
No replies
Fri, 2013-10-18 10:24
Guest
Postdoctoral Researchers in Statistical Genetics
Applications are invited for Postdoctoral Researchers to join Matthew
Stephens's research group within the departments of Human Genetics and
Statistics at the University of Chicago.
>http://stephenslab.uchicago.edu
Applicants should have, or be studying for, a PhD in statistics,
computer science, quantitative biology, or related quantitative
discipline. A strong computational background is also required.
Applicants should send a CV, Research Statement, and names of 3
referees to
http://bayesian.org/forums/jobs/6162

【在 d******1 的大作中提到】
: 现在病理学研究正逐渐从看片子,染染色体转向sequencing. 一个exome sequencing
: 去年不到1000,现在应该更低了,也许过几年就降到200一个人。最大的瓶颈就在于序
: 列分析。。。。

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
Postdoctoral Researcher position open (博后招聘)问个UCSC Genes 的小白问题
请教个学术问题。microarray 分析 问题求教!
如何区分杂带和不同isoform弱问:ABO gene 上的一个SNP G703A, 怎么样知道它的rs号是什么?
p-Stat3 antibodyBGI Hunts for Genetic Links to High IQ
包子求一个database (clinical gene isoforms)Postdoctoral Research fellow in standford
招人denovo assemblyA statistical genetics journal
Re: Northern vs RT-PCR请教:Research Fellowship Award对申请绿卡的影响 (转载)
What is advantage and disadvantage of intronless genesresearch associate
相关话题的讨论汇总
话题: gene话题: isoforms话题: assembly话题: pacbio