f*******r 发帖数: 36 | 1 各位大大,在下最近在成年小鼠颅骨中提RNA做real time PCR,碰到了很头疼的问题:
虽然产量不高,不过浓度和OD260/280看起来很正常,但是OD260/230 variation很大
,大都不到1.8,做内参18S波动也大到惨不忍睹。看看RNA的各项参数和18S的ct值,千
头万绪,看不出来什么东西影响了RNA的质量,或者RT-PCR。请帮忙出出主意,比如关
于提骨头totalRNA,做反转和real time PCR的trick,等等,跪谢!
ps 试剂部分,最近也有做细胞的提RNA》》real time PCR,看起来挺正常的,所以,
我个人觉得不是试剂的错儿。 |
D***s 发帖数: 5613 | 2 230的吸收主要受盐和多糖的影响,
你尝试提取的RNA再过一根新的Qiagen柱子纯化看看会不会好点
也就是你第一次抽出来之后不管质量怎么样,先用DNase I处理,
然后用新的Qiagen RNeasy的column纯化一下
【在 f*******r 的大作中提到】 : 各位大大,在下最近在成年小鼠颅骨中提RNA做real time PCR,碰到了很头疼的问题: : 虽然产量不高,不过浓度和OD260/280看起来很正常,但是OD260/230 variation很大 : ,大都不到1.8,做内参18S波动也大到惨不忍睹。看看RNA的各项参数和18S的ct值,千 : 头万绪,看不出来什么东西影响了RNA的质量,或者RT-PCR。请帮忙出出主意,比如关 : 于提骨头totalRNA,做反转和real time PCR的trick,等等,跪谢! : ps 试剂部分,最近也有做细胞的提RNA》》real time PCR,看起来挺正常的,所以, : 我个人觉得不是试剂的错儿。
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f*******r 发帖数: 36 | 3 谢谢回复 看来不纯还是主要原因
【在 D***s 的大作中提到】 : 230的吸收主要受盐和多糖的影响, : 你尝试提取的RNA再过一根新的Qiagen柱子纯化看看会不会好点 : 也就是你第一次抽出来之后不管质量怎么样,先用DNase I处理, : 然后用新的Qiagen RNeasy的column纯化一下
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q***7 发帖数: 144 | 4 Please try this company's RNA isolation kit which is much better than Qiagen
kit.
http://www.greenbioresearch.com/mitotal-rnamini-using-qiagen-ki |