CHIP-Seq analysis - Biology版 - 未名存档

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档，一周内的贴子最多显示50字，超过一周显示500字访问原贴

Biology版 - CHIP-Seq analysis

相关主题
● Transcription factor, Promoter分析软件	● Chip-seq 实验球助
● 想快速入门NGS sequence analysis, 怎样开始比较科学？	● 请教--啥技术能像microarray一样比较两组细胞的epigenetic status?
● 请问在哪个网站可以查到别人发表的CHiP-Seq DATA	● 求推荐做Chip-Seq的tag
● 伊利偌依大学芝加哥分校医学院招聘生物信息专业研究人员	● 怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙
● RNA-seq结果分析求助	● 求助：请牛人指点 Chip－Seq ！！！
● 真心求教：关于CHIP-Seq library 的数据分析问题	● Chip-Seq 样品制备求助
● 什么软件可以分析Chip-seq数据	● ChIP-qPCR问题求助
● 有做过CHIP-Seq的吗？可否介绍一下经验？	● CHiP seq

相关话题的讨论汇总
话题: chip话题: seq话题: what话题: http话题: analysis

进入Biology版参与讨论

1

(共1页)

s******a 发帖数: 134	1 What is the best way to analyze published CHIP-seq data (deposit in GEO)? What software would be easy for a non-bioinformatics major? Many thanks!!!!!
c***3 发帖数: 251	2 最好得办法是找个bioinformatics的组合作大部分软件都没有那么智能化，需要多少有一点编程的工作，而且每个人从数据里想得到的东西不一样，数据分析方法上肯定有差异你可以试试 Bioconductor里面的package ChIPseeqer 或者用encode里面得方法也行
l**********1 发帖数: 5204	3 RE LZ: pls go to bleow three web links then by key word: for searching your wanted hits, HTTP: //liulab.dfci.harvard.edu/software.htm HTTP: //www.stanford.edu/group/wonglab/software.html HTTP: /www.chenglilab.org/software 【在 s******a 的大作中提到】 : What is the best way to analyze published CHIP-seq data (deposit in GEO)? : What software would be easy for a non-bioinformatics major? : Many thanks!!!!!

1

(共1页)

进入Biology版参与讨论

相关主题
● CHiP seq	● RNA-seq结果分析求助
● 包子求3xFlag CHIP-Seq protocol	● 真心求教：关于CHIP-Seq library 的数据分析问题
● 新手求教，大家用哪个genome browser看别人publish的Chip-Seq data?	● 什么软件可以分析Chip-seq数据
● 问一下，大家都用哪个chip Protocol或者Chip kit做表达量不高的transcription factor 的Chip/Chip-SEq	● 有做过CHIP-Seq的吗？可否介绍一下经验？
● Transcription factor, Promoter分析软件	● Chip-seq 实验球助
● 想快速入门NGS sequence analysis, 怎样开始比较科学？	● 请教--啥技术能像microarray一样比较两组细胞的epigenetic status?
● 请问在哪个网站可以查到别人发表的CHiP-Seq DATA	● 求推荐做Chip-Seq的tag
● 伊利偌依大学芝加哥分校医学院招聘生物信息专业研究人员	● 怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙

相关话题的讨论汇总
话题: chip话题: seq话题: what话题: http话题: analysis

未名新帖统计// 7月16日

#	版面	帖数(主题数)
-	全站	4871 (796)
1	Military	3777 (569)
2	Stock	341 (51)
3	Joke	117 (17)
4	History	116 (3)
5	Automobile	100 (9)
6	USANews	55 (9)
7	Midlife	45 (1)
8	Headline	41 (41)
9	Dreamer	33 (13)
10	FleaMarket	32 (20)
11	Living	30 (7)

* 这里只显示发帖超过25的版面，努力灌水吧:-)