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b*****g
发帖数: 26 | 1 我最近想build一个structure model. 现在已有receptor cryo-EM tetramer
structure . 有一个小protein 和这个receptor 有interaction,而且比例是1:1.
我们有一些关于protein-protein interaction的数据，也可以docking 到单体上。但
是四聚体就有一些问题。因为如果是1：1，在四聚体上就是4：4，一共8个protein。
所以请大家个我推荐个docking program ，可以解决这个问题。 先谢过了。 | m**m
发帖数: 349 | | Z******5
发帖数: 435 | 3 autodock可以做protein-protein docking吗？ Discovery Studio里面的zdock貌似只
能做两个蛋白的docking。 | l**********1
发帖数: 5204 | 4 LZ can try
David Baker lab
Rosetta@
//boinc.bakerlab.org/rosetta/
//depts.washington.edu/bakerpg/drupal/
'docking' intra google site://boinc.bakerlab.org/rosetta
//www.google.com/search?q=docking&domains=http%3A%2F%2Fboinc.bakerlab.org&
sitesearch=http%3A%2F%2Fboinc.bakerlab.org%2Frosetta
original
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31631075.html
20th floor
【在 b*****g 的大作中提到】
: 我最近想build一个structure model. 现在已有receptor cryo-EM tetramer
: structure . 有一个小protein 和这个receptor 有interaction,而且比例是1:1.
: 我们有一些关于protein-protein interaction的数据，也可以docking 到单体上。但
: 是四聚体就有一些问题。因为如果是1：1，在四聚体上就是4：4，一共8个protein。
: 所以请大家个我推荐个docking program ，可以解决这个问题。 先谢过了。
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