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Biology版 - 请教质粒dimer问题
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话题: 质粒话题: dimer话题: 菌落话题: lb话题: 单切
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g***j
发帖数: 40861
1
正在构建一个质粒,挺简单,就是把这个质粒上的gfp换成同样大小的dsRed,质粒的骨
干不变。
连接,转化以后,有不少菌落。
第一天挑了4个菌落,长在LB里,amp浓度100ug/ml.结果只长了一个。试剂盒提质粒,
solution3 以后离心,结果上清非常浑浊,白色的东西离不下去。继续做,提完,跑胶
,没质粒。
第二天,又挑了4个菌落,长在LB里,amp浓度50ug/ml。4个都长了,试剂盒提质粒。同
样,solution3 以后离心,结果上清非常浑浊,白色的东西离不下去。继续做,提完,
跑胶,都有质粒。质粒大小和原质粒dimer 一样大。单切,跑胶,3个切不开,1个切开
后和原质粒单切大小一样。更加确定是形成dimer了。
问题一,为啥会形成dimer呢?
问题二,我是重新做连接,转化呢?还是把那个能切开的切一下,然后稀释,连接,再
转化呢?
e****s
发帖数: 1125
2
觉得你提的更可能是Trash,不是你的目标质粒。
重新来吧。

【在 g***j 的大作中提到】
: 正在构建一个质粒,挺简单,就是把这个质粒上的gfp换成同样大小的dsRed,质粒的骨
: 干不变。
: 连接,转化以后,有不少菌落。
: 第一天挑了4个菌落,长在LB里,amp浓度100ug/ml.结果只长了一个。试剂盒提质粒,
: solution3 以后离心,结果上清非常浑浊,白色的东西离不下去。继续做,提完,跑胶
: ,没质粒。
: 第二天,又挑了4个菌落,长在LB里,amp浓度50ug/ml。4个都长了,试剂盒提质粒。同
: 样,solution3 以后离心,结果上清非常浑浊,白色的东西离不下去。继续做,提完,
: 跑胶,都有质粒。质粒大小和原质粒dimer 一样大。单切,跑胶,3个切不开,1个切开
: 后和原质粒单切大小一样。更加确定是形成dimer了。

g***j
发帖数: 40861
3
谢谢,是要重做。
另外我想问是不是dimer既有可能是形成一个大环,也有可能形成两个小环套在一起?
不过要是后者,感觉没法一直复制了啊。

【在 e****s 的大作中提到】
: 觉得你提的更可能是Trash,不是你的目标质粒。
: 重新来吧。

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