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Biology版 - KO backcrossing
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话题: ko话题: b6话题: snp话题: backcross
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s*********y
发帖数: 579
1
正在backcrossing一个基因敲除的小鼠,ES细胞是B6/129。
backcross到B6,才3个generation,和B6的相识度已经98%了,这是Dartmouse公司的
SNP给的结果。为什么会这么快?
D*a
发帖数: 6830
2
因为他们筛SNP吧。
从第二代开始因为有crossing over,不是绝对的75%而是有的多于75有的少于75,他们
就全基因组筛一遍选最高的来backcross
s*********y
发帖数: 579
3
我前面三代backcross都没用他们公司的SNP,都是我随便挑几个做的。为了加快速度,
才开始用了他们的服务。
D*a
发帖数: 6830
4
那你不是应该送很多老鼠尾巴去再根据结果选用哪只么,怎么只有一个数据?
s*********y
发帖数: 579
5
刚开始图省钱,都是我自己随便挑两个交配的。
后来为了赶进度,就寄了几个老鼠尾巴,结果发现都是超过95%的B6 background了,我
估计应该只有85%左右的。
D*a
发帖数: 6830
6
运气太好?要么就是他们SNP不准。
我们这里听各种大小讲座这个技术听了好几遍,但是都不认识谁真用了这个技术。
不知道测一遍贵不贵,要不你寄个F1的尾巴去测测看是不是50%、、、

【在 s*********y 的大作中提到】
: 刚开始图省钱,都是我自己随便挑两个交配的。
: 后来为了赶进度,就寄了几个老鼠尾巴,结果发现都是超过95%的B6 background了,我
: 估计应该只有85%左右的。

s*********y
发帖数: 579
7
一根尾巴129刀,别的公司更贵。
l**********1
发帖数: 5204
8
好运道LZ
争取发个Cell 一作啥的
进Ivy Leage Medical School 当AP/PI
超过sunnyday

【在 s*********y 的大作中提到】
: 一根尾巴129刀,别的公司更贵。
D*a
发帖数: 6830
9
要不你自己选几个SNP或者PCR的loci做做看看结果是不是一致吧。。。
100bp左右如果差个10bp左右,PCR还是可以分出来,4%的agarose胶。
jax网上marker很全,但是strain不全/长度不准,得自己订了primer来跑跑看。
s*********y
发帖数: 579
10
多谢DUA,我准备再cross一代,然后看看什么情况。
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