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Biology版 - 怎样找一个基因在各种tissue里面的表达?
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话题: 基因话题: 表达话题: tissue
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g*******g
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1
Hi,
刚刚接触生物信息,现在有一个gene list,要确定做siRNA的可能性。目前需要从da数
据库里找到这些基因在各种组织(包括正常和疾病)里面的表达情况。
能否推荐一个好用的数据库?最好能输出一个heatmap之类的。
多谢!
l**********1
发帖数: 5204
2
please try SEURAT:
paper link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20525257
Package link:
//seurat.r-forge.r-project.org/manual.html

【在 g*******g 的大作中提到】
: Hi,
: 刚刚接触生物信息,现在有一个gene list,要确定做siRNA的可能性。目前需要从da数
: 据库里找到这些基因在各种组织(包括正常和疾病)里面的表达情况。
: 能否推荐一个好用的数据库?最好能输出一个heatmap之类的。
: 多谢!

s********s
发帖数: 3945
3
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/unigene

【在 g*******g 的大作中提到】
: Hi,
: 刚刚接触生物信息,现在有一个gene list,要确定做siRNA的可能性。目前需要从da数
: 据库里找到这些基因在各种组织(包括正常和疾病)里面的表达情况。
: 能否推荐一个好用的数据库?最好能输出一个heatmap之类的。
: 多谢!

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挖GEO的工具?求助: 推荐一个买human tissue lysate的公司
只会用现成的工具可以转bioinformatics了吗Question about human tissue sample
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Re: HELP: how to select RNAi target sequence需要购买human / mouse tissue,有卖的吗? :D
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