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Biology版 - 这周做的western blot结果很烂,请教!!
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s***i
发帖数: 160
1
周一到今天连续每天跑两个胶
结果每个都有问题
取成年小黑鼠样本
测PDK1,P-PDK1 还有其他protein
第一次的样本是上星期做的,结果pdk1 和P—pdk1 各出来bands,PDK比 P-PDK弱,第
一个不解
怀疑操作有问题,另取样本重新制作,第二次PDK没显示出来,P-PDK却一直存在,只不
过对比第一次稍弱
因为只load10ug跑胶,怀疑太少重复第三次,20ug,其他条件和第一次一样
结果PDK1还是没有显示 P—PDK1有显示
怀疑抗体浓度不够,今天使用一抗和二抗都用1:500,之前一直用1:1000
换用TPS—T 冲洗,之前都用PBS—T
另外操作过程反复检查过,把蛋白转到膜后ponceau检查没有问题,5%nonfat milk
incubate 1.30小时,冲洗都足15min,一抗体4度冰箱过夜,冲洗三次后二抗两小时,
再冲洗三次。抗体用的是cell signaling technology的。
百思不得其解,为啥第一次显示得出来~
另外同在一个胶跑的还有AKT和P-AKT,AKT显示正常,就是P-AKT有超多nonspecific
bands,有什么办法可以改进吗?
s***i
发帖数: 160
2
今天停止实验,彻查问题
有大牛可以帮忙给些建议吗?
g********0
发帖数: 6201
3
1。并不是你说每步操作(特别是转膜)没问题就没问题的,找个老手帮你看看。
2。不同组织目标蛋白含量不一样,对抗体的反应也不一样,对同样抗体,有些组织带
就很干净,有些就出杂band。
3。cell signaling似乎鼠源抗体效果强于兔源抗体。
4。在效果不好的情况下,就不要再用最便宜的那种250ml一大瓶的普通ECL发光液
了。卖贵一点的 ECL plus或ECL extra之类的增强液。
h*******o
发帖数: 4884
4
p-PDK和PDK用得不是同一个抗体,不同抗体质量差距太大了, 强弱不能简单的比较
一般做pProtein/Protein都是先p在strip做总的,像你这种情况的话,我的建议是
parallel 跑两块一样的胶,一块做pPDK一块用个强一点的Femto显影做PDK就行了
至于AKT和P-AKT,我用过cell signaling 的p-AKT具体哪一个忘记了,band非常specific
.
另外二抗用的太高浓度了, 一般条带出不来,提高二抗是没有用的,反而会增加背景或者非特异性的条带
普通ECL的话,二抗我都是1:10000-20000
s***i
发帖数: 160
5
多谢两位的指教
下周根据意见改进
我通常是用普通ECL显示 然后再把半个小时还没有显示的膜再用supersignal显示一遍
不过通常普通ECL显示不出来 super也没辙
上面的PDK就是这样的例子
s***i
发帖数: 160
6
请问Hellozero
我做这个实验就是要看PDK和P-PDK在同一个组织中显示出来量的不同
和对比不同组织的情况
你说不同抗体不能对比的话 那应该在怎么样对比两个的量呢?
今天再看发现AKT/P-AKT用的不是cell signaling的,是santa cruz的。这是唯一一个
不是cell那个公司的抗体
我实验室一哥们一直在用,不过他只取特定size的band 所以有nonspecific band他也
不知道
我在想是不是抗体的问题
我刚进实验室 有很多东西其实都不懂,真正菜鸟一只

specific
者非特异性的条带

【在 h*******o 的大作中提到】
: p-PDK和PDK用得不是同一个抗体,不同抗体质量差距太大了, 强弱不能简单的比较
: 一般做pProtein/Protein都是先p在strip做总的,像你这种情况的话,我的建议是
: parallel 跑两块一样的胶,一块做pPDK一块用个强一点的Femto显影做PDK就行了
: 至于AKT和P-AKT,我用过cell signaling 的p-AKT具体哪一个忘记了,band非常specific
: .
: 另外二抗用的太高浓度了, 一般条带出不来,提高二抗是没有用的,反而会增加背景或者非特异性的条带
: 普通ECL的话,二抗我都是1:10000-20000

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