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Biology版 - blastall 2.2.25的一个bug
相关主题
关于引物问题的请教如何根据蛋白的氨基酸序列预测其酶活性
哪位老师给推荐一下作多个DNA序列比对得软件吧!新人求助!请教:如何提高Blast result #?
基因序列和氨基酸序列的对应cDNA克隆的编码区缺失一个核苷酸?
?怎样Blast较大的序列?请教缺失体构建
怎么blast deep sequencing结果fastaq file中有没有一段特殊序列?为何进化领域的华人faculty这么少呢 (转载)
请问有什么做PHI-BLAST的program or software?关于染色体检查的问题46, XY, del(6)(p24)
问个blast的基本问题blast
怎样从一个DNA序列中找出与人类基因不同的部分?Re: 谁知道有什么好的序列分析软件?
相关话题的讨论汇总
话题: blastall话题: wwpdb话题: bug
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C*********m
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1
不知道版上各位有没有碰到过:
blastall -p blastp -d wwpdb -e 0.01 -F F -m 8 -i a.fasta | awk '$3 > 90'
wwpdb 是pdb 里所有蛋白序列,ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/derived_data/pdb_
seqres.txt,a.fasta 是 NP_113671.3 序列 (862 a.a),blast 2.2.15给出8个结果,
blast2.2.25只给出 7个,缺失的那个2p4r_T 只有25 a.a, 好像是 -F F 在 2.2.25版
本里不起作用.
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Re: 谁知道有什么好的序列分析软件?怎么blast deep sequencing结果fastaq file中有没有一段特殊序列?
My understanding of Bioinformatics请问有什么做PHI-BLAST的program or software?
Re: 什么软件可以做amino acid sequence alignment?问个blast的基本问题
[转载] 科学技术的重大变革:生物芯片怎样从一个DNA序列中找出与人类基因不同的部分?
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基因序列和氨基酸序列的对应cDNA克隆的编码区缺失一个核苷酸?
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