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Biology版 - 有没有高人对斑马鱼的学术前景加以指点分析?
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以后想做医学疾病相关的研究,现在选做斑马鱼的实验室合适吗?问个要突变体签协议的事
实验室组会上,老板要求我们每一步实验都要严谨…单克隆细胞系的制备
进化有几多 摇鼠点标问仙人进化论也太不靠谱了吧!
问个关于Prion领域发文章的事请推荐In Vitro Transcription / Translation kits
请教一个关于epistasis analysis的问题版主过分了啊!
Genetic Background of KO mouse当科学家成为一种高危行业?!转自新语丝
Affymetrix microarray 只有15个基因有差异,请教可能的原因疟原虫玩起“虫海战术”
俺来介绍一把Re: what is DNA shaffling?问大家一个问题:关于野生型P53表达的
相关话题的讨论汇总
话题: 斑马鱼话题: fish话题: decades话题: mouse话题: 没有
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1 (共1页)
l****q
发帖数: 404
1
自认自己不是特有天资的研究天才,属于脚踏实地做事的人。在国内二流实验室做了一
些斑马鱼基础研究,本来可以转行到细胞去,结果没处理好关系,冲动地换了实验室,
然后只好重新回到斑马鱼界。本以为国外的斑马鱼进展会快很多,没想到我还是天真了。
在一个老鼠实验室,靠着一个新起步的斑马鱼facility,几乎没有什么积累,完全靠自
己摸索条件。没有什么技术支持,也没有人力支持,非常的艰辛。估计没有3年5载是不
可能有什么文章的。已经摸爬了将近2年,只有一点可怜的对paper可能不会有什么贡献
的data。
总有人劝我尽量转到细胞或者老鼠,可是手上斑马鱼的工作量太大,说转也很迷茫。继
续做下去好像也不得要领。
我疑惑是否应该去哪里改进一下技术?比如更新一下显微注射的技术。或者去洗洗脑,
更新一下思路。老板是老鼠专家而不了解斑马鱼,我觉得我还需要给他经常洗洗脑,提
升一下他的兴趣(我很笨,不久前才意识到这个问题的严重性)。
现在经常担心整个斑马鱼这一块被砍掉,现在如果重新找工作就非常麻烦,国外没有
paper,研究经历也没有太多特色和长处。
现在斑马鱼的长处在哪里呢?我做的这一块既没有表型分析也没有抗体可用而且还是研
究成鱼里的功能。老板希望我构建转基因,研究突变体。万丈高楼,还要平地起。我倒
是不怕困难,关键最后老板会有足够的时间、耐心和funding来支持这样的从basic做起
的project吗?着急的时候全身发热发毛。
请大家说两句?
l*h
发帖数: 4124
2
斑马鱼只是一个模型动物,至于你用这个模型做什么东西就没有什么限制了,只要你的
设计合理,用到这个模型优于其它模型的性质。虽然斑马鱼的研究多数是做发育,但也
有很成功地用于肿瘤的例子。

了。

【在 l****q 的大作中提到】
: 自认自己不是特有天资的研究天才,属于脚踏实地做事的人。在国内二流实验室做了一
: 些斑马鱼基础研究,本来可以转行到细胞去,结果没处理好关系,冲动地换了实验室,
: 然后只好重新回到斑马鱼界。本以为国外的斑马鱼进展会快很多,没想到我还是天真了。
: 在一个老鼠实验室,靠着一个新起步的斑马鱼facility,几乎没有什么积累,完全靠自
: 己摸索条件。没有什么技术支持,也没有人力支持,非常的艰辛。估计没有3年5载是不
: 可能有什么文章的。已经摸爬了将近2年,只有一点可怜的对paper可能不会有什么贡献
: 的data。
: 总有人劝我尽量转到细胞或者老鼠,可是手上斑马鱼的工作量太大,说转也很迷茫。继
: 续做下去好像也不得要领。
: 我疑惑是否应该去哪里改进一下技术?比如更新一下显微注射的技术。或者去洗洗脑,

O******e
发帖数: 4845
3
你的长期目标决定你的短期计划。先问问你以后到底想干什么。如果一直做科研,
想做什么?接着做鱼还是想换做别的?
从实际的角度讲,你在一个做小鼠的实验室单打独斗斑马鱼,是事倍功半的选择。
做鱼有它的好处,可惜你得有那些资源才行。

了。

【在 l****q 的大作中提到】
: 自认自己不是特有天资的研究天才,属于脚踏实地做事的人。在国内二流实验室做了一
: 些斑马鱼基础研究,本来可以转行到细胞去,结果没处理好关系,冲动地换了实验室,
: 然后只好重新回到斑马鱼界。本以为国外的斑马鱼进展会快很多,没想到我还是天真了。
: 在一个老鼠实验室,靠着一个新起步的斑马鱼facility,几乎没有什么积累,完全靠自
: 己摸索条件。没有什么技术支持,也没有人力支持,非常的艰辛。估计没有3年5载是不
: 可能有什么文章的。已经摸爬了将近2年,只有一点可怜的对paper可能不会有什么贡献
: 的data。
: 总有人劝我尽量转到细胞或者老鼠,可是手上斑马鱼的工作量太大,说转也很迷茫。继
: 续做下去好像也不得要领。
: 我疑惑是否应该去哪里改进一下技术?比如更新一下显微注射的技术。或者去洗洗脑,

h*****t
发帖数: 103
4
了解不多,Look, A.T.不是既做斑马鱼又做老鼠的么,而且两个方向也做得很好啊。只
要老板有钱让你玩这个方向,就是件非常幸运的事情了,羡慕ing。
这个方向国内做的人不多吧,如果在这里搞好了,是不是回国更有优势呢?印象中有个
从马普回去的30岁就提正高、博导,拿973首席的,好像也是搞斑马鱼的吧。

了。

【在 l****q 的大作中提到】
: 自认自己不是特有天资的研究天才,属于脚踏实地做事的人。在国内二流实验室做了一
: 些斑马鱼基础研究,本来可以转行到细胞去,结果没处理好关系,冲动地换了实验室,
: 然后只好重新回到斑马鱼界。本以为国外的斑马鱼进展会快很多,没想到我还是天真了。
: 在一个老鼠实验室,靠着一个新起步的斑马鱼facility,几乎没有什么积累,完全靠自
: 己摸索条件。没有什么技术支持,也没有人力支持,非常的艰辛。估计没有3年5载是不
: 可能有什么文章的。已经摸爬了将近2年,只有一点可怜的对paper可能不会有什么贡献
: 的data。
: 总有人劝我尽量转到细胞或者老鼠,可是手上斑马鱼的工作量太大,说转也很迷茫。继
: 续做下去好像也不得要领。
: 我疑惑是否应该去哪里改进一下技术?比如更新一下显微注射的技术。或者去洗洗脑,

s******y
发帖数: 28562
5
斑马鱼只是模型的一种,相对于其他模型,好处就是胚胎体外发育,以及透明。
一般做法有两种:
1。针对某特定感兴趣的基因来做表型。
2。大规模筛选,针对表型来倒推基因。
如果不是做这两个角度的话,几乎是必死无疑。

了。

【在 l****q 的大作中提到】
: 自认自己不是特有天资的研究天才,属于脚踏实地做事的人。在国内二流实验室做了一
: 些斑马鱼基础研究,本来可以转行到细胞去,结果没处理好关系,冲动地换了实验室,
: 然后只好重新回到斑马鱼界。本以为国外的斑马鱼进展会快很多,没想到我还是天真了。
: 在一个老鼠实验室,靠着一个新起步的斑马鱼facility,几乎没有什么积累,完全靠自
: 己摸索条件。没有什么技术支持,也没有人力支持,非常的艰辛。估计没有3年5载是不
: 可能有什么文章的。已经摸爬了将近2年,只有一点可怜的对paper可能不会有什么贡献
: 的data。
: 总有人劝我尽量转到细胞或者老鼠,可是手上斑马鱼的工作量太大,说转也很迷茫。继
: 续做下去好像也不得要领。
: 我疑惑是否应该去哪里改进一下技术?比如更新一下显微注射的技术。或者去洗洗脑,

r******l
发帖数: 53
6
论前景,斑马鱼永远赶不上小鼠,甚至还不如果蝇和线虫,在cns级别的paper中,关于
斑马鱼的少得可怜。sunnyday说得不错,做斑马鱼不外乎正向和反向遗传学,既然你老
板已经让你做转基因或突变体,这就是一个好paper的开始。关键是你要做的基因或突
变体是否够新够重要,如果是,还是值得一做。
你做的是胚胎免疫还是成鱼的免疫机制?如果不能利用胚胎透明的优势,做斑马鱼就没
什么意思了。看能不能将你老板的方向往胚胎发育方面带?
j*****d
发帖数: 787
7
上次死掉的那个也是斑马鱼,苦逼的命
Lmh说得好,关键是想解决什么问题
然后再去考虑你的模型
一味想籍此CNS也不对
因为很多injection的试验不好解释
不如mouse genetics可靠
个人觉得斑马鱼live cell imaging才是脊椎动物里独一无二的,两年前德国已有相关
显微镜发布,后续结果不知道如何。但这些都太基础。也许有些器官也可以做再生医学
,其实这些都是发育领域,病理很少。

★ 发自iPhone App: ChineseWeb - 中文网站浏览器

【在 h*****t 的大作中提到】
: 了解不多,Look, A.T.不是既做斑马鱼又做老鼠的么,而且两个方向也做得很好啊。只
: 要老板有钱让你玩这个方向,就是件非常幸运的事情了,羡慕ing。
: 这个方向国内做的人不多吧,如果在这里搞好了,是不是回国更有优势呢?印象中有个
: 从马普回去的30岁就提正高、博导,拿973首席的,好像也是搞斑马鱼的吧。
:
: 了。

q******g
发帖数: 3858
8
我觉得他的老板是想让他在斑马鱼里做突变,进行筛选,找到影响发育或者信号通路的
基因,然后再回到小鼠里做。感觉这个老板还是比较有野心的,应该是不缺钱。关键是
,楼主要尽快把基因库做起来,找到一些有趣的基因。
M*****n
发帖数: 16729
9
这么重要的学术问题应该请教peoplem.
M*****n
发帖数: 16729
10
要找基因,用cell system足够了。
从fish mutant开始找gene,long shot, 不划算, NIH不会fund这样的project的。

【在 q******g 的大作中提到】
: 我觉得他的老板是想让他在斑马鱼里做突变,进行筛选,找到影响发育或者信号通路的
: 基因,然后再回到小鼠里做。感觉这个老板还是比较有野心的,应该是不缺钱。关键是
: ,楼主要尽快把基因库做起来,找到一些有趣的基因。

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Genetic Background of KO mouse问个要突变体签协议的事
Affymetrix microarray 只有15个基因有差异,请教可能的原因单克隆细胞系的制备
俺来介绍一把Re: what is DNA shaffling?进化论也太不靠谱了吧!
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X******n
发帖数: 914
11
8挂一下,上次去umich面试的那个牛姐(Bai)最后怎么样了?做fish的,在
这里还热烈讨论了一下的。
M*****n
发帖数: 16729
12
这个mm到底是不是去 Ann Arbor?
俺还想拉拉关系呢。
BTW, 不过此人mouse,fish都做的

【在 X******n 的大作中提到】
: 8挂一下,上次去umich面试的那个牛姐(Bai)最后怎么样了?做fish的,在
: 这里还热烈讨论了一下的。

p*****m
发帖数: 7030
13
你一个做了decades fish的嘲笑俺一个做了months的 不Nice 哼哼

【在 M*****n 的大作中提到】
: 这么重要的学术问题应该请教peoplem.
p*****m
发帖数: 7030
14
这个 不敢苟同
fish mutagenesis没找到什么好gene 这个应该说是有历史原因的吧

【在 M*****n 的大作中提到】
: 要找基因,用cell system足够了。
: 从fish mutant开始找gene,long shot, 不划算, NIH不会fund这样的project的。

M*****n
发帖数: 16729
15
俺不能直接说阿,有conflict of interest.
你是新手上路,看法比较公正。
没有嘲笑你的意思
况且这个问题以前咱们也讨论过。

【在 p*****m 的大作中提到】
: 你一个做了decades fish的嘲笑俺一个做了months的 不Nice 哼哼
M*****n
发帖数: 16729
16
你说说啥原因?

【在 p*****m 的大作中提到】
: 这个 不敢苟同
: fish mutagenesis没找到什么好gene 这个应该说是有历史原因的吧

S**********l
发帖数: 3835
17
牛妹妹叫bai啥?

【在 X******n 的大作中提到】
: 8挂一下,上次去umich面试的那个牛姐(Bai)最后怎么样了?做fish的,在
: 这里还热烈讨论了一下的。

M*****n
发帖数: 16729
18
白晓英

【在 S**********l 的大作中提到】
: 牛妹妹叫bai啥?
S**********l
发帖数: 3835
19
哦。瞻仰一下
http://connects.catalyst.harvard.edu/profiles/profile/person/53
是这个么?去harvard了啊

【在 M*****n 的大作中提到】
: 白晓英
a********k
发帖数: 2273
20
她是Harvard的博后

【在 S**********l 的大作中提到】
: 哦。瞻仰一下
: http://connects.catalyst.harvard.edu/profiles/profile/person/53
: 是这个么?去harvard了啊

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请推荐In Vitro Transcription / Translation kits疟原虫玩起“虫海战术”
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p*****m
发帖数: 7030
21
我觉得是他们挑错了问题一开始
Nusslein-Volhard一开始挑fish做model,无非是因为做果蝇做腻了(这是我瞎说的 lo
l),然后想用fly的手法(forward genetics)搞搞有脊柱的动物。换句话说,fish当时看
起来的优势,无非是一方面能做genetics,一方面有脊柱。
但是她在八十年代可能没想到fly和mouse在embryonic development上相似性是如此的大
,也没预料到现在mouse reverse genetics可以做得这么漂亮复杂。因此在fish上没找
到什么新东西并不奇怪:该找到的fly已经找到了,而且在mouse上验证好了;更要命的
是,mouse自己也可以找gene了(像spinal cord neuron的transcriptional code,基本
是全部从mouse自己做起做出来的) fish再做那不浪费么。
但是这不一定就说明fish这个model就是废物。如果利用fish能screen的长处,做fly没
有、mouse in vivo不能搞的phenotype还是可以的。这个怎么找就是个问题。。

【在 M*****n 的大作中提到】
: 你说说啥原因?
p*****m
发帖数: 7030
22
那是postdoc时期

【在 S**********l 的大作中提到】
: 哦。瞻仰一下
: http://connects.catalyst.harvard.edu/profiles/profile/person/53
: 是这个么?去harvard了啊

O******e
发帖数: 4845
23
Decades??如果说至少20年才能称decades。。。

【在 p*****m 的大作中提到】
: 你一个做了decades fish的嘲笑俺一个做了months的 不Nice 哼哼
S**********l
发帖数: 3835
24
10年就可以叫decades,俺们都是decades了。morphin可能还真做了20年。

【在 O******e 的大作中提到】
: Decades??如果说至少20年才能称decades。。。
p*****m
发帖数: 7030
25
20年那是不太可能的 超过10年我很看好 嗯。。

【在 S**********l 的大作中提到】
: 10年就可以叫decades,俺们都是decades了。morphin可能还真做了20年。
O******e
发帖数: 4845
26
10年还不能算是“几十年decades"吧?
呵呵,我太抠字眼了。。。

【在 S**********l 的大作中提到】
: 10年就可以叫decades,俺们都是decades了。morphin可能还真做了20年。
s******y
发帖数: 28562
27
关键就看你在语法里怎么处理非整数。
比方说1肯定是单数,2肯定用复数,那么1.1, 1.2 这种数字到底是用单数还是复数?
我依稀记得英语老师说用复数?

【在 S**********l 的大作中提到】
: 10年就可以叫decades,俺们都是decades了。morphin可能还真做了20年。
b****r
发帖数: 17995
28
我怎么记得你还是谁说过斑马鱼适合扫chemical

【在 s******y 的大作中提到】
: 斑马鱼只是模型的一种,相对于其他模型,好处就是胚胎体外发育,以及透明。
: 一般做法有两种:
: 1。针对某特定感兴趣的基因来做表型。
: 2。大规模筛选,针对表型来倒推基因。
: 如果不是做这两个角度的话,几乎是必死无疑。
:
: 了。

s******y
发帖数: 28562
29
好像是别人说的吧。不过这个说法我也赞成。

【在 b****r 的大作中提到】
: 我怎么记得你还是谁说过斑马鱼适合扫chemical
a***y
发帖数: 19743
30

最近看到一个用fish的
因为透明做imaging很好。这个算利用fish的优势。

lo
时看
的大
基本

【在 p*****m 的大作中提到】
: 我觉得是他们挑错了问题一开始
: Nusslein-Volhard一开始挑fish做model,无非是因为做果蝇做腻了(这是我瞎说的 lo
: l),然后想用fly的手法(forward genetics)搞搞有脊柱的动物。换句话说,fish当时看
: 起来的优势,无非是一方面能做genetics,一方面有脊柱。
: 但是她在八十年代可能没想到fly和mouse在embryonic development上相似性是如此的大
: ,也没预料到现在mouse reverse genetics可以做得这么漂亮复杂。因此在fish上没找
: 到什么新东西并不奇怪:该找到的fly已经找到了,而且在mouse上验证好了;更要命的
: 是,mouse自己也可以找gene了(像spinal cord neuron的transcriptional code,基本
: 是全部从mouse自己做起做出来的) fish再做那不浪费么。
: 但是这不一定就说明fish这个model就是废物。如果利用fish能screen的长处,做fly没

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S**********l
发帖数: 3835
31
如果把小学时候养鱼的经验也算上的话。或许是有的。

【在 p*****m 的大作中提到】
: 20年那是不太可能的 超过10年我很看好 嗯。。
1 (共1页)
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