有一些human cell的CTCF的chip-seq data，怎么找切入点 - Biology版 - 未名存档

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Biology版 - 有一些human cell的CTCF的chip-seq data，怎么找切入点

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e*****t 发帖数: 642	1 未发表的。大约20个细胞系。。。我是做bioinfo的，seq alignment以后，怎么找一些生物学意义？比如，寻找一些有趣的motif（这个比较不靠谱，我承认，但也能发文章）。或者，特定motif和gene expression的关系，这个很有意思，可惜没有gene expression的data。还能干些啥？大家来讨论讨论。多谢。
g**********t 发帖数: 475	2 都是什么细胞系？病理的还是正常的？不同组织的？
e*****t 发帖数: 642	3 都是不同组织的正常细胞，比如纤维细胞，上皮细胞。
s*********x 发帖数: 1923	4 没啥希望, encode的CTCF都做了十几个细胞系了，也没看出什么门道。

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