G********e 发帖数: 528 | 1 在做一个600AA左右的蛋白生物学功能,有细胞和老鼠模型
本人是蛋白结构盲,请教,
如果想从蛋白结构去分析推测它可能有的功能
不知道是否可能有免费的软件或者网络分析平台,或者人工读码?
Thanks |
I*********r 发帖数: 8 | 2 Do sequence alignment and structure alignment first. |
g**********t 发帖数: 475 | 3 可能的功能?如果是要很粗的分析,先做一个GO(gene ontology)分类。 |
f**********e 发帖数: 1994 | 4 先用 hmmer 看看 domain (600AA 大概有四个 domains), 再用
psipred 看看二级结构,顺便看看和已知结构有没有相似性,有的话
用 modeller 做 homology modeling, 和 structural
alignments.
【在 G********e 的大作中提到】 : 在做一个600AA左右的蛋白生物学功能,有细胞和老鼠模型 : 本人是蛋白结构盲,请教, : 如果想从蛋白结构去分析推测它可能有的功能 : 不知道是否可能有免费的软件或者网络分析平台,或者人工读码? : Thanks
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