g*********3
发帖数: 177 | 1 版上各位童鞋周末快乐哈。（如果有。。。）
最近拿到了一批质谱的raw data:形如
Accession Coverage # PSMs # Peptides # AAs MW [kDa] calc.
pI Score Description
数据省略
怎样对这批数据进行预处理呢？（目前想对这些蛋白按功能分类）
先谢谢大家。 |
j****x
发帖数: 1704 | 2 这已经不算raw data了，是经过扫库比对之后的结果。你可以简单的类比理解成一段测
序的结果做blast之后的输出。
不知道你所谓的是什么样的预处理？结果中都是经过简单注释的比对上的蛋白，按照与
质谱结果的匹配程度排列，分值越高匹配度越好，类比blast。后面的GO功能分类就没
什么好说的了，纯流程了。
.
【在 g*********3 的大作中提到】
: 版上各位童鞋周末快乐哈。（如果有。。。）
: 最近拿到了一批质谱的raw data:形如
: Accession Coverage # PSMs # Peptides # AAs MW [kDa] calc.
: pI Score Description
: 数据省略
: 怎样对这批数据进行预处理呢？（目前想对这些蛋白按功能分类）
: 先谢谢大家。
|
T****O
发帖数: 407 | 3 O, lord...why did you run mass spec at the first place...I am curious |
b******e
发帖数: 3348 | 4 ft,我们的raw data是要靠自己手算peptide sequences，你这个算什么raw data啊。
.
【在 g*********3 的大作中提到】
: 版上各位童鞋周末快乐哈。（如果有。。。）
: 最近拿到了一批质谱的raw data:形如
: Accession Coverage # PSMs # Peptides # AAs MW [kDa] calc.
: pI Score Description
: 数据省略
: 怎样对这批数据进行预处理呢？（目前想对这些蛋白按功能分类）
: 先谢谢大家。
|
