x*****a 发帖数: 972 | 1 在一个cover slip上养了一些muscle cells,就算100个吧。用Fluo-4(一种calcium
dye)染
色后,一旦用endothelin刺激,这些细胞会spike(表现为很强的荧光绿);不刺激的
时候,也有些
自发性的spike,那个就不是重点了。现在用一个inhibitor抑制了一下,然后再
endothelin刺激,
想看下刺激后,抑制剂是否把spike压下去了,要做个dosage curve,试不同的
inhibitor浓度。
现在的问题是:在不加inhibitor的情况下,endothelin导致的spike也不是完全同步的
,但是差别
不太大;加了inhibitor后,这100个细胞就完全不同步了,如果还有spike的话。
问了个两个人,得到2中说法:
1)计算每个细胞的spike的情况,normalize后作为这个dosage的曲线。
2)选一个具有代表性的单个细胞,把它的曲线作为这个sample的曲线,然后多搞几个
sample,
normalize几个sample,作为该dosage的曲线。
哪一个更对呢?貌似第二个有点道理,但是很容易biased了。 |
s******s 发帖数: 13035 | 2 当然是1啦,2一点没有道理
【在 x*****a 的大作中提到】 : 在一个cover slip上养了一些muscle cells,就算100个吧。用Fluo-4(一种calcium : dye)染 : 色后,一旦用endothelin刺激,这些细胞会spike(表现为很强的荧光绿);不刺激的 : 时候,也有些 : 自发性的spike,那个就不是重点了。现在用一个inhibitor抑制了一下,然后再 : endothelin刺激, : 想看下刺激后,抑制剂是否把spike压下去了,要做个dosage curve,试不同的 : inhibitor浓度。 : 现在的问题是:在不加inhibitor的情况下,endothelin导致的spike也不是完全同步的 : ,但是差别
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t**r 发帖数: 93 | 3 当然用2. 哪有统计100个细胞的做法? 那样会死人的.但是只用一个细胞也有问题,最好
是重复2-3次实验(sample),每次实验选几个细胞. |
h******3 发帖数: 190 | 4 不太懂你的实验。
Graphpad prism5的nonlinear curve fitting有fit repeated experiment data的功能
,不知道是不是你想要的。
http://www.graphpad.com/prism/curve.htm |
x*****a 发帖数: 972 | 5 选几个和选100个,这没区别了吧。100个确实很难搞,不过用ImageJ和matlab,还是可
以搞定。
我的问题是:应该选一个,还是选多个,来代表某个sample?
【在 t**r 的大作中提到】 : 当然用2. 哪有统计100个细胞的做法? 那样会死人的.但是只用一个细胞也有问题,最好 : 是重复2-3次实验(sample),每次实验选几个细胞.
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t**r 发帖数: 93 | 6 选多个, 以降低误差
【在 x*****a 的大作中提到】 : 选几个和选100个,这没区别了吧。100个确实很难搞,不过用ImageJ和matlab,还是可 : 以搞定。 : 我的问题是:应该选一个,还是选多个,来代表某个sample?
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