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Biology版 - 问个电生理的问题,请统计学高人进
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x*****a
发帖数: 972
1
在一个cover slip上养了一些muscle cells,就算100个吧。用Fluo-4(一种calcium
dye)染
色后,一旦用endothelin刺激,这些细胞会spike(表现为很强的荧光绿);不刺激的
时候,也有些
自发性的spike,那个就不是重点了。现在用一个inhibitor抑制了一下,然后再
endothelin刺激,
想看下刺激后,抑制剂是否把spike压下去了,要做个dosage curve,试不同的
inhibitor浓度。
现在的问题是:在不加inhibitor的情况下,endothelin导致的spike也不是完全同步的
,但是差别
不太大;加了inhibitor后,这100个细胞就完全不同步了,如果还有spike的话。
问了个两个人,得到2中说法:
1)计算每个细胞的spike的情况,normalize后作为这个dosage的曲线。
2)选一个具有代表性的单个细胞,把它的曲线作为这个sample的曲线,然后多搞几个
sample,
normalize几个sample,作为该dosage的曲线。
哪一个更对呢?貌似第二个有点道理,但是很容易biased了。
s******s
发帖数: 13035
2
当然是1啦,2一点没有道理

【在 x*****a 的大作中提到】
: 在一个cover slip上养了一些muscle cells,就算100个吧。用Fluo-4(一种calcium
: dye)染
: 色后,一旦用endothelin刺激,这些细胞会spike(表现为很强的荧光绿);不刺激的
: 时候,也有些
: 自发性的spike,那个就不是重点了。现在用一个inhibitor抑制了一下,然后再
: endothelin刺激,
: 想看下刺激后,抑制剂是否把spike压下去了,要做个dosage curve,试不同的
: inhibitor浓度。
: 现在的问题是:在不加inhibitor的情况下,endothelin导致的spike也不是完全同步的
: ,但是差别

t**r
发帖数: 93
3
当然用2. 哪有统计100个细胞的做法? 那样会死人的.但是只用一个细胞也有问题,最好
是重复2-3次实验(sample),每次实验选几个细胞.
h******3
发帖数: 190
4
不太懂你的实验。
Graphpad prism5的nonlinear curve fitting有fit repeated experiment data的功能
,不知道是不是你想要的。
http://www.graphpad.com/prism/curve.htm
x*****a
发帖数: 972
5
选几个和选100个,这没区别了吧。100个确实很难搞,不过用ImageJ和matlab,还是可
以搞定。
我的问题是:应该选一个,还是选多个,来代表某个sample?

【在 t**r 的大作中提到】
: 当然用2. 哪有统计100个细胞的做法? 那样会死人的.但是只用一个细胞也有问题,最好
: 是重复2-3次实验(sample),每次实验选几个细胞.

t**r
发帖数: 93
6
选多个, 以降低误差

【在 x*****a 的大作中提到】
: 选几个和选100个,这没区别了吧。100个确实很难搞,不过用ImageJ和matlab,还是可
: 以搞定。
: 我的问题是:应该选一个,还是选多个,来代表某个sample?

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