s******r 发帖数: 2876 | 1 同样的sample,同样的actin抗体,follow它的protocol,
ECL 1 min 有很清楚的带,Odyssey扫出来的看不见,加强intensity也只有很淡的条带,
大家有什么经验,Odyssey能达到普通ECL的灵敏度吗? |
I*****y 发帖数: 6402 | 2 ECL用的二抗有HRP酶,而Odyssey用的二抗是有荧光的。这个灵敏度应该是有差异的,
不过我不确定Odyssey的灵敏度是否差一些
带,
【在 s******r 的大作中提到】 : 同样的sample,同样的actin抗体,follow它的protocol, : ECL 1 min 有很清楚的带,Odyssey扫出来的看不见,加强intensity也只有很淡的条带, : 大家有什么经验,Odyssey能达到普通ECL的灵敏度吗?
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f*********r 发帖数: 1233 | 3 为了能一次就找出问题,请提供以下信息:
1)二抗的厂家和cat. #
2)odyssey扫描参数
3)扫描所得图像,一共三个图(波长700黑白,波长800黑白,两个波长混合彩色) |
s******y 发帖数: 28562 | 4 正常。
其实就是因为显示的方式问题,把对比调一下就好了
带,
【在 s******r 的大作中提到】 : 同样的sample,同样的actin抗体,follow它的protocol, : ECL 1 min 有很清楚的带,Odyssey扫出来的看不见,加强intensity也只有很淡的条带, : 大家有什么经验,Odyssey能达到普通ECL的灵敏度吗?
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s******r 发帖数: 2876 | 5 多谢你能抽空指点,
我block用的是5% milk in 1xTBST,
2抗之前步骤都相同,同一张膜剪两半。
2抗也是5% milk,1xTBST, 室温1hr,
TBST洗完了后,PBS洗两边,膜完全晾干后scan.
1), 2Ab是Licor自己的IRDye 800CW Goat anti-Mouse,#926-32210
1:5000 in 5% milk.
2), 双色彩图700 intensity 2.5, 800 intensity 5.
800单独扫描参数是 intensity 7.5.
sensitivity都用的缺省值5。
3), 上了四个图,ECL扫描的图,彩图包括700和800 channel,参数如上,
800单色图,参数如上,800灰度图,从800单色图export,没有压缩。
主要比较第一条lane。
因为只用了一种一抗,所以700灰度图应该没什么用。
麻烦帮着诊断诊断。
【在 f*********r 的大作中提到】 : 为了能一次就找出问题,请提供以下信息: : 1)二抗的厂家和cat. # : 2)odyssey扫描参数 : 3)扫描所得图像,一共三个图(波长700黑白,波长800黑白,两个波长混合彩色)
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s******r 发帖数: 2876 | 6 你觉得ECL和Odyssey比哪个更灵敏一些?
我知道这里可能有带,所以还能调来调去看能不能出来,
如果是不知道的话,可能就会当做没有带了。
正常。
其实就是因为显示的方式问题,把对比调一下就好了
带,
【在 s******y 的大作中提到】 : 正常。 : 其实就是因为显示的方式问题,把对比调一下就好了 : : 带,
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s**********o 发帖数: 14 | 7 我一直用Licor,我的经验是他的灵敏度要比ecl高。
我增经用过低于5ug的total protein上样,actin的结果也还是非常好。
要trouble shooting别人的问题,总是比较难。根据你的介绍,
我不知道blocking buffer是不是问题,在licor的manual里,
他有专门的blocking buffer的配方的,我一直用那个,配完后分装冻起来。
用milk和BSA据说都会减弱或者产生比较强的background。我们旁边的实验室
也有人用milk,但他们2抗用的浓度要大,1;2000。我一般用1:10000。
还有一个问题就是,不知道你的2抗是不是长期放在4度,时间太长会显著的降低他的灵
敏度的。
分装,放在4度尽量在1-2月内用完,最好。
别的,我也不知道了,你先试试,回头UPDATE一下进展。 |
s**********o 发帖数: 14 | |
f*********r 发帖数: 1233 | 9 actin,我的理解是表达极强的蛋白。基本可以看作是housekeeping,做loading
control。所以应该是极强,至少也是很强。在默认设置下,应该是强信号,甚至是过
饱和。这种背景还算低,但actin信号几乎没有的情况,说明western本身有问题。
如果其他步骤没有出差错的话,最大问题就是二抗-milk组合出了问题。
odyssey是不推荐使用奶粉的。就是因为它太灵敏,牛奶甚至普通bsa的背景太高。
因为很多公司这么做,所以我怀疑licor也可能会这样。licor一向推荐自己出的二抗和
blocking buffer。尤其是后者,比牛奶和bsa都贵很多,是他们公司主打消耗品之一。
他们非常不愿意见到客户用廉价的奶粉。别家出的二抗他管不了,但是自家的二抗,很
可能有什么技术,保证它与奶粉和普通bsa不兼容。
下面有两个选项可以尝试一下。
1)改用licor专用blocking buffer试一下。
2)改用别家二抗试一下。(rockland, invitrogen等公司都有比较成熟的红外荧光二
抗)。
2个选项交叉试一下,一共4种条件(含原先二抗-奶粉组合)。有了这四种对比,就可
以明确到底是二抗问题,还是奶粉问题,还是两者都有问题。 |
f*********r 发帖数: 1233 | 10 我也觉得不用晾干。当然,晾干也可以。
湿的条件,尤其是在扫描平面上加上一些水,然后放上膜,就有了类似全反射的效果,
就像显微镜油镜。在信号比较弱的情况下,湿比干效果好。
【在 s**********o 的大作中提到】 : 还有一个,你的膜为何要晾干??
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s******y 发帖数: 28562 | 11 你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose?
如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高!
另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein,
那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致
背景很高。
在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是
绝对比普通的ECL强的多
【在 s******r 的大作中提到】 : 多谢你能抽空指点, : 我block用的是5% milk in 1xTBST, : 2抗之前步骤都相同,同一张膜剪两半。 : 2抗也是5% milk,1xTBST, 室温1hr, : TBST洗完了后,PBS洗两边,膜完全晾干后scan. : 1), 2Ab是Licor自己的IRDye 800CW Goat anti-Mouse,#926-32210 : 1:5000 in 5% milk. : 2), 双色彩图700 intensity 2.5, 800 intensity 5. : 800单独扫描参数是 intensity 7.5. : sensitivity都用的缺省值5。
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s**********o 发帖数: 14 | 12 其实从sigma买东西自己配的话,也很便宜
【在 f*********r 的大作中提到】 : actin,我的理解是表达极强的蛋白。基本可以看作是housekeeping,做loading : control。所以应该是极强,至少也是很强。在默认设置下,应该是强信号,甚至是过 : 饱和。这种背景还算低,但actin信号几乎没有的情况,说明western本身有问题。 : 如果其他步骤没有出差错的话,最大问题就是二抗-milk组合出了问题。 : odyssey是不推荐使用奶粉的。就是因为它太灵敏,牛奶甚至普通bsa的背景太高。 : 因为很多公司这么做,所以我怀疑licor也可能会这样。licor一向推荐自己出的二抗和 : blocking buffer。尤其是后者,比牛奶和bsa都贵很多,是他们公司主打消耗品之一。 : 他们非常不愿意见到客户用廉价的奶粉。别家出的二抗他管不了,但是自家的二抗,很 : 可能有什么技术,保证它与奶粉和普通bsa不兼容。 : 下面有两个选项可以尝试一下。
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s**********o 发帖数: 14 | 13 PVDF还好吧,我就是用这个
【在 s******y 的大作中提到】 : 你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose? : 如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高! : 另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein, : 那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致 : 背景很高。 : 在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是 : 绝对比普通的ECL强的多
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s******r 发帖数: 2876 | 14 谢谢,有空我再试一下,二抗跟别人借的,也可能有点问题。
我一直用Licor,我的经验是他的灵敏度要比ecl高。
我增经用过低于5ug的total protein上样,actin的结果也还是非常好。
要trouble shooting别人的问题,总是比较难。根据你的介绍,
我不知道blocking buffer是不是问题,在licor的manual里,
他有专门的blocking buffer的配方的,我一直用那个,配完后分装冻起来。
用milk和BSA据说都会减弱或者产生比较强的background。我们旁边的实验室
也有人用milk,但他们2抗用的浓度要大,1;2000。我一般用1:10000。
还有一个问题就是,不知道你的2抗是不是长期放在4度,时间太长会显著的降低他的灵
敏度的。
分装,放在4度尽量在1-2月内用完,最好。
别的,我也不知道了,你先试试,回头UPDATE一下进展。
【在 s**********o 的大作中提到】 : 我一直用Licor,我的经验是他的灵敏度要比ecl高。 : 我增经用过低于5ug的total protein上样,actin的结果也还是非常好。 : 要trouble shooting别人的问题,总是比较难。根据你的介绍, : 我不知道blocking buffer是不是问题,在licor的manual里, : 他有专门的blocking buffer的配方的,我一直用那个,配完后分装冻起来。 : 用milk和BSA据说都会减弱或者产生比较强的background。我们旁边的实验室 : 也有人用milk,但他们2抗用的浓度要大,1;2000。我一般用1:10000。 : 还有一个问题就是,不知道你的2抗是不是长期放在4度,时间太长会显著的降低他的灵 : 敏度的。 : 分装,放在4度尽量在1-2月内用完,最好。
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s******y 发帖数: 28562 | 15 PVDF在我的经验中只能湿的时候用,一旦晒干就会有很强的背景荧光
【在 s**********o 的大作中提到】 : PVDF还好吧,我就是用这个
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s******r 发帖数: 2876 | 16 这个sample本身就比较稀,第一条lane已经是1:5稀释,后面是1:25, 1:125稀释。
所以western 本身的问题应该不大,主要是想看看在我手里ECL和Odyssey哪个好使,
可能二抗和blocking buffer都不够好,所以我这个看起来Odyssey比普通ECL要弱上
几倍。
actin,我的理解是表达极强的蛋白。基本可以看作是housekeeping,做loading
control。所以应该是极强,至少也是很强。在默认设置下,应该是强信号,甚至是过
饱和。这种背景还算低,但actin信号几乎没有的情况,说明western本身有问题。
如果其他步骤没有出差错的话,最大问题就是二抗-milk组合出了问题。
odyssey是不推荐使用奶粉的。就是因为它太灵敏,牛奶甚至普通bsa的背景太高。
因为很多公司这么做,所以我怀疑licor也可能会这样。licor一向推荐自己出的二抗和
blocking buffer。尤其是后者,比牛奶和bsa都贵很多,是他们公司主打消耗品之一。
他们非常不愿意见到客户用廉价的奶粉。别家出的二抗他管不了,但是自家的二抗,很
可能有什么技术,保证它与奶粉和普通bsa不兼容。
下面有两个选项可以尝试一下。
1)改用licor专用blocking buffer试一下。
2)改用别家二抗试一下。(rockland, invitrogen等公司都有比较成熟的红外荧光二
抗)。
2个选项交叉试一下,一共4种条件(含原先二抗-奶粉组合)。有了这四种对比,就可
以明确到底是二抗问题,还是奶粉问题,还是两者都有问题。
【在 f*********r 的大作中提到】 : actin,我的理解是表达极强的蛋白。基本可以看作是housekeeping,做loading : control。所以应该是极强,至少也是很强。在默认设置下,应该是强信号,甚至是过 : 饱和。这种背景还算低,但actin信号几乎没有的情况,说明western本身有问题。 : 如果其他步骤没有出差错的话,最大问题就是二抗-milk组合出了问题。 : odyssey是不推荐使用奶粉的。就是因为它太灵敏,牛奶甚至普通bsa的背景太高。 : 因为很多公司这么做,所以我怀疑licor也可能会这样。licor一向推荐自己出的二抗和 : blocking buffer。尤其是后者,比牛奶和bsa都贵很多,是他们公司主打消耗品之一。 : 他们非常不愿意见到客户用廉价的奶粉。别家出的二抗他管不了,但是自家的二抗,很 : 可能有什么技术,保证它与奶粉和普通bsa不兼容。 : 下面有两个选项可以尝试一下。
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s******r 发帖数: 2876 | 17 是PVDF,millipore non-fluoscence的,用intensity 7.5,背景已经很高了,
anyway,想省钱大概是不行了。
你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose?
如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高!
另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein,
那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致
背景很高。
在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是
绝对比普通的ECL强的多
【在 s******y 的大作中提到】 : 你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose? : 如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高! : 另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein, : 那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致 : 背景很高。 : 在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是 : 绝对比普通的ECL强的多
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f*********r 发帖数: 1233 | 18 你的结论有两点不确切。
第一,背景并非很强。我以前专门发贴阐述过这个问题。你的那张膜是个很典型的例子。
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31358315.html
请注意该贴第二页的跟贴。有些具体的图例讲解图像调节问题。
第二,费用方面。硬件上,建造暗室、购买和安装设备的费用不比licor节省。耗材上
,底片、显影药都不便宜,而且还有回收废液的费用。
【在 s******r 的大作中提到】 : 是PVDF,millipore non-fluoscence的,用intensity 7.5,背景已经很高了, : anyway,想省钱大概是不行了。 : : 你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose? : 如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高! : 另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein, : 那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致 : 背景很高。 : 在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是 : 绝对比普通的ECL强的多
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m*****l 发帖数: 28 | 19 看你probe什么蛋白了。 有的抗体在Licor上work的不如ECL, 有可能是二抗的问题。 |
m******5 发帖数: 1383 | 20 同发现PVDF绿色背景很高,得用红色
怎么解决?我有一个蛋白用Nitrocellulose做不出来
【在 s******y 的大作中提到】 : 你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose? : 如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高! : 另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein, : 那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致 : 背景很高。 : 在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是 : 绝对比普通的ECL强的多
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I*****y 发帖数: 6402 | 21 多大的蛋白?
【在 m******5 的大作中提到】 : 同发现PVDF绿色背景很高,得用红色 : 怎么解决?我有一个蛋白用Nitrocellulose做不出来
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m******5 发帖数: 1383 | 22 我用pvdf膜全膜绿色背景很高啊,和蛋白大小关系不大
【在 I*****y 的大作中提到】 : 多大的蛋白?
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I*****y 发帖数: 6402 | 23 pvdf的背景对于li-cor的荧光尔康就是背景高
【在 m******5 的大作中提到】 : 我用pvdf膜全膜绿色背景很高啊,和蛋白大小关系不大
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d****i 发帖数: 2346 | 24 Licor相对方便,但是太敏感,背景太高。如果你要strip就更麻烦,远不如ECL的strip
后好用。 |
r*****m 发帖数: 231 | 25 我个人的经验是LICOR的灵敏度介于ECL pico和femto之间,很弱的signal用LICOR看很
吃力,因为背景还是太高了,不像ECL,只要操作得好背景应该为0。
不过我觉得LICOR最要命的是二抗的specificity问题,IP下来的sample用不同species
的二抗竟然能看到很强的IgG,这个让我直接怀疑用它同时做两个primary的
specificity可靠性。。。事实上我也确实遇到过一个channel的signal透到另一个
channel的情况,不过不知道是荧光的bleed through还是二抗的cross-reactivity? |
d*******e 发帖数: 110 | 26 我一直在用Licor Odessey,觉得Licor Odessey 的灵敏度非常的高。用的是它家的二
抗,稀释到1:10000都能得到很好的信号。我一直用5%的脱脂奶粉block, 有时候背景
比较强,但总体上好过得去。哪位好人能提供一下Licor Odessey自家的blocking
buffer 的配方,老板不同意买这个blocking buffer.
带,
【在 s******r 的大作中提到】 : 同样的sample,同样的actin抗体,follow它的protocol, : ECL 1 min 有很清楚的带,Odyssey扫出来的看不见,加强intensity也只有很淡的条带, : 大家有什么经验,Odyssey能达到普通ECL的灵敏度吗?
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y****6 发帖数: 196 | 27 Any one reuse Odyssey blocking buffer? How is the performance? |
g*********5 发帖数: 2533 | 28 用了4年licor了。感觉比ecl灵敏。
如果用pdvf (我一般只用nc),二抗中加点sds可以降低背景 。
actin不出来,原因应该是二抗问题。
还有,我从来不干膜,总是湿扫。
他家有专门的strip buffer,管用。
1:5,但是我用1:10,室温20分钟,4度两小时。
tbst洗4遍,可以直接用别的一抗。
有时候tubulin去不干净。
【在 s******y 的大作中提到】 : 你的那种绿色的膜背景很高啊,不知道你用的是不是Nitrocellulose? : 如果你不小心用错了PVDF,会导致背景非常高! : 另外,最好不要用牛奶。我的经验是,要么就用牛奶里面提纯的那个casein, : 那么就乖乖的用Licor 产的blocking buffer。直接用牛奶的话也很容易导致 : 背景很高。 : 在我的经验里,Licor Odessey 的灵敏度比Femto kit稍微低一点点,但是 : 绝对比普通的ECL强的多
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