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Biology版 - 跟风, 请教ILLUMINA data analysis
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s**********e
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1
本人bioinformatics的东西不懂,不过也想学学.自学的话,怎么起步,大牛给点建议.
最近课题需要,用ILLUMINA测了几个genome (20Mb/genome).有一个faculty帮我分析数
据.感觉还是挺难的,你要懂生物,统计,计算机才能把数据分析的很好.不过觉得还挺有
意思,有机会觉得应该学一下.
现在我的问题是,highly repetitive 序列怎么处理.我们想在reference genome的基础
上assemble我们的序列得到新的genome序列,不是很容易阿,特别是高重复序列.我们测
得序列长度是76bp.
欢迎大家讨论.
t*d
发帖数: 1290
2
高重复序就忽略吧。

【在 s**********e 的大作中提到】
: 本人bioinformatics的东西不懂,不过也想学学.自学的话,怎么起步,大牛给点建议.
: 最近课题需要,用ILLUMINA测了几个genome (20Mb/genome).有一个faculty帮我分析数
: 据.感觉还是挺难的,你要懂生物,统计,计算机才能把数据分析的很好.不过觉得还挺有
: 意思,有机会觉得应该学一下.
: 现在我的问题是,highly repetitive 序列怎么处理.我们想在reference genome的基础
: 上assemble我们的序列得到新的genome序列,不是很容易阿,特别是高重复序列.我们测
: 得序列长度是76bp.
: 欢迎大家讨论.

s**********e
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3
是啊,目前就是忽略了.
s**********e
发帖数: 178
4
要是自学的话,bioinformatics 的东西容易吗?
t*d
发帖数: 1290
5
看你想干什么。如果只是想解决一个非常具体的问题,而且如果相关领域比较成熟了,
就会比较容易。你学的大概就是怎么用几个常用的软件。
如果想往深了学、广了学,那就要花费一些功夫。

【在 s**********e 的大作中提到】
: 要是自学的话,bioinformatics 的东西容易吗?
s**********e
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6
Thank you so much! At this stage, I may just try to learn how to solve
specific questions.
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