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全部话题 - 话题: 首揭
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x********e
发帖数: 35261
1
现在蛋白结构研究的问题主要是静态。研究静态结构用处不大。不管是RNA还是protein
,没有kinetics都是扯淡。
特别是像阿兹海默这种研究misfolding和peptide aggregation的,解个晶体结构能说明
什么呢?蛋白酶晶体结构倒是用处很大。
w******l
发帖数: 67
2
那好吧,既然mm(?)你都说用处不大了,那就是用处不大了。
我也挺你!

protein
说明
b******k
发帖数: 2321
3
你这是典型的回帖不看帖 11g解的难道不是蛋白酶?

protein
说明
y***i
发帖数: 11639
4
太扯了。你这好比说发动机的结构图用处不大,因为还没有发动机动起来的图。
事实上发动机的结构图已经有了它在动态情况下的绝大部分 ---99%以上的信息。

protein
说明
x********e
发帖数: 35261
5
我回帖没说是11g的工作啊
就是感觉整体蛋白结构这块缺少folding kinetics的研究
x********e
发帖数: 35261
6
我不觉得蛋白和RNA结构可以类比成发动机
发动机造好了就不会散架,可生物大分子是处于一种非常不稳定的动态平衡。温度,盐
浓度,chaperones,crowding factors,都会影响kinetics
y***i
发帖数: 11639
7
一个蛋白结构就那么几个大domain,动态情况下,只会有少量变化,而不会整个
domain折叠变化,更不可能这个蛋白质有大的折叠变化,所以拿一个静态结构就能猜想
出很多动态信息了。无数结构都是这么做的:得到一个结构,根据这个结构去猜想那些
是重要的氨基酸,动态情况下结构可能做什么变化,然后做几个mutation验证猜想。
我觉得你是没看过什么结构文章,在瞎猜,而且猜错了。
x********e
发帖数: 35261
8
有专家大牛出来说说protein NMR吗?
有没有可能在溶液中解蛋白结构?

扯。
concern
x********e
发帖数: 35261
9
我对晶体结构没什么了解。知道点用optical tweezer做动态peptide folding的,觉得
protein folding并不是之前想象的那么简单。
s******s
发帖数: 13035
10
你这是何不食肉糜。有静态结构比没有强100倍

protein
说明
y***i
发帖数: 11639
11
你这是本科生化实验的结论。真正有价值的酶的动态,几乎必然是静态下的微小变
化。本科实验那种煮一煮加高盐,和生理状态的动态变化一点关系都没有。
f*******g
发帖数: 245
12
俺还是挺下玄月同学的观点。 动态结构才是真的结构,静态结构可能与功能相差十万
八千里。
比如DNA的双螺旋,这个狗屁结构除了画在图书上好看点,真是一点功能没涉及。
x********e
发帖数: 35261
13
我没说解晶体结构不好啊,我只是提出我觉得未来应该突破的方向
y***i
发帖数: 11639
14
我猜想你说的是整个蛋白怎么折叠成functional结构。但这个问题其实价值不大。有
价值的动态结构是:比如酶结合底物和不结合底物的对比,马达蛋白不同步骤时候的对
比。。。这些变化,就我所知,基本都是domain之间的相对位置变化,不会有一个大
domain整个辩了。就象汽车装客人的时候,是车门开关的变化,不会整个车架子卸开再
装人。

猜想
那些
x********e
发帖数: 35261
15
很多蛋白不光是水解个ATP就完了的事
比如说V-SNARE和t-SNARE怎么互相识别dimerize的,motor protein怎么就在水解ATP后
发生构象改变了,光解个kinase domain解决不了问题。还有些intrinsic disordered
protein或者protein domain,根本无法用静态结构去理解。比如核孔蛋白含的FG doma
in。
x********e
发帖数: 35261
16
说得那么轻松,就说马达蛋白吧
dynein/dynactin的部分结构很早就用电镜看到了,到现在50年肯定有了,还是那个样子
t******n
发帖数: 138
17
DNA的双螺旋结构是它的功能的最好注释吧?
b******k
发帖数: 2321
18
motor protein从我一个外行看来已经了解的够清楚了 剩下的问题是细枝末节而已 当然
也许你是内行 可以谈谈motor protein的机理还有啥特别核心的部分不知道

样子
x********e
发帖数: 35261
19
kinesin和myosin好像挺轻松的,dynein的貌似特别难。我就半罐子水,算不上内行,不
过某个当年解了dynein结构的教授在系里,每次听他讲都觉得痛苦

当然
y***i
发帖数: 11639
20
是啊,解释了 1.碱基配对 2. DNA的半保留复制是怎么回事 3. 细胞分裂时怎么保证
DNA信息精确复制。
把DNA所有最基本的最重要的功能都解释了。历史上最震撼人心的精致,简洁又完美
的结果。什么叫一点功能没涉及。生化没学好啊。

十万
w******l
发帖数: 67
21
所以,mm,我必须得挺你!
都没什么了解也能下结论!
挺你一万年!
t******n
发帖数: 138
22
那模拟对peptide folding的解释可信吗?
x********e
发帖数: 35261
23
我没说DNA双链没涉及一点功能啊
我说的是没有揭示染色体高级结构,对基因转录调控方面没什么暗示
x********e
发帖数: 35261
24
optical tweezer不是模拟
t******n
发帖数: 138
25
哈哈,这个我知道,就是想问问做实验的对模拟结果有什么看法。
f*******g
发帖数: 245
26
你该好好看看那半篇paper,涉及个屁。
玩结构就玩结构,结构和生化还离得远。
你说的这几个,都不是那个双螺旋结构解决的。
a********k
发帖数: 2273
27
谨慎同意,我当年看那小文章的时候也这么想。不晓得现在有闲工夫看一遍的话是不是
有不同的感受
x********e
发帖数: 35261
28
我自己不做结构,只是经常去听听生物物理系的讲座,了解一下不同的领域
专业问题回答不上来
t******n
发帖数: 138
29
不好意思,我不是学生物出身,麻烦你解释一下没有双螺旋结构为基础,这些问题是怎
么解决的?

保证
完美
x********e
发帖数: 35261
30
1.碱基配对:DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1
2.噬菌体碱基同位素标记
s**a
发帖数: 2138
y***i
发帖数: 11639
32
你说的是两个现象,这个两个现象的机理被双螺旋解释。
DNA中(A+T):(C+G)永远是1:1 的现象在这以前就被发现了,但为什么?没人知道。直
到双螺旋告诉你 A和T配对,C和G配对。
同样,在双螺旋被发现之前,人们不能理解为什么有半保留现象。双螺旋完美解释。
然后双螺旋加碱基配对,自然解释基因精密复制遗传的机理。

是怎
f*******g
发帖数: 245
33
Chargaff law, in any species, A=T, C=G, the complimentary law.
w**********k
发帖数: 386
34
90年代的时候,由于软盘容量小,放不了avi, 拿到一些QPEG 就可以撸好几天。
x********e
发帖数: 35261
35
双螺旋结构哪里揭示了半保留复制?在不知道分子机制前孟德尔等人早就用其他方式总
结出了遗传的基本原理。原理一直在那里,只能说双螺旋解释了为什么是这样的原理。
y***i
发帖数: 11639
36
这就是我说的。双螺旋--解--释--了这3个现象的机理。

。直
释。
D*******D
发帖数: 100
37
问个土问题,我在一直不了解,解结构这个越来越接近工业化生产的工作,为什么不像
有些lab 一样去成立一个公司专门做产品卖给别人(如做转基因老鼠的),利人利己,
而不是在这里抢占研究资源?为什么还十年如一日的发NS?
a*********n
发帖数: 2526
38
麦当劳快餐模式 对 中餐馆老师傅模式 呵呵
b****s
发帖数: 872
39
要能产业化,肯定早做了。这种结构,估计卖不出去。
产业化最起码得有需求,离应用近,人家肯出钱买。
s******y
发帖数: 17729
40
双螺旋这个还算好的了
有一小错人在研究的东西更扯犊子,好像是用啥nono技术,基于原子里的显微结构观察
DNA结构,观测这些结构真的是让人无语
x********e
发帖数: 35261
41
另外,我觉得晶体结构有时候是有误导,或者说片面的。就说双螺旋吧,只有在原核生
物里是线性的。在真核生物in vivo的情况下,大部分时候DNA都是有histone
chaperone包裹着。双螺旋反应不了高级结构
x********e
发帖数: 35261
s******y
发帖数: 17729
43
AFM观测DNA单分子结构
不懂结构,偶尔听听报告而已,感觉他们蛋扯的没边的感觉
b****s
发帖数: 872
44
盲人摸象的不同摸法。有人喜欢摸象的汗毛,你说这不叫摸,他们会不高兴的
y***i
发帖数: 11639
45
。。。。。我说了这么半天,你还没明白?双螺旋结构对DNA的机制的揭示,绝对震古
烁今,说是生物学历史上最伟大的工作都不为过。在那之前,人们只是知道生物有遗传
信息的现象,而双螺旋让人们真正明白机理是什么。其机制的简洁,优美,让人震惊。
而你说的东西,比双螺旋结构揭示的知识,鸡毛蒜皮而已。
这些话根本不该在这里说,因为是学生物的都该知道,怎么还有好几个人能顶着生物
的tittle在这里自作聪明。。。。。
x********e
发帖数: 35261
46
AFM还可以这样用?我只知道从细胞层面上用AFM看表面结构
x********e
发帖数: 35261
47
我都说是片面了。说不叫摸的是你吧。
你作为搞结构的,能不能简单介绍一下结构生物学研究技术方面的进展呢?我感觉从富
兰克林时代就开始用X光衍射到现在还是用同样的技术。还有结晶技术方面,有什么突
破性进展吗?
b**z
发帖数: 1351
48
施一公在NATURE发表的科研故事作为一个系列,精彩度和价值已经超越莫言的小说
希望施一公早日获得诺贝尔奖
照这样的速度下去,感觉他已经很近很近
我不熟悉、也不清楚蛋白结构领域,究竟啥样的成果是诺贝尔奖级别
但就最近2年的生理学奖的几个获奖人,感觉也就是搞出了些RNA啥的结构啊
D*******D
发帖数: 100
49

我的想法比如: 像有的公司需要做莫些药,那么相联系的靶点,蛋白的结构的case发
给yg他们,然后他们定向去解,从中盈利。
D*******D
发帖数: 100
50

其实现在都有川菜学校的了,真真有什么是像千年传承的技艺不外传的?很少了吧?
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