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全部话题 - 话题: 重复
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1
来自主题: Biology版 - Ng-Ago 重复进展(集合贴)
刚开始韩春雨的文章发表,我也是支持者和粉丝,对质疑者很不满。现在觉得韩春雨在
北大和遗传所等的报告中强调必须高超的实验技巧才能做出来,就是为以后别人质疑他
重复不出来提前辩解。又说等他的2.0和smart版,感觉只是为了拖延时间。不然解释不
了,已经发表的文章、效率跟CRISPR差不多,为什么做不出来。连我这种手残党,按着
张锋的protocol、addgene上买来的质粒、做CRISPR一把就做出来了。
韩春雨在报告中反复强调他是初级版、需要高超的实验技巧、等他推出2.0版,实在让
人听了生疑。而且这些表述跟他发表的文章的描述、那么高的效率、以及methods &
materials部分也都是矛盾的,因为他描述的并不是什么复杂的实验,就是转染而已。
T7E1和测序也都是现成的。除非他故意删掉了关键的细节。但是这么说也讲不通,因为
发表文章的目的就是想要公开,何况这是方法学文章、故意隐藏细节不让他人重复,也
讲不通。
感觉韩春雨的泡泡要破灭了。
楼主挺积极的,干嘛不给nature biotechnology的编辑写信提出?editor让他解释的话
,我看韩春雨怎么解释。
S**********e
发帖数: 620
2
来自主题: Biology版 - Ng-Ago 重复进展(集合贴)
赶紧,那些重复不出来的人们赶紧试试,听起来有些刺激,同时也不可想象,少一个磷
酸基团就能死死卡住?希望能重复出来,DNA的功能就拓宽了许多。难道韩春雨在导演
过山车,逗你们玩,女主角的小心脏会被玩死的。。。

发帖数: 1
3
来自主题: Biology版 - Ng-Ago 重复进展(集合贴)
所谓做出来了 是怎么做出来的?
测序了吗?看到切割了吗?
重复的fig4?
[在 sunnyday (胖头鱼。按斤卖就赚了) 的大作中提到:]
:我好奇的去看了一眼,刚刚有一个人出来说他做出来了。他的做法是用激酶来磷酸
:化那个oligo,而不是从厂家订磷酸化的oligo。因为这个5'-end 磷酸化很关键,
没有
:磷酸化的Oligo不能被NgAgo识别。从理论上来说,如果oligo 的磷酸化不完全的话,
就有可能出现那些没有磷酸化的oligo和磷酸化的oligo 互相竞争结合基因上的位点而降
:低酶的效率。所以弄不好这个磷酸化就是其中的技术要点。
:貌似这个是目前第一个跳出来说重复出来了的人。静待更多的跟进报道。
:Jan Winter
:Hi guys,
:Just had a couple of tests with ngago from addgene and custom Oligos, so I
did not try to reproduce the paper.
:And in my hands I see an effect that is slight... 阅读全帖

发帖数: 1
4
来自主题: Biology版 - Ng-Ago 重复进展(集合贴)
说到底还是没有人重复出来
韩春雨老师就是在自己打自己的嘴巴,什么Fig4有难度,不好重复,都是鬼话,真那么
有难度,请问他是怎么做到的能够精准的切割50个位点?
d********m
发帖数: 3662
5
重复出来的确是好事。但你看到重复出来那些都是些什么人就会感觉这并不是好事。每
个人都是有一个关键步骤,但这个关键步骤就像他们老婆在通奸,家丑不可外扬。
N****n
发帖数: 294
6
如果第一篇也重复不出来,说明这个系统没有证据能用做基因编辑。

:我就搞不懂了,文章A重复不出来,关文章B有毛关系?
l****y
发帖数: 486
7
我听到的消息是已经有几家实验室联系杂志了, 说重复不出,
杂志在叫别的实验室重复, 大家再等等就知道了.

发帖数: 1
8
韩文中用的是注射胚胎?最简单的重复是repeat韩文中的实验


: 国内同行也表示不能重复,注了一堆胚胎。


发帖数: 1
9
140个实验室,只有一个实验室重复做出来了。有人估计是仇子龙实验室。那么证明火
锅哥和晚饭哥两个实验室都没有做出来。
如果星期一早上仇哥出来否认他的实验室重复出来了,那么火锅哥和晚饭哥当中必然有
一个是骗子。
r*******e
发帖数: 680
10
这些也是同行嘛。做不出来当然可以质疑。
文责自负,老韩发的文章自己要负责回答同行的疑问。这是科学,不是艺术。你发表文
章说这样这样,同行要是想重复,必须得能重复。而且这个发现是个实验工具,好用了
大家都要用。现在谁也用不成,还不能说吗?难道还要质疑人家大牛实验室不会实验技
巧?

发帖数: 1
11
【澳大利亚的这位教授,前一阵说实验可重复,前天又说不能重复,科学不是这么儿戏
的。对此,我都不打算做解释和回应,外界的这些纷纷扰扰我不太在意。对我来说,最
重要的就是把实验和科研做好】
。。。。。。。。。。
r********k
发帖数: 258
12
若有人密而不宣重复出来,他们将在老板面前灰头土脸。若继续试验,如果韩的结果不
能重复,则浪费时间和资源。他们茫然不知所措,只好发帖逼韩揭盖。
s******y
发帖数: 17729
13
有意思吗?他自己重复的,所谓第三方在场也不能取信于人,关键是其他实验室能独立
重复,否则,按照第一次糊弄鬼的方法,再糊弄一次,轻车熟路,一个星期就够了,剩
下时间陪第三方喝酒
i***9
发帖数: 106
14
个人感觉是中国特色。
在美国很少会听到非科研人员对于学术研究指手画脚。也就是说大家通常不跨界,各自
在所属的领域发言。在中国则不一样,就像当初的药家鑫案,很多八竿子打不着的人都
站出来指手画脚。现在则发展到任何事件,所有人都可以指点江山,发起投票。
在这件事情上,也是一样的。国内的科研单位,无论能否重复,没有一个站出来进行实
质上的讨论(我说的是晒data)。或撑或贬,都是毫无根据的转发,大放厥词。
澳大利亚的实验室,虽然也就是个中游偏下的实验室,但毕竟人家是按照科研圈子的规
矩办事儿,重复不到,就有理由怀疑。其他的质疑声音,也都是做科学研究的。
现在国内网络上发声的基本都是民科,甚至是和科研学术毫不沾边的。虽然有些人有生
物背景,但基本没有什么真正做实验的。
裘千仞毫无依据的5%,也是民科水平的嚷嚷。
没有实验数据支持的比嗓门,就是民科。
w*p
发帖数: 16484
15
他自己重复出来没用,必须得第三方独立实验室重复出来才会被科学界接受。
b*****n
发帖数: 1841
16
来自主题: Biology版 - 我遇到的生物学不可重复事件
曾经在一个小鼠上通过某个简单手术发现显著表型,表型还有分子变化完全与假说吻合
,而且做的两只小鼠完全一样。这样的结果如果是真的是可以发表在最好的杂志的。但
是后来重复,做了一百多只小鼠,各种因素全考虑到了,没有一只重复出来,也是见了
鬼了。有人可能就敢把结果发出去,我呢只能接受失败。 现在多年过去了,也不知道
这个鬼是什么。生物学这个系统不稳定的因素很多。
当然说这个并不佐证韩春雨的结果是偶然的。他的文章必然有很多假的东西。

发帖数: 1
17
韩春雨在遗传所信誓旦旦说过20个实验室可以重复,NBT一定要他把这个名单公布。
只要韩春雨不能公布这20个实验室名单,造假自然而然就是事实了。后面的闹剧大
家都不要再看下去了。
退票。。。。。

发帖数: 1
18
听了电话录音的人说韩在电话里讲了20家实验室能够重复的事

发帖数: 1
19
N+1不是这样来的。
首先是1,然后是N,最后要N+1
140个实验室已经是N+1了,已经证明不丁了。
小保方和一个验证小组平行重复都重复不出来,连1都没有过。
韩春雨肯定过不了1,否则细胞室怎么会污染?
韩希望有一个实验室比仇子龙还有运气?
韩春雨从文科家庭出身,估计数学一定很差。找N这个数字很容易的,N不大于20.不信
让韩春雨把20个实验室名单讲出来吧?

发帖数: 1
20
大家用楼主的format,把自己看到的那些重复或无法重复的例子加进来。
c********n
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21
第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
暂只收录包含有具体实验信息(eg. 实验材料,步骤,etc)的发布报告
第二则
- 发布方:James Gagnon
- 发布时间:2016年7月8日至2016年7月29日
- 发布平台:google groups, twitter
- 发布方国家:美国
- 发布方城市:Cambridge, MA
- 发布方研究机构:Harvard University
- 实验室PI:Dr. Alex Schier
- NgAgo的来源:Addgene
o cloned into pCS2 vector for mRNA transcription, for use in zebrafish
- 应用验证实验结果:
o MiSeq PCR Amplicon高通量测序作为检测手段
o Twitter post “And no indels after amplicon MiSeq of NgAgo injected
... 阅读全帖
c********n
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22
第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Yuichiro (Ichi) Miyaoka 宮岡佑一郎 博士
- 发布时间:2016年8月16日
- 发布平台:twitter
- 发布方国家:日本
- 发布方城市:东京
- 发布方研究机构:Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science東京都医
学総合研究所
- 实验室PI:Dr Yuichiro (Ichi) Miyaoka 宮岡佑一郎 博士
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
- 应用验证实验详细信息:
−参考2016年8月8... 阅读全帖
m****a
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23
第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
-    重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
-    包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具
体信
息的发布报告
信息简述:
-    发布方:蔡宇伽 博士
-    发布时间:2016-8-17
-    发布平台:科学网
-    发布方国家:丹麦
-    发布方城市:Aarhus
-    发布方研究机构:Aarhus University
-    实验室PI:JACOB GIEHM MIKKELSEN
-    NgAgo的来源:Addgene
-    应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
-    ... 阅读全帖
c********n
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24
鉴于在2016年8月17日,Pooran's NgAgo Google Survey,有7则“Yes” - NgAgo 编辑
基因组重复验证实验成功的votes,被证实无效(voter非行业研究人员,并未进行重复
实验);本总结暂时去除来自Pooran's NgAgo Google Survey “NgAgo Yes”的信息
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25
第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
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息的发布报告
- 需包含发布时间
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信息简述:
- 发布方:Thomas DANIELE
- 发布时间:2016年8月16日
- 发布平台:wormbase forum
- 发布方国家:Austria 奥地利
- 发布方城市:Vienna 维也纳
- 发布方研究机构:Research Institute of Molecular Pathology (IMP)学総合研
究所
- 实验室PI:Dr. Cochella
- NgAgo的来源:Synthetic codon optimized NgAgo
“NgAgo DNA sequence has been taken directly from Entrez NCBI, then codon
o... 阅读全帖
c********n
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26
2016年8月24日
业界大规模重复验证NgAgo基因编辑功能,而不得其果的经历,
可能会带来对于“重复” (replication)实验数据发表方式的革新:
《自然》杂志 2016年8月24日 Editorial
http://www.nature.com/news/go-forth-and-replicate-1.20473
Go forth and replicate!
“To make replication studies more useful, researchers must make more of
them, funders must encourage them and journals must publish them.”
“To foster better behaviour, replication attempts must become more common.
We urge researchers to open their file drawers. We urge authors to cooperate
with reasonable req... 阅读全帖

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27
韩春雨的实验看来只有韩春雨能够重复了。
小保方开始也是怎样说她能够重复出来。
c********n
发帖数: 225
28
特别记录
Date:2016年9月6日
Title:《自然》子刊回复澎湃:报道不应作为韩春雨实验可重复的证据
Link:
http://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_1525020
Key points:
1. 澎湃新闻文章
2. 回应另一篇新闻报道:
韩春雨回应成果被质疑:《自然》已证实实验可重复
http://www.chinanews.com/sh/2016/09-06/7995020.shtml
c********n
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29
特别记录
信息来源:
- 新京时报
- 2016.10.26
Title:
多名学者提交重复实验结果
学者称结果有所不同;《自然·生物技术》回应调查需要一段时间
link:
http://www.chinanews.com/sh/2016/10-26/8043400.shtml
http://epaper.bjnews.com.cn/html/2016-10/26/content_656996.htm?div=-1
Key points
原文引用
- "近日,多名科学家向《自然·生物技术》期刊提交其实验结果。昨日,该杂志新闻
发言人回应称,已收到关于韩春雨论文的多个意见,批评意见经同行评议后,有可能会
被刊登。"
- “提交者之一北京大学生命科学学院研究员魏文胜介绍,实验结果主要以论文的形式
提交,内容主要为多位学者重复韩春雨实验过程后的结果,“与韩春雨的论文结果有所
不同”。
- "另一位提交者哈尔滨工业大学生命科学与技术学院教授黄志伟介绍,内容主要整合
了多个学者此前的实验结果,“比如实验后,发现样本没有活性”。"

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30
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第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
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第二则
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o cloned into pCS2 vector for mRNA transcription, for use in zebrafish
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o MiSeq PCR Amplicon高通量测序作为检测手段
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第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
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-    发布时间:2016-8-17
-    发布平台:科学网
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-    应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
-    ... 阅读全帖
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鉴于在2016年8月17日,Pooran's NgAgo Google Survey,有7则“Yes” - NgAgo 编辑
基因组重复验证实验成功的votes,被证实无效(voter非行业研究人员,并未进行重复
实验);本总结暂时去除来自Pooran's NgAgo Google Survey “NgAgo Yes”的信息
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2016年8月24日
业界大规模重复验证NgAgo基因编辑功能,而不得其果的经历,
可能会带来对于“重复” (replication)实验数据发表方式的革新:
《自然》杂志 2016年8月24日 Editorial
http://www.nature.com/news/go-forth-and-replicate-1.20473
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韩春雨的实验看来只有韩春雨能够重复了。
小保方开始也是怎样说她能够重复出来。
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特别记录
Date:2016年9月6日
Title:《自然》子刊回复澎湃:报道不应作为韩春雨实验可重复的证据
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1. 澎湃新闻文章
2. 回应另一篇新闻报道:
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信息来源:
- 新京时报
- 2016.10.26
Title:
多名学者提交重复实验结果
学者称结果有所不同;《自然·生物技术》回应调查需要一段时间
link:
http://www.chinanews.com/sh/2016/10-26/8043400.shtml
http://epaper.bjnews.com.cn/html/2016-10/26/content_656996.htm?div=-1
Key points
原文引用
- "近日,多名科学家向《自然·生物技术》期刊提交其实验结果。昨日,该杂志新闻
发言人回应称,已收到关于韩春雨论文的多个意见,批评意见经同行评议后,有可能会
被刊登。"
- “提交者之一北京大学生命科学学院研究员魏文胜介绍,实验结果主要以论文的形式
提交,内容主要为多位学者重复韩春雨实验过程后的结果,“与韩春雨的论文结果有所
不同”。
- "另一位提交者哈尔滨工业大学生命科学与技术学院教授黄志伟介绍,内容主要整合
了多个学者此前的实验结果,“比如实验后,发现样本没有活性”。"
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40
实例记录 - 首例 第三类信息
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Jialing Qi et al
- 发布时间:2016年11月11日
- 发布平台:Cell Research
- 发布方国家:中国
- 发布方城市:江苏南通
- 发布方研究机构:Co-innovation Center of Neuroregeneration, Jiangsu Key
Laboratory of Neuroregeneration, Nantong University
- 实验室PI:Dong Liu
- NgAgo的来源:Synthetic codon opti... 阅读全帖
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41
实例记录 - 第三类信息, 第二例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Burgess, Cheng, et al
- 发布时间:2016年11月15日
- 发布平台:Protein & Cell
- 发布方国家:二十家中外实验室, 18所科研院校
- 发布方城市:美国及中国
- 发布方研究机构:
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns Hopkins University
S... 阅读全帖
c********n
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42
特别记录
Function of NgAgo uncovered by Dr Jin-Soo Kim's group
- NgAgo is a DNA-guided endoribonuclease, cleaving RNA, rather than DNA, in
a
targeted manner
信息来源: BioRxiv
Date: 2017年1月20日
Title:DNA-dependent RNA cleavage by the Natronobacterium gregoryi Argonaute
Link to article:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/01/20/101923.full.pdf
Link to supplementary information:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2017/01/20/101923.DC1/101923-1.pdf
编者注
1. NgAgo 无法切割 DNA,因此, NgAgo不具有成为基因编辑工具的能... 阅读全帖
c********n
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43
实例记录 - 首例 第三类信息
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Jialing Qi et al
- 发布时间:2016年11月11日
- 发布平台:Cell Research
- 发布方国家:中国
- 发布方城市:江苏南通
- 发布方研究机构:Co-innovation Center of Neuroregeneration, Jiangsu Key
Laboratory of Neuroregeneration, Nantong University
- 实验室PI:Dong Liu
- NgAgo的来源:Synthetic codon opti... 阅读全帖
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44
实例记录 - 第三类信息, 第二例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文

− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Burgess, Cheng, et al
- 发布时间:2016年11月15日
- 发布平台:Protein & Cell
- 发布方国家:二十家中外实验室, 18所科研院校
- 发布方城市:美国及中国
- 发布方研究机构:
1.National Human Genome Research Institute, NIHBethesdaUSA
2.Division of Hematology in Department of MedicineJohns Hopkins University
S... 阅读全帖
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45
特别记录
Function of NgAgo uncovered by Dr Jin-Soo Kim's group
- NgAgo is a DNA-guided endoribonuclease, cleaving RNA, rather than DNA, in
a
targeted manner
信息来源: BioRxiv
Date: 2017年1月20日
Title:DNA-dependent RNA cleavage by the Natronobacterium gregoryi Argonaute
Link to article:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/01/20/101923.full.pdf
Link to supplementary information:
http://biorxiv.org/content/biorxiv/suppl/2017/01/20/101923.DC1/101923-1.pdf
编者注
1. NgAgo 无法切割 DNA,因此, NgAgo不具有成为基因编辑工具的能... 阅读全帖

发帖数: 1
46
有一段时间是88家实验室已经完成相关实验,只有一家能重复,现在此数字已经涨到92
家(+4),可重复试验的实验室却爆涨到8家(+7),可能么??
结论:恶意灌水
m****a
发帖数: 270
47
您选了啥啊?韩副主席曾经说过没重复出来和重复出来的比例是3:1, 8家还是太少了。
你这个帖子唯一说明的问题就是,韩副主席最近刚学会翻墙,否则他早就去乱点了。
各位在论坛上的要小心咯,说不定人肉要开始了。
S**********e
发帖数: 620
48
这种东西没有任何意义,没有人需要这种调查来作为造不造假的证据,真他妈的奇葩啊
根本不是一个神奇高深技术,protocol拿来重复不出来就是假的,老子混了这么多年至
今没有做不成的实验,也没有听说别人连方法都重复不出来。

发帖数: 1
49
写文章卖方法的还得说个请你重复你才重复?电视剧都明说他有秘密不告诉你了,你干
嘛还看?
z****y
发帖数: 6864
50
据说是韩的发言,百度 985吧
谢谢吧主和层主,虽然早有第三方宣称已经重复出来,最近也有海外实验室重复出来,
我认为一定要等到第二篇文章出来才算完美,虽然时间会稍长。让跳梁小丑跳去吧,本
大爷等着那几个被人肉-----
上面是 韩春雨的发言
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