由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: 超螺旋
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t*****z
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1
图在这里,看不到的点击链接啊:
[img]http://www2.picturepush.com/photo/a/6117040/img/6117040.jpg[/img]
我在琢磨大质粒的降解和构象变化的问题。这是一个大约17kb的质粒,大抽出来的,没有切过。最左边的是ladder,然后从左到右依次是冻在-20度的,藏在4度的和丢在室温的。过了五天拿出来电泳,看看降解得怎么样了。如大家所见,最左边的条带(-20度)看上去挺好,超螺旋和开环的分明。但是中间和右边的已经降解了,在超螺旋条带下面又多出一条细细的但是明显的小条带。请问谁知道这个小条带是怎么回事呢?
多谢啦!
c******r
发帖数: 3778
2
明显4度的和室温的发生了降解。细条带是降解产物。应该还有条相应的小分子条带,
可能EB跑出去了,所以看不清楚了。maxi没做干净,还有enzyme的contamination,所
以这个降解是比较特意性的,而不是smear。
室温的降解更明显,full length的已经全部降解,但是那个细条带由于继续水解的速
度远不如从full length降解的速度,所以还比较明显。但是多放几天,这个条带也会
消失。
艳阳天说了,要加EDTA才能防止水解,但是有时候EDTA会影响下面的反应,最好还是-
20度或者-80度保存比较安全方便。

没有切过。最左边的是ladder,然后从左到右依次是冻在-20度的,藏在4度的和丢在室
温的。过了五天拿出来电泳,看看降解得怎么样了。如大家所见,最左边的条带(-20
度)看上去挺好,超螺旋和开环的分明。但是中间和右边的已经降解了,在超螺旋条带
下面又多出一条细细的但是明显的小条带。请问谁知道这个小条带是怎么回事呢?
b******n
发帖数: 4225
3
denatured plasmid which is resistant to enzymatical digestion
it's due to long time treatment of solution II(NaOH/SDS)

没有切过。最左边的是ladder,然后从左到右依次是冻在-20度的,藏在4度的和丢在室
温的。过了五天拿出来电泳,看看降解得怎么样了。如大家所见,最左边的条带(-20
度)看上去挺好,超螺旋
s*k
发帖数: 144
4
排骨, 以下是对您以上的关于DNA拓扑异构酶文章背景知识的一点补充.
对于DNA,当其处于正常生理溶液环境时,每隔10对碱基即大约3.4nm
DNA分子旋转一周(这是1953 Watson and Crick最重要的发现,即DNA的双螺旋).
多于此(每少于10对碱基即互旋360度)的在生理溶液环境下的DNA称之为超螺旋
(supercoil), 少于此的叫欠螺旋,两者在生理溶液中均具有张力(物理里是不是称
其为具有较高自由能?), 对于此,DNA拓扑异构酶使其回复到张力较低的状态是不
需要外能的, 即不消耗ATP, 而DNA拓扑异构酶使DNA达到高张力的状态是需要
外能的(消耗ATP).
在一般生物体中的DNA是处于超螺旋状态,它使DNA两条链缠得更紧, 而在DNA复制或
转录的时候,DNA拓扑异构酶使其解螺旋到常态或欠螺旋状态.
一般从生物里提取的genome DNA是处于常态,但病毒或质粒的DNA常是超螺旋态.
以上讨论均指B型DNA,另外还有A型和Z型DNA,三链DNA,这些是DNA分子在不同
溶液环境下的自然状态,螺旋数与B型不一样.
有两本书值得推荐:
Cantor, C.
z*******6
发帖数: 679
5
来自主题: Biology版 - 问一个基本的质粒电泳的问题
确实,我也觉得明显说反了啊... 超螺旋的未酶切质粒跑的比线性化的质粒快...
还有就是maxi-prep做的不好的时候,跑胶会看到两条带,一条超螺旋的跑得快的带,
另外一条应该是没有超螺旋的(这个我不太确定)...
M********t
发帖数: 5032
6
来自主题: Joke版 - 哈勃望远镜拍摄奇景:NGC 4696星系中心超巨型黑洞缓慢吞噬 cnBeta.COM KungfuDogg 17小时52分钟前 NGC 4696星系,它离开地球约1.5亿光年。在该星系中心有一个明亮活跃核心,而在核心的中心处是一个超巨黑洞。最近NASA发布了一张由哈勃太空望远镜拍摄到的NGC 4696星系中心超巨黑洞在吞噬整个星系的超清壮观图片,超巨黑洞将整个螺旋状星系往中间拉扯吞噬,中心部位红色炽热气流和磁场构成了这一独特形状的奇景。 http://static.cnbetacdn.com/thumb/article/2016/1202/f979763a187de9f.jpg_600x600.jpg 据科学家推测整个约200光年宽度的星系将会逐渐被这一超巨型黑洞吞噬,尽管过程将会十分漫长。 高清图片链接 [广告]活动入口: 买美股,上老虎 - 超低佣金,每股只需1美分
哈勃望远镜拍摄奇景:NGC 4696星系中心超巨型黑洞缓慢吞噬
cnBeta.COM
KungfuDogg
17小时52分钟前
NGC 4696星系,它离开地球约1.5亿光年。在该星系中心有一个明亮活跃核心,而在核
心的中心处是一个超巨黑洞。最近NASA发布了一张由哈勃太空望远镜拍摄到的NGC 4696
星系中心超巨黑洞在吞噬整个星系的超清壮观图片,超巨黑洞将整个螺旋状星系往中间
拉扯吞噬,中心部位红色炽热气流和磁场构成了这一独特形状的奇景。
据科学家推测整个约200光年宽度的星系将会逐渐被这一超巨型黑洞吞噬,尽管过程将
会十分漫长。
高清图片链接
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c*********d
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7
http://dzb.studytimes.cn/shtml/xxsb/20160519/19794.shtml
作者:宫春科
美国海军采办中心助理部长在提交参议院军事委员会的证词中给出了首艘级航母“福特
”号服役的时间表。据该时间表,其“福特”号航母(CVN 78)计划于2016年9月交付
。该航空母舰排水量达10万吨,长335.28米,耗资129亿美元,是美国迄今为止建造的
最昂贵战舰。该型航母和其前辈最明显的不同就是,它将用电磁弹射系统取代传统的蒸
汽弹射系统。其实,这个消息并不只是意味着弹射方式的新变化,还暗含着打击功能的
新拓展,那就是和电磁弹射具备同一原理甚至可以使用同一装置设备的电磁轨道炮诞生
之必然。此炮非彼炮,但实用性电磁炮的运用却意味着在海战中日益被导弹边缘化的舰
炮的地位将发生根本变化,这将是海战史上又一次跨时代的革命,将影响推动战争形态
的升级换代。
新型电磁弹射核动力航母是电磁炮实战部署的最佳平台
目前,电磁炮还存在耗电量大、炮管使用寿命短、轨道部件易受损坏、体积大、伪
装、隐蔽困难等不足,机动不便等缺点,正因为如此,体积大、载重量大、机动性强、
动力充足的新... 阅读全帖
j****x
发帖数: 1704
8
同事之前收到别人给寄过来的质粒,已经是大提好了的。送测序公司简单测了一个反应
,匹配。
后来同事基于这个质粒又构建了其他几个衍生,测序据说也都啥没问题。后来再做酶切
时,顺便点了个质粒对照,结果问题来了。
单酶切,双酶切,片段大小都正确。单单这个未酶切的质粒对照,不是正常超螺旋质粒
应有的迁移速率快于线形片段的情形,反而显示条带还显著大于单酶切后的线形片段。
(质粒大小6.5kb,正常的超螺旋结构约3.5-4kb,而该未切质粒显示8kb)
同事今天找我讨论,想了半天没法解释。从来没遇到这种情况,确切地说很少做质粒对
照,单双酶切正确就完了。没想到还有这种情况,怎么解释?
t*****z
发帖数: 1598
9
我抽的一些质粒,尺寸在15kb以上,把它们放到一般的琼脂糖电泳(0.8-1%)上去跑,
跑出来的结果,往往不是常见的开环和超螺旋的样子,而是几条带,目前还没有找到这
几条带的分布、亮度、出现频率和电泳时间、电压、胶浓度、上样缓冲液、上样量等等
之间的关系。看上去就好像质粒自己断裂成小片段了的样子。但是酶切鉴定,却没有杂
带,说明质粒是完整的。QIAGEN的手册上说,对于像BAC这么大的质粒,开环的会跑得
比超螺旋还快。我的15kb也没到BAC的程度,难道发生了同样的现象吗?
不知谁有类似经历的,分享下经验。多谢!
s***e
发帖数: 911
10

超螺旋我知道.实际上超螺旋就是由linking number来描述的. topo II的作用也影响
linking number. type I topo也影响Linking number.
Sov.Phys.Usp.24(8),679,1981
也是一篇好文章...
v**e
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11
来自主题: Military2版 - 枭龙的前世:超-7史话
枭龙的前世:超-7史话
•航空档案06.9-07.4
屠基达
编者按:本刊自本期起独家连载中国工程院院士、著名飞机设计师屠基达的长篇力
作《超-7史话》,作者以亲身经历和独特的视角,再现了那段中外合作改进战机。研
发"超-7"的不平凡岁月和布满艰辛的坎坷之路。《超-7史话》资料翔实、文笔生
动,具有重要的史料价值和研究价值。
"超-7"者,超越歼-7之谓也。意思就是在歼-7的基础上改进,以超过歼-
7。
作为"超-7"中方项目负责人的屠基达,曾任成都飞机工业公司总工程师,他主
持设计成功的飞机中,两种机型获得全国科学大会奖,两种机型获得国家科技进步一等
奖,三种机型(系统)获得国家质量金质奖,他本人获航空金奖,可以说已功成名就。
可他和千千万万航空人一样,"总想为振兴我国的航空事业,奉献自己的无悔年华,回
报祖国的培育和人民的期望。"所以才对"超-7"的研发不遗余力。如今,全新的"
枭龙"已翱翔兰天,中国的航空工业需要更多的奋斗者。
◆作者寄语
很多同志都说超-7是搞不成的。十几年了,几起几落,的确很困难。
要搞出一种军用飞机,一无国家的预算拨款,二无公司自己的雄厚财力,三... 阅读全帖
c***n
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12
世界新聞報消息:據日本媒體12月28日報道,日本海上自衛隊的P-1反潛偵察機已於最
近開始裝備現役部隊。
報道稱,這款日本自產反潛機具備很強的警戒偵察和反潛能力。日本海上自衛隊目
前擁有94架P-3C偵察機,由於日本在關鍵儀器上進行了一些改進,使得這種偵察機的實
際性能要超過美國同型飛機。但考慮到部分P-3C偵察機已經接近退役年限,日本海上自
衛隊最近開始裝備P-1反潛機。
公開資料顯示,P-1長38米,機體寬35.4米,重79.7噸,裝備有日本自行研發的光
波探測器和紅外線深海探測器,其反潛能力大大超過P-3C,尤其對大潛深潛艇的形狀、
聲響特征和性能有著更好的判別能力。
此外,與P-3C偵察機使用螺旋槳發動機不同,P-1裝備有4台渦扇發動機,續航能力
和飛行高度遠超P-3C,能夠在短時間內趕赴任務現場。
據悉,P-1反潛機已經裝備日本海上自衛隊厚木基地(位於神奈川縣綾瀨市),此後
還將逐步裝備其他的海上自衛隊基地。一旦性能先進、飛行距離遠的P-1反潛機大量服
役,日本海上自衛隊的空基反潛實力勢必大增,進而壓縮周邊國家海軍潛艇的活動空間
l****D
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13
来自主题: SanDiego版 - 五月天LA演唱会
有没有人有兴趣一起去? Group order discount applies.
時間/Time: 2010年4月10日晚上
April 10th, 2010
地點/Location: 環球影城Gibson Amphitheatre
100 Universal City Plaza
Universal City, CA 91608
”五月天DNA 創造演唱會”World Tour
洛杉磯Gibson Amphitheatre
放肆的,再活1次!
在傳說中一生至少該來爽一次的五月天演唱會,再活一次!
[靈魂對撞D超感應] N’ [肉體暈眩A超螺旋]
每個人都可以辦演唱會,只有五月天膽敢創造演唱會!
票價/Ticket Price: $48, $68, $98, $148, $188
Seating chart is avaliable at https://www.starzoneusa.com/pdf/mayday_stadium
.jpg
查看座位圖請到:https://www.starzoneusa.com/pdf/mayday_stadium.jpg
http://www.st
d********y
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14
北京时间8月8日消息,据美国《连线》杂志报道,在最近于美国佛罗里达州进行的一
次试飞过程中,西科斯基公司研制的X2高速直升机的时速达到 259英里 (约合每小时
417公里)。此次试飞打破了自1986年以来便牢不可破的直升机速度纪录,当时一架
Westland“山猫”直升机的飞行速度达到每小时 249英里(约合每小时400公里)。
西科斯基X2扮演的是一个“技术验证者”角色,旨在帮助研制巡航速度能够轻松达
到传统直升机两倍的高速直升机。X2采用双旋翼设计,装有一个螺旋桨推进器同时在空
气动力学性能方面进行大量改进。西科斯基表示这种类型的设计能够让直升机轻松拥有
更快的巡航速度。
在达到时速259英里这一创纪录速度之后,X2项目负责人吉姆·卡格迪斯表示这架
直升机的表现超出预期。他说:“振动级和飞机性能均实现或超出我们的预期,我们可
以很高兴地给出报告,飞机所有系统均表现出色,能够在这一年晚些时候达到250节(约
合每小时463公里)的巡航速度。”
通常情况下,直升机受到旋翼叶片转动时形成的复杂空气动力学现象限制,会在旋
翼叶片相对于飞行方向向后旋转时失去浮力。X2尾部的螺旋推进器允许直
O*******k
发帖数: 901
15
中国社会科学院美国研究所前所长、研究员资中筠在12月17日举办的经济观察报“2011
观察家年会”上表示,在新的全球化背景下,美国面临第三个拐点,包括三点:1)所
谓“世界领袖”的负担沉重不堪。2)出现了“虚拟经济”,离实体经济越来越远。3)
全球化带来的利益在国内分配严重不均,加剧社会不平等。中国改革开放30年所累积的
严重问题也不容回避,现在中国也面临新的拐点:1)当前发展模式不可持续。2)腐败
丛生难以遏制。3)两极分化日益严重,社会矛盾尖锐化。
资中筠强调,不论“中国崛起”被怎样宣扬,有一点是客观事实:不论美国目前遇到多
大的困难,相对于其他国家和地区的深刻危机,它还是比较容易克服的。在相当长的时
间内,美国还将是远超过其他任何国家国力的最强大的国家——无论是硬实力或软实力
都是如此。它也仍占据世界财富的最大份额——不论是虚拟还是实体经济,不论是军用
还是民用资源。因此,对全球发展起决定性影响的还要看美国如何使用它的超强力量。
也就是扮演“良性领导”还是“恶性领导”的角色。
今后几十年间,中美关系更将是世界最重要的双边关系,至少是最重要的之一,任何以
邻为壑、幸灾乐祸的政策都是... 阅读全帖
D**s
发帖数: 6361
16
来源:科学网丁广进博客、BioArt微信公众号
引言:《韩非子·喻老》一文中曾有言曰:“楚庄王莅政三年,无令发,无政为也。右
司马御座而与王隐曰:“有鸟止南方之阜,三年不翅,不飞不鸣,嘿然无声,此为何名
?”王曰:“三年不翅,将以长羽翼;不飞不鸣,将以观民则。虽无飞,飞必冲天;虽
无鸣,鸣必惊人。”
5月2日,Nature系列顶级刊物Nature Biotechnology在线发表了来自河北科技大学生物
科学与工程学院青年教师韩春雨副教授题为“DNA-guided genome editing using the
Natronobacterium gregoryi Argonaute”的重大原创性成果。文章甫一发表,瞬间刷
爆微信朋友圈,这里面有两层原因,其一,该项新的基因编辑手段对目前热火朝天的
CAS9技术提出了挑战;其二,领导该项研究的青年老师所在的单位和个人基本上籍籍无
名(抱歉,请允许我用了这个词)。
“不鸣则已,一鸣惊人”韩春雨老师在Nature?Biotech上发表诺奖级原创成果
Nature Biotechnology文章截图
小编先引用河北科技大学生物科学与工程学院官... 阅读全帖
y****g
发帖数: 36950
17
她也有幽门螺旋杆菌吧

发帖数: 1
18
自然界里是的要双螺旋超螺旋
但是不是非得这样
实验条件下一小段线性的单链DNA就可以复制
f****e
发帖数: 24964
19
原来吹鳖和晒娃一个意思?问题鳖都成年了,不能晒了
老毛时期还能吹吹共产主义前途无可限量

:这就好比show娃,今天终于会走路了,耶!!并发朋友圈。大部分正常人都是like,
点赞。当然也有像板上的某些冷静多视角的人士上来说,我家娃都考大学了,走路算个
屁!
:【 在 finite (螺旋) 的大作中提到: 】
f****e
发帖数: 24964
20
这是菌版啊,晒娃被批的更狠
还是无关话题得删贴,吹鳖待遇算不错了

:是啊,轻松点,不要这么苦大仇深,不要这么悲愤。
:【 在 finite (螺旋) 的大作中提到: 】
f****e
发帖数: 24964
21
来自主题: Military版 - 米帝制造业能力还是远超天朝
就算不如德日也比天朝强多了啊
况且德日也就是机械材料有些优势,电子工业老大还是米帝

:买了些德日生产线就以为自己是制造业巨头了?
:【 在 finite (螺旋) 的大作中提到: 】

发帖数: 1
22
来自主题: Military版 - 米帝制造业能力还是远超天朝
问题我确实啥也没干就成了百万富翁,还是按美元算

:本来就是西方技术,雇你干活的,中央心里门清。小将不知道中国经济靠的是房地产
金融泡沫,以为真崛起了呢,共产党肯定有灵丹妙药,大伙儿啥也没干,各个都是百万
富翁,还是按美元算。太牛逼了。
:【 在 finite (螺旋) 的大作中提到: 】
y****i
发帖数: 2108
23
见了一万次了。是六年后看了很多翻案报道后突然宣称自己无辜。
[在 finite (螺旋) 的大作中提到:]
:为什么
q****i
发帖数: 6923
24
来自主题: NextGeneration版 - 中国人都应该去查查幽门螺旋杆菌
我用commonsense思考而已,有自己的理论不奇怪,难道你对人生没有认识没有感悟吗
?偏听偏信某些片面的科学研究,才是思考过程中致命的弱点。人类最重要的技能不是
去收集知识和数据(包括现代的科研结果),而是如何利用尽可能多的(同时也是有限
的)知识来做出尽量正确的思考和判断。我在科研过程中也是这么做的,事实证明我是
一块科研的好料。很多东西都是先在我脑子里想出来,后来去开会增加了知识才发现市
场上其实有好多我想出来的东西,也是这么用的。很有趣。今天我老板,一个比我大
25岁在我的领域知识丰富的老科学家,很郁闷的发现,某个超好结果的样品是我想出
来的(被他ignore的)。所以再重复一遍,知识真的不那么重要。重要的是你如何用基
本知识来思考,从而获取更多的知识,进行更完整的思考。最后的目的,是完成一个电
脑完成不了的逻辑运算。
q****i
发帖数: 6923
25
来自主题: NextGeneration版 - 中国人都应该去查查幽门螺旋杆菌
我用commonsense思考而已,有自己的理论不奇怪,难道你对人生没有认识没有感悟吗
?偏听偏信某些片面的科学研究,才是思考过程中致命的弱点。人类最重要的技能不是
去收集知识和数据(包括现代的科研结果),而是如何利用尽可能多的(同时也是有限
的)知识来做出尽量正确的思考和判断。我在科研过程中也是这么做的,事实证明我是
一块科研的好料。很多东西都是先在我脑子里想出来,后来去开会增加了知识才发现市
场上其实有好多我想出来的东西,也是这么用的。很有趣。今天我老板,一个比我大
25岁在我的领域知识丰富的老科学家,很郁闷的发现,某个超好结果的样品是我想出
来的(被他ignore的)。所以再重复一遍,知识真的不那么重要。重要的是你如何用基
本知识来思考,从而获取更多的知识,进行更完整的思考。
i***a
发帖数: 11826
26
嗯,这个不错了,用螺旋形做主题,颜色搭配的有种旋转、下滑的感觉,甚至能看出前
后位置距离。。。
s*k
发帖数: 144
27
来自主题: Biology版 - 今天上午作了presentaion的预讲
请允许我这个半瓶醋插两句嘴:-)
大家知道在细菌里染色体是环形的,质粒也是环形的.
那么当它们复制的时候,到了最后关头,就会形成一种
两环互相套在一起的局面. (这个在数学上好象叫knot
我不大敢肯定,希望专家指正) 这时候,正是Topo II
挺身而出,解决了这一尴尬局面,将两个环彻底分离.
ATP若是参与到这个反应,没看文献,按照我的猜测可能
用于断开双链DNA,即形成一个dsDNA-->2ATP的中间体,
以打断DNA.当另一双链DNA穿过dsDNA的断端,酶再将
ATP水解会来,所以整个反应没有ATP的净消耗.
现在教主面临的问题是:
反应既然没有能量的消耗,为什么反应产物却不是处于
统计上的平均分布?
Roca 的工作从酶的作用机理和DNA的超螺旋性上这一
微观角度来解释这一问题.
而教主的工作是从热力学和分子动力学这一宏观角度
解释这一问题.
不知道以上我的这些说法是不是漏洞百出,还请专家斧正.
b******n
发帖数: 4225
28
呵呵,抽质粒老手也碰上这种奇怪的事情
某种Gram-菌的一个isolate/strain,通过conjugation转进了shuttle vector之后
抽质粒用的是Qiagen mini-prep kit
跑电泳发现是很亮的smear
作为对照,该种菌的另外一个isolate/strain同时进行了conjugation和plasmid
extraction得到了清晰的质粒超螺旋条带
做了几次都是这样
现在有点迷糊,不知道可能的问题所在
谢谢指点
j****x
发帖数: 1704
29
我们也想到过可能是dimer或者双环套叠,因为迁移速率刚好是超螺旋质粒的2倍,但是
不太懂这个在复制过程中是怎么形成的,而且条带很单一很纯,如果是套叠感觉应该是
mixture才对。
nicked plasmid可能性也不大,首先是新置备的质粒,而且胶上也能在主带后看到微弱
的nicked条带。如果主带是nicked plasmid,大小也不对(和其他衍生质粒的nicked
条带对不上)。
gDNA的污染可以排除,因为可以被完美的酶切鉴定。
确实很奇怪,有谁也遇到过类似情况吗?感觉双环套叠的可能性最大,能解释一切现象
,但是不明白怎么形成的。
v*******a
发帖数: 759
30
左边的也有啊
t*****z
发帖数: 1598
31
是这样啊。可是我刚刚抽提好的质粒,是没有这一条带的,放上几天才出现。是否放置
本身也会让质粒变性呢?

20
s******y
发帖数: 28562
32
会。
至少有两个可能性:
1。完整的双链环状质粒是很稳定的,但是大质粒在提取的时候容易受损,
可能会在其中一条链上有缺口什么的,放在水中就慢慢会被降解。
2。提取的时候蛋白没有去干净,可能有少量核酸酶残留。特别是如果最后的
溶液里没有加EDTA的话就很容易被降解。
f**u
发帖数: 346
33
5.5kb的超螺旋质粒差不多就在3k左右
s*********t
发帖数: 600
34
是吗?多谢
不过我看到有人说mini的plasmid的quality较差,因为没有去掉内毒素,有较多开环和线性,而maxi的去除了内毒素,且
多为超螺旋,更适合转细胞
还有G418和puro该怎么保存?
x*****e
发帖数: 309
35
来自主题: Biology版 - 请教:关于DNA克隆里的双酶切
建议1.看看酶活性单位的定义,One unit is defined as the amount of enzyme
required to digest 1 µg of λ DNA in 1 hour at 37°C in a total
reaction volume of 50 µl. 切超螺旋质粒提高到5-10倍。确定你加的酶足够,
但不要超过总体积的1/10; 2.看看两个酶切位点之间距离是否大于6nt,小于还是选其
他酶吧。3.如果不能同时切,可以先用低盐buffer,切好后再补NaCl变成高盐buffer,加
第二个酶。 Good luck! 其实如果是刚要来的质粒,怎么切都不行的话,还是测序吧。
F*K
发帖数: 608
36
来自主题: Biology版 - 问个克隆问题
最近克隆做不出,怀疑是酶切的问题。
现在用一个以前装好的质粒来测试,DNA是用同样的酶A和B切开后装进去的
现在问题是A和B单独反应都能切开质粒(超螺旋消失),但共同作用却切不出insert,
见附图。两个酶要求的Buffer和反应条件是一样的。请问这个结果该如何解释?谢谢
n****0
发帖数: 696
37
来自主题: Biology版 - 问一个基本的质粒电泳的问题
是啊,按说是环状没被切跑的快啊,我以前做的也是这样的。可是这次我的结果是有一
条非常非常浅的线状大小的条带(可能质粒没提好断开了),还有一条或多条(有点
smear的感觉)跑的很慢的带,但是没有超螺旋那条带(应该跑的比线性的快才对),
这怎么回事呢?我只是做个酶切确定下自己的构建,双酶切倒是也有我的那个大小的片
段。不知道碍不碍事啊?之前subcloning的时候已经sequence过了,再克隆到donor
vector时就不用再sequence了吧?
j****x
发帖数: 1704
38
那抽出来的应该是超螺旋DNA吧,怎么判断size呢?另外,如果刮colony直接热解的话,
就算鉴定出来正确的克隆咋扩增呢?
x****6
发帖数: 4339
39
谢谢你提供的信息,我看了一下,这片文章发现的蛋白质只针对ssDNA和超螺旋的质粒
DNA,所以不可与河北这个组发现的蛋白同日而语。但是有可能前者给后者启发了灵感
。读到14年的文章之后,大家玩命的去试那个蛋白的同源蛋白,运气好的人就试出来了
。而CRISPR/Cas9的那帮大佬们太自信,看不上这些野路子,一如既往的在cas9系统上
砸资源进行优化,最后傻X了:无名之辈竟然找到了天生丽质、不加雕琢就把Cas9比下
去的系统。
s*********y
发帖数: 579
40
来自主题: Biology版 - 热议韩春雨
海内外学者、读者热议“韩春雨”现象
原创 2016-05-10 知识分子 知识分子
韩春雨(右)及其合作者沈啸(左)、高峰(中)。供图:沈啸
编者按:
5月8日,《知识分子》发文(详见《韩春雨:“一鸣惊人”的中国科学家发明世界一流
新技术 | 特稿》)介绍了河北科技大学副教授韩春雨团队发表的NgAgo-gDNA基因编辑
技术的学术贡献和意义后,引发巨大反响。文章发表仅一天,通过《知识分子》在微信
、微博、今日头条、知乎上的传播渠道,就获得超过320万阅读量,近2600条评论。国
内外生命科学界学者纷纷就这项技术的突破性意义发表评论,各方读者也就韩春雨的“
另类出身”在网络上展开评论。《知识分子》搜集并摘编了部分精彩观点,与读者分享。
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01
高屋建瓴派
饶毅:北京大学讲席教授
韩春雨的工作对基因编辑技术的推进作用是国际一流的。与现有CRISPR相比,可以看到
的优点是新技术使用DNA,因而更稳定,但还需要更多的研究才能真正比较二者优缺点
以及适用范围的异同。此外,韩春雨在条件有限的情况下做出这样的工作,让我们更加
关注中国广大科技工作者。
鲁白:清华大学医学院教授
在一所不太... 阅读全帖
L*****t
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1.argonaute这个东西的相关文献很多,应该是真的
2.韩的NgAgo在低温下有活性应该也是真的,目前大部分实验室可以重复到Fig.3c切GFP
质粒这一步
3.现在大家怀疑的是这东西究竟能不能切开染色体。因为NgAgo没有PAM序列,理论上无
法主动打开双链DNA。那么也就说明这个东西对转录不活跃的区域切割效率是很可疑的
。就算是转录活跃区域,在37度下形成负超螺旋然后切割的难度也很大,没有试验数据
支持很难让人相信这个现象确实存在。

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首先 我不觉得有很多人重复了fig3c,有的看到了gfp下降,但是并没有看到indel数据。
然后14年高温的ttAgo是不能切割线性质粒的,文章中称ttago的切割需要负超螺旋结构
,切割的产生需要dna结构的帮助,而这个切割基因组的切割活性并不能确认。
退一万步讲,ttAgo在高温下能产生给切割,并不是说NgAgo在37度下就一定能切割,反
过来,如果NgAgo没有切割活性,也不能证明ttAgo就也在高温下没有活性。。这是两个
物种的ago系统,这两个之前没有什么必然的逻辑联系。
最近的例子,张锋的cpf1系统,张锋鉴定了好多物种的cpf1,很多在体外都有切割活性
的,都是cpf1系统,但是在哺乳动物细胞内,只有两个cpf1系统能够有效切割基因组。

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试着回答一下,看我是否合格的千老:
老鼠半夜交配
从上到下依次是线性开环超螺旋
让细菌复苏开始表达抗性基因
[在 thomasz (thomasz) 的大作中提到:]
:做bioinfo的我来贡献三个问题:
:为毛杀老鼠的时间点都是半天半天的?比如E13.5这种?
:质粒跑凝胶电泳跑出来几条带,各是嘛玩意?
:细菌转化后为毛要晾一段时间再加抗生素?
F**********y
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来自主题: _PerfectMoms版 - 钢琴进度超慢的
还是要陪, 学琴基本是螺旋型的上升过程
开始的时候曲子短又简单, 我不用专心也可以听出她对错来,然后如果她中间有一个地
方总错,我也能帮她找到原因提高一下
现在不行了, 我经常是听不出来, 她经常给自己放水, 到老师那里自然就会出各种状况
, 于是我只好经常在边上放CD核对. 另外有朋友跟我说(小提琴业余高手), 应该要锻炼
小朋友自己集中精力练习的能力, 一天练半小时的话, 应该是一次15分钟, 中间不可以
分心, 短暂休息一下, 然后再15分钟. 现在我们正在监督她每15分钟至少要做到专心致
志, 不容易
c****t
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casact (尝尝也) 于 (Tue Jul 5 01:17:00 2011, 美东) 提到:
第一章 被驱逐的高手
更新时间 2011-2-28 15:15:57 字数:4023
“卡卡卡,嗒嗒……”
一双灵巧的手飞舞着操纵着键盘和鼠标,富有节奏的敲击声仿佛是一首轻快的乐
章。屏幕上漫天的光华闪过,对手飞扬着血花倒了下去。
“呵呵。”叶秋笑了笑,抬手取下了衔在嘴角的烟头。银白的烟灰已经结成了长
长一串,但在叶秋挥舞着鼠标敲打着键盘施展操作的过程中却没有被震落分毫。摘下的
烟头很快被掐灭在了桌上的一个形状古怪的烟灰缸里,叶秋的手飞快地回到了键盘,正
准备对对手说点什么,房门却突得咣一声被人打开了。
叶秋没有回头,像是早就在等着这一刻一样,只是问了一句:“来了?”
“来了。”苏沐橙的回答也同样简单。
“那就走吧!”叶秋拒绝了对手又一次的邀战,轻轻地从网游荣耀专用的登录器
上摘下了一张卡片,起身来到门旁衣架顺手取下了外套。
夜已... 阅读全帖
w*********g
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何修毅:美国经济的全面崩溃不可避免
来源: unit 于 2010-08-14 20:23:16 [档案] [博客] 旧帖] [转至博客] [给我悄悄话
] 本文已被阅读:16653次 字体:调大/调小/重置 | 加入书签 | 打印 | 所有跟帖 |
加跟贴 | 查看当前最热讨论主题 作者:何修毅 来源:和讯网
2010年07月06日
读懂并理解本文的逻辑,您的未来局面也许会完全不同。本文的篇幅稍长,需要您一
点点耐心。
从2008年金融危机到现在已经过去一年多了,到目前为止,关于此次危机及其后续
发展仍在众说纷纭。如果您相信了危机已基本过去,那就大错特错了。要透视这次危机
一定要站在高处,才能避免肓人摸象,透过纷繁复杂的表象,找到问题的根本。关于此
次危机的根源,作者已在2009年11月发表的文章《美元危机近在咫尺,全球经济将再次
探底》中作了详析,在该文中,我们认定了“美元霸权”是导致这次金融危机的根源。
本文是对危机及其后续发展的进一步分析。
不受约束的美元霸权是崩溃的基因
绝大部分政府有天生的赤字爱好和通胀爱好,为什么呢,当政者要取悦选民,赢得
选举,总会做出太多的承诺,导致支... 阅读全帖
g****t
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来自主题: Detective版 - 三体3:好书必须看
《三体III:死神永生》
作者:刘慈欣
申明:本书由奇书网(Www.Qisuu.Com)自网络收集整理制作,仅供预览交流学习使用,版权归原作者和出版社所有,如果喜欢,请支持订阅购买正版.
写在"基石"之前
姚海军
"基石"是个平实的词,不够"炫",却能够准确传达我们对构建中的中国科幻繁华巨厦的情感与信心,因此,我们用它来作为这套原创丛书的名字。
最近十年,是科幻创作飞速发展的十年。王晋康、刘慈欣、何宏伟、韩松等一大批科幻作家发表了大量深受读者喜爱、极具开拓与探索价值的科幻佳作。科幻文学的龙头期刊更是从一本传统的《科幻世界》,发展壮大成为涵盖各个读者层的系列刊物。与此同时,科幻文学的市场环境也有了改善,省会级城市的大型书店里终于有了属于科幻的领地。
仍然有人经常问及中国科幻与美国科幻的差距,但现在的答案已与十年前不同。
在很多作品上(它们不再是那种毫无文学技巧与色彩、想象力拘谨的幼稚故事),这种比较已经变成了人家的牛排之于我们的牛肉。差距是明显的--更准确地说,应该是"差别"--却已经无法再为它们排个名次。口味问题有了实际意义,这正是我们的科幻走向成熟的标志。
与美国科幻的差距,实际上是... 阅读全帖
c****t
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来自主题: SciFiction版 - 三体2 黑暗森林
英国代表打断雷迪亚兹的发言:“你还是解释一下为什么要在水星上进行地下核试验吧,
除了变着法子花钱外,我们找不到别的解释。”
“主席先生,各位代表,”雷迪亚兹冷静地反击道,“你们应该看到,到目前为止,行星
防御理事会已经失去了对面壁者起码的尊重,也失去了对面壁原则的尊重,如果我们的
所有
计划细节都要做出解释,那面壁计划意义何在?”他用灼人的目光挨个逼视各大国代表
,令
他们都把眼睛转向别处。
雷迪亚兹接着说:“尽管如此,我还是愿意对刚才的问题做出解释:在水星进行超深地
下核试验的目的,是想在行星的地下炸出一个大洞窟,作为日后的水星基地,对这样一
个工
程来说,这显然是一个最节省的方案。”
雷迪亚兹的话引起了一片窃窃私语,有代表问:“面壁者雷迪亚兹,你的意思是要把水
星作为恒星型氢弹的发射基地?”
雷迪亚兹胸有成竹地说:“是的,目前主流防御的战略理论认为,防御体系的重点应该
放在地球外侧行星上,而对内侧行星没有给予足够的重视,认为它们不具备防御意义,
我所
规划的水星基地,正是对主流防御的薄弱环节的补充。”
“他怕见太阳,却要跑到距太阳最近的行星上去,这不是很奇怪吗?”美国代表说,引
起... 阅读全帖
l***i
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49
来自主题: paladin版 - 灵吸怪备忘录-魔网杀机
灵吸怪备忘录
分卷阅读
1、引子
2、龙脉者号
3、船上谋杀
4、重罪通缉犯
5、艾克林恩种马小说术
6、内爆屠夫
7、连环计中计
8、激战的序曲
9、重在参与
10、勇者斗恶龙
11、宿敌交锋
12、浴火重生
13、“真神”的信徒
14、真菌溶洞
15、月夜归来
16、纯爷们儿之怒
17、魔网崩溃之谜
18、影魔网神力传输协议
19、长刀之夜
20、影之亵渎祭司
21、决战在蛛网深渊
22、新冒险

1、引子
更新时间:2009-8-15 21:29:24 字数:6607
“这个世界上,”迪洛矮人说,“总有些个家伙,以为自己是个[哔-],想插谁插
谁,等事到临头
了才发现自己是个[哔-],被人日了都不知道。”
“譬如说你,软体杂碎。”他盯着我嗬嗬笑着,眼里射出凶猛的光,活像是盯上腐
尸垂涎欲滴的土
狼。
木桌上的魔法光焰随着船体轻轻摇曳,狭窄的船舱里充斥着生物腺体散发的臭味。
这儿总共有八
个家伙,他们都是一伙的。一身紫黑长袍的迪洛矮人大模大样地坐在我对面,在他身后
站着个武僧打
扮的螳螂武士。在我身后,两个背负战锤的灰矮人双手环胸,把舱门堵了个严严实实,
还有三个吉斯
洋基人... 阅读全帖
s*******n
发帖数: 4605
50
http://club.xilu.com/emas/msgview-821955-4746960.html
中国靠的就是这些关键节点一个一个的突破,发挥协同作用,各行各业才有全面喷发式
发展的可能性。其他民主国、宇宙国、猴子国要跟上中国似乎不太现实。
深呼吸一下,开始。
中国力量-- 中国超级机器一览
世界最大桥式起重机
--大连重工20000吨桥式起重机
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工程总投资:3。5亿元
工程期限:2006年--2008年
这台2万吨桥式起重机提升高度最高为118米,相当于把250节满载的火车车厢提升
到23层高的楼上,横梁长129米,为双箱型梁结构,如果把这台起重机放倒,要一个足
球场才能把它装下。
2008年4月18日上午10时,烟台来福士海洋工程有限公司大水坞坞门西侧3号码头彩
旗飘扬,世界最大的桥式起重机--命名为"泰山",将自重2万吨的驳船缓缓吊离水面,
这标志着2万吨桥式起重机的成功启用。 这是目前世界上起重量最大、跨度最大、起升
高度最大的起重设备,也是当今世界技... 阅读全帖
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