f******g
发帖数: 1003 | 1 DNA聚合酶每天都在不停的合成DNA，包括高等动物，低等动物，原核，真核。但是在不
停的合成中会产生突变。
我的问题是哪种DNA聚合酶的突变率最低?
到目前为止，to my knowledge, 能够买到的DNA聚合酶中，phusion的突变率是最低的
。有没有可能人的DNA聚合酶的突变率比phusion更低呢?
thank you |
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z********4
发帖数: 701 | 2 有没有proof reading功能对保真性影响很大，但是活性中心本身也是一个因素，不同
来源的DNA聚合酶活性中心差异导致的保真性差别也可以是量级的。不过商业化的PCR用
酶基本都是复制型DNA聚合酶，即使没有校正功能保真性也是很高的，Taq在标准条件下
也是4－5万个碱基里面出个突变，用来clone一般够了，多挑几个克隆只要运气不是太
差应该没问题。 |
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j****x
发帖数: 1704 | 3 DNA模板中包含dU碱基（由dC deamination而来），一般的高保真聚合酶比如Pfu无法正
常扩增。Taq酶可以扩增但本身错误率较高。
哪位知道何种高保真酶可以完成这种non-canonical base pairing？fidelity越高越好。
多谢！ |
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K**4
发帖数: 1015 | 6 Well, I can not give you an answer to your question like 哪种DNA聚合酶的突变
率最低?
But from my friend's work, I can tell you that for DNA replication, many polymerases are involved, but only one is the primary enzyme. In the case of archaea and eukaryotes, this is Pol II (or better known as Family B DNA polymerase) and in bacteria, this is Pol III. Also note that Pol II and Pol III belong to distinct folds.
In nature, organisms dont need to maintain very reliable polymerases since allowing mutation duri... 阅读全帖 |
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m********2
发帖数: 317 | 7 有个疑问，现在用的高保真聚合酶为什么能高保真？
是proof reading 的功能很强吗》 |
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m********2
发帖数: 317 | 8 有个疑问，现在用的高保真聚合酶为什么能高保真？
是proof reading 的功能很强吗》 |
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m********2
发帖数: 317 | 9 寿命长的物种或者说突变率低的物种是不是聚合酶的proof/reading的功能就强呢？ |
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t****p
发帖数: 1504 | 10 （作者toptip注明：本文是基于个人理解来整理的端粒和端粒酶的发现历史，因为知识
时间有限，其中必有偏差和谬误的地方，关键之处还是以原始文献为主。本人之所以赶
这趟诺贝尔奖热，花大量的时间进行文献阅读和整理，是因为它提供了一次极好的向公
众传播科学思想的机会。由于端粒和端粒酶领域的一系列发现贯穿着“发现现象/问题
”-“提出概念/模型”-“实验验证”的思路，重现这个思路对科学工作者是有启发意
义的。本文也提供了一个很好的教学案例。物当尽其用，欢迎转载传播。）
染色体末端的两个难题以及端粒的概念
20世纪70年代初，对DNA聚合酶特性的深入了解引申出了一个染色体的复制问题。DNA聚合酶在复制DNA的时候必须要有引物来起始，而且它的酶活性具有方向性，只能沿着DNA5’到3’的方向合成。染色体复制之初可以由小RNA作为引物起始合成，之后细胞的修复机器启动，DNA聚合酶能够以反链DNA为模板，以之前合成的DNA为引物，合成新的DNA取代染色体中间的RNA引物。但是线性染色体最末端的RNA引物因为没有另外的引物起始，没有办法被DNA取代。所以线性染色体DNA每复制一轮，RNA引物降解后末端都将 |
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a****o
发帖数: 1786 | 11 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 端粒和端粒酶的发现历程（简史版）
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Oct 7 03:34:42 2009, 美东)
20世纪70年代初，对DNA聚合酶生化机制的深入了解引申出了一个“复制问题”：由于
DNA聚合酶需要RNA引物来起始DNA复制，线性染色体DNA每复制一轮，都将缩短一个RNA
引物的长度(1)。这意味着细胞需要引入特殊的机制来解决这个“末端复制问题”。而
早在1939年，McClintock报道，在减数分裂后期产生的染色体断裂很容易重新融合起来
，而在紧接着的有丝分裂中，这种染色体“断裂－融合－桥－断裂”的循环将不断继续
(2)。人们从而推测，染色体的自然末端应该不同于一般的DNA断裂末端，它有一个特殊
的结构来避免染色体间的相互融合。
在逐渐明晰了染色体末端特殊结构，即端粒的概念后，Blackburn实验室于1978年第一
次报道，四膜虫（Tetrahymena thermophila）的染色体外线性rDNA的端粒是由重复的5
’-CCCCA |
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t****p
发帖数: 1504 | 12 20世纪70年代初，对DNA聚合酶生化机制的深入了解引申出了一个“复制问题”：由于
DNA聚合酶需要RNA引物来起始DNA复制，线性染色体DNA每复制一轮，都将缩短一个RNA
引物的长度(1)。这意味着细胞需要引入特殊的机制来解决这个“末端复制问题”。而
早在1939年，McClintock报道，在减数分裂后期产生的染色体断裂很容易重新融合起来
，而在紧接着的有丝分裂中，这种染色体“断裂－融合－桥－断裂”的循环将不断继续
(2)。人们从而推测，染色体的自然末端应该不同于一般的DNA断裂末端，它有一个特殊
的结构来避免染色体间的相互融合。
在逐渐明晰了染色体末端特殊结构，即端粒的概念后，Blackburn实验室于1978年第一
次报道，四膜虫（Tetrahymena thermophila）的染色体外线性rDNA的端粒是由重复的5
’-CCCCAA-3’序列组成的(3)。1984年，Blackburn实验室通过将酵母端粒克隆到线性
人工染色体的方法，发现酵母（Saccharomyces cerevisiae）的端粒序列是由不太规则
的TG1-3/C1-3A组成的(4,5)。
在同一篇文章 |
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s******y
发帖数: 28562 | 13 一个最简单的高保真酶的机理就是一个双向酶，既能加一个碱基也能切掉一个碱基。
但是往后退切碱基的活性取决那个碱基对是否是正确的配对，如果是正确的配对，那么
后退切的效率很低，如果是不正确的配对，切的效率就很高。
通过这个简单的机理就能实现高保真。比方说pfu就是这种机理。 |
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b*********1
发帖数: 1054 | 15 其实这个研究挺有意思的。来一个简易的方法，把培养菌种或者细胞的培养液里的氨基
酸都换成手性对应体，看看细胞能否存活，能否合成对映体蛋白，功能咋样？
做着玩挺不错。我木有钱，玩不起。
【
以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: jllh (Seaman), 信区: Biology
标 题: 清华大学发表合成生物学重要成果：迈出构造镜像生命体征途的关键一步
发信站: BBS 未名空间站 (Tue May 17 09:18:25 2016, 美东)
清华大学发表合成生物学重要成果：迈出构造镜像生命体征途的关键一步
赛先生2016-05-17 12:42:53阅读(1472) 评论(0)
细胞内的DNA螺旋就像右旋的螺丝钉（底部）；而复制左旋的DNA（顶部）则需要天
然DNA聚合酶的镜像聚合酶。
作者Mark Peplow
编译李娟
北京时间5月17日凌晨，Nature Chemistry 杂志在线发表了清华大学朱听团队的最
新合成生物学研究成果。他的团队构造出了某一蛋白的镜像版本，该蛋白在两个最基本
的生命学过程里行使重要功能：参与复制DNA，并将其转录成RNA。
朱听博士阶... 阅读全帖 |
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j**h
发帖数: 126 | 16 清华大学发表合成生物学重要成果：迈出构造镜像生命体征途的关键一步
赛先生2016-05-17 12:42:53阅读(1472) 评论(0)
细胞内的DNA螺旋就像右旋的螺丝钉（底部）；而复制左旋的DNA（顶部）则需要天
然DNA聚合酶的镜像聚合酶。
作者Mark Peplow
编译李娟
北京时间5月17日凌晨，Nature Chemistry 杂志在线发表了清华大学朱听团队的最
新合成生物学研究成果。他的团队构造出了某一蛋白的镜像版本，该蛋白在两个最基本
的生命学过程里行使重要功能：参与复制DNA，并将其转录成RNA。
朱听博士阶段的导师、2009年诺贝尔生理学或医学奖得主、哈佛医学院的分子生物
学家Jack Szostak说，这项工作代表着科学家在制作镜像生命形式的路上迈出了“一小
步”。他哈佛的同事George Church认为这项研究成果是了不起的里程碑，他希望有一
天能构建出完整的镜像细胞。
许多有机分子是“有手性”的，它们以不可重叠的镜像形式存在，就像左右手的手
套那样。但生命却几乎总是使用其中的一个形式，比如细胞利用的是左旋的氨基酸，
DNA扭转成的则是如右旋螺丝钉样的结构... 阅读全帖 |
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C****o
发帖数: 1549 | 17 人类首次拍摄DNA复制！美科学家：人类理论完全瞎编，中学课本错误百出！
2017-06-21 环球科学大观 基因谷
近日，来自美国加利福尼大学的科学家Stephen博士在顶级杂志《Cell》上发表成果称
，所在团队创奇迹般的摄录了单个DNA分子复制的近距离高清无码影像。事实证明人类
半个多世纪以来“臆想”的模型是何其错误百出，此发现彻底改写我们高中所学的生物
知识，颠覆了整个科学界！
传统观念中，DNA双螺旋结构由4类不同碱基相互交织成链。在遵循碱基互补配对原则、
半保留复制与半不连续复制等规则的条件下，解旋酶、DNA聚合酶与连接酶等物质分别
作用于链状结构，使得新产生的遗传物质与母体完全匹配。
其中最为特征的现象是位于前导链与滞后链上的DNA聚合酶在某种程度上彼此协调，以
避免在解旋时引发突变。
团队的科研人员从大肠杆菌中提取出单个DNA分子并施加着色剂，令科学家震惊的是，
实时镜头显示出真实的DNA在复制过程中，连接酶并不相互协调，而是每条单链高度独
立复制，充满随机性，最后却能够完美与母链相匹配！
在镜头中，时而滞后链停止运行，但前导链继续增长，时而其中一条链突然以10倍正常... 阅读全帖 |
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r****o
发帖数: 105 | 18 BSA这里起类似与分子伴侣的作用，主要是防止酶蛋白发生
由疏水相互作用引起的聚合和沉淀。也有可能起避免残存
蛋白酶分解酶蛋白的作用。不管怎么样，主要是为了稳定酶了。
别的添加物比较常见还有：
(1)甘油：也是避免疏水作用引起的蛋白质聚合。尤其可以保护酶
在溶解/冷冻时得活性。
(2)EDTA：可能是为了消除少量protease 的活性，从而使酶蛋白不
会被分解吧。
(3)DTT/BME: 还原剂。防止形成蛋白质分子之间非天然的二硫键。从
而防止蛋白发生聚合。
(4)Sodium Azide: 毒药。抑制微生物生长。如果长期保存蛋白，加
这个会有帮助。
(5) 其他比较常见的盐或者温和的去垢剂：帮助蛋白保持可溶状态。
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a******g
发帖数: 129 | 19 故事终于进入真核时代了，下面将提到的众多人物很多是现在活跃在第一线的非常hot
的PI,板上恐怕也少不了有人在这些人的实验室，所以如果我写的东
西有什么地方不太准确的还请大家多多包涵。
Roeder在69年的Nature paper中报道，从海胆中分离到了三种对盐浓度敏感程度不同的
RNA聚合酶 ，而在大鼠肝脏中有两种这样的活性。这是人们第一次明确的在真核生物中
找到RNA聚合酶。有趣的是这样一篇Nobel级别的文章一开始被Nature给直接咔嚓了。这
是Roeder在一篇访谈中提到的，他当时觉得再找个地方赶快发了，不过最后他的院士老
板William Rutter一个电话搞定了Nature的editor，最终我们在Nature上看到了这篇历
史性的文献。(呵呵，这个怎么说呢，有个大老板就是不一样啊，关键的时候起到的是
一锤定音的作用，所以大家可以的话还是尽量找大腿抱吧。)一年之后，Pierre
Chambon (Nuclear Receptor的那位大拿)拿α鹅膏覃碱对真核的RNA聚合酶 搞了搞，然
后么，大家就在每本生化教科书上看到了依照对α鹅膏覃碱的抗性而分成的RNA聚合酶I
, |
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Z******5
发帖数: 435 | 20 1）However, I do not know 聚合酶2的峰值位置，组蛋白修饰，转录因子结合?
A.这个说起来比较复杂。
a. 和转录起始位置相关的一些组蛋白修饰看这篇文献 The mammalian epigenome.
Cell. 2007 Feb 23;128(4):669-81.
b. 聚合酶2的我忘了哪篇文献了，不过很好理解，基因的转录肯定需要聚合酶2的
结合，自然就会有聚合酶2的结合ChIP数据。你可以去UCSC随便找几个熟悉的基因看看
，比如GAPDH等。
c. 转录因子的ChIP在UCSC genome browser上的数据是有限的，现在已经有几十个
转录因子了吧，这个只是参考。还是那句话，找个你熟悉的基因，看看周围的结合情况
就知道了。
d. 再提一下RIKEN的问题，你可以参考下面几篇文献
Cap analysis gene expression for high-throughput analysis of
transcriptional starting point and identification of... 阅读全帖 |
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v**********m
发帖数: 5516 | 21 该文中四处提出诺贝尔奖字眼跟施论文的科学内容没有任何关系，作者那么牵强的把施
的工作和诺贝尔奖扯在一起是为什么？
当然如果你读不出清华吹捧它为诺贝尔奖级别的意思，当我没说，我向虎肉教授个人道
歉。
http://news.tsinghua.edu.cn/publish/news/4205/2015/201508230948
施一公教授研究组在《科学》发表两篇论文
报道剪接体的三维结构并阐述RNA剪接的分子结构基础
清华新闻网8月23日电8月21日，清华大学生命科学学院施一公教授研究组在《科学
》（ScienceStructure of a Yeast Spliceosome at 3.6 Angstrom
ResolutionStructural Basis of Pre-mRNA Splicing）。第一篇文章报道了通过单颗
粒冷冻电子显微技术（冷冻电镜）解析的酵母剪接体近原子分辨率的三维结构，第二篇
文章在此结构的基础上进行了详细分析，阐述了剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本
工作机理。这在世界上首次捕获了真核细胞剪接体复合物的高分辨率空间三维结构，阐
述了剪接体对前体信使RNA... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 22 转贴来源于：
http://www.genechina.com/news.php?id=577
http://www.sciencenet.cn/m/user_content.aspx?id=29704
核酸体外扩增最早的设想
本世纪60年代末、70年代初人们致力于研究基因的体外分离技术，1971年，Khorana及
其同事提出：“经过DNA变性，与合适引物杂交，用DNA聚合酶延伸引物，并不断重复该
过程便可克隆tRNA基因。”但由于当时很难进行测序和合成寡核苷酸引物，且当时(
1970年)Smith等发现了DNA限制性内切酶，使体外克隆基因成为可能，所以，使Khorana
等的早期设想被人们遗忘。
聚合酶链反应的发明
直到1985年，美国PE-Cetus公司的人类遗传研究室Mullis等人才发明了具有划时代意义
的聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR),使人们梦寐以求的体外无限扩增
核酸片段的愿望成为现实。1993年，Mullis等人因发明PCR而获得了诺贝尔化学奖。
PCR背后的故事
其实PCR技术诞生的背后还有一段故事。PCR的发明人，一般公 |
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发帖数: 1 | 23 近日在湖北省一家三甲医院ICU病区，在临床观察和CT检查中，一位危重症病人的症状
符合感染新冠肺炎的情况，但重复做了4次核酸检测，才出现双阳性的结果。
类似情况也发生在刚刚去世的武汉市中心医院医生李文亮身上。2月1日他在微博上发信
息：“核酸检测结果阳性，尘埃落定，终于确诊了”。据了解，之前他已做过不止一次
核酸检测，结果均为阴性。
《新京报》2月8日也报道了一个类似案例，北京中日友好医院接诊了一位武汉来京的发
热肺炎患者，经过四次核酸检测，最终确诊新冠病毒阳性，前三次咽拭子新冠病毒核酸
检测均为阴性，甲流核酸检测阳性，曾以“重症甲流”收入院，2月5日确诊为新型冠状
病毒感染肺炎。
“出现这种情况很正常。”301医院检验科主任王成彬对《财经》记者分析，造成现在
核酸检测阳性率不高主要有三种原因，一是病毒、病情发展阶段；二是采集流程与方式
；三是检测试剂盒的问题。
“李文亮医生刚开始检测呈阴性、没测到，可能是上述三个原因导致的。他整个就诊流
程，哪出了问题，需要调查。”王成彬说。
尽管检出率有争议，但核酸检测仍然是当下新型冠状病毒感染肺炎的一个最重要的诊断
和确诊手段。
北大第一医院感染... 阅读全帖 |
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w*********g
发帖数: 30882 | 24 笔者对此发表以下看法：
（1）卫生部2007年颁布实施《新资源食品管理办法》有意取消了2002年颁布实施
的《转基因食品卫生管理办法》“第五条 转基因食品的食用安全性和营养质量不得低
于对应的原有食品”这个条款，是退步，而不是进步！这种删除的实质是，进一步顺从
邪恶孟山都为首跨国转基因产业的私利与压力，置中国人民持续安全、健康、生存与繁
衍于不顾！
（2）卫生部2007年颁布实施《新资源食品管理办法》有意取消了2002年颁布实施
的《转基因食品卫生管理办法》“第五条”，但是卫生部《新资源食品管理办法》“第
三条”规定：
第三条 新资源食品应当符合《食品卫生法》及有关法规、规章、标准的规定，对
人体不得产生任何急性、亚急性、慢性或其他潜在性健康危害。
依据该第三条规定，在对于抗草甘膦转基因大豆加工的转基因大豆油，检测出超过
俄罗斯对大豆油草甘膦残留量允许标准与中国卫生部对棉籽油草甘膦残留最高限量2.9-
6倍的草甘膦残留量，已经证实对人类健康，特别对青少年、儿童、婴儿与孕妇及其胎
儿，造成极其严重危害情况下，（1）对人类健康不是形成 “潜在性健康危害”而是... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 25 新型冠状病毒2019-CoV是一个和SARS病毒非常接近的冠状病毒，Spike蛋白空间结构和
SARS的Spike蛋白结构相似，现在也已经证明新冠病毒使用和SARS病毒一样的ACE2受体
进入人体细胞。 除此以外，新冠病毒的RNA聚合酶RdRp和SARS病毒的RNA聚合酶RdRp相
似，新冠病毒的蛋白酶也和SARS病毒的蛋白酶相似，新冠病毒的E蛋白和造成SARS病毒
毒性的E蛋白几乎一模一样。
对于所有现在在武汉一线治疗武汉新冠病毒肺炎的医生，你们都需要回答一个问题，
那就是你们为什么没有参考2003年香港医生治疗SARS病毒的临床经验和2015年韩国治疗
MERS冠状病毒的经验？
如果你们中有人参考了2003年香港医生治疗SARS病毒的临床经验和2015年韩国治疗MERS
冠状病毒的经验， 一个月之前就会提出针对新冠病毒的蛋白酶使用克力芝，或者针对
新冠病毒的RNA聚合酶RdRp使用Gilead的新药remdesivir.
一个月以前你们还有理由，因为你们那时候既没有克力芝也没有remdesivir。 现在，
你们的手上有足够上千人使用的克力芝， 五百人使用的remdesivir， ... 阅读全帖 |
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d*******h
发帖数: 5 | 26 方舟子这几天的微薄和昨天在《搜狐微访谈：方舟子谈铊中毒》中谈及了不少朱令
铊中毒案，他“呼吁警方重启该案调查，扩大排查范围”[1]；并且把最初帮助朱令在
互联网求助的贝志城归为投毒嫌疑对象，认为“不能因为贝不是化学专业的就排除其嫌
疑” [2] 。同时方舟子在微薄中强调“我没有说贝志诚就是凶手，是有很多人这么怀
疑”[3]。在同一条微薄方解释假设贝是凶手，那么存在的犯罪动机可能有：
“比如，也许他本来并不想毒死朱，只是要演一出英雄救美来获得朱的欢心，没想
到被医生耽误演砸了，所以受到良心谴责为朱奔波。又比如，高智力罪犯往往是不甘寂
寞的，他是以这种方式来让人们不要忘了他的杰作。”
这样一个犯罪动机假设不禁让我联想：能不能把方舟子排除在投毒嫌疑之外呢？除
了他上面提到的高智力犯罪不甘寂寞想让大家记住杰作的特点，他还谈及“高智力罪犯
因为蔑视警方，往往非常高调，把火引到别人”[4]。假设方舟子是投毒凶手的话，这
个动机以及特征也符合他本人。
当然这些都是比较微弱的怀疑理由，比较引起我注意的是方舟子2005年3月30日在
《中国青年报》发表的一篇文章《就这样被慢... 阅读全帖 |
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O******e
发帖数: 4845 | 27 ☆─────────────────────────────────────☆
yuuli (听，...听) 于 (Thu Nov 16 23:23:06 2006) 提到:
http://www.cell.com/content/article/fulltext?uid=PIIS0092867406012256&highlight=polymerase
Cell, Vol 127, 317-327, 20 October 2006
Role of the Sigma Factor in Transcription Initiation in the Absence of Core
RNA Polymerase
Hsin-Hsien蔋su,1 Kuei-Min蔆hung,1 Tsung-Ching蔆hen,1 and Ban-Yang蔆hang1,*
1 Institute of Biochemistry, National Chung-Hsing University, Taichung 40227
, Taiwan, Republic of China
从第二个图... 阅读全帖 |
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t****p
发帖数: 1504 | 28 如果有人告诉你用显微镜实时观测单分子DNA聚合酶复制DNA，并用它来测序，你一定会
认为他异想天开，没有一点生物的sense。
我最初就是这样认为的，然而它不仅可以实现，而且已经实现了！这个就是被称为第三
代的测序技术，Pacific Biosciences公司推出的“Single Molecule Real Time (SMRT
™) DNA Sequencing”（单分子实时DNA测序）。
我有幸在NIH听到了这个技术发明人Stephen Turner博士的讲座，根据自己粗浅的理解
记录整理一下。
要实现单分子实时测序，有三个关键的技术。
第一个是荧光标记的脱氧核苷酸。显微镜现在再厉害，也不可能真的实时看到“单分子
”。但是它可以实时记录荧光的强度变化。当荧光标记的脱氧核苷酸被掺入DNA链的时
候，它的荧光就同时能在DNA链上探测到。当它与DNA链形成化学键的时候，它的荧光基
团就被DNA聚合酶切除，荧光消失。这种荧光标记的脱氧核苷酸不会影响DNA聚合酶的活
性，并且在荧光被切除之后，合成的DNA链和天然的DNA链完全一样。
第二个是纳米微孔。因为在显微镜实时记录DNA |
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g*********d
发帖数: 233 | 29 用流行病学研究工具分析金融危机
在一篇评论文章中，英格兰银行负责金融稳定性的执行董事Andy Haldane和流行病学家
Robert
May，利用通常更多用来分析生态系统食物链及传染病扩散情况的工具，对2007年导致
国际银行体系
全球危机的风险的性质进行了分析。
他们得出的结论是，从这次危机可以吸取一些教训，为未来公共政策方面的决策提供借
鉴。认为其他
领域的理论可应用于金融机构的观点并不被普遍接受，由Neil Johnson 和Thomas Lux
进行的一
场论坛辩论就反映了这个问题。
白血病细胞中的基因变异
对不同患者体内的癌细胞所作的全基因组分析显示了广泛的遗传异质性。现在，两个小
组对“急性淋巴
母细胞白血病”(ALL)患者进行了全面分析。
Mel Greaves及其同事获得了来自60位ETV6-RUNX1-阳性ALL患者的大量单细胞突变分布
图，而
John Dick及其同事则对BCR-ABL1-阳性ALL患者进行了分析。
两个小组都推断出了在疾病发展过程中不同亚克隆是如何形成的演化途径。
转移该疾病的白血病传播细胞映照大体积肿瘤的基因变异，从而为在基因层面上了解这
些... 阅读全帖 |
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m****g
发帖数: 530 | 30 最新的研究表明，病毒聚合酶可能为宿主适应的禽流感治疗提供新的治疗方向。
Gabriel等人在2009年9月份的《American Journal of Pathology》上发表的一篇文章"
Spread of Infection and Lymphocyte Depletion in Mice Depends on Polymerase
of Influenza Virus"中阐述了这项研究结果。
尽管禽流感病毒很少穿越物种传播，但是将来可能产生适应性并对人类造成致命的感染。
为了证实遗传改变可能导致宿主适应，Gülsah Gabriel等人检测了两个禽流感病毒菌
株，一个是没有适应性的禽流感菌株，另一个则已经产生变异并能够感染老鼠，后者的
病毒聚合酶的效能有所增强。
结果表明，前者只是感染了肺，而变异的菌株则引起了免疫系统的抑制，并导致多个器
官感染。此外，鸟类的菌株产生的症状比较温和，而老鼠适应的菌株导致了严重的疾病
，包括肺炎以及脑部感染。
研究人员表示，病毒聚合酶可能为预防人类系统性流感的发生提供了重要的靶标。
参阅文献：
1. Gabriel et al. Spread o |
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W*****B
发帖数: 4796 | 31 这个比施一公和彦宁做的东西有意义多了吧？
：人类首次拍摄DNA复制！美科学家：人类理论完全瞎编，中学课本错误百出！
：2017-06-21 环球科学大观 基因谷
：近日，来自美国加利福尼大学的科学家Stephen博士在顶级杂志《Cell》上发表成果称
：，所在团队创奇迹般的摄录了单个DNA分子复制的近距离高清无码影像。事实证明人类
：半个多世纪以来“臆想”的模型是何其错误百出，此发现彻底改写我们高中所学的生
物知识，颠覆了整个科学界！
：传统观念中，DNA双螺旋结构由4类不同碱基相互交织成链。在遵循碱基互补配对原则
、半保留复制与半不连续复制等规则的条件下，解旋酶、DNA聚合酶与连接酶等物质分别
：作用于链状结构，使得新产生的遗传物质与母体完全匹配。
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：其中最为特征的现象是位于前导链与滞后链上的DNA聚合酶在某种程度上彼此协调，以
：避免在解旋时引发突变。
：.......... |
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v********a
发帖数: 646 | 32 浙江大学最近好生猛啊
月23日，国际学术期刊Cell刊登浙大医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队的研
究成果：Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq（利用微孔板测序技术构
建小鼠细胞图谱）。该团队自主研发低成本、高效率、完全国产化的高通量单细胞测序
平台Microwell-seq，并在短时间内利用这一平台构建了全球首个哺乳动物的细胞图谱。
从看一群细胞到看单个细胞
细胞是生命最小的独立遗传单位。生命体从一个受精卵开始分裂，逐渐发育成个体，细
胞之间的差异也随之增大，承担不同的功能。即使相同功能的细胞也存在差异。极端的
例子是，肿瘤细胞最初是由一个正常细胞变异而来。
传统的测序技术“看”的是一组一组、成群的细胞，“读”的是一堆细胞遗传信号的均
值，因此单个细胞的特异性表现容易被忽略。
单细胞测序通过“读”取单个细胞的遗传信息，很好地应对细胞群体异质性问题。正因
为如此，近年来，单细胞测序技术成为各国科学家研究的热点，并进一步推动了人类对
于生命奥秘的认知。
郭国骥认为，单细胞组学技术使人类能够从单个细胞的视角，精确地解析细胞的分化、... 阅读全帖 |
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l***d
发帖数: 1828 | 33 关于替比夫定的一些介绍
慢性乙型肝炎由肝炎病毒家族的双螺旋环状封闭DNA病毒引起，是世界上第9位最常见的
死亡原因。世界范围内每年死于乙型肝炎的估计有100-200万人。乙型肝炎病毒(HBV)主
要在肝细胞内通过RNA介导的逆转录进行复制。治疗的主要目的是抑制HBV复制，防止产
生不可逆肝损伤。标准的慢性乙型肝炎治疗用干扰素a-2b、拉米夫定和阿德福韦。然而
，长期用药(>12个月)的主要问题是发生耐药，例如，拉米夫定。耐拉米夫定的HBV，其
特点是位于 HBV聚合酶催化域的YMDD氨基酸发生突变。复合用药可能避免产生耐药，例
如，拉米夫定与干扰素或其他抗病毒药合用。因此，重点在于研制新的直接抗 HBV的药
，即通过抑制聚合酶、逆转录酶或其他病毒酶而阻断HBV的复制。已发现一系列简单非
天然核苷类化合物有选择性抑制HBV复制的作用。与其他核苷类似物不同的是，这些分
子并非通过化学修饰起作用。这些分子很像天然的脱氧核苷化合物，差别仅在于它们的
碱基和糖分子空间关系属于L型，而天然的脱氧核苷属于D型。这些(β-L-核苷，包括β
-L-脱氧胞苷(L-dC)、β-L-2'-脱氧腺苷(L-dA) |
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s*****e
发帖数: 16824 | 34 中国已将中国军方研发的一种实验性抗埃博拉(Ebola)药物送往非洲，数量达到数千剂
。制造该药的公司表示，计划在那里很快开始人体临床试验。
四环医药(Sihuan Pharmaceutical)上周向中国军事医学科学院(简称“军科院”)
买下jk-05的商业化权利。该公司表示，它在该药8月“获得军队特需药物批件”后就投
入了制造。
四环医药研发部总经理助理、该公司旗下北京澳合药物研究院院长霍彩霞介绍说，
中国军方已向西非发运了足以治疗1万人的药物。四环医药的创始人是前军医。摩根士
丹利(32.85, 0.24, 0.74%)(Morgan Stanley)旗下的私募股权基金持有该公司部分股权。
她说，目标是准备好药物储备，以备被派去帮助抗击埃博拉疫情的中国医务人员受
到感染，并用于目前正在策划的临床试验。她表示，迄今该药尚未被用于治疗非洲的任
何病人，但随后又说，无法查证这一点。
中国正加大其对抗击埃博拉疫情所作的贡献，急于巩固中国与可能受疫情影响的非
洲国家之间的关系。
北京方面已向受影响的国家派出200名医务工作者，并承诺向塞拉利昂、利比里亚
、几内亚和世界卫生组织(WHO)提供3... 阅读全帖 |
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v**********m
发帖数: 5516 | 35 http://news.tsinghua.edu.cn/publish/news/4205/2015/201508241450
还有这篇。
中国科学家为人类生命科学做出巨大贡献
来源：新华网 2015-8-23 任卫东 张漫子
清华大学生命科学学院施一公研究组近日在生命科学基础研究领域取得重大原创性
突破，成功解析剪接体的三维结构，并阐述其工作机理，成果于21日在线发表于《科学
》。业内称此“至关重要”的突破为揭示与剪接体相关遗传病的发病机理提供重要的结
构基础和理论指导。
首次获得高分辨率剪接体三维结构并揭示其工作机理
成果发布后，新华社记者第一时间在清华园甲所见到了刚完成北京高精尖特批项目
评审工作、风尘仆仆骑车赶回的施一公。
施一公介绍，在所有真核生物中，基因表达分三步进行，在第一步转录中，储存在
DNA中的遗传信息经RNA聚合酶的作用转变为前体信使RNA；由多个内含子与外显子间隔
形成的前体信使RNA必须经过剪接体的作用去除内含子、连接外显子后才转化为成熟的
信使RNA，此过程为剪接；最后，信使RNA经核糖体转化为蛋白质。
据同行介绍，第一步与第三步中的关键催化机器RNA聚合酶... 阅读全帖 |
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a******g
发帖数: 129 | 36 1959-1960年间，RNA聚合酶的发现为转录研究奠定了酶学基础，接下来的问题顺理成章
就是转录是如何被调控的。于是在1961年的cold spring harbor symposia on
quantitative biology会议上，两个法国佬Jacob和Monod根据已知的遗传和生化证据提
出了操纵子模型，其具体内容我不多说了，每本教科书上都有介绍。这个模型最关键之
处在于预测了一个可以和DNA结合的抑制因子。这个因子与DNA的结合阻止了RNA聚合酶
对DNA的识别。同年他们将这篇经典文章发在了JMB上。不过他们的模型实在太领先于时
代了，以至于5年之后，大家才找到这个传说中的抑制因子。1966和67年, Harvard的两
位大拿Walter Gilbert(发明DNA化学测序法和Sanger一起拿1980年Nobel的那位)和Mark
Ptashne（1997年Laskar）先后在大肠和lamba噬菌体中找到了61年Jacob和Monod预测
的抑制因子。此时操纵子模型就不在是模型了，而成为了教科书中的经典理论，而且影
响了以后整个领域。不过原核转录的研究并没有完结，因为 |
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W*********n
发帖数: 775 | 37 真核生物的基因 （转录出来的是mRNA），打算看一下调控它的转录因子（
transcription factors）,请问是否它的转录因子结合位点一定在转录起始位点上游？
以我的知识我认为：基因转录出来是mRNA, 所以转录酶是RNA聚合酶II，而 RNA聚合酶
II 的转录因子应该是在上游的（不知道这么说是否正确？）。
因为我的目标基因的翻译起始位点在第二个预测的Exon的中部，第一个Exon（500bp）
和第一个Intron（4500bp）比较长， 所以我想知道分析这个基因的转录因子，应该从
第一个Exon之前分析呢，还是应该从翻译起始位点之前分析？
谢谢！ |
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a****o
发帖数: 1786 | 38 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: acroding (闲云野鹤), 信区: Biology
标 题: 转录五十年 II: 操纵子
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Feb 5 21:21:35 2010, 美东)
1959-1960年间，RNA聚合酶的发现为转录研究奠定了酶学基础，接下来的问题顺理成章
就是转录是如何被调控的。于是在1961年的cold spring harbor symposia on
quantitative biology会议上，两个法国佬Jacob和Monod根据已知的遗传和生化证据提
出了操纵子模型，其具体内容我不多说了，每本教科书上都有介绍。这个模型最关键之
处在于预测了一个可以和DNA结合的抑制因子。这个因子与DNA的结合阻止了RNA聚合酶
对DNA的识别。同年他们将这篇经典文章发在了JMB上。不过他们的模型实在太领先于时
代了，以至于5年之后，大家才找到这个传说中的抑制因子。1966和67年, Harvard的两
位大拿Walter Gilbert(发明DNA化学测序法和Sanger一起拿1980年Nobel的那位)和M |
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f******s
发帖数: 288 | 39 合成dna，rna的时候，它们可不是像催化剂，是聚合酶起到催化剂的作用，dna或rna是
反应底物／产物。
不过，从化学反应角度想，一切都取决于能量，酶的作用就是拉近反应基团，降低能级
，所以到底是什么使细菌里的各种酶能够无障碍的识别砷，是个问题。但是再想想，其
实对酶来说，真正识别反应基团的 amino acid residue 就那么几个。细菌本身的
adpation快， 或者说是mutation 速度快。比如砷最开始的可能就是某一两位置上取代
了磷，如果又没有特定的修复机制，就会保存下去，会加速整个系统突变的过程。不用
产生新的酶，只要原有酶上的某个关键位点改变了，这样突变的过程会无限制的扩大下
去。如果是做酶的，这个根dna damage 的研究路线可以很相似的。
而且，看了这个我都想回去继续做我的polymerase了，人工合成些dntp，在a,b,r位置
放上砷，然后把进化线上的各种细菌，真菌，哺乳动物的酶都拿来试试，看看谁可以合
成，合成到什么程度，说不准低级的可以，到某高一级上发现就不可以了，然后就再找
哪个位点最重要，不用很大工作量，很容易出paper呀，呵呵。
这... 阅读全帖 |
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l***d
发帖数: 1828 | 40 http://www.dfdaily.com/html/8755/2011/5/14/604774.shtml
作者 李福洋 来源:东方早报
DNA 储存在细胞核内，生物体在死亡过程中，细胞会逐渐发生自溶，大量酶类如蛋白酶
、DNA酶等释放，细胞的DNA很快会被降解，即便是细胞没来得及自溶，但是天长日久，
微生物进驻组织或细胞，就像寄居蟹一样，在那里吃喝拉撒、生老病死，它们产生的酶
类也会把原细胞内的DNA破坏掉，一般死亡的动物和人的遗体，DNA很难完整保存下来。
最终技术的进步打破了这个咒语，研究人员成功地获得图坦卡蒙的DNA，也成功地得到
了各个木乃伊的DNA指纹图谱。
古埃及法老（国王）的尸体都被做成木乃伊，保存在金字塔里，据传说，冒犯了法老王
的干尸，就会中法老的咒语。在美国电影的渲染下，这个咒语被传得充满玄机，神秘莫
测。似乎在埃及北部第六代塞加拉王朝的法老墓外，或内侧出现类似“咒语”的文字，
据说也只是针对祭司的，好让其尽职保护墓地，而非防盗墓贼设定的神秘“咒语”或机
关。考古学家其实并未在法老墓内发现任何咒语。
既然法老的咒语不一定有，那也就不存在打破一说。不过，法老... 阅读全帖 |
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g*********d
发帖数: 233 | 41 RNA干扰及其在动物繁殖中的应用
2009-12-28
RNA 干扰(RNA interference, RNAi)是生物进化过程中遗留下来的一种在转录后通
过 RNA 调控基因表达的机制, 它是指在真核细胞中引入双链 RNA分子从而导致具有序
列同源性的基因产生特异性基因沉默 (gene silencing)的现象 。由于 RNA干扰可以阻
断特定的基因表达, 具有超越疫苗和抗病毒药物的诸多优点, 因此在阐述基因功能以及
蛋白质相互作用等方面, 表现出诱人的前景。近年来随着分子生物学的发展, RNAi 的
机制也不断被阐明, 同时国内外研究也证实 RNAi 技术可以为动物繁殖过程中所涉及的
基因功能提供一条新的思路, 这在科研和生产实践上都具有重要的意义。
1 RNAi的发现
Matzke 等于 1989 年报道了启动子介导的序列同源性基因共转染烟草可引起转
基因表达发生沉默。 1990 年, Napoli 和 Van der Krol 等为了让矮牵牛花的颜色更
加鲜艳, 把与紫色相关的查尔酮(chalcone)基因转染到牵牛花内, 结果意外发现, 植物
体的颜色... 阅读全帖 |
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D***s
发帖数: 5613 | 42 当年PCR的发明者Kary Mullis提出循环扩增的idea，然后确实做出来。当时的实验条件
非常简陋，就是在三个不同温度的水浴锅循环，每个循环人工添加热敏感的E. coli
DNA聚合酶。但是他证明这个方法可行，后来公司的日本人将这个方法完善，使用热稳
定的DNA聚合酶，并自动化。使用起来更方便，应用更广泛。但是诺贝尔奖颁给了Kary
Mullis而不是日本人。
Kary Mullis为人狂放不羁，在实验室招妓，但不影响他因为这个idea而获得Nobel。 |
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i***l
发帖数: 223 | 43 我觉得RNA聚合酶更加关键
光有RNA，没有相应的酶催化也是不行
相反，如果有蛋白质酶，并且该酶能催化RNA合成，开始没有模板，
但是该酶刚好能合成表达自身的RNA的话，一切就OK了 |
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x****u
发帖数: 12955 | 44
你还是没搞明白先后顺序。
氨基酸在没有酶的时候也可以自然聚合成链，然后在无数次随机组合中产生一个能产生
聚合酶的顺序来。反过来的可能性就太低了。 |
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c****0
发帖数: 993 | 45 有神药法匹那韦?
治疗新冠方面是“慢热型”实力派
2月5日，《细胞研究》（《Cell Research》）发表我国学者的论文《伦地西韦和磷酸
氯喹在体外有效抑制新型冠状病毒》，论文中提到研究团队对7种化合物进行了体外试
验，从对细胞的毒性（安全性）、对病毒的抑制和对细胞的保护率（有效性）等方面进
行了试验，研究结果显示均有效果。法匹拉韦就在其中。
法匹拉韦也是RNA依赖的RNA聚合酶抑制剂，不同的是，它本身是前药，需要在体内三磷
酸化后才会发挥作用。
钟武介绍，法匹拉韦在体内需要三磷酸化才能作为竞争性底物与RNA聚合酶作用，这也
是在前期的抗冠状病毒体外试验中，法匹拉韦“表现平平”的原因，但其临床效果或许
会有不俗的表现。
科技日报记者在此前的采访中了解到，科研攻关组组织深圳市第三人民医院开展了临床
研究，入组26例，其中普通型25例，重型/危重型1例。目前看来，法匹拉韦尚未发现明
显的副作用，患者依从性好；对发热患者退热作用较好，服药后两天内退热率达72%；3
天内肺部影像学好转率38%，6天内肺部影像学好转率70%。 |
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发帖数: 1 | 46 bingbing2200 发于 2020-03-17 07:51, 论坛:
标 题: “人民的希望”瑞德西韦让业界专家大失所望
http://finance.sina.com.cn/stock/relnews/us/2020-03-17/doc-iimxxstf9769290.shtml
根据RBC资本市场权威分析师审议美国12例确诊新冠病毒感染患者的临床试验数据，给
出最乐观说法是「好坏参半或不及50%效果」。
华尔街资深分析师表示在评估该项12名患者临床试验报告数据后，得出结论是「不确定
该抗病毒药是否会成功」。该结论对投资者至关重要！
相关临床研究论文已发表在预印本服务器上。论文详述了12例新冠病毒患者的流行病学
，临床病程和病毒学特征，包括3例接受瑞德西韦的治疗结果。该临床试验是由美国CDC
应急小组人员开展的，确诊患者是从钻石公主号游轮接回来的患者。
该报告称「对早期确诊的轻至中度新冠病毒感染患者进行了随机双盲对比治疗性试验，
结果表明患者在疾病确诊后第二周出现恶化迹象。」
具体讲，与未接受瑞德西韦治疗的患者相比，接受该药治疗患者的给氧需求，发烧和病
毒感染症状改善之间没有「... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 47 犬冠状病毒(CCV)基因组为一28～ 32 kb大小的单股正链RNA,基因在病毒自身RNA聚合酶
的存在下、以先导引物转录机制进行转录,不同的病毒基因组和亚基因组翻译产生除病
毒依赖RNA的RNA聚合酶以外,还产生其它病毒的结构蛋白和非结构蛋白,其中有相对比较
保守、参与病毒核衣壳形成、介导宿主细胞免疫的核衣壳蛋白(N);在病毒出芽、组装和
成熟中起重要作用的膜蛋白(M);能刺激机体产生中和抗体,且易变异的纤突蛋白(S)，另
外S蛋白还决定着病毒血清型、感染力,同时通过识别,并与病毒宿主细胞受体相互作用
决定病毒感染的宿主范围;参与病毒组装的小膜蛋白(E)和其它病毒蛋白.CCV还可识别猫
氨肽酶N(fAPN)并与之相互作用。[2]
发病特点
该病多发于寒冷的冬季 ，传播迅速，数日内常成窝暴发 ；该病的发生虽无品种 、年
龄、性别之分 ，但在犬群中流行时 ，通常都是幼犬先发病 ，然后波及其他年龄的犬
。幼犬的发病率和致死率均高于成年犬。幼犬症状加剧，呕吐和腹泻是该病的主要症状
，成年犬症状轻微 。该病的临床症状和流行病学与轮状病毒感染相似 ，而且常与轮状
病毒、犬细小病毒等混合感染 ，诊... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 48 犬冠状病毒(CCV)基因组为一28～ 32 kb大小的单股正链RNA,基因在病毒自身RNA聚合酶
的存在下、以先导引物转录机制进行转录,不同的病毒基因组和亚基因组翻译产生除病
毒依赖RNA的RNA聚合酶以外,还产生其它病毒的结构蛋白和非结构蛋白,其中有相对比较
保守、参与病毒核衣壳形成、介导宿主细胞免疫的核衣壳蛋白(N);在病毒出芽、组装和
成熟中起重要作用的膜蛋白(M);能刺激机体产生中和抗体,且易变异的纤突蛋白(S)，另
外S蛋白还决定着病毒血清型、感染力,同时通过识别,并与病毒宿主细胞受体相互作用
决定病毒感染的宿主范围;参与病毒组装的小膜蛋白(E)和其它病毒蛋白.CCV还可识别猫
氨肽酶N(fAPN)并与之相互作用。[2]
发病特点
该病多发于寒冷的冬季 ，传播迅速，数日内常成窝暴发 ；该病的发生虽无品种 、年
龄、性别之分 ，但在犬群中流行时 ，通常都是幼犬先发病 ，然后波及其他年龄的犬
。幼犬的发病率和致死率均高于成年犬。幼犬症状加剧，呕吐和腹泻是该病的主要症状
，成年犬症状轻微 。该病的临床症状和流行病学与轮状病毒感染相似 ，而且常与轮状
病毒、犬细小病毒等混合感染 ，诊... 阅读全帖 |
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x********e
发帖数: 35261 | 49 关键还是要人24小时轮流工作处理样本。ID Now platform目前有5万台吗？试剂有多少
更不好说。LAMP PCR用的聚合酶不是普通聚合酶，网上已经断销了。 |
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x****6
发帖数: 4339 | 50 她有贴具体的分析数据吗？
非编码区域的进化速度不会比编码区域慢，在有的情况下甚至更快，比如人的基因组了
（如果我没记错的话）
并且非编码区的调控序列控制突变 这一说法是错误/误导。
病毒的突变率是由 聚合酶决定的，在新冠这里是 RNA-dependent RNA polymerase。它
也是remdesivir的成药靶点。这种酶是出了名的制造高突变率，因为和它的亲戚 DNA
polymerase比起来，它的蛋白少了一整个结构域。而这个结构域是用来校对聚合过程中
的出错的。 |
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