m****m
发帖数: 395 | 1 实验室的Amp用完了，Order要好久一段时间，于是就用Carbenicillin代替，加了同样
浓度同样体积的量，结果细菌产量减半，尤其是加 IPTG后的 M9 MEDIA，蛋白产量减半
。查了网上都说Carbenicillin好，就搞不懂了。难道是用量要减半吗？请指教！！ |
|
g**********9
发帖数: 24 | 2 如果是细菌污染，24小时后培养基肯定就会变浑浊了。 |
|
n***g
发帖数: 5027 | 3 应该不是细菌污染，支原体到有可能
ru
signific
t |
|
f**e
发帖数: 2160 | 4 看到这个好玩的文章，转过来
=======================================
http://www.sina.com.cn 2010年05月21日 07:40 新民周刊
紫菜只爱日本胃？
法国科学家们在研究海洋微生物如何消化海藻时，意外得到了一个令人大吃一惊的
关于日本人的结果……
撰稿/覃 言
俗话说“一方水土养一方人”，不同地方的人们有不同的饮食习惯，比如寿司，众
所周知，这是日本人的最爱，而欧美人却可能对此“感冒”。一直以来，我们都认为这
只不过是一种口味上的喜好，但科学家的最新研究发现，某一特定的人群可能只能从某
一特定的饮食中摄入能量。也就是说，只有日本人才能消化包寿司的紫菜，并获取能量
，而北美人就没有这种能力。这一令人吃惊的实验结果或许可以表述为：日本人的胃天
生就是为寿司而生的。相关研究结果已发表于著名的《自然》杂志。
意外的发现
来自法国布列塔尼沿岸的罗斯寇夫生物研究所的化学家Mirjam Czjzek及其同事，
一开始只是在研究海洋微生物如何消化海藻，他们对一种以海藻为食的海洋细菌非常感
兴趣，并发现它能产生一种酶来分解海苔——也就 |
|
n**a
发帖数: 212 | 5 靠谱吗? 应该比较一下全基因组序列看这个肠道细菌到底是源于海藻菌还是仅仅一个片
段源于海藻菌.前者的可能性远大于后者. |
|
|
o**i
发帖数: 1165 | 7 可以把兽人的大便拿出来 然后培养里面细菌
最后放在酸奶里面给胖人喝 |
|
|
Z******5
发帖数: 435 | 9 1，貌似对质粒有特别要求，要那种在多数细菌中都不能复制的自杀质粒吧（和一种蛋
白质有关）。
2，缺失管家基因是不是可以考虑在条件培养基上培养？（没做过，瞎诌的） |
|
s******y
发帖数: 28562 | 10 等正式发表了再说。
弄不好其实只是一个能在高浓度Arsenic 里面生长的细菌，那就没有什么意思了
NASA |
|
s******y
发帖数: 28562 | 11 这样的话其实就没有那么有意思了。
因为这个可以是adaptive evolution, 因为砷和磷的化学性质非常像，
细菌在缺乏磷的环境里，被迫使用砷，这个并不是不可想象的。
如果他们发现了一个全新的遗传系统，比方说用的根本就不是DNA/RNA
这种东西，才有足够的意义。 |
|
M*****n
发帖数: 16729 | 12 Where is Craig Venter?
丫找怪细菌那么多年了，居然没有发现这个？ |
|
s*****g
发帖数: 731 | 13 太牛了。如果DNA或者RNA上的磷酸或者ATP之类上面的磷酸在这种细菌里都被砷取代了
的话，简直就是外星生命了。
说不定以后还真能拿硅，砷之类的东西合成DNA |
|
s******y
发帖数: 28562 | 14 可是这里有一个问题啊。因为这个细菌貌似是进行了adaptive evolution 才
从磷系统过渡到了砷系统的。因为它用的还是我们常见的DNA系统。
那么这里就涉及一个问题：假如一开始就没有磷的话，这个生命能否从头组建起来？ |
|
T**********t
发帖数: 1604 | 15 这个问题至少在地球上是找不到答案的吧，因为前提就不存在。。。但是这个细菌的发
现至少说明有这个可能性，我觉得已经是很groundbreaking的发现了。 |
|
s******y
发帖数: 28562 | 16 既然连DNA 都用砷了，那么那个细菌里面的什么ATP 其实就变成了ATAs
别忘了我们所谓的能量分子大部分都是核酸。 |
|
f**u
发帖数: 346 | 17 感觉你好像是做生化的，看来你还有真正的化学背景，那正好这个问题仍给你了。
我在想，既然核酸里面的磷可以被砷取代，
那么能不能上地球上的哪个角落找找看有没有蛋白质里的氮全都被磷取代了的细菌，
如果找不到也可以试试看在实验室里弄个出来，那个好像也会非常非常地酷，
从化学上来说你觉得可能吗？ |
|
S******G
发帖数: 965 | 18 对，细菌到底是survive呢还是能无限繁殖呢，这个区别很大。 |
|
s******y
发帖数: 28562 | 19 关于那个藻类，这个还真不一定。
那些科学家一开始想到那个湖，就是因为湖里含有高浓度砷，但是磷含量非常低。
而因为砷很容易形成磷的analog,所以才引出了她们去找那些细菌的动机 |
|
s******y
发帖数: 28562 | 20 他们的证据是这个东西在缺乏磷的培养基里面可以繁殖增长好几代，所以说明这个东西
不需要磷也能繁殖。
另外，他们从那个细菌提取出来的DNA含有高量的砷
这些本来含磷的活性物质的活性比一般生物体高。比方说一般生物体里面需要1ppm的
ATP，它只需要1ppb。 |
|
w***a
发帖数: 4361 | 21 我觉得更有趣的问题是，这些细菌体内到底存在了一群什么样的酶可以handle这么多的
砷。而对于普通的细胞，trace amount的砷就足够致死了吧。 |
|
Q*K
发帖数: 3464 | 22 很牛逼的发现啊
估计现在大家都要去极端环境下找怪异细菌了。。。，呵呵
不知道这种系列的DNA能不能进化出来高级生命。。。
NASA |
|
|
c****l
发帖数: 1086 | 24 有不有可能这个细菌可以把砷转化成磷啊？ 核聚变。。。。。。 |
|
f**u
发帖数: 346 | 25 是啊。砷中毒的原因好像是在氧化磷酸化的过程中间，
这套东西是超级保守的，那么这些细菌肯定有什么办法来一直砷的毒性。 |
|
|
|
|
z*t
发帖数: 863 | 29 不过他们说细菌大概是需要特殊的环境的（gamma-羟基丁酸？）聚合酶的对As偏好作用
也要在这种条件下筛选吧。我倒觉得按你的思路这种菌的polymerase倒是很好的研究对象 |
|
|
O******e
发帖数: 4845 | 31 这下子微生物学领域要热闹一阵子了。
大家多讨论讨论现在这个“外星细菌”跟以往研究的相似和不同？
G. Miller, and J. F. Stolz. 2005. A microbial arsenic cycle in a salt-
saturated, extreme environment: Searles Lake, California. Science. 308:1305-
1308. |
|
S**I
发帖数: 15689 | 32 如果能提取纯化细菌的DNA做个晶体结构就清楚了。 |
|
Y**I
发帖数: 444 | 33 哇，那目前的测序技术也不能测这个细菌了。。咋整。。。 |
|
s********n
发帖数: 2939 | 34 他们做的这个细菌也不是很特殊，以前已经分离过，但是这次分离的环境比较特殊而已
（高砷低磷）。
大伙赶紧试吧！ |
|
C*******e
发帖数: 4348 | 35 希望他们二月份的paper会有更直接的证据在里面
不过不管怎么样，这个细菌在含40 mM AsO4(3-),5 uM PO4(3-)的培养基里能传代
还是挺unique的 |
|
s********n
发帖数: 2939 | 36 感觉他们这个细菌估计也不是很unique，那那些和它同属的说不定也有相似的性质。 |
|
Z**********g
发帖数: 222 | 37 以前用于证明3'-5'磷酸二酯键的方法，现在也可以用来证明此细菌的核酸是否通过3'-
5'砷酸二酯键连接的，这可能是直接证据？ |
|
y***i
发帖数: 11639 | 38 看了一下原文，medium中原本有3.1um的磷酸，然后所谓的As+/P-的条件是指这个
medium加了 5mM的砷酸。不是没有磷。
估计这个细菌抓磷酸的效率很高。 |
|
T*****n
发帖数: 897 | 39 大家又没有比较好的检测组织切片中的细菌的FISH protol? 关键步骤是什么？谢谢了
。 |
|
b****o
发帖数: 193 | 40 Gram-stain
DAPI
FISH比较麻烦，用细菌通用荧光探针Eu-388. |
|
A********2
发帖数: 107 | 41 抗生素抗药的问题远比大家想得要严重的多，尤其是在中国和印度，印度是猜测没去过
，但是国内的情况显而易见，只不过这些抗药菌株都在医院里，感染的人主要是免疫力
低或者被破坏的，比如老人和癌症病人，如果有一天这些高致病性高抗性的细菌感染正
常人群了，这个问题就严重了，这就不是什么一个国家的问题，体制的问题了，是全人
类的问题。 |
|
s*******m
发帖数: 24 | 42 需要大量纯化一个小蛋白，大概9KD左右。在大肠杆菌里面表达量一直不高。以前看过
一篇文章，说需要在蛋白N端第2个或者第3个氨基酸做一个突变，可以提高表达量。有
谁知道是什么突变不？或者有谁知道怎么在细菌里面大量表达小蛋白的办法不？多谢了
！ |
|
s*******m
发帖数: 24 | 43 以前有一篇文章，专门讲小蛋白的。据说一般情况下，小蛋白在细菌里面表达量都比较
低。好像是因为容易被降解。但是要是在第2或者第3个氨基酸的位置放一个特定的氨基
酸，就可以保护蛋白不被降解。不过我怎么也找不到那个文章了。。。。 |
|
k***g
发帖数: 4904 | 44 配working solution用啥media啊，manual上只是写“Dilute the stock solution to
a final working concentration of 0.5-25 µM in serum-free medium. Avoid
amine- and thiol- containing buffers.”像E.coli这种在LB broth里面养的细菌，
应该用什么media配这种working solution呢？谢谢！ |
|
a*******a
发帖数: 4233 | 45 CFDA SE可不可以
染细胞一个月没问题，染细菌不知道，说明上好像可以。
488激发 绿色荧光。
solution
吗？ |
|
g******1
发帖数: 295 | 46 请问细菌的16S rRNA gene DNA sequence是在plus strand上还是 minus strand上？ |
|
F*Q
发帖数: 3259 | 47 Y形状的细菌细胞，我查到一种是 Aerobic anoxygenic photosynthetic bacteria，还
有人知道别的么？多谢！ |
|
e***y
发帖数: 358 | 48 这个membrane (e.g.ceramic ) filtration 有意思，不过查了下好像主要是过滤水中
细菌，可以用来收菌体吗？会不会堵塞。 |
|
F*Q
发帖数: 3259 | 49 多谢回复。它们好像和细菌的budding没什么关系呀？ |
|
|
