m********r
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大质量弱相互作用粒子(Weakly interacting massive particles，简称WIMP)，是一种
仍然停留在理论阶段的粒子，是暗物质最有希望的候选者。理论预言这种粒子应该有以
下两个特点：
1. 粒子只通过弱核力和引力产生相互作用，或者粒子的相互作用截面小于弱核力作
用截面；
2. 与普通粒子相比质量较大。
由于它们不参与电磁力作用，因此无法被直接探测到；由于它们不参与强核力作用，因
此它们基本上与普通物质不发生相互作用；由于它们较大的质量，因此它们运动的速度
相对缓慢，因而能够成团聚集。根据以上特点，WIMP被认为是最有可能的“冷暗物质”
候选者。
现在很多实验正在寻找在理论上的“大质量弱相互作用粒子”(WIMPS)的粒子，它最有
可能是暗物质。各个实验在地下的那些定做的设备全都等着一颗“大质量弱相互作用粒
子”撞击原子核并引起一次反弹 |
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b***y
发帖数: 372 | 2 力学所椭偏光学显微成像研究生物分子相互作用项目通过验收
中科院力学所靳刚研究员主持的中科院“九五”重点项目“椭偏光学显微成像研究
生物分子相互作用”于近日通过验收。由我国著名免疫学专家顾方舟院士
为组长的验收专家组在认真听取了靳刚研究员的项目总结报告和答辩后，
经过充分讨论，一致认为：该项目全面完成了预定目标。在系统研究的基础
上，实现了多种生物分子的吸附和多对生物分子间相互作用的实时动态观测，为研究
蛋白分子间相互作及结构功能关系提供了一种崭新的手段。同时还发展了具有应用前景
的光学生物活性探针技术和光学多元蛋白芯片，申请了两项发明专利。
建立了生物分子及其相互作用的数据库框架，包括配体 受体反应结果、实时反应标准曲线
、反庆物类别、实验条件和优化结果等。该项目组已开展了若干生物医学应用方面的研究
。上述研究展示了以光学成像技术为基础的多元蛋白质光学芯片和实用化的单元蛋白质活
性探针均属国际现有生物芯片的创新技术之一，具有国际先进水平和广阔的应用前景。
（力学所） |
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s******s
发帖数: 13035 | 3 我瞎说两句。比如研究一下到底哪个domain有相互作用。比如A蛋白的S domain
和B蛋白的T domain有相互作用。然后用已知有相互作用的domain比如X和Y替代。
理想化的结果就是A(S)+B(T)正常，A(S)+B(Y)或者A(X)+B(T）不正常，但是双突变
A(X)+B(Y）能够rescue表型。不过这个估计比较看运气 |
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M********t
发帖数: 5032 | 4 来自主题: Joke版 - 从引力波谈爱因斯坦的幸运 作者：施郁 （复旦大学物理学系） 2016年2月12日是中国农历大年初五。因为所谓“抢财神”的习俗，在零点前后，我当时所在的城市鞭炮声大作。这成了我浏览互联网上铺天盖地的引力波被探测到的新闻发布和原始论文的喜庆伴奏。当时, 我想到爱因斯坦的幸运，便开始写这篇文章。 爱因斯坦曾经感叹牛顿的幸运，而他自己又何尝不幸运至极。他在广义相对论方面的工作就有很多幸运之处。 在创立狭义相对论并为量子论奠基十年以后，居住在柏林的爱因斯坦在个人婚姻纠葛的时期，于1915年创立了广义相对论[1,2,3]，并在次年预言了引力波的存在[4,2]。1918年他得到能量变化率与质量4极矩3阶变化率的关系[5]。美国激光干涉引力波天文台（LIGO）观测到引力波这件事正好成为对广义相对论100周年的纪念。 广义相对论的精髓是物质运动与时空几何的统一和相互影响，在引力场方程上表现为能量和动量与代表时空弯曲程度的量之间的相等。引力使得时空弯曲，需要用非欧几里德几何描述。爱因斯坦创立广义相对论时，物理学家对此还不熟悉，但数学上对于非欧几何已经有深入的研究。在20世纪50年代后的广义相对论和杨-米尔斯场论大发展之前，几何独立于理论物理，取得了长足的进展，可以用杨振宁的诗句“欧高黎嘉陈”概述（指欧拉、高斯、黎曼、嘉当、陈省身）。而爱因斯坦创立广义相对论时，幸运地得到了他的数学家朋友格罗斯曼（M. Grossmann）的帮助，导致他能够最终成功地将物理思想用数学公式表达出来。 创立广义相对论的高潮在于爱因斯坦1915年的一段非常紧张的工作[2,3]。6月他在哥廷根向希尔伯特等人做了一个星期学术报告，介绍他在广义相对论上的工作。10月，爱因斯坦发现自己工作有错误，还听说希尔伯特也发现了他的数学错误并正在取得进展。11月4日开始，按照既定安排，爱因斯坦在普鲁士科学院每周一次介绍广义相对论。经过非常紧张的工作，爱因斯坦终于在11月16日收到希尔伯特的引力场方程之前取得成功，并算出与天文观测相符的水星近日点进动。在11月25日的最后一次报告中，他终于能够写下他的引力场方程。幸运的爱因斯坦！ 1861年，麦克斯韦写下后来以他的名字命名的电磁场方程组，在接下来的几年内他提出了电磁波的存在，并认为司空见惯的光就是一种电磁波。而完备的专著发表于1864年。赫兹在1887年（即麦克斯韦去世8年后）人工产生并探测了无线电波这种电磁波。与之类似，1916年爱因斯坦发表了一篇论文，预言了引力波[2]。爱因斯坦去世60年后的现在，引力波终于被探测到。在4中基本相互作用中，只有电磁作用和万有引力是长程的，所以引力波显然是了解宇宙的一个新窗口。 波是振动的传播。而引力波所传播的是时空度规的振动。度规是一种几何性质。比如平面或者球面上两点之间的间隔都可以用面上的坐标算出，但是公式不一样，这就是因为度规不一样。而在相对论中，有一个与参照系无关的固有时间间隔，它可由时间间隔和空间坐标间隔算出，具体的公式也取决于度规。当物质质量分布发生巨大的变化时，比如高密度天体（如中子星或者黑洞）之间碰撞或者恒星爆炸或坍塌时，会产生引力波。胡斯（R. A. Huse）和泰勒(J. H. Taylor Jr.)于1974年发现的脉冲双星（两个互相旋转的脉冲星）的轨道不断减小，这可以用引力波来解释。他们获得了1993年的诺贝尔物理学奖。理论上认为，宇宙极早期的暴涨会产生原初引力波，从而导致宇宙微波背景辐射在某个尺度上有某种偏振现象。该现象被位于南极的宇宙学河外偏振背景成像（BICEP2）望远镜于2014年观察到，但是后来发现是宇宙尘埃造成的。 LIGO观测到的引力波产生于两个黑洞的并合[6]。大约13亿年前两个黑洞并合产生的引力波于2015年9月14日经过LIGO的两个探测器。幸运的是升级后的LIGO在两天前刚开始运行[7]。这两个探测器实际上是两个巨大的迈克尔孙干涉仪。垂直于干涉仪通过的引力波使得每个干涉仪的4公里长的两臂的长度各有微小的振荡，导致振荡的相位差，从而给出振荡的干涉信号。110年前，狭义相对论解释了迈克尔孙干涉仪测量以太漂移的零结果。现在，迈克尔孙干涉仪又测量到了引力波，检验了广义相对论。确实，现代光学和精密测量技术对引力波探测立下汗马功劳，使得LIGO能够测出小于原子核大小的两臂长度差。历史上引力波探测曾催生量子非破坏性测量的概念，也有原来从事引力波探测的研究人员成为量子测量的专家。 回到爱因斯坦。1933年爱因斯坦移居到美国普林斯顿，引力、统一场论和对量子力学的质疑是他当时关心的问题。爱因斯坦和他的助手罗森（N. Rosen）寻找引力波方程的平面波解，发现这使得度规中不可避免会有奇点（变得无穷大）。现在我们知道这只是表明单一坐标系不足以描述平面引力波，就好比南极和北极的经度无法确定，不是物理上真正的奇点。但是他们当时却以此认为引力波不存在。1936年，他们写了一篇文章投到美国期刊《物理评论（Physical Review）》[8]。这时，爱因斯坦的幸运表现在文章被编辑泰特（John Tate）退回，要求考虑审稿人的意见。审稿意见长达10页，出于专家之手。其实，虽然指出爱因斯坦和罗森的错误，审稿人仍然认为这篇文章有值得赞誉之处，建议经过修改后发表。显然，气愤的爱因斯坦没有研究审稿意见，把文章原封不动地改投到《富兰克林学会会刊（Journal of Franklin Institute）》，文章很快被接受。再次幸运的是，从加州理工学院等地访问回来的同事罗伯森（H. P. Robertson，量子力学教科书上不确定关系的证明源于他）通过爱因斯坦的新助手英菲尔德告诉他们爱因斯坦-罗森工作的错误，并帮助解决了问题。这导致最后发表出来的文章结论完全改变了，成为圆柱状引力波[9]。爱因斯坦幸运地没有否定自己20年前对引力波的预言。近年来Kennefick发现，爱因斯坦本来可以通过阅读《物理评论》的审稿人意见知道自己的错误，因为罗伯森正是泰特为爱因斯坦-罗森文章所找的审稿人。这段历史的详细分析和记述来源于2005年Kennefick发表于《Physics Today》的文章[8]以及刘寄星发表于《物理》的文章[10]（根据美国物理学会期刊主编M. Blume参考Kennefick一篇预印本文章所作的报告，包含Kennefick文中所没有的泰特致爱因斯坦两封信件的复印件）。 几天前出现LIGO探测到引力波的传言时，我便想到爱因斯坦的这件事。 1936年的爱因斯坦幸运地被同行评议制度避免了发表一篇错误的论文，而1905年的爱因斯坦恰恰曾幸运地因为德国《物理学年鉴(Annalen der Physik)》的宽松而得以在该杂志发表5篇改变物理学的论文，特别是看上去离经叛道的狭义相对论和光量子论文。而在爱因斯坦移居普林斯顿后完成的爱因斯坦、罗森和玻多尔斯基（B. Podolsky）质疑量子力学完备性的论文（EPR论文）以及爱因斯坦和罗森关于爱因斯坦-罗森桥（即虫洞）的论文都未经审稿在物理评论发表[8]。后来的历史表明这两篇文章也极为重要，当然是应该发表的。EPR成了爱因斯坦被引用最多的论文。Kennefick认为引力波当时是广义相对论众所周知的预言，所以泰特经过犹豫后将爱因斯坦-罗森证明它不存在的这篇论文送审。而关于爱因斯坦-罗森桥的论文是当时与别人进行的一个争论，所以未经审稿直接发表。那么，质疑当时从一个胜利走向另一个胜利的量子力学的EPR论文为何不经审稿直接发表呢？笔者认为，这是因为EPR承认量子力学技术上的正确性，质疑的只是量子力学的完备性，即是否完全描述客观实在，讨论具有哲学性质。顺便说一下，最近这两篇论文在关于黑洞量子性质的理论讨论中被联系起来。 1917年，爱因斯坦将广义相对论用于宇宙学[11]。如果只有引力而没有斥力，宇宙整体上不能保持静止，所以他在引力场方程中又加了一个代表斥力的宇宙学常数项，虽然他也觉得这个做法很不自然（现在我们知道这也不能真正使宇宙静止）。但是很快人们开始讨论宇宙膨胀，从弗里德曼(A. Friedmann) 、勒梅特（G. Lamaite）和德希特（W. de Sitter）等人的模型研究到哈勃(E. Hubble)的1929年的观测发现。 大爆炸宇宙学的创始人伽莫夫（G. Gamow）在他的自传《我的世界线(My Worldline)》（笔者本科生时代读到这本书后，一直记忆犹新，所以将世界线用于本人的博客名称中）中告诉我们，爱因斯坦曾说过宇宙学常数是他一生最大的错误[12]。所以1936年爱因斯坦-罗森关于引力波的文章所用的引力场方程中，已经没有宇宙学常数。但是在当代，作为联系宇宙学与微观的量子场论的一个桥梁，宇宙学常数成了一个重要的研究课题。近年来宇宙加速膨胀和暗能量的发现更使得宇宙学常数的概念得到复活。这又是爱因斯坦的幸运，虽然他失去了预言宇宙膨胀的机会。 最后，用笔者与杨振宁先生以前的一段讨论结束本文。 施：您认为爱因斯坦(而非麦克斯韦)是仅次于牛顿的伟大物理学家。我也这样认为。您能不能简单说说您的理由？ 杨：麦克斯韦是一位伟大的物理学家，他对人类的贡献无法可以被夸大。但是从对物理学基本概念的贡献的角度来说，他不能与爱因斯坦相比。爱因斯坦（1）改变了我们对于时间和空间的理解，从而给理论物理带来对称性的概念和对称性支配相互作用的思想，（2）创造了引力的几何概念，（3）帮助创立了量子力学。 感谢杨振宁先生的交流和阅读本文。 参考文献: [1] A. Einstein,Sitzungsber. K. Preuss. Akad. Wiss. (1915) 844. [2] A. Pais, Subtle is the Lord, OxfordUniversity Press, New York (1982). [3] W. Isaacson, Einstein:His Life and Universe. Simon & Schuster, New York (2007). [4] A. Einstein,Sitzungsber. K. Preuss. Akad. Wiss. (1916) 688. [5] A. Einstein,Sitzungsber. K. Preuss. Akad. Wiss. (1918) 154. [6] B. P. Abbott et al. (LIGO Scientific Collaboration and the Virgo Collaboration), Phys.Rev. Lett. 116 (2016) 061102. [7] E. Berti, Physics9 (2016) 17. [8] D. Kennefick,Physics Today, September 2005, p. 43. 这篇文章后来吸收进该作者的书《Traveling at the speed of thought》. [9] A. Einsteinand N. Rosen, J. Franklin Institute 223(1937) 43. [10] 刘寄星，物理，34, 2005, p.487. [11] A. Einstein, Sitzungsber.K. Preuss. Akad. Wiss. (1917) 142. [12] G. Gamow, 《My Worldline》, Viking, New York, 1977. (XYS20160218) 从引力波谈爱因斯坦的幸运
作者：施郁 （复旦大学物理学系）
2016年2月12日是中国农历大年初五。因为所谓“抢财神”的习俗，在零点前后，
我当时所在的城市鞭炮声大作。这成了我浏览互联网上铺天盖地的引力波被探测到的新
闻发布和原始论文的喜庆伴奏。当时, 我想到爱因斯坦的幸运，便开始写这篇文章。
爱因斯坦曾经感叹牛顿的幸运，而他自己又何尝不幸运至极。他在广义相对论方面
的工作就有很多幸运之处。
在创立狭义相对论并为量子论奠基十年以后，居住在柏林的爱因斯坦在个人婚姻纠
葛的时期，于1915年创立了广义相对论[1,2,3]，并在次年预言了引力波的存在[4,2]。
1918年他得到能量变化率与质量4极矩3阶变化率的关系[5]。美国激光干涉引力波天文
台（LIGO）观测到引力波这件事正好成为对广义相对论100周年的纪念。
广义相对论的精髓是物质运动与时空几何的统一和相互影响，在引力场方程上表现
为能量和动量与代表时空弯曲程度的量之间的相等。引力使得时空弯曲，需要用非欧几
里德几何描述。爱因斯坦创立广义相对论时，物理学家对此还不熟悉，但数学上对于非
欧几何已经有深入的研究。在20世纪50年代后的... 阅读全帖 |
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C*******e
发帖数: 4348 | 5 biotin-avadin的相互作用不是很强么？应该有不少这方面的研究比如离子浓度多高仍
然不会破坏 biotin-avadin相互作用什么的
DNA-DNA 相互作用方面的文献资料也很多啊 |
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o**4
发帖数: 35028 | 6 这个都有人做了，关键的问题是我发现这个很重要的蛋白A跟另外一个很重要的蛋白B能
相互作用，
而A跟B的功能很重要，都已经有研究了，但是没人发现他们能相互作用，
接下来该怎么办呢？ |
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f******g
发帖数: 1003 | 7 以下观点纯属猜想
我看到的很多文章，包括很好的文章，象CNS级别的文章，很多都是描述一个现象，展
示某个基因有某些功能，机制上主要是向很经典的pathway靠，其实这些机制不一定是
最主要的机制，但是为了快速发表发文章，就往最经典的通路上靠了。
这样做的结果就是，与很经典的基因，例如p53，有相互作用的基因有成百个，当然了
，在不同细胞中，相互作用的基因可能是不一样的。
我总是想，细胞基因相互作用中有没有可能发现很基本的定律，象物理中的牛顿三定律
，数学中的很多公理定理。
比如影响一个基因的表达的因素有很多，目前我所知道的有：转录因子调控，microRNA
调控，甲基化调节，乙酰化调节，磷酸化调节，泛素化调节。
我们有没有可能应用数学上的知识，用一个方程来描述这个基因的表达，各个参数可以
用不同条件下的实际测量值来解决。
to be continued |
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a*****e
发帖数: 4577 | 8 主要有两个问题，
1. 电子之间的相互作用是不是不能用能带理论来解释？如果是，那么电子电子的相互
作用用什么理论来描述？
2 我现在想考虑一个电子decay的路径的问题
比如一个电子受到激发，可以通过发射光子或者发射声子来回到原来状态
但是电子和电子也是有相互作用的
请问，这个电子在发射光子/声子之前，是否会先和其他电子相互作用达到平衡？ |
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s******s
发帖数: 13035 | 9 打算用biotinylated的RNA probe做一些检测蛋白、核酸相互作用的实验， 加热revers
e crosslink以后
需要用beads把这些RNA probe和直接相互作用的核酸除掉，但是不想碰那些pull-down下
来的蛋白和其他核酸。
Anyway, 简单说，就是用什么浓度的什么detergent可以解决掉蛋白/蛋白和蛋白/核酸的
interaction,
但是不影响核酸/核酸以及biotin/avidin的interaction？ |
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o**4
发帖数: 35028 | 10 这个是mapping domain，
怎么证明这个相互作用对于细胞很重要的？ |
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o**4
发帖数: 35028 | 11 但是相互作用的domain有可能有别的功能啊 （十分有可能） |
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o**4
发帖数: 35028 | 12 这个基因跟别的蛋白相互作用的domain功能相当多 （本身基因功能就相当多），
所以我觉得不可能rescue mutant phenotype的啊 |
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m******5
发帖数: 1383 | 14 我遇到过这个问题
AB已知有相互作用，我第一次用GST fusion A N terminal 拉B，怎么拉也拉不下来，
strigency多低也不行
后来用N-terminal fusion B拉A，相互作用非常强，结果用靠马斯亮蓝就能做得很
convincing
所以我觉得不管是什么情况， 如何才能做出来都是不一定的
你的case我觉得拉不下来，这几乎是很reasonable的-_- |
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m******5
发帖数: 1383 | 15 我觉得你的case 最重要的是map出相互作用位点
用缺失相互作用位点的蛋白作阴性对照
反拉本来就是不一定能拉出来的，原因太多了 |
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h**********8
发帖数: 650 | 16 关于蛋白相互作用
在microarrey， peptides pull down, gst pull down 中， 都可以重复到肽段和兴
趣蛋白的相互作用
但是在293细胞中共表达了全长蛋白，coip就是没有结果。
求助高人 |
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u***e
发帖数: 71 | 17 各位大佬，我们实验室发现某种激素能引起3个转录因子的相互作用 （IP and DNA
pull dwon），并协同激活基因A的表达。现在我们下一步想研究这个3个转录因子相互
结合的kinetics。这三个蛋白之中任两个的相互作用都有人研究过了。大家有什么建议
？谢谢~ |
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a*******u
发帖数: 19 | 18 做mapping的时候，根据什么原则分段比较好？
按照蛋白的domain或者motif进行分段的话，domain两侧保留多少amino acids？
每一小的分段大小多少为好？200-300？一般分多少段？
分段的时候两个分段可不可以有交叉？
如果采取没有交叉的的分段，交叉的位置的相互作用怎么排除？
一般在domain区相互作用的可能性比非domain区高吗？ |
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e********c
发帖数: 30 | 19 一个蛋白质单独转染时只存在与细胞核内，但是和另外一个蛋白质（主要集中在核内，
胞浆内也有）一起转染时被定位到核里去了。已经这两个蛋白有相互作用，这说明前者
是通过二者的相互作用被后者带进去核里面的吗？ |
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I****8
发帖数: 34 | 20 非常谢谢lilybank的回复。病人最近的BNP是1050， 对于房颤病人这个是否很高或者正
常。其他检查都没有问题。病人饮食也正常。amlodipine是病人必须用的降压药，因为
只有这药对病人血压有效。血压不是一直都低，是一天的某个时段。可能需要减少
amlodipine或 Irbesartan用量。停用statin的4天里，INR就从2.27降到1.29。可见华
法林与其它药物的相互作用是很明显的。
我把我最近查到的跟大家分享一下：
涉及的华法林的代谢CYP450同工酶包括CYP2C9，2C19，2C8，2C18，1A2和3A4。更有效
的华法林的S-对映异构体是由CYP2C9代谢，而R-对映异构体是由CYP1A2和3A4代谢。
amlodipine是3A4的抑制剂。瑞舒伐他汀（Crestor）经CYP2C9代谢。所以停用了瑞舒伐
他汀，对法华林代谢抑制减少很多，INR明显降低。
大多数他汀类药物通过细胞色素P450（CYP）代谢途径代谢;阿托伐他汀（
atorvastatin），辛伐他汀（simvastatin），洛伐他汀（美降脂，Altocor）通过
CYP3A4同工酶，氟... 阅读全帖 |
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m****g
发帖数: 530 | 21 美国塔夫茨大学的科学家通过三个独立的研究调查，发现基因和饮食相互作用可以影响
人的体重。这项研究发表在11月9日
《Archives of Internal Medicine》杂志上。
该研究中，基因与饮食之间联系与载脂蛋白A-II(apolipoprotein A-II，APOA2)基因启
动子有关。APOA2启动子有两种变
异体，T或是C，因此其基因型有三种CC,TT或TC。Jose Ordovas等人对从三个不同地区
共3,462人进行研究。
研究人员以22克饱和脂肪为界限，将所有试验参与者分成两组：饱和脂肪酸摄入较多组
和饱和脂肪酸摄入较少组。研究人
员发现CC基因型的人若食用大量饱和脂肪酸，其BMI数值以及肥胖的发生率比TT、TC基
因型或饱和脂肪酸摄入较少的人更
高。
所有3,462例实验参与者中，大多数人都是TT或TC基因型。CC基因型的人群大约只占总
人数的10%～15%。研究人员
称，虽然CC基因型人数只占总人数的少部分，饱和脂肪酸和BMI之间的相互作用关系值
得研究人员对其进行深入研究。
（编译：高芳） |
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发帖数: 1 | 22 求审稿机会：
方向： 病毒学，病毒遗传进化，病毒宿主相互作用， 疫苗。
为申请绿卡：
可以站内,QQ:595820476 或者邮件[email protected]
多谢先 |
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m****m
发帖数: 395 | 23 求蛋白结构功能、相互作用方向的审稿机会，请站内短信我，长期有效！ |
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发帖数: 1 | 24 求审稿！光学专业 激光与原子分子及团簇的相互作用方向！
谢谢 |
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发帖数: 1 | 25 求审稿 光学专业 激光与原子分子及团簇的相互作用方向。
谢谢！ |
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m****m
发帖数: 395 | 26 求蛋白结构、相互作用方向的审稿机会，请站内短信我，长期有效！ |
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M********t
发帖数: 5032 | 27 引力波
带人类倾听星辰大海之声
新浪科技
ugmbbc
8小时9分钟前
在一波又一波传言后，终于！北京时间2016年2月11日23：40左右，激光干涉引力波天
文台（LIGO）负责人、加州理工学院教授David Reitze宣布，人类首次发现了引力波。
发布会上究竟揭开了哪些谜团？与之前的传言有何不同吗？中国科学院国家天文台黑洞
来客团队（团队主要成员苟利军 研究员为国家天文台恒星级黑洞研究创新小组负责人
，而这次被探测到的引力波正是来自双黑洞系统），全面解读这场激动人心的发布会。
正如发布会所言，在被预言将近百年、苦苦追寻几十年之后，首个位于地球之外13亿光
年的引力波源GW150914被人类直接探测到，这是一个值得纪念的伟大时刻，一个新时代
的序幕正在拉开——地球人，欢迎你来到引力波时代！
激动人心的发布会结束了，其重点内容可以被简单归纳为三点：
（1）引力波终于被探测到了。
（2）引力波产生于两个恒星量级黑洞的合并（merger）。
（3）引力波是美国的激光干涉引力波天文台（英文简称LIGO）发现的。
接下来，让我们逐个分析和解释一下以上三点，从而对这项具有划时代意义的科学发现
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h*****u
发帖数: 6 | 28 【 以下文字转载自 Exile 讨论区 】
【 原文由 vieplivee 所发表 】
有关艺术或文艺与当今社会之相互作用（习作）
[纲要]
1. 艺术是形而上的
2. 艺术的解释是困难的
3. 艺术批评是以大众的方式存在的
4. 艺术是可以通过学习的方式掌握的
[正文]
所谓形而上就是，简单说来，是存在于我们生活的上空可知而不可看见的一
样东西，很多时候，是精神。艺术是作为一种精神，通过文学、绘画、音乐等方
式与我们进行传达和交流，所以我们在欣赏一样作品时，不仅需要这个作品本身
有艺术性质（否则无欣赏可言），也需要观赏者有一定的艺术素质，方才能达到
不仅看见而且知道的程度。他甚至可以用自己的理念曲解作品作者之原意，但他
至少要能够“解”，像解开一个谜，或解开一个结那样机械的方式也行。
正因为大部分的解法都是曲解，而一个观点之正确与否我们又常常用多数人
占优的方式去判别，于是真正的作品之作者若要出来表达己意，其结果会很糟糕
的。而我们如果是听从大多数人的意见去看待这作品，其结果离作品之原意会有
多远呢？因此，每个人，只要他敢，当他说出自己的一些付诸于这艺术品的观点 |
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z********i
发帖数: 610 | 29 如果一个蛋白的晶体已经知道了，比如receptor and ligand，用什么软件能知道哪些
aa参与了他们的相互作用呢？
对于结构的东西涉及的不多，谢了。 |
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m******5
发帖数: 1383 | 30 不能说明这个问题
实际上，binding domain在这两个蛋白的中部
是的，我觉得是竞争，实际上很多文章哟国内已知识别某个特殊binding位点的抗体转
入细胞disrupt特定相互作用 |
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c******g
发帖数: 49 | 31 不是高人.
先确定是不是假阳性，肽段做的相互作用假阳性比较多.
COIP 也可以改进下条件，这个有时候比较tricky |
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p****9
发帖数: 240 | 32 我觉得可能是293中蛋白表达的蛋白丰度不够，不知道你对共表达的检测用的什么手段
，如果是western那有可能就是这个问题。
蛋白相互作用其实是一个K值反应，和浓度有很大关系，在活细胞中就是丰度问题。 |
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k******0
发帖数: 1073 | 33 共表达两个蛋白质（40 和15kda），能够分离到复合体。
问题是，已知它们有个很短的序列（5，6个残ji）足够将两个蛋白质结合在一起，现在
想看看其他部分是否也有相互作用？
想用简单的生物物理方法来鉴定。有没有什么好办法？
好像有人用isothermal titration calorimetry（ITC），好用不好用？
谢谢解答。 |
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k******0
发帖数: 1073 | 34 谢谢建议。
我的想法是如果结合位点更多的话，需要更多的能量to disrupt the protein
interactions. 我有最少结合位点complex作为对照。
我不知道if there is a thermo effect.
我的结合蛋白太小了，只有15kDa，K and R rich， 进行trypsin limited digestion
好像不好用胶检测。没有MS仪器。
有没有什么光谱检测可以快速检测蛋白质相互作用情况？ |
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k******0
发帖数: 1073 | 35 已经知道一个motif足够将两个蛋白质结合在一起，comigrate by GF
问题是如何检测其它部分也有蛋白质相互作用？ |
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p****s
发帖数: 3153 | 36 NMR, 这个算简单方法么？
还有就是突变了...把你觉得可能有相互作用的残基突变成alanine，做个alanine scan
，如果要看个别残基，只能用针对这些残基的方法了吧 |
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s**a
发帖数: 293 | 37 他说的应该是c terminal……可能尾部的片段对binding不太重要，我就做过这样的
constructs，从c端几乎删掉蛋白全长的一半，相互作用基本不变。
顺便搭车求co-IP需要的蛋白浓度 |
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G*****g
发帖数: 80 | 38 该小分子溶解性差，所以ITC结果不可信。还有哪些实验方法可判断小分子和目的蛋白
相互作用？ |
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s********x
发帖数: 472 | 39 如果本来就不溶，其实你用溶解的那部分做实验就可以了，反正也是一个固相液相的平
衡，因此用饱和溶液做实验不是一样的么？你的sample又不代谢这些药。
即使你勉强弄溶了，也未必会增加有效和蛋白相互作用浓度。 |
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a*****v
发帖数: 128 | 40 这个原理也考虑过，但是最终希望定量，所以希望知道溶解的浓度
溶解的那些部分，有些峰有split，应该是证明有相互作用了。 |
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Y*X
发帖数: 1 | 41 大家好,我有一个RDRP,在大约2-4mM Mg2+的浓度下有polymerase的活性.现在我们做了
很多突变,想确定镁离子的结合位点.请问下大家有没有什么好的方法能够检测蛋白与镁
离子相互作用或者结合常数的. 这个结合的KD估计在mM级或者几百uM级. |
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y*******a
发帖数: 303 | 42 在植物里面研究protein kinase，怎么样寻找与它相互作用的蛋白比较靠谱呢？本来想
用yeast two hybrid，可是似乎false positive会很多。不知道有什么比较可行的方法
？ |
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g*********5
发帖数: 2533 | 43 rna 蛋白相互作用
想直接从公司 order rna 5‘ 标记的oligo, 50 bp long。 IDT could link Licor
dye to the RNA.So use it I could see the shift directly from gel.
大家order rna的时候，是不是 都要用hplc纯化？
charge another 75刀
脱盐不要钱, but I don't know if the desalt quality is fine for the RNA-shift
experiment.
thanks |
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p*****c
发帖数: 116 | 44 非常感谢你的指导：
两个蛋白都不是transcription factor，但是其中一个有报道可以识别sequence
specific DNA motif by a zinc finger protein。敲除之后，能看到另一个蛋白DNA
binding显著增高了。
chromatin fraction IP显示两个蛋白是在chromatin上相互作用。有没有相关的文献推
荐几篇给我？ 我找了挺久的，都没找着。
Ternary complex 不知道怎么检测？ |
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r*******y
发帖数: 48 | 45 1. 两个蛋白都不是transcription factor，但是其中一个有报道可以识别sequence
specific DNA motif by a zinc finger protein。
Do you mean it recognizes DNA motif by a zinc finger domain?
2. 敲除之后，能看到另一个蛋白DNA binding显著增高了。
taken 1&2, it suggests that 1) the other protein is also able to bind DNA, 2
) the presence of the protein mentioned in "1" inhibited the DNA binding of
the other protein.
3. chromatin fraction IP显示两个蛋白是在chromatin上相互作用。
Regular ChIP does not tell you that these proteins interact on chromatin; it
only tells... 阅读全帖 |
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p*****c
发帖数: 116 | 46 非常感谢你的建议！
是的，两个组独立做出来的。
3. chromatin fraction IP显示两个蛋白是在chromatin上相互作用。
Regular ChIP does not tell you that these proteins interact on chromatin; it
only tells that both proteins bind to the same or similar region of
chromatin;
我是isolate细胞的chromatin组分做的IP。如果证据不充分的话，是不是必须要做
Sunnday建议的体外reconstitution的实验才可以？ |
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m****m
发帖数: 395 | 47 求蛋白结构功能、相互作用方向的审稿机会，请站内短信我，长期有效！ |
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c*******t
发帖数: 15 | 48 本质上当然是物理的东西，绝对不是化学的东西，学化学的一
般都无法完全理解这些区别。
然后往下可以算材料和光学的东西，两方面都有涉及。
查查有没有optical properties of materials方面的书。
我试着简单解释一下：
general speaking,光和物质的作用就是electro-magnetic wave
和原子分子的作用。
首先一点，电子质量比原子核要小得多得多，所以一般
情况下就考虑电磁波与原子和分子中电子(确切的说是最
外层电子)的相互作用。
如果是金属，dominant的就是电磁波和自由电子的作用，
如果是绝缘体，就是电磁波和被spring束缚的电子(Lorentz
model)作用。
FT-IR是红外光谱的一种，红外吸收是因为分子中
各个原子之间相对震动(或转动)与电磁波发生共振而产生的吸收，
当入射的电磁波频率与分子中各原子之间的某震动固有
频率相同时，这个频率的光就会被强烈吸收。一般这些
固有频率的波段都在红外，所以叫红外吸收。
光电效应中电子吸收入射光而挣脱束缚，如果入射能量越高，
电子挣脱束缚之后获得的动能就越高。光电效应要求的入射
激 |
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I****8
发帖数: 34 | 49 想询问有关药物相互作用及房颤病人用药问题。
病人，女，72岁，长期高血压，永久性房颤5个月，现用药如下：
目的
rosuvastatin 5mg/片 0.5片/天 控制血脂
Amlodipine Besylate 5mg/片 0.5片/天 控制血压 必须服用的降压药
Irbesartan 1.5g/片 1片/天 控制血压
metoprolol succinate 47.5mg/片 0.5片/天 控制心律
warfarin 0.75片/天 防止中风
目前INR 2.27, 血压90/110，心律50-70，最近血检有以下异常
正常
ALT 83 ... 阅读全帖 |
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r********r
发帖数: 352 | 50 1. AST/ALT 只是 mildly elevated, 不足以说明是肝功能异常。单纯CK elevation 也
和心衰没有关系。CK其实也不算很高了，我觉得这三个lab偏高主要是 rosuvastatin的
副作用 － LFT elevation, muscle break down. 其实CK也没有高太多，病人有没有肌
肉疼痛的症状呢？我觉得应该再查一下scr, 以及lipid panel。不过既然你有AST/ALT
了，说明做了CMET, 那creatinin 你没有列出来说明不高对吗？那说明还没有发展到
rhabdomyolysis。这个时候如果LDL不太高，可以暂停 rosuvastatin. 针对lipid
profile 选择合适的降脂药。
2. calcium channel blockers may decrease the metabolism of statins. but the
dosage for rosuvastatin is not high. 如果一定要用其他statin可以试试
pravastatin or atorvastatin，这样可以s... 阅读全帖 |
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