由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: repressor
1 (共1页)
d******k
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1
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: dudulook (Final Fantasy), 信区: Biology
标 题: 请问有用过lambda repressor的吗?哪里可以买到λ repressor
发信站: BBS 未名空间站 (Fri Mar 21 16:32:51 2008)
哪位同学组里面有,可以赠送或者卖给我们一些?
或者告诉我哪里可以买到?
多谢了
s***e
发帖数: 911
2
来自主题: Biology版 - 外行也来读读汤超的cell文章
Sunny Xie最近有个工作,是在bacterial level理解epigenetics. 方法是在Lac genes上
标记一个YFP, 然后用显微镜定量每个E.Coli的荧光强度. 从一个single e.coli开始,
跟踪观察其后代. 因为Lac repressor的关系, YFP表达是比较低水平的. 随着分裂继
续, 一个pheno type出现,这些e.coli具有高表达的YFP. 这个特征可以遗传下去.
解释: e.coli里只有几个Lac Repressor. 一个reporessor有两个DNA binding sites.
热力学上具有很小的机会让这个repressor完全离开DNA. 一旦完全离开, 因为inducer
会compete bind 到repressor上, 则rebinding的kinetics会非常慢. 于是在一个相当
长的时间内, 这些e.coli的特性会遗传到下一代.他强调的是, 至少对他研究的这个
model system来说, epigenetics无非是一个小概率偶发事件, 并且远离热力学平衡态
的结
果.
我这也是报告会上听的。不
A********e
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3
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
p*******g
发帖数: 2976
4
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
O***n
发帖数: 13127
5
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
s****6
发帖数: 34
6
来自主题: Biology版 - A difficult question
Thanks!! The trouble is that repressor X didn't show itself up in the
profiling data, i.e. none of the decreased mRNA seems to be such a repressor
and a direct target of that microRNA. No direct "targets" was ever found in
the profiling data...but those increased and decreased were indeed
confirmed with qPCR.
Could microRNAs alter gene expression via a mechanism that is not Waston-
Crick base-paring based?
Could microRNAs directly interact with protein factors or anything in the
transcriptional ... 阅读全帖
a****o
发帖数: 1786
7
来自主题: Biology版 - A difficult question
It may have additional repressor Y not identified yet.

repressor
in
n*********m
发帖数: 38
8
Look his publication
Conversion of D-ribulose 5-phosphate to D-xylulose 5-phosphate: new insights
from structural and biochemical studies on human RPE.
Liang W, Ouyang S, Shaw N, Joachimiak A, Zhang R, Liu ZJ.
FASEB J. 2011 Feb;25(2):497-504. Epub 2010 Oct 5.
PMID:
20923965
[PubMed - indexed for MEDLINE]
Related citations
2.
Structural basis for the inhibition of human 5,10-methenyltetrahydrofolate
synthetase by N10-substituted folate analogues.
Wu D, Li Y, Song G, Cheng C, Zhang R, Joac... 阅读全帖
h******u
发帖数: 131
9
分子生物学技术“圣经”的作者 精选
已有 7001 次阅读 2011-6-8 07:55 |个人分类:科学|系统分类:观点评述|关键词:生物
技术 圣经 基因组 中国 美国
科学和《圣经》有着根本的冲突。
但有时,某些科学书籍很有权威、或非常流行,人们戏称为“圣经”,是引号
,不是书名号。
最近几十年,生物理论书籍中最权威的,可能是旧金山加州大学教授、美国科
学院前院长、现任《科学》杂志主编Bruce Alberts主编的《细胞的分子生物学》(
Molecular Biology of the Cell),五大洲学生用了二十多年。
2011年6月8日,也就是本周三的下午4点,应谢晓亮教授邀请来北大给学术报
告的Tom Maniatis教授,曾是我这一辈人做学生期间一本“圣经”的作者。
这本书为《Molecular Cloning》,是1980到1990年代分子生物学技术最常用
的手册,很多人靠此书入门学会克隆DNA。
Maniatis是1970年代几项主要分子克隆技术的发明者:第一个构建基因... 阅读全帖
s*******k
发帖数: 7
10
来自主题: Biology版 - Operator和Silencer的区别?
Repressor 在原核中可以识别并结合到Operator上,从而阻断RNA聚合酶的与启动子的结
合。Repressor 也可以识别并结合到Silencer上,从而阻断RNA聚合酶的与启动子的结合

那么Operator 和Silencer的区别是否只是前者的命名用在原核上,后者的命名用在真核
上,但它们的作用机制其实是一回事?
a********k
发帖数: 2273
11
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branches in lamellipodia. Cell. 2008 Sep
5;134(5):828-42. PubMed PMID: 18775315; PubMed Central PMCID: PMC2570342.
Cai L, Makhov AM, Bear JE. F-actin... 阅读全帖
j****n
发帖数: 3370
12
来自主题: Biology版 - 诱导型启动子的leaky
如果是repressor型的 可以考虑高表达repressor或者operator搞成多个tandem repeat
也可以利用gene circuit实现更好的信号控制

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 1.0.2
p*******g
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13
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: albertsmwk (.)(.), 信区: Biology
标 题: 第一批“青年千人计划”生物类@publication列表@
发信站: BBS 未名空间站 (Thu Aug 18 15:04:16 2011, 美东)
花了一个小时,深深的鄙视一下自己的无聊行径!!
125 蔡亮 男 1980年11月 复旦大学 生命
科学 2007年12月毕业于[美国]北卡大学 [美国]加州大学旧金山分校 博士后
Cai L, Mostov K. Polarity is destiny. Cell. 2009 Nov 13;139(4):660-2. PubMed
PMID: 19914162; PubMed Central PMCID: PMC2900917.
Cai L, Makhov AM, Schafer DA, Bear JE. Coronin 1B antagonizes cortactin and
remodels Arp2/3-containing actin branche... 阅读全帖
r****a
发帖数: 1212
14
这个能不能用到没有这个基因的人身上啊?
原标题:《科学》子刊:睡四个小时记忆力还超棒的基因被找到了!科学家找到新
“短睡基因”,携带者只需睡4-5小时,且不影响认知丨科学大发现
来源:奇点网
能短睡,是这个年代的核心竞争力,这话是两只已经在养四脚吞金兽的奇点糕说的
。对这血与泪哭与闹当中总结出的体会,不认同都难。再说了,有多少伟人说过,自己
不需要多睡,就能精力旺盛全力工作?
而绝大多数人,哪怕只是晚睡或者早睡几小时,影响都会很明显。奇点糕的感受,
就是第二天魂不守舍,完全大脑失能了,而且作为球迷,奇点糕基本每周熬一次,还算
是早就适应了呢……不争气的主队能赢球的情况除外
所以说啊,能短睡还能元气满满,绝对是一种意义不亚于天才头脑的天赋。而天赋
,很多时候是藏在基因里的,还记得上个月奇点糕们介绍过的,只需要睡4-6小时的基
因吗?
那支加州大学旧金山分校的团队,又发现了迄今为止的第三个短睡基因——突变的
NPSR1。而且这个基因突变,不仅让人只需要4-5小时睡眠,还在实验中抵御了剥夺睡眠
导致的认知功能损害!这项研究登上了《科学·转化医学》的封面[1]。
先睡为敬,有事也别叫……(图片... 阅读全帖
f*********e
发帖数: 24
15
A microRNA as a translational repressor of APETALA2 in Arabidopsis flower
development.
Chen X.
Science. 2004 Mar 26;303(5666):2022-5. Epub 2003 Jul 31.
PMID:
12893888
[PubMed - indexed for MEDLINE]
b**********9
发帖数: 87
16
来自主题: Returnee版 - 青千为何落选
http://www.bio.whu.edu.cn/News_reads.asp?cid=174&id=3053
周 宇
职称职务:研究员
学科专业:生物信息与功能基因组学
研究方向:生物信息学、功能基因组学、RNA组学
实验室位置:生命科学学院6109、6101室
联系电话:027-68756749
Email: [email protected]
/* */
学习经历
1999-09-2003-06 武汉大学 本科 生物学基地班
2003-09-2004-09 武汉大学 硕士 生化与分子生物学
2004-10-2005-07 法国巴黎十一大学 硕士 生物信息与生物统计学
2005-09-2008-12 武汉大学 博士 生化与分子生物学
2005-09-2008-12 法国巴黎十一大学 博士 计算机 (与武汉大学联合培养)
主要工作经历及任职情况
2009-07-2015-05 美国加州大学圣地亚哥分校 博士后
2015-05-至今 武汉大学 研究员
2015-08-至今 武汉大学高等研究院 兼职研究员
主要研究领域及兴趣
近年来发展起来... 阅读全帖
T**7
发帖数: 264
17
来自主题: Immigration版 - 审稿机会-microbiological research
杂志:Microbiological Research
Title: Small regulatory RNAs regulate the biocontrol property of Pseudomonas
fluorescens strain Psd
ABSTRACT:
Abstract
The production of biocontrol factors by many pseudomonads is reported to be
controlled at post-
transcriptional level by the GacS/GacA signal transduction pathway. This
involves RNA- binding translation repressor proteins, RsmA and RsmE, and the
small regulatory RNA(sRNAs) RsmX, RsmY and RsmZ .While the former represses
some of the genes involved in ... 阅读全帖
G****a
发帖数: 10208
18
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 从骨科医生到诺贝尔奖-山中伸弥的研究历程
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Oct 17 00:04:30 2012, 美东)
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳... 阅读全帖
c******r
发帖数: 889
19
来自主题: TrustInJesus版 - 《旧约》,一言以蔽之:?
奴分两种。
被迫的和心甘情愿的。
前者叫奴隶,被胁迫。身体被胁迫,处境低贱,精神可以是自由的,高贵的,蔑视
repressor 的.
心甘情愿,予取予夺,三呼万岁,谢主隆恩,那是精神上彻底匍匐在地,行动上为虎作
伥的,那是奴才。
同学要注意用词准确。
c******r
发帖数: 889
20
来自主题: TrustInJesus版 - 蓄意反基,何患无辞?
你就是利用本站有问题的“版主负责”制度,来施行个人agenda的repressor, 大家争
取的是合法合理的权利。
反复的体制内渠道沟通无效,那么怎么办?
美国民权法案是怎么建立并通过的?
不要以为你“合理”利用规则就真的“合理”了。
不公正的体制内规则也是可以被改变的。
基督教对人类思想的钳制早就被丢进历史垃圾堆了。你想开倒车,必然激起众怒。
只是,你好像被真理模糊了常人的判断,已经看不明白了。
I*****y
发帖数: 6402
21
来自主题: Biology版 - Re: Question regarding inducible operon
hmmm, to answer your question, I'd like to start as if you understood the
transcription machinery in prokaryotes (E.coli falls into the category of
prokaryotes). In the lac operon (repressor) experiment, we use the plasmid
construct that has incorporated the selective marker gene (e.g. uracil
gene,etc). The marker gene can tell you whether the transcription occurs or
not, because the media that we use contains no uracil, the E.coli iteself has
to produce the uracil. The plasmid construct is alr
a****o
发帖数: 1786
22
来自主题: Biology版 - transcription factor和activator
different. anyting involved in transcription can be called transcription
factor. it includes at least activator and repressor.
s******y
发帖数: 28562
23
来自主题: Biology版 - A very funny title of a new Nature paper
NINJA connects the co-repressor TOPLESS to jasmonate signalling
Laurens Pauwels et al.
doi:10.1038/nature08854
m*****n
发帖数: 760
24
有没有哪些网站,或者数据库,
能够比较靠谱的computationally predict转录因子的binding site?
Z******5
发帖数: 435
25
这个预测现在貌似没有靠谱的吧。
可信度比较高的数据时UCSC genome browser里面的whole genomic ChIP-seq, 不过目
前也只有几十个转录因子的数据。
m*****n
发帖数: 760
26
多谢。
能不能给个连接?去UCSC找了半天,愣是没找着。
另外,还有哪些不怎么靠谱的资源吗?
Z******5
发帖数: 435
27
http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgBlat?command=start&org=Human&db=hg18&hgsid=171610172
把你的序列贴进来,比对之后打开browser,在页面的最下方有设置。
预测binding motif我比较喜欢用这个http://jaspar.binf.ku.dk/cgi-bin/jaspar_db.pl
a****o
发帖数: 1786
28
pubmed
bulyk m
a****o
发帖数: 1786
29
来自主题: Biology版 - A difficult question
This could be due to indirect effect. e.g.these genes are all negatively
regulated by a repressor X, X is the target of the microRNA. overexpresseion
of the microRNA, downregulated X and derepress the expression of that group
of genes.
s**2
发帖数: 1287
30
呵呵,借大牛的名气来做个广告。:)
Third Annual Tufts Neuroscience Symposium & William Shucar
Thursday May 12, 2011 9:00 AM - 5:00 PM
The Department of Neuroscience is hosting the third annual Tufts
Neuroscience Symposium & William Shucart Lecture on Thursday 5/12/11. All
talks will be in the Behrakis Auditorium, located in the Jaharis Family
Center for Biomedical Education and Nutrition Sciences at 150 Harrison
Avenue, Boston MA 02111. For directions and a campus map, please click here.
Lunch will be provided f... 阅读全帖
b*****u
发帖数: 75
31
来自主题: Biology版 - 八卦:老尚的Cell paper
(3p is the guy who has worked a lot on PTEN in cancer)
The Shang Nature paper kind of propose 1, PAX2 is a transcription target of
ER, 2. PAX2 is positively correlated with tumor growth.
However, the 2008 Nature paper says that PAX2 is a co-repressor of HER2 gene
transcription, which is tyrosine receptor kinase implicated in malignancy
transformation. I am not sure about HER2 amplification or any functional
roles in endometrical cancer. But still the two papers' conclusions seems
very different.
k*****n
发帖数: 417
32
来自主题: Biology版 - 列几个被引用过万的PIs
Their top5 highly cited research papers:
Wei Gu:
Title: Negative control of p53 by Sir2 alpha promotes cell survival under
stress
Times Cited: 822 (from Web of Science)
Title: Deacetylation of p53 modulates its effect on cell growth and
apoptosis
Times Cited: 331 (from Web of Science)
Title: Deubiquitination of p53 by HAUSP is an important pathway for p53
stabilization
Times Cited: 319 (from Web of Science)
Title: Mono-versus polyubiquitination: Differential control of p53 fate by
Mdm2
Times Ci... 阅读全帖
a****o
发帖数: 1786
33
Most transcription factors bind to upstream of transcription start sites (
TSS).
General transcription factors bind to core promoter and activators/repressor
bind to UAS/enhancers.
5' UTR refers to regions in mRNA, but do not encode protein.It is not riched
for TF binding sites.
j****x
发帖数: 1704
34
The 5' UTR may also contain regulatory elements and may be part of the
promoter, and more and more updated TFBS searching tools include it into
analysis to increase the sensitivity. That's my point. I do have no problem
with the textbook knowledge you mentioned.

repressor
riched
m******5
发帖数: 1383
35
我觉得你和我回帖的思路差不多…… RE 切fix过的,southern + western,都是size
sepcific的
前面有人说还不知道是什么蛋白怎么办,其实我觉得关键是有一个idea这个序列是
activate的还是repressive 的 可以用一些已知的co-activator或者co-repressor来
locate. 要是序列的功能都不知道就难办了……
B*****e
发帖数: 1005
36
140后的几个也不是美国AP啊,文章比跟前几个有距离
140 黄亿华 男 1971年10月 中国科学院生物物理研究所 生命
科学 2004年02月毕业于[美国]康奈尔大学 [美国]休斯医学研究所/西南医学中
心 讲师
1: Huang Y, Smith BS, Chen LX, Baxter RH, Deisenhofer J. Insights into pilus
assembly and secretion from the structure and functional characterization of
usher PapC. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 May 5;106(18):7403-7. Epub 2009
Apr
20. PubMed PMID: 19380723; PubMed Central PMCID: PMC2670885.
2: Lin SC, Huang Y, Lo YC, Lu M, Wu H. Crystal structure of the BIR1 doma... 阅读全帖
f*********9
发帖数: 258
37
来自主题: Biology版 - TREx pcDNA6/TR
有人用Tet-on system 吗,Co-transfection Tetracycline repressor expression
vector。
是否可以share 点, 邮件:l******[email protected]
L****L
发帖数: 367
38
来自主题: Biology版 - 请问哪里可以买到 Lac repressor?
或者其他的一些sequence specific DNA binding protein? 还是必须set up
collaboration?
多谢各位了 !!!
g******w
发帖数: 852
39
来自主题: Biology版 - paper help again!
No1
Sci. Signal., 2 February 2010
Vol. 3, Issue 107, p. ra8
[DOI: 10.1126/scisignal.2000568]
RESEARCH ARTICLES
T. Kino, D. E. Hurt, T. Ichijo, N. Nader, G. P. Chrousos, Noncoding RNA Gas5
Is a Growth Arrest– and Starvation-Associated Repressor of the
Glucocorticoid Receptor. Sci. Signal. 3, ra8 (2010).
No2
Long noncoding RNAs and human disease Review Article
Trends in Cell Biology, Volume 21, Issue 6, June 2011, Pages 354-361
Orly Wapinski, Howard Y. Chang
No3
RNA Biol. 2010 Sep-Oct; 7(5): 582–5... 阅读全帖
f*********e
发帖数: 24
40
A microRNA as a translational repressor of APETALA2 in Arabidopsis flower
development.
Chen X.
Science. 2004 Mar 26;303(5666):2022-5. Epub 2003 Jul 31.
PMID:
12893888
[PubMed - indexed for MEDLINE]
t****p
发帖数: 1504
41
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳定的资助,那
么类似的科学突破就会随机但是必然地产生。从这种意义上讲,展示Shinya Yamanaka
在研究过程中的这种随机性和必然性,向公众科普科研活动是如何进行的,是值得我花
一点时间的。
解析Shinya Yamanaka发现诱导干细胞(iPS... 阅读全帖
t****p
发帖数: 1504
42
引言
山中伸弥(Shinya Yamanaka)获得诺奖已经有几天了,虽然两年前在听完他的讲座后
我兴致很高地写了两篇文章,这些天我却没有多少动力再写一篇完整的文章来介绍他的
工作。
我一直对中国现在还盛行的规划性科研,应用导向型科研耿耿于怀。这些所谓的重大项
目在立项的当初对目标/前景写得宏大无比,之后却通常草草收场。如果那些重大项目
真的能实现立项当初的用意,那诺贝尔奖早就在中国遍地开花了。广大科研人员都觉得
这种运行模式是一个笑话,饶毅、施一公等大牛也重炮轰击,但是分钱游戏还在进行着
。而公众,包括相当一部分科研人员也并不了解科研的自身规律,总是一再地问做基础
研究有什么用。
Shinya Yamanaka的成功是典型的小实验室自由探索的成功。他的成功再一次提示,有
相当多的科学突破是不可预测的。如果中国有大批优质的小实验室得到稳定的资助,那
么类似的科学突破就会随机但是必然地产生。从这种意义上讲,展示Shinya Yamanaka
在研究过程中的这种随机性和必然性,向公众科普科研活动是如何进行的,是值得我花
一点时间的。
解析Shinya Yamanaka发现诱导干细胞(iPS... 阅读全帖
d*****8
发帖数: 29
43
用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
。非常感谢!!!!
d*****8
发帖数: 29
44
用果蝇做model, 我找到一个transcriptional repressor在stem cell中有non-
autonomous effect, 在人里面报道过这个转录因子能抑制很多cytokines表达。 现在
我想用Chipseq找它在干细胞中的targets。 在果蝇里还没有报道过这个因子的已知的
binding region,只知道它的consensus elements跟人的是保守的。人里面已知的
targets可能在果蝇里不保守。 如果这种情况想做Chipseq,要怎么找一个control
binding region。跟我们合作的一个实验室说没有control region也能做但是风险很大
。非常感谢!!!!
C********4
发帖数: 308
45
来自主题: Biology版 - Whole genome基因表达求建议
还有,要知道,做ChIP的话,你的蛋白必须是个通过绑在chromatin发挥功能的蛋白,
比如转录因子,coactivator/repressor,而不是其他的,比如kinase,在signaling
里面发挥功能,或者E3 ligase等等,不进基因组和染色体。
H*******i
发帖数: 196
46
来自主题: Biology版 - shRNA cloning site of pGIPZ?
随便问问 原核里面的Activator在真核里面不管用是肯定的
不过因为原核里面最常用的LacI/TetR都是repressor,而且都有造成DNA looping的可
能,所以问问。另外Yeast里面Gal1是可以IPTG诱导的吧。
真核里面ptet也是基于TetR吧
H*Q
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email, h********[email protected]
thanks a million
Nat Med. 2011 Nov 7;17(11):1359-70. doi: 10.1038/nm.2537.
Tumor angiogenesis: molecular pathways and therapeutic targets.
Weis SM, Cheresh DA.
Source
Department of Pathology and Moores University of California-San Diego Cancer
Center, University of California-San Diego, La Jolla, California, USA.
Abstract
As angiogenesis is essential for tumor growth and metastasis, controlling
tumor-associated angiogenesis is a promising tactic in limiting cancer
pro... 阅读全帖
m******g
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Science 14.03.28
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the power of students' army, haha
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s******y
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我们在Addgene翻了半天了,看到的可诱导系统都是需要两个vector 的,就是需要把那
个repressor 放在另外一个vector 上的。但是我们的细胞因为转了其他东西已经用掉
了两个marker 了(Neo/Kan 和GFP),所以希望弄一个单vector的系统。
另外,我的博士后们不肯用gateway。他们貌似对没有用过的东西都有戒心。我怎么说
都不行。麻烦啊。
c********n
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谈谈和蛋白打交道的日子 (八)
第八篇 轮回
引子
主题构思于美国独立日,一个国家的生日。每一个新事物的产生,往往都伴随着老事物
的离去。日月轮回, 周而复始。这在LIVE乐队一首经典的Lighting Crashes MTV里,
有着令人心动的视觉体现。旋律混合着实验室几个人深夜coffee break的aroma,深深
印在脑海:
oh now feel it comin' back again
like a rollin' thunder chasing the wind
forces pullin' from the center of the earth again
I can feel it.
这次来简单思考一下轮回吧。
最近施一公与Sjors Scheres合作得到了4.5A 分辨率γ secretase的晶体结构, 和
amyloid生成相关, 涉及到了蛋白在体内轮回的重要性,特别是在neurological
diseases的集中体现。
蛋白aggregation是一点一滴积累起来的,一旦形成就很难被细胞正常的protein
degradation机制消化掉。大量垃圾... 阅读全帖
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