b*******g
发帖数: 1309 | 1 修仪器不好玩，搭仪器才好玩呢
以前一个牛人，花了20K就搭了个iontrap，后来去bruker工作，工资150K以上 |
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r******l
发帖数: 48 | 2 It seems the machine has problem and needs to be fixed. The data from such
machine is not reliable. |
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x*****g
发帖数: 82 | 3 问题1： MALDI-TOF发现单一的产物峰M+122（DMAP分子量），怎么解释？
问题2： 柱层析产品核磁总是有DCC的存在，如何继续纯化？ |
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n*****g
发帖数: 4117 | 4 ☆─────────────────────────────────────☆
kenny514 (kenny rockefeller) 于 (Fri May 8 08:32:46 2009) 提到:
my product was treated with water. and in the TOF spec. the molecular weight
is 54 higer than supposed. i think it may caused by coordinating with water
.
who can tell me crystal water or water coordinated can be revealled in TOF.
or lose it when transform it to ions?
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flywithwind (flywithwind) 于 (Fri May 8 11:48:46 2009) 提到:
What kind of product |
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W*******R
发帖数: 1224 | 6 PITC对氨基的衍生物在酸性下很不稳定，你过柱子柱子如果是硅胶柱等弱酸性物质，你
当然什么都拿不到。好好看看edman降解是怎么回事，机理要搞懂。 |
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q****i
发帖数: 6923 | 7 aggregation 不一定要用uv测阿，有的aggregation不会改变uv。你一定要拿uv测的话
就按楼上说的去买很薄的curvette了，但那个改变不了很多不一定能搞定。可以用
light scattering测aggregation。多大的分子啊？用maldi不行吗？ |
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y***e
发帖数: 6082 | 8 不要光看IF，作biosensor怎么能根这些个有背景的nano比，一般也就发发AC和BB了
MS貌似也就LC好点吧，做啥MALDI，SIMS啥的一样不好
不是冒犯啊
我感觉他做的nano bioanal 出来不好找工作吧？
发文章也还好，不到特别牛的程度
另外跟做nano的比，好像也不太突出，跟nano大牛比如Xia YN，Yang PD， Dai HJ，还
是很大差距的
知道我有点不厚道，拍吧拍吧
做bioanal还是要奔好找工作的MS 方向去 |
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a******z
发帖数: 1464 | 9 介个maldi imaging的薄厚广告列了有一年了吧，还没收到人那。。。 |
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L****r
发帖数: 333 | 10 MALDI IMAGING 除此之外还有个优点，就是找biomarker， 血液里的marker浓度太低，
如果在切片的时候能够做到，一边是正常组织，一边是肿瘤组织，由于marker在肿瘤组
织里浓度相对较高， 也可以得到很好的结果。 |
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w********g
发帖数: 447 | 11 根据颜色深浅判断什么？判断肿瘤还是非肿瘤？you already known this in the
first place. 如果你说你看肿瘤组织内部的heterogeneity，这是非常有意义的研究。
比如你track不同的时间点的heterogeneity，看看肿瘤如何扩散的，如何变化的。但不
是caprioli鼓吹的imaging可以解决的。因为不像MRI，你的imaging是destructive的，
至多只能看到一个时间点的东西。而且看到差异你怎么validate这个差异？别忘了你是
n=1啊。你的颜色深浅是因为啥引起的？没有严格的validation，天知道。颜色深浅是
量上的区别，要用MALDI回答quantitative的问题，没SIL的standard，太不靠谱。如果
抛开颜色深浅不说，说qualitative的有或者没有的问题。可信度会高很多。但是我感
觉caprioli同志所鼓吹的cancer biomarker，都是正常细胞里的蛋白被digest的产物。
这个结果其实自打1924年Warburg hypothesis的诺贝尔奖以后不多久，人们就想明白了。
我不 |
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L****r
发帖数: 333 | 12 不好意思， 没说清楚。
MALDI Imaging反映某一marker浓度的变化是通过颜色的变化来实现的，比如， 颜色深
就代表其浓度大， 颜色浅代表其浓度低。通过颜色变化我们就可以知道毒物，药物或
者代谢产物在组织里的分布，甚至动物全身的分布。如果一块板上有肿瘤和健康组织，
通过颜色的变化，就可以初步筛选出marker, 当然要确定它就是marker,后面还有很长
路要走。 |
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P***e
发帖数: 804 | 13 Run LC-MS to monitor disulfide peptide change over time.
If no MS connected to LC, collect fractions then run MALDI.
In terms of purification, HPLC is the way to go.
not |
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C***k
发帖数: 1570 | 14 帮朋友问的，纯生物背景，选Ph.D thesis实验室，生物谈不上非常喜欢，比较car
e以后的工作前景，现在有机会进一个做mass spectrometry的实验室做Ph.D student，
可以做MALDI,LC-MS,主要是分析biomarker之类的project，老板比较牛，学
生找工
作传说都不错，只是因为没有化学基础，而且实验室太大，老板经常不在，担心不能得
到很好的training，另外还有一个实验室做纯生物cell biology/cancer,老板很nice，
名校MD/PHD,对学生很好，实验室气氛很好，不过publication一般（多为JBC,MCB，偶
尔有JCI之类的）。这里想听听大家的建议选哪一个好，特别的化学出身的朋友，生物
背景的做mass会不会很吃力，以后在工业界和学术界的发展如何？因为传说做mass去工
业界找工作很容易，所以特来请教，先谢了。 |
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i*****s
发帖数: 1170 | 15 你确定用了足够量的DNA? 我没做过，但听做过的人讲需要大约10pmol |
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K****l
发帖数: 861 | 16 谢谢
我用了非常浓的试过...还是没有信号...不过那个浓溶液是不纯的... |
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K****l
发帖数: 861 | 17 恩...还是一样
没信号...都是noise~~~
有什么需要注意的地方吗？因为刚开始做这方面的工作
谢谢先... |
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t***u
发帖数: 20182 | 19 不熟，只做过polymer的。用的matrix是文献来的？用别的试试？ |
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K****l
发帖数: 861 | 20 这个到真没做？不知道具体是怎么一个步骤？
我知道这一步很重要
好像按照文献的说法，我用在Matrix里面的Ammonium Citrate大概是这个作用
具体能说解释一下吗？
谢谢了... |
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K****l
发帖数: 861 | 21 恩...这个是文献的
一开始用CHCA，也没信号... |
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s**c
发帖数: 34339 | 22 DNA最好是纯化后除过盐的，否则噪音太大，很难看到离子峰。
除盐的方法可以有很多种，用G25柱子除，或者用小的C18 Cartrige除都可以。
另外，在做质谱的时候，注意你选的方法中的离子范围，激光强度等。
DNA的量一般要在0.01OD，大概是100pmol左右。
Matrix好像我们用的都一样 |
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s**c
发帖数: 34339 | 23 方法实际上都没太大区别，好像也就是选Matrix，激光强度和离子范围，当然了，我也就注意过这些，其他的没仔细看过。主要是这方法也是从以前人那里直接拷贝过来用的。
激光强度这个，我们都是选数值，大概要在2000左右才好，甚至更高。
30%这个，我没概念 |
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d********6
发帖数: 76 | 24 DNA要先除盐，可以用乙醇沉降或者过NAP柱子。
如果想取得比较好的效果，可以在sample溶液里加入少量的 dowex resin (NH4+ form)
，进一步除盐。
用HPA做matrix的时候，你会看到matrix成一簇一簇的针状，所有的针状末端汇集在一
起，laser最好打在这些针状晶体汇集的地方比较容易出峰。 |
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d********6
发帖数: 76 | 25 方法可以选择linear mode，linear后面的数字表示分子量的大小，最好比较接近你
sample得分子量。 |
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K****l
发帖数: 861 | 26 谢谢，谢谢...
我明天按照你们的建议再试试... |
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K****l
发帖数: 861 | 27 谢谢你的建议...
这两天再试试...
也就注意过这些，其他的没仔细看过。主要是这方法也是从以前人那里直接拷贝过来用
的。 |
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L****r
发帖数: 333 | 28 这个我做的比较多， 根本不用desalting，直接做， 峰型非常好， 请参阅Nucleic
Acids Research, 1993, Vol. 21, No. 14. |
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K****l
发帖数: 861 | 32 赞...刚才没用页码随便google了一下就搜到这篇文章
看来是篇经典之作啊...
谢谢 |
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h*****e
发帖数: 1330 | 33 Desalting and concentrating your sample,
Use negative mode because DNA is ionized in a negative molecular,
10000 DNA requires a higher energy to fly, so try high power.... |
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m********l
发帖数: 491 | 34 no need to desalt, just use appropriate matrix, such as THAP |
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b*******g
发帖数: 1309 | 35 imaging (very very hot!!)
and polymer analysis |
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d**o
发帖数: 2188 | 37 polymer is the best now |
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S********o
发帖数: 368 | 38 我咋听人说做大分子分析才是王道,小分子迟早都会被外包? |
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h*****t
发帖数: 1226 | 41 ESI can get better accuracy. |
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b*******g
发帖数: 1309 | 42 替老板发个非正式的广告吧
我们组有个postdoc的position， 需要马上fill， 一直都没找到合适的人选
需要有nanoparticle 跟mass spectrometry （MALDI） 背景的人？
最好马上就能工作
有意向的给我发个信吧
b***********[email protected]
A postdoctoral position is available starting immediately. The research is part of an NIH-funded project to study the cellular uptake of functionalized nanoparticles. We are developing new mass spectrometric approaches to track nanoparticles in cells and tissues. A strong background in mass spectrometry is required. The appointment will be initial... 阅读全帖 |
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x*****g
发帖数: 82 | 43 国内有机硕士毕业，博士期间的工作经历如下
Synthesis and characterization of Polymer & monomer, Modification functional
molecules to polymer scaffolds
The application of synthetic biocompatible polymers, like drug and gene
delivery
Operating Instrumentals, NMR, HPLC, GPC, MS (MALDI-TOF),TEM, Confocals IR,
DLS etc.
publication现在只有一篇jacs和国内时候发的几篇有机方向文章，还有4-5篇已经投出
或者即将投出。
明年五月份毕业，不知道能不能在毕业前找到位子，其实也想找工业的，但是自己口语
不好，没信心。
将来何去何从还没有打算。
罗嗦了一大堆，请大家给点建议，现在心里很忐忑，谢谢 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 44 Bruker Autoflex 3
250K-400K, 看你的配置跟service，以及关系 |
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K****l
发帖数: 861 | 46 4.6*50的柱子，一开始 A是12%-34.5% methanol，B是HFIP-TEA
0.5mL/m和1.0mL/m的流速都是试过
进样一般20ul，含1-3mole的样品
进空白几乎没有峰
接了峰去做MALDI，几乎就是进样的样品
而且只用buffer跑的话，也是瞬间下来。
看起来似乎是柱子出了问题，但是跑另外一个修饰过的DNA，出峰很正常~~
有方法判断是否柱子出问题了吗？
谢谢 |
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b*******g
发帖数: 1309 | 47 duo.... hen duo
half of MALDI market, and most FT-ICR-MS (>90% market) are produced by
Bruker
and 3D ion-trap is also from Bruker. |
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f*********e
发帖数: 1144 | 48 yup, maldi-tof(/tof) is dominated by Bruker, leave not many options |
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h********n
发帖数: 4079 | 49 我的意思是, 多数都是MALDI-TOF, 但我看到一个MS是Quadrupole TOF, 这个有啥特点
或者特别的原因要这样设计呢?
专业人士能不能给说说.
谢谢. |
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b*****r
发帖数: 203 | 50 MALDI-TOF can only do MS, Quadrupole TOF can do MS/MS. |
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