由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: gpcrs
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f********n
发帖数: 6465
1
来自主题: Biology版 - 讲个牛人做实验的事
农药的一个靶点,GPCR。
物种是一种虫。
c***o
发帖数: 35
2
来自主题: Biology版 - 很多人都在找的重要蛋白
rotten egg smell receptor 这个更奇怪了,跟GPCR好像没有任何关系,俺看到那个蛋
白的名字都晕了,不懂。

story
plasma
c***o
发帖数: 35
3
来自主题: Biology版 - 很多人都在找的重要蛋白
Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
-Induced Pruritus
这个不算?

story
plasma
c***o
发帖数: 35
4
来自主题: Biology版 - 很多人都在找的重要蛋白
rotten egg smell receptor 这个更奇怪了,跟GPCR好像没有任何关系,俺看到那个蛋
白的名字都晕了,不懂。

story
plasma
c***o
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5
来自主题: Biology版 - 很多人都在找的重要蛋白
Sensory Neuron-Specific GPCR Mrgprs Are Itch Receptors Mediating Chloroquine
-Induced Pruritus
这个不算?

story
plasma
c****l
发帖数: 1086
6
GPCR的结构有机会,Brian Kobilka有望
m******g
发帖数: 69
7
来自主题: Biology版 - 分生做到头
这个帖子对于一个即将要读生物PHD的人是个很大的打击。 我个人感觉随便找个人,在
实验室教他一个月,怎么cell culture, 怎们做western。只要有钱买抗体,就能做
cell signal的活。我现在觉得cell signal就是一个大大的坑!一看公司送来的signal
poster,他妈的全都有联系。从A一只能联系到Z,随便找个信号分子,做做induction
,看看pathway的key enzyme的变化,就可以下结论说,哦,这个分子影响这个pathway
,然后做做细胞功能assay,得出结论这个分子有神马功能。然后发现这个分子是蛋白
大家族的一员,有开始做其他成员的pathway,或者又发现个上游或者下游的调节因子
,然后又开始做这个因子的pathway,最后做做in vivo,KO mice,会玩的还会看看这
个分子在免疫细胞的作用。
然后做做siRNA,shRNA,FISH,IHC 说是这个东西是潜在的biomarker,又说mAb,si/sh-
RNA可能成为治疗某种疾病的手段。
我感觉太胡掰了,简直是自己给自己讲故事。天天MAPK.NF-KB,AP1,GP... 阅读全帖
c*********7
发帖数: 148
8
来自主题: Biology版 - 你不能只知道华人生物学家zz
赞一个!
说说一公吧,一公绝对是个很有才华的结构生物学家,只是他做的东西太广了。什么都
碰一点,提到一公很难想得到一个完完全全属于他的领域。GPCR大家都知道是Kobilka
和Raymond,钾离子通道大家都知道是Roderick MacKinnon,转录翻译complex也是想到
Roger Kornberg,TCR MHC想到Ian Wilson,cytokine receptor想到KC Garcia,HIV
抗体想到Peter kwong,Wane hendrickson 或者Bjorkman...
s******c
发帖数: 331
9
来自主题: Biology版 - 你不能只知道华人生物学家zz
忍不住继续歪。
做生物的,有hot的领域,也有传统的领域,在hot的领域也不是都能做的很牛,
membrane protein的crystal structure很牛吧,可是发一堆bacteria的或古菌的
membrane protein结构,哪怕都能发NCS,又怎样?别人只能惊叹你有钱,如果你发
GPCR的,真核的channels,transporters,那才算本事。就像fashion一样,你花个1,
2K去买个burberry的格子包包,就觉得自己有品味了?No..... 至少也得是burberry
prorsum级别的才算。
i****g
发帖数: 3896
10
来自主题: Biology版 - 11gong cns大灌水
施一公主动邀请Brian Kobilka在清华建实验室,是不是想近水楼台学学如何解GPCR的
结构?毕竟他解的那些细菌膜蛋白结构虽然容易发CNS,但没太大现实意义,也不容易
被人重视。

一公都到了这个程度了还把精力全部放在灌cns了,眼界小了点。
他这个人很聪明,但是精力也是有限的,如果满眼都是为了发cns,在国内取得地位甚
至走仕途,
那就浪费了他的聪明。如果把有限的精力放在解决一些最基本最重大的问题上,说不定
能出大成就。
不过他从读书开始走到现在这个地位,基本上是拜cns所赐。所以崇拜cns也是可以理解。
但我总觉得那是薄厚更该关心的。
l**********1
发帖数: 5204
11
RE: 德艺双馨的楼主
please go to
//www.creativebiomart.net/description_10243_28.htm
You Position: Home >> Antibody >> Polyclonal Antibody >> Rabbit PAb >> Anti-Cdh5 PAb
Anti-Cdh5 PAb
Cat. No.
CPB-133RM
>
Immunogen
Recombinant mouse CDH5 protein.
Antibody Type
Rabbit Polyclonal Antibody.
Ig Type
Rabbit IgG.
Formulation
0.2 μm filtered solution in PBS with 5% trehalose
Preparation
Produced in rabbits immunized with purified, human cell-derived, recombinant mouse CDH5 extracellula... 阅读全帖
s*******e
发帖数: 1010
12
来自主题: Biology版 - 吐槽一下这期的nature
这是四种结构呀,而且和成瘾与止痛相关的GPCR,任何单独一篇都是有意义的文章。
b******k
发帖数: 2321
13
来自主题: Biology版 - Interesting article on biotech jobs
筛选本身问题不大 问题是target出来的速度越来越慢吧。这个也不奇怪,low hanging
fruit都吃完了,下来的要么是根本没有单一target,要么是target很难被target(不再
是GPCR,kinase这种的了)。
s******m
发帖数: 255
14
替朋友发的,请不要发站内信给我。
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
博雅干细胞科技有限公司是一家于2009年成立、位于无锡的的民营企业,注册
资本一亿人民币,2012年营业额预计5000-6000万。
博雅干细胞是一个国际化的企业:董事长、总裁、副总、首席科学家、技术总监
等均为留学归国人员。当前主营业务为干细胞的存储和技术开发、基于GPCR的新
药创制。公司目前处于快速成长期,一个由公司建设并运营的亚洲最大的干细胞
库将于2012年底竣工。
为进一步增强自身的科研力量,公司的研发中心拟引进三名从事干细胞研究的
“海归”。申请者需要有PhD或MD,或者有硕士学位并有两年以上干细胞研究的
经验。薪资和fringe benefits高于民营企业平均水平。公司实行人人持股机制,
并计划于2014年上市。有意者请发简历至:
h******[email protected] (Senior Scientist, Hao Wang)
l*********[email protected] (HR Director, Lillian Guo)
谢谢!
e****s
发帖数: 1125
15
我没什么经验,瞎扯下,
GPCR glycosylation也会让样品跑成Smear。 有没有报道D2R的glycosylation比较厉害
l**********1
发帖数: 5204
16
pls try Monte Carlo Markov Chain Stochastic simulation
因为目前的技术无法在deterministic 纳米反应酶动力学 确定 PAM or NAM or even
both.
One reference:
Trzaskowski B et al. (2012)
Action of molecular switches in GPCRs--theoretical and experimental studies.
Curr Med Chem. 19: 1090-109.
PubMed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22300046
Ps:
具体啥叫 Markov Chain model
pls 考古本版 下
发信人: kdfox11 (狂奔的蜗牛), 信区: Biology
标 题: Re: 感慨一下数学/物理 和 生物 合作之难
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 3 14:21:33 2012, 美东)
如果你想用马尔可夫过程来表示因果关系,也很简单,就是... 阅读全帖
a*****x
发帖数: 901
17
Gs alpha。有什么检测方法?集思广益一下。多谢各位大牛。
a*****x
发帖数: 901
18
自己顶一下
s****9
发帖数: 932
19
Gs is limited. You overexpressed another well-known Gs-coupled protein to
see whether it can interfere your gene expression.
s******y
发帖数: 28562
20
哇靠,这个问题超过了我的专业范围,我只能大概就我知道的其他文章的例子
来建议一下吧。
要检测是否通过G protein, 无非就是这么几个思路:
1. G-protein specific inhibition: non-hydrolyzable GTP analog, GEF analog,
Knockdown of G-protein.
2. G protein dominant negative mutant
3. G protein dominant positive mutant
4. Or if you know something is in the middle of a pathway, you can also cut
off that middle player with methods similar as above.
a*****x
发帖数: 901
21
多谢!G protein dominant positive mutant没有听说过,是哪个reference?
non-hydrolyzable GTP analog和GDP analog我以前常用。但是它们不能穿过细胞膜,
所以用在看基因表达的实验有点困难。
s******y
发帖数: 28562
22
dominant positive mutant需要做screening 的,除非你有这个资源,不然不要
自己做。一般就是直接查文献看看你关心的那个蛋白有没有人做过。
大体思路就是,其实GTP什么的就是用电荷来改变蛋白结构嘛,所以干脆把相关
binding pocket 的氨基酸给突变加上负电荷,有时候是可以产生dominant positive
s******y
发帖数: 28562
23
另外,non-hydrolyzable GTP analog和GDP analog,你难道不能用脂类包埋的
方式来辅助过膜么?要确认是否成功过膜也比较简单,同时放点可溶的荧光分子
就好了。
m***i
发帖数: 4637
24
PI3P/2P level ?
a*****x
发帖数: 901
25
试过,不work。文章里有先permeablize cell的,但觉得动作太大了,会引起很多
artifact,尤其我们要看的readout还很慢。
s******y
发帖数: 28562
26
那就比较麻烦了。
先看看有没有人做过你们用的Ga的突变体吧。
另外,要证明是否artifact 还是可以的,关键是要做好control experiments,
比方说用普通的GTP 进行对照。我也知道有人用microinjection 的方法来做的,
但是这个方法一样是artifact非常严重,关键是要作好对照。
a*****x
发帖数: 901
27
我们以前就是inject的,但是readout很快,而且是单细胞readout,作了很多control。
用permeablized的方法主要担心细胞活不了这么久。。。
s******y
发帖数: 28562
28
在我听来的印象中,permeablize 的方法并不比injection harsh 多少。
a*****x
发帖数: 901
29
也许。但是之前是inject后几分钟就可以看到变化或者做测试,这里要几十个小时。。。
p*****e
发帖数: 93
30
two isoforms for Gas; short one, GasQ213L; long one, GasQ227L. these are
constitutive active mutants. Dominant negative mutants, GasQ213L/D281N and
GasQ227L/D295N. you can buy from www.cDNA.org
p*****e
发帖数: 93
31
but, I personally think the knockdown is the best way.
s******y
发帖数: 28562
32
他建议的是knockdown 不是knockout :)
s******y
发帖数: 28562
33
狂赞,还是内行人的意见比较靠谱。

and
a*****x
发帖数: 901
34
多谢多谢。给你发包子

and
l**********1
发帖数: 5204
35
看错啦 matrix
作为将功补过
LZ
pls refer
Castellone MD et al. (2005)
title:
Prostaglandin E2 Promotes Colon Cancer Cell Growth Through a
Gs-Axin-b-Catenin Signaling Axis
Science. 310: 1504-10.
its Fig. 2B
PubMed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16293724
M*****e
发帖数: 279
36
Try toxins, such as PTX, CTX
d******u
发帖数: 99
37
来自主题: Biology版 - 王晓东:种好改革试验田
张大鹏的那个虽然有人质疑,但是他之后在plant cell和plant phys又有后续文章,从
遗传学上证明可能的确有通过镁敖合酶受体的ABA信号通路。马博主要是被陈金贵给坑
了,那哥们发了几个小文章到处说gcr2不是aba receptor,突变体没有表型什么的。
前年那个系列的受体真实性肯定没问题,从结构到体外重组aba信号通路都做了,不过
对于中国学者的两个受体现在一棍子打死也还有点早。
话说09年Sarah Assaman发了个cell说一个gpcr是aba 受体,最近有人又发文章质疑了
,说突变体没表型。
aba表型有时候比较tricky,种子萌发,时间长点短点,光强点弱点,可能就会看到或
者看不到表型,所以都不好讲。科学还是要百家争鸣吧。
a*****x
发帖数: 901
38
控制expression或者activity的很多,但是有控制degradation的吗?
s******y
发帖数: 28562
39
有啊。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1995 Nov 21;92(24):11259-63.
Signal-induced degradation of I kappa B alpha requires site-specific
ubiquitination.
Scherer DC, Brockman JA, Chen Z, Maniatis T, Ballard DW.
Source
The inhibitor protein I kappa B alpha controls the nuclear import of the
transcription factor NF-kappa B. The inhibitory activity of I kappa B alpha
is regulated from the cytoplasmic compartment by signal-induced proteolysis.
Previous studies have shown that signal-dependent phosphorylation ... 阅读全帖
s******y
发帖数: 28562
40
具体哪个我不知道,但是应该是由外部信号控制的。
s******y
发帖数: 28562
41
在我模糊的记忆中(大学时候学的了。。。)
貌似是TNF receptor
p*****e
发帖数: 93
a*****x
发帖数: 901
p*****e
发帖数: 93
44
1.
CARMA3 deficiency abrogates G protein-coupled receptor-induced NF-κB
activation
Brian C. Grabiner1,5, Marzenna Blonska1,5, Pei-Chun Lin1, Yun You1, Donghai
Wang4, Jiyuan Sun1, Bryant G. Darnay2, Chen Dong3, and Xin Lin1,6
2.
MEKK3 is required for lysophosphatidic acid-induced NF-kappaB activation.
Sun W, Li H, Yu Y, Fan Y, Grabiner BC, Mao R, Ge N, Zhang H, Fu S, Lin X,
Yang J.
3.
Bcl10 plays a critical role in NF-κB activation induced by G protein-
coupled receptors
Donghai Wang * , † ... 阅读全帖
a*****x
发帖数: 901
45
你是说ikBa的降解?老实说那个数据真的没有什么说服力。。。不过多谢了!

Donghai
p*****e
发帖数: 93
46
? Ok, see figure 4C in the following paper.
The Lysophosphatidic Acid 2 Receptor Mediates Down-regulation of Siva-1 to
Promote Cell Survival*
Fang-Tsyr Lin ‡ 1 , Yun-Ju Lai ‡ 2 , Natalia Makarova § , Gabor
Tigyi § and Weei-Chin Lin
f*****r
发帖数: 993
47
他们是师徒吧, 八十年代末就开张了, 干的太好了, 不给奖都不行. 前年和其他几个朋
友聊天, 有两个也拿到了几个GPCR的晶体, 忙着分析. 看看这两年koblika发的一标的
nature, 估计在往这里挤, 铁定没戏.
m***i
发帖数: 4637
48
来自主题: Biology版 - 这次也是博后获奖吧
不过网页上指的是
The study of Gpcr
不单指结构

★ 发自iPhone App: ChineseWeb 7.5
m*b
发帖数: 1421
49
来自主题: Biology版 - 这次也是博后获奖吧
koblika在解出结构前也是gpcr领域的大拿吧
s****m
发帖数: 472
50
They were the first ones to clone the gene of Adrenergic receptors!
Also the beta-arrestin signaling in addition to the traditional G protein
signaling from GPCRs.
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