发帖数: 1 | 1 如果没有价值,也不会有这么多实验室在重复。可以考虑一下原理,就是生物体抵御外
源DNA的机制,NGAGO似乎组装上合适的gDNA很困难,组装后则很难解离重新利用,保证
表达后正确组装应该是关键点。 |
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发帖数: 1 | 2 不是已经公布了一个了吗?
1. 仇子龙
其他的都在闷声发大财吧。敲个老鼠,发篇Cell,敲个猪,发篇Cell Reports;用病毒
导入gDNA,发篇Nature;做个screen,还能再发篇Science,都精明着呢,现在谁出来
说。别灌水了,快去搬砖吧,谁先做出来谁先发大文章呗。仇子龙敢公开宣布,估计是
文章已经投出去了,不怕scoop。 |
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发帖数: 1 | 3 郑 重 声 明
作者:河北科技大学 | 发布日期:2016-06-20 09:13:00
2016年5月2日,英国《自然生物技术》杂志(Nature Biotechnology)刊发了我校韩春
雨教授团队发明的一种基因编辑技术NgAgo-gDNA,引发国内外广泛关注。在此,我校郑
重声明:
我校以及韩春雨教授本人未委托任何培训机构或个人开展“NgAgo基因编辑技术” 有关
的培训工作。任何机构或个人发布相关信息,均与本校及韩春雨教授本人无关。
特此声明。 |
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g********0 发帖数: 6201 | 4 【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: Mayingba (吳鐘學), 信区: Military
标 题: 中国新闻周刊:新晋“网红科学家”韩春雨:科学其实是一件非常酷的事情
发信站: BBS 未名空间站 (Sat Jul 23 08:42:36 2016, 美东)
【一个偏安河北科技大学的副教授,一鸣惊人地发表了一项“诺贝尔级”的实验成果,
韩春雨从学术圈的“泛泛之辈”一跃成为“诺贝尔奖级别的科学家”。他自嘲“连续十
年没有发过文章了,以前就算有点战绩,也就那样了”。】
韩春雨(摄影:董洁旭)
一个从没有海外留学背景的副教授,偏安河北科技大学,却一鸣惊人地发表了一项“诺
贝尔级”的实验成果,而他自己也因此成为了“网红”科学家。
“河北科技大学、一个副教授、连续十年没有发过文章了,以前就算有点战绩,也就那
样了。说要把文章发到通常只向哈佛、耶鲁、北大、清华、浙大敞开大门的顶端学术平
台,没人信啊,就高峰傻,傻了就信了。”韩春雨对《中国新闻周刊》自嘲地说。
此时,他正在河北科技大学分子药物学研究室里,多家媒体在排着队等待采访这个新晋
的“网红科学家”。他的学生高峰,... 阅读全帖 |
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y****i 发帖数: 2108 | 5 "网红"学者韩春雨:正在持续实验 将适时公开验证
2016年08月02日21:23:35 [新闻大杂烩]
中国学者韩春雨团队的诺奖级实验,近日引起一些人质疑。质疑者认为这种新的基因编
辑技术不能重复试验,为此围攻韩春雨为“造假者”,但拥挤韩春雨的也大有人在。针
对这些激烈讨论,“中国网事”记者展开调查。Mitbbs.com
2016年5月2日,河北科技大学副教授韩春雨作为通讯作者在国际顶级期刊《自然·生物
技术》(Nature Biotechnology)杂志上发表了一篇研究成果。他的团队发明了一种
新的基因编辑技术——NgAgo-gDNA,向已有的最时兴技术CRISPR-Cas9发起了挑战。
CRISPR-Cas9被认为是第三代基因编辑技术,近些年来一直是诺贝尔奖的热门。Mitbbs
.com
此后,韩春雨被媒体广泛关注,被网民称为“网红”科学家,并被广大网民誉为“寒门
”学者的典范。Mitbbs.com
此后不久,有人提出韩春雨的试验无法重复,有人说可以重复,争论不休、难有定论。
7月29日,此前曾宣布可以重复韩春雨实验结果的澳大利亚国立大学研究者盖坦·布尔
焦称,尽管他和同事在过... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 6 质疑是科学研究不断前进的动力
作者:熊丙奇
2016-08-01北京青年报
河北科技大学副教授韩春雨震惊全球学术界的新基因编辑技术NgAgo-gDNA,
正遭遇越来越多的质疑。从5月2日他的论文发布在《自然-生物技术》网络版之
后,到现在为止,全球仍没有一家实验室对外宣布,能够完全成功重复韩春雨的
实验。现在已有多国科学家要求《自然-生物技术》介入调查,并公开韩春雨实
验中的所有原始数据和实验条件。
一项新技术诞生,同行对其可行性进行重复实验,并根据实验效果对技术进
行质疑,这是太正常不过的事。这样的质疑在科学研究中屡见不鲜,有的质疑推
进了技术的完善、进步,而有的质疑,则发现研究者学术造假、伪造数据,不管
是哪一种结果,这都对学术研究有利无弊。前者推进科学研究进步,后者则纯净
学术研究的环境。
韩春雨和其所在学校应该有直面质疑的常识和勇气。据报道,面对质疑,韩
春雨把质粒信息上传到一家全球科学家质粒共享的非盈利组织——addgene,在
协和讲座发放质粒,“对自己实验的重复性还是很有胆气的”,而之前,他还针
对方舟子的质疑文章,进行了较为详细的回应,强调NgAgo系统对污染特别敏感,... 阅读全帖 |
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m****a 发帖数: 270 | 7 没道理,因为韩春雨同志曾经说过
“按照讲座说的,完全按照supplementary data里面general protocol做,能重复出来
。”
他还曾经教导我们:
“照着Protocol of NgAgo/gDNA-mediated genome editing and examination (T7E1
assay) and a representative experiment来一遍,做出来好像也没那么难。有那么难
?按北大讲座说的直接做gfp doner NHEJ knock in,3天能直接能
看见插入表达”
如果这些都做不出来那你就别做分子生物学了,直接转行吧。 |
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发帖数: 1 | 8 你说没道理,那绝对肯定没道理了。哈哈
: 没道理,因为韩春雨同志曾经说过
: “按照讲座说的,完全按照supplementary data里面general protocol做,能重
复出来
: 。”
: 他还曾经教导我们:
: “照着Protocol of NgAgo/gDNA-mediated genome editing and examination (
T7E1
: assay) and a representative experiment来一遍,做出来好像也没那么难。有
那么难
: ?按北大讲座说的直接做gfp doner NHEJ knock in,3天能直接能
: 看见插入表达”
: 如果这些都做不出来那你就别做分子生物学了,直接转行吧。
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c********n 发帖数: 225 | 9 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
暂只收录包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)的发布报告
第一则
- 发布方:Dr. Davide Seruggia
- 发布时间:2016年6月23日 至2016年7月20日
- 发布平台:google groups
- 发布方国家:美国
- 发布方城市:Boston
- 发布方研究机构:Boston Children's Hospital
- 实验室PI:Dr. Davide Seruggia
- NgAgo的来源:Addgene
- 重复及验证实验结果:
o 重复文章中的NgAgo/gDNA - GFP实验不成功 (对比实验Cas9 –“dramatic
reduction”)
o 拓展实验inject embryos - ”pups with no phenotype, no indels”
- 重复及验证详细信息: oligo来源及用量,实验简介,实验结果简汇
- 实验数据发... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 10 鉴于在韩春雨实验室2016年8月8日于Addgene更新了实验流程 (Note-1)之后,
已有具有可靠科研训练基础及科研诚信度的研究人员们,在2016年8月8日之前重复验证
NgAgo基因组编辑功能失败之后,宣布基于韩春雨实验室更新发布的试验流程,开始重
新实施重复验证实验。
“【记录历史】谁重复验证了NgAgo?”将持续跟进。
特例留档:
由于以下关于NgAgo重复验证实验的发布情况比较特殊,发布人背景未知,特于其发布
人实验结果完全公布之前,留档记录
- 2016年8月8日,joshhaha@mitbbs在mitbbs biology 版发布了“如何验证韩春雨
老师的NgAgo编辑基因作用?虚心学习”的文章 (Note-2)。发布人宣称正在使用“韩
老师送来的NgAgo DNA (N)”进行重复验证实验。
- 按其发布的实验设计相关细节,并未遵循韩春雨实验室于2016年8月8日在Addgene
更新的实验流程。
- 于2016年8月13日,[email protected]/* */更改了原始发布信息,删除了NgAgo DNA来源
以及删除并更改了一... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 11 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Yuichiro (Ichi) Miyaoka 宮岡佑一郎 博士
- 发布时间:2016年8月16日
- 发布平台:twitter
- 发布方国家:日本
- 发布方城市:东京
- 发布方研究机构:Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science東京都医
学総合研究所
- 实验室PI:Dr Yuichiro (Ichi) Miyaoka 宮岡佑一郎 博士
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
- 应用验证实验详细信息:
−参考2016年8月8... 阅读全帖 |
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m****a 发帖数: 270 | 12 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具
体信
息的发布报告
信息简述:
- 发布方:蔡宇伽 博士
- 发布时间:2016-8-17
- 发布平台:科学网
- 发布方国家:丹麦
- 发布方城市:Aarhus
- 发布方研究机构:Aarhus University
- 实验室PI:JACOB GIEHM MIKKELSEN
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
- ... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 13 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Thomas DANIELE
- 发布时间:2016年8月16日
- 发布平台:wormbase forum
- 发布方国家:Austria 奥地利
- 发布方城市:Vienna 维也纳
- 发布方研究机构:Research Institute of Molecular Pathology (IMP)学総合研
究所
- 实验室PI:Dr. Cochella
- NgAgo的来源:Synthetic codon optimized NgAgo
“NgAgo DNA sequence has been taken directly from Entrez NCBI, then codon
o... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 14 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Dr Gaetan Burgio*
- 发布时间:2016年8月26日
- 发布平台:twitter,medium.com
- 发布方国家:澳洲 Australia
- 发布方城市:Canberra
- 发布方研究机构:JCSMR,ANU College of Medicine, Biology and Environment
- 实验室PI:Dr Gaetan Burgio
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
作者特别声明
1.是在“mouse zygote”系统应用的NgAgo,是作者实验室非常熟悉的系统,无... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 16 特别记录
Date:2016年9月9日
Title:韩春雨基因编辑项目获国家自然科学基金资助:两年100万元
Link:
http://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_1526501
Key points:
1. 澎湃新闻 文章
(原文引用)
从国家自然科学基金委员会官网查询发现,韩春雨作为项目负责人的《NgAgo-gDNA基因
编辑技术的完善及应用探究》项目已经获批100万元,项目起止年月为2017年1月至2018
年12月
编者注:
韩春雨(河北科大)凭借韩春雨NBT文章NgAgo基因编辑功能,获得的中国政府资金款项:
1. 河北省发改委, 2.24亿RMB
其中,隶属于财政部的中国政府采购网发布的信息
- 采购进口仪器设备招标预算 1958万RMB
- 已于2016年8月31日获取招标文件
- 2016年9月21日开标
2. 中国国家自然科学基金, 100 万元RMB
- 项目起止年月为2017年1月至2018年12月 |
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c********n 发帖数: 225 | 17 特别记录
Date:2016年9月9日
Title:方舟子“向国家自然科学基金委员会举报河北科技大学韩春雨”
Link:
http://fangzhouzi.baijia.baidu.com/article/619996
Key points:
1. 韩春雨凭借NBT论文NgAgo基因编辑功能而获得来中国国家自然科学基金资助,项目
批准号31650002,项目名称为《NgAgo-gDNA基因编辑技术的完善及应用研究》,批准金
额100万元,项目起止年月2017-01至2018-12
2. 由于韩春雨NBT论文NgAgo基因编辑功能至今为止,世界各地没有科学家能够重复,
以及综合分析其他一些原因,此项技术是不真实不可靠的,可以判断是有意造假嫌疑。
3. 方舟子实名向国家自然科学基金委员会举报河北科技大学韩春雨,并提出了建议,
由国家自然科学基金委员会监督委员会组成独立调查组进行调查。 |
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c********n 发帖数: 225 | 18 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
暂只收录包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)的发布报告
第一则
- 发布方:Dr. Davide Seruggia
- 发布时间:2016年6月23日 至2016年7月20日
- 发布平台:google groups
- 发布方国家:美国
- 发布方城市:Boston
- 发布方研究机构:Boston Children's Hospital
- 实验室PI:Dr. Davide Seruggia
- NgAgo的来源:Addgene
- 重复及验证实验结果:
o 重复文章中的NgAgo/gDNA - GFP实验不成功 (对比实验Cas9 –“dramatic
reduction”)
o 拓展实验inject embryos - ”pups with no phenotype, no indels”
- 重复及验证详细信息: oligo来源及用量,实验简介,实验结果简汇
- 实验数据发... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 19 鉴于在韩春雨实验室2016年8月8日于Addgene更新了实验流程 (Note-1)之后,
已有具有可靠科研训练基础及科研诚信度的研究人员们,在2016年8月8日之前重复验证
NgAgo基因组编辑功能失败之后,宣布基于韩春雨实验室更新发布的试验流程,开始重
新实施重复验证实验。
“【记录历史】谁重复验证了NgAgo?”将持续跟进。
特例留档:
由于以下关于NgAgo重复验证实验的发布情况比较特殊,发布人背景未知,特于其发布
人实验结果完全公布之前,留档记录
- 2016年8月8日,joshhaha@mitbbs在mitbbs biology 版发布了“如何验证韩春雨
老师的NgAgo编辑基因作用?虚心学习”的文章 (Note-2)。发布人宣称正在使用“韩
老师送来的NgAgo DNA (N)”进行重复验证实验。
- 按其发布的实验设计相关细节,并未遵循韩春雨实验室于2016年8月8日在Addgene
更新的实验流程。
- 于2016年8月13日,[email protected]/* */更改了原始发布信息,删除了NgAgo DNA来源
以及删除并更改了一... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 20 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Yuichiro (Ichi) Miyaoka 宮岡佑一郎 博士
- 发布时间:2016年8月16日
- 发布平台:twitter
- 发布方国家:日本
- 发布方城市:东京
- 发布方研究机构:Tokyo Metropolitan Institute of Medical Science東京都医
学総合研究所
- 实验室PI:Dr Yuichiro (Ichi) Miyaoka 宮岡佑一郎 博士
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
- 应用验证实验详细信息:
−参考2016年8月8... 阅读全帖 |
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m****a 发帖数: 270 | 21 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具
体信
息的发布报告
信息简述:
- 发布方:蔡宇伽 博士
- 发布时间:2016-8-17
- 发布平台:科学网
- 发布方国家:丹麦
- 发布方城市:Aarhus
- 发布方研究机构:Aarhus University
- 实验室PI:JACOB GIEHM MIKKELSEN
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
- ... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 22 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Thomas DANIELE
- 发布时间:2016年8月16日
- 发布平台:wormbase forum
- 发布方国家:Austria 奥地利
- 发布方城市:Vienna 维也纳
- 发布方研究机构:Research Institute of Molecular Pathology (IMP)学総合研
究所
- 实验室PI:Dr. Cochella
- NgAgo的来源:Synthetic codon optimized NgAgo
“NgAgo DNA sequence has been taken directly from Entrez NCBI, then codon
o... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 23 第四类“重复” 验证实验信息:实名, 网络、论坛发布
- 重复、拓展验证实验不能支持NgAgo基因组编辑功能
- 包含有具体实验信息(eg实验材料,步骤,etc)以及发布方具体信
息的发布报告
- 需包含发布时间
- 建议注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Dr Gaetan Burgio*
- 发布时间:2016年8月26日
- 发布平台:twitter,medium.com
- 发布方国家:澳洲 Australia
- 发布方城市:Canberra
- 发布方研究机构:JCSMR,ANU College of Medicine, Biology and Environment
- 实验室PI:Dr Gaetan Burgio
- NgAgo的来源:Addgene
- 应用验证实验结果: 无法验证韩春雨NgAgo基因编辑的实验结果
作者特别声明
1.是在“mouse zygote”系统应用的NgAgo,是作者实验室非常熟悉的系统,无... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 25 特别记录
Date:2016年9月9日
Title:韩春雨基因编辑项目获国家自然科学基金资助:两年100万元
Link:
http://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_1526501
Key points:
1. 澎湃新闻 文章
(原文引用)
从国家自然科学基金委员会官网查询发现,韩春雨作为项目负责人的《NgAgo-gDNA基因
编辑技术的完善及应用探究》项目已经获批100万元,项目起止年月为2017年1月至2018
年12月
编者注:
韩春雨(河北科大)凭借韩春雨NBT文章NgAgo基因编辑功能,获得的中国政府资金款项:
1. 河北省发改委, 2.24亿RMB
其中,隶属于财政部的中国政府采购网发布的信息
- 采购进口仪器设备招标预算 1958万RMB
- 已于2016年8月31日获取招标文件
- 2016年9月21日开标
2. 中国国家自然科学基金, 100 万元RMB
- 项目起止年月为2017年1月至2018年12月 |
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c********n 发帖数: 225 | 26 特别记录
Date:2016年9月9日
Title:方舟子“向国家自然科学基金委员会举报河北科技大学韩春雨”
Link:
http://fangzhouzi.baijia.baidu.com/article/619996
Key points:
1. 韩春雨凭借NBT论文NgAgo基因编辑功能而获得来中国国家自然科学基金资助,项目
批准号31650002,项目名称为《NgAgo-gDNA基因编辑技术的完善及应用研究》,批准金
额100万元,项目起止年月2017-01至2018-12
2. 由于韩春雨NBT论文NgAgo基因编辑功能至今为止,世界各地没有科学家能够重复,
以及综合分析其他一些原因,此项技术是不真实不可靠的,可以判断是有意造假嫌疑。
3. 方舟子实名向国家自然科学基金委员会举报河北科技大学韩春雨,并提出了建议,
由国家自然科学基金委员会监督委员会组成独立调查组进行调查。 |
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c********n 发帖数: 225 | 27 实例记录 - 第三类信息, 第三例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:SH Lee et al
- 发布时间:2016年11月28日
- 发布平台:Nature Biotechnology
- 发布方国家:韩国,德国,美国
- 发布方城市:见文章
- 发布方研究机构:
-Center for Genome Engineering, Institute for Basic Science (IBS), Seoul,
South Korea.
-Institute for Cell and Gene Therapy, Medical Center—Universit... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 28 实例记录 - 第三类信息, 第四例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Nay Chi Khin, Jenna Louise Lowe, Jensen M Lora, Gaetan Burgio
- 发布时间:2016年12月6日
- 发布平台:bioRxiv
- 发布方国家:澳大利亚
- 发布方城市:见文章
- 发布方研究机构:
John Curtin School of Medical Research, the Australian National University
- 实验室PI:Dr Gaetan Burgio
- NgAgo的来源:... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 30 实例记录 - 第三类信息, 第三例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:SH Lee et al
- 发布时间:2016年11月28日
- 发布平台:Nature Biotechnology
- 发布方国家:韩国,德国,美国
- 发布方城市:见文章
- 发布方研究机构:
-Center for Genome Engineering, Institute for Basic Science (IBS), Seoul,
South Korea.
-Institute for Cell and Gene Therapy, Medical Center—Universit... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 31 实例记录 - 第三类信息, 第四例
第三类“重复” 验证实验信息:实名,科研杂志发布
− 在科研杂志上实名发表的关于重复、验证NgAgo基因组编辑功能的文
章
− 需有具体实验设计流程描述,实验材料来源信息,实验数据及分析
− 需有citation link
- 需包含发布时间
- 需注明是否应用2016年8月8日韩春雨组在Addgene更新的Protocol的相关条件
信息简述:
- 发布方:Nay Chi Khin, Jenna Louise Lowe, Jensen M Lora, Gaetan Burgio
- 发布时间:2016年12月6日
- 发布平台:bioRxiv
- 发布方国家:澳大利亚
- 发布方城市:见文章
- 发布方研究机构:
John Curtin School of Medical Research, the Australian National University
- 实验室PI:Dr Gaetan Burgio
- NgAgo的来源:... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 33 【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
项目 结题
date: 2017年8月2日
updated: 2017年8月4日
Note2017080401: added a few notable reviews/summaries
---------------------------------------
- NBT retraction note:
http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n7/full/nbt.3547.html#correction2
原文引用
“Retracted online 02 August 2017
We are retracting our study because of the continued inability of the
research community to replicate the key results in Figure 4, using the
protocols provided in our paper. In this figure we report that the
Natro... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 34 我手里用的是韩老师送来的NgAgo DNA (N).
1。 我们设计了CAS9-gRNA plasmid (C) & Podicin promotor-GFP plasmid (P) using
lipo-fectamine 2000 co-transfection into podocyte. Podicin is only
specifically and weakly expressed in podocyte.当然,我们也加了neomycin选择.
按照设计思想,只有Podicin promotor-GFP 正确编辑插入,才可以看见绿色。我们确
实可以看见微弱绿色荧光。基本吻合设计思路。
2。然后我把 NgAgo&gDNA & (P) using co-transfection into podocyte.
我们也可以看见微弱的绿色。
请问, 下一步应该怎么验证?请详细说明。不要乱喷。我是做实验。
希望可以有所发现
非常感谢! |
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m****a 发帖数: 270 | 35 下一步你可以照韩老师NBT文章 supplementary data里面general protocol (Protocol
of NgAgo/gDNA-mediated genome editing and examination (T7E1 assay) and a
representative experiment) 来一遍。
里面有非常详细的说明。
using
. |
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发帖数: 1 | 36 新的实验步骤有几处更改,其中包括“血清品牌由 Hyclone 变更
为 Gibco”,“293T细胞贴壁不牢,换液时要小心操作”,“溶解和稀释质粒及
gDNA 的缓冲液变更为水(pH 8.0)
实在忍不住爆下粗口,我操,耍人也要有点诚意行吗?joshhaha,替我问候下你老婆,
等你身败名裂了,也许出于人道主义我可以出钱让你家隔壁老王照顾她一下。 |
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m****a 发帖数: 270 | 37 其他部分大同小异,贴一下关键的note部分
Note:
1. NgAgo/gDNA system is extremely sensitive to contamination of
intracellularbacteria (including mycoplasma) which are widespread
and leave no visible signs of presence. Carefully excluding the
presence of intracellular bacteria before performing experiments.
2. Because Agos need magnesium, avoid EDTA when detaching and seeding cells
into the plates for transfection. Alternatively, supplementing Mg 2+ to 5 mM
(may need optimization to your cell type).
3. Avoid using L... 阅读全帖 |
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m****a 发帖数: 270 | 38 你要是觉得这个是新的,只能说你没好好读过韩老师的论文。整个figure 2都在讲这件
事情。
gDNA |
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c********n 发帖数: 225 | 39 总结2016.08.08【记录历史】谁重复验证了NgAgo?
引子
我们生活在一个幸运的时代,我们生活在一个变化的时代。
历史就在我们每一天不经意的时候悄悄地留了下来。
世界各地的2016年都不同寻常,记录一下有些瞬间即逝的印记。
鉴于韩春雨实验室于2016年8月8日在Adgene更新了实验流程 (Note-1),
“【记录历史】谁重复验证了NgAgo?”
于2016年8月8日进行第一次汇总留档。
第一类:NgAgo可否编辑基因组?
- Yes!
- 匿名或无记名网络、论坛发布
- 共计 11则 (Note-2)
第二类:NgAgo可否编辑基因组?
- Yes?!Wait,but No!
- 实名网络、论坛发布
- 共计 3则
第三类:NgAgo可否编辑基因组?
- Yes or No
- 实名科研杂志发布
- 共计 0则
第四类:NgAgo可否编辑基因组?
- No
- 实名网络、论坛发布
- 共计 2则(Note-3)
第五类:NgAgo可否编辑基因组?
- No
- ... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 40 【记录历史】NgAgo’2016 - Milestones Draft#1 2016.08.25
2016年夏天,大规模重复验证NgAgo基因编辑功能的各种信息,在网络上不断
地更新着, 大部分是不可重复的困惑,至今还没有正式的可重复的实验结果
的报道。
为了以后有兴趣的人们可以更好地了解和回顾这次“事件”的进程,记录一下
一些比较重要的milestones
第一阶段:
o记录draft日期:2016.08.25
o记录从NBT paper 上线 2016.05.02 到“火锅哥”的重复实验信息 发布于
2016.07.15
第一阶段Milestone记录简述:
Date:2016年5月2日
Title:DNA-guided genome editing using the Natronobacterium
gregoryi Argonaute
Link:
http://www.nature.com/nbt/journal/v34/n7/full/nbt.3547.html
Key Points:
- NBT paper 上线
Date:2016年05月26日(NBT paper 上线... 阅读全帖 |
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c********n 发帖数: 225 | 41 更新后的Note部分:
(NBT 原文里没有)
Note:
1.NgAgo/gDNA system is extremely sensitive to contamination of intracellular
bacteria (including mycoplasma) which are widespread and leave no visible
signs of presence. Carefully excluding the presence of intracellular
bacteria before performing experiments.
编者注:不能有细菌污染
2.Because Agos need magnesium, avoid EDTA when detaching and seeding cells
into the plates for transfection. Alternatively, supplementing Mg2+ to 5 mM
(may need optimization to your cell type).
编者注... 阅读全帖 |
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v********e 发帖数: 1597 | 43 已完成用韩春雨在自然生物技术所报道的NgAGO做基因敲除的实验,按照韩春雨提供的
Genbank号找到了序列,做了密码子优化,在蛋白N端加了V5标签,C端加了SV40核定位
信号,全基因合成了这个蛋白的基因序列克隆到了lenti病毒载体,用包装的病毒转导
了A549细胞,可以检测到蛋白表达,克隆了转导细胞拿到了稳定表达NgAgo的细胞系,
按照韩春雨文章中列出的方法设计了一对gDNA 靶向基因RNASEL的起始密码子区域,10
倍于韩春雨所示DNA的量转染细胞,48小时后克隆转染细胞,一共筛选了36个克隆,未
见到任何RNASEL敲除的表型,大家看着办吧,我做不出来 |
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c********n 发帖数: 225 | 44 Date:2016年9月9日
Title:方舟子“向国家自然科学基金委员会举报河北科技大学韩春雨”
Link:
http://fangzhouzi.baijia.baidu.com/article/619996
Key points:
1. 韩春雨凭借NBT论文NgAgo基因编辑功能而获得来中国国家自然科学基金资助,项目
批准号31650002,项目名称为《NgAgo-gDNA基因编辑技术的完善及应用研究》,批准金
额100万元,项目起止年月2017-01至2018-12
2. 由于韩春雨NBT论文NgAgo基因编辑功能至今为止,世界各地没有科学家能够重复,
以及综合分析其他一些原因,此项技术是不真实不可靠的,可以判断是有意造假嫌疑。
3. 方舟子实名向国家自然科学基金委员会举报河北科技大学韩春雨,并提出了建议,
由国家自然科学基金委员会监督委员会组成独立调查组进行调查。 |
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发帖数: 1 | 45 谢谢。
今天重新做了1-2小时的fpg incubation,最后得到了很好的预期的结果,就是(fpg -
mock)和 (fpg+ 样本)在qPCR后Ct有明显的3-4 cycle的差别。
然后把这些genomic DNA都跑了1%的gel ,如图。lane1(mock)和lane2(+fpg)是切一
小时的结果;lane3和lane4明显什么都没有,lane5是positive ctrl。
还是很惊讶nebuffer+BSA incubate genomic DNA overnight会导致DNA degradation;
另外如图里lane1和lane5都是标准的gDNA gel pattern就是有个23kb的sharp bands,
而lane2中因为fpg treat所以high-molecular-weight band都被切没了。不知道这解释
对不对 |
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v********a 发帖数: 646 | 46 以前去除基因组DNA,都是用DNASE消化之后,用酚-氯仿抽提。现在动辄就是十几个细
胞培养板,这种方式已经不合适。试用了几家的gDNA removal kit,效果都不是很理想。
请问,有没有一种简便可靠的方法,去除RNA里面的基因组DNA,并且不会残留DNASE污
染,影响下游cDNA合成? |
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f*******e 发帖数: 3433 | 47 这个给细胞治病是怎么回事?
http://news.sina.com.cn/c/nd/2016-10-31/doc-ifxxfysn8162532.shtml
发表论文 比肩诺奖
韩春雨,河北科技大学副教授。
今年5月,这位非名校的普通副教授,在国际顶级期刊《自然·生物技术》杂志发
表了一篇被称为可比肩诺奖的研究成果:发明了一种新的基因编辑技术——NgAgo,向
现有最时兴的CRISPR-Cas发起了挑战。
这一成果曾经轰动一时,韩春雨被称为“三无”科学家(指其无博士学位、无留学
背景、无院士头衔),成为网红,引发全国媒体前往报道。
但随后,又有一些科研人员指出,韩春雨的实验结果无法重复,韩春雨被指科研造
假,陷入舆论泥潭。
重复实验 谁成功了?
据《科技日报》报道,韩春雨曾对该报表示,如果没有做出实验的人实名出来,他
也愿意公布已经做出实验的另3人名单。随后,有13位科研人员公开称未做出实验,但
韩春雨拒绝公布已做出实验的人员名单。
韩春雨说,他并未有过这样的表态,是否公布另3人名单,是要看对方的意愿,而
别人不愿卷入此事件中。
后来,河北科技大学以官方名义公布,称有独立于该校之外的... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 48 http://news.sohu.com/20161101/n471949214.shtml
[摘要] 对于河科大恳请给予“多些时间的说法”,北京大学生命科学学院研究员魏
文胜提出,“这个实验的周期就两到三个星期,(韩春雨)想要证明,并不会花费太长
时间”。
时代周报记者 付聪 发自石家庄
纷扰半年的韩春雨谜题,谜底依然没揭开。
时至今日,打开河北科技大学生科院网站,一首《浣溪沙/贺韩春雨博士发明基因
剪刀》的词还挂在第三条,后面两条新闻也是关于半年前韩春雨因“诺奖级”发现的论
文发表在顶级刊物《自然·生物技术》(下称“《自然》”)期刊而扬名。五个月以来
,这位年轻学者又因为实验的可重复性而饱受质疑。
近日,12名科学家向《自然》期刊提交其实验结果,均与韩春雨的论文结果有所不
同。该期刊新闻发言人回应称,已收到关于韩春雨论文的多个意见,批评意见经同行评
议后,有可能会被刊登。
10月31日,前后十几通电话之后,时代周报记者终于联系上韩春雨本人。他对时代
周报记者表示,希望质疑的科学家能当面与他讨论。
“今年8月,校方突然停电造成了实验室的实验材料全部损坏,让我一直很被动。
”韩春雨语气... 阅读全帖 |
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o*******4 发帖数: 105 | 49 时代周报记者 付聪 发自石家庄
纷扰半年的韩春雨谜题,谜底依然没揭开。
时至今日,打开河北科技大学生科院网站,一首《浣溪沙/贺韩春雨博士发明基因
剪刀》的词还挂在第三条,后面两条新闻也是关于半年前韩春雨因“诺奖级”发现的论
文发表在顶级刊物《自然·生物技术》(下称“《自然》”)期刊而扬名。五个月以来
,这位年轻学者又因为实验的可重复性而饱受质疑。
近日,12名科学家向《自然》期刊提交其实验结果,均与韩春雨的论文结果有所
不同。该期刊新闻发言人回应称,已收到关于韩春雨论文的多个意见,批评意见经同行
评议后,有可能会被刊登。
10月31日,前后十几通电话之后,时代周报记者终于联系上韩春雨本人。他对时代周
报记者表示,希望质疑的科学家能当面与他讨论。
“今年8月,校方突然停电造成了实验室的实验材料全部损坏,让我一直很被动。
”韩春雨语气中带有一些无奈,但语速很快,他多次强调自己很忙,半年来被一波波记
者追访,他已经颇有些疲惫。
同在今年8月,韩春雨曾透露已有六七家实验室成功复制NgAgo研究结果,但拒绝
透露是哪几家。而近日在接受《成都商报》记者采访时,韩春雨表示“让我自证清白是
明显给我设... 阅读全帖 |
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发帖数: 1 | 50 http://biorxiv.org/content/biorxiv/early/2016/12/06/091678.full.pdf
结论摘要
Importantly, and in agreement with recently published reports [5-7], we
found strictly no evidence of a double strand break of the DNA with NgAgo,
and no editing of the mouse and human DNA despite an efficient delivery of
NgAgo and the gDNA. We did not observe an editing event in over 100 mouse
embryos injected with NgAgo, giving an editing efficiency of less than 1%,
contradicting the results reported in Gao et al.
小鼠细胞和人类... 阅读全帖 |
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