c****g
发帖数: 37081 | 1 除了500k那篇打不开。3篇J.Arg.Food. Chem. 基本上就是trash papers. It is
impossible to conclude that GM crop has any significant effect either on genetic or epigentic. The evidence is insufficient and extremely weak. The hypothesis is basically unfounded. 这种水货文章真的只能发在水货杂志上。鱼妈还是看点正经杂志的文章。
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w********2
发帖数: 632 | 2 就是说EPIGENTICS是代偿机制？是为了稳定GENOME的表达？ |
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b********2
发帖数: 125 | 3 审稿是短板，最近有些时间，想多审几篇为申请绿卡做准备。
希望能得到前辈推荐，先在这里谢过了！
我的方向是
1. biochemistry and proteomics in epigentics
2. biosynthesis, enzyme kinetics and reaction mechanism |
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S*******1
发帖数: 1860 | 4 我已经解释了好几遍了。你都快赶上goldcs。不过你的逻辑思维好像比他强点。
如果学校给上同性恋的课，过几年再上异性恋的课，那我一定会关注。
现在是两个都一起上。王子和公主的故事和王子和王子的故事并行教。你怎么说同性恋
更高了？
我觉得学校教育孩子们LGBT，那些同性恋的小孩从小受到正确的待遇，让他们更加健康
成长，很好。
异性恋的孩子不会因为这个课程变成同性恋。你们怎么这么害怕？
我觉得喜欢同性和喜欢异性是basic instinct。我觉得这是基因和epigentics决定的。
我相信不久的将来有人会做这个研究。
题， |
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H********g
发帖数: 43926 | 5 在胚胎早期的一个阶段（非常早），细胞里一个X缩起来变成Barr体，然后这个细胞的
后代里这个X都是Barr体（可能就是所谓epigentics的一个方面）。因为这个事情发生
的时候胚胎里还没有多少细胞，而且形成猫皮的那些细胞一般也不会跑得很远，一般一
个祖宗细胞对应猫身上某个部分，所以猫身上就一块一块的。
似乎人也是一块一块的，但是因为人的色素基因不在X上所以没有花人。 |
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K**********e
发帖数: 188 | 8 清华大学的孙芳霖；上海生化细胞所的陈德桂。
在国内算是不错的了吧。当然，没有CNS文章。 |
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i*********0
发帖数: 915 | 13 sun看publication还是不错的，他在瑞士的时候，我准备申请他的lab，那个时候他正好准备回国，从回的email来看，他还是相当的nice了。
不过，要是现在申请做epigenetics的话，我觉得还是等等，等他在清华先prove自己在说了。 |
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l******u
发帖数: 936 | 14 孙芳霖 在瑞士 FMI （诺华成立的研究所， 欧洲最好的研究所之一）
做PI的时候有 Nature Genetics 文章。
中大有个做 microRNA and cancer stem cell 的不错， 前年有个 cell 文章 |
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r***e
发帖数: 2539 | 16 Thank everyone for the discussion!
As pineseed pointed out, too many topics were discussed here.
But my personal interests are:
1. what is the cell origin of different type of lung cancers?
2. does cell origin or mutation decide tumor types?
3. how to model different type of lung cancer?
HGTPase, it seems you are working in this field (more lung development than
lung cancer?), and I hope you can give your opinions. We can also discuss in
private mails for technique details.
1. ... 阅读全帖 |
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a********k
发帖数: 2273 | 17 genetic screen对3dpf之前的发育有局限，因为有maternal RNA的存在，所以找到的大
多是morphogene，因为这玩意靠gradient影响。对5dpf之后的东西也有局限，因为无数
基因会影响鱼鳔的发育，影响游泳，8dpf之后就死了。死之前的secondary自然不属于
genetic screen感兴趣的了。作为basic research的用途，我同意你关于epigenetics
的意见。epigentics对早期发育，至少在我看来，只有fish能解决。
screen |
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n***g
发帖数: 5027 | 18 这个总结不错：
申请精华帖：我了解的Epigenetics牛人一览
我是从C.D.Allis，Danny Reinberg，Tony Kouzarides，Yi Zhang， Yang Shi这几个
人发的文章看起的，这几个人基本上就是目前做表观遗传最牛的一批人了。然后你看看
他们文章citation里面出现频率比较高的人名，那往往就是大牛了，然后一点一点扩展
。个人感觉看CNS及其子刊还是王道。另外推荐一个很好的网站，http://www.epidna.com/ 可以查这个领域最top的lab，也可以查该领域最新的论文。
# ^2 P/ }, _0 h" U8 m) P6 b
; l* o$ y- |- V5 g0 I0 T然后在申请选校的过程中，我也逐渐了解到一些
epigenetics领域的big names和rising stars。所以我感觉看各个牛校的faculty也是
了解一个领域的好学校好lab的方法。我的做法是每看一个学校，就把相关领域做
epigenetics的faculty留下来，然后以后看CNS时或者Journal club上看到熟悉的名字
，就重点关注下。$ ... 阅读全帖 |
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l******o
发帖数: 3764 | 19 1.if high blood cholesterol/glucose level can change the epigenetic pattern
of somatic cells--i.e. up/down regulates methylation or histone modification
, I think it is also possible to change that of germ cells to some extent.
2.not quite understand what you mean...
3.as joyhead said, I tend to view epigenetics as a part of gene expression
regulation, and also epigentic chances as quantitative rather than
qualitative traits. In another word, changes are subtle. So I don't see why
it would viola... 阅读全帖 |
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s******s
发帖数: 13035 | 20 你要知道，BAC里面就是你要的基因 + 调控序列 - epigenetic markers
虽然很多被epigentically repressed的基因很可能表达，但是你缺少必要
的TFs的话就没有办法了。
?
is |
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G******i
发帖数: 5 | 21 midwestern的还不错的大学，
招epigentics方面的ap，
如果有意这个职位的可以近期站内投条给我。 |
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O******e
发帖数: 4845 | 22 变化，那是change, not evolution。翻译成进化，我没觉得有什么不妥。进化的意思
就是当时的环境下使最适应这个环境的细胞/组织/生命体被选择存在下去。
你这个比喻很好，但是归根结底还是这个进化库大小，多样化以及环境的多样化的问题。
再回到肿瘤，这个进化库的规模可以无穷大，因为很多基因的很小的突变加在一起也
可能导致肿瘤的发生－－你可以将它定性为多基因疾病。那肿瘤环境的多样化就更
恐怖了。不同细胞来源的－－不同组织/器官位置的－－不同生理状态下的－－不同
先前及后续突变的－－epigentical－－血管发生的时间和程度上的。。。。
我不是否认肿瘤测序的重要性。我只是想说，它只是我们认识肿瘤继而战胜或者与肿瘤
共生过程中的一部分，不是全部。就像人类基因组一样，你测出来了又怎样，你得知道
那些ATCG是代表什么；具体到肿瘤，你得知道那些突变代表什么。所以有肿瘤测序的
结果，在我们研究的方向上会有很大的帮助，因为我们可以比以前更快地找到努力的
方向。但真正的治疗不是直接从对测序结果的分析上产生的。 |
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h******1
发帖数: 384 | 23 Cua的工作一再表明可能存在一个和Th1,Th2并列的第三种helper cells,但Cua本人并没有
意识到这一点，他只是提出Il-23诱导了一种pathogenic T cells.是Dong/Weaver在同
期NI上明确提出存在一个第三种T helper cells,并用in vitro/in vivo的试验证明了
Th17可以独立于Th1/Th2的发育program而存在并相互拮抗。因此业界一般认为Dong/
Weaver是Th17的发现者，Cua的工作对于Th17的发现起了关键作用。
Dong在Th17领域内的重要贡献还包括发现IL-21对于Th17的发育的关键作用，鉴定Act1
作为IL-17R signaling的一个关键adaptor蛋白，Th17的plasticity以及epigentics等
等。
Cua和Dong group都曾发现RORgt在Th17里高表达。可惜没有老鼠，Littman有现成的
RORgtKO老鼠。Cua写信问了结果littman不给.然后littman赶快看了一下RORgt对Th17
的影响，自己发了。Dong后来做了RORa KO 老鼠... 阅读全帖 |
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s******y
发帖数: 28562 | 24 是啊，所以现在一个有趣的问题就是，XX 能诱导成精子么？以及XY 能诱导成
卵子么？
自然界存在的XXY 以及 YYX 都是表现为男的，所以这个可能性不能直接推导，
必须试了才知道。不过这个肯定会比原来的实验更复杂一些吧。
另外，其实我对这个实验最感兴趣的还是epigentic marker, x-silencing 这些
问题。 |
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s******y
发帖数: 28562 | 25 是啊，如果这个技术能够被他们开发成熟的话，估计以后epigentics 和developmental
biology 的诺奖都应该有他们的份了。
不过这个技术如果成熟了的话，一大堆做鱼的人可就要饭碗被抢了。因为目前
做鱼的人有一大堆是在做胚胎早期发育的。 |
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b*****n
发帖数: 4 | 26 不过人家一做phd一做就是10年，顶上一个phd 加两轮博后了。独立出来后还是不给力
，所以还是老板的主意最要紧啊。。。人家anjana rao实验室最近几年一出手就是引领
一个潮流，先是orai钙离子通道，人家找了二十年没有找到，给她先第一个找到了，还
泄密给了其他实验，顺便让人家占了便宜；这几年还在领着离子通道领域的热点之一。
然后是tet， 和david liu哈佛号称天才化学家合作鉴定出了hmc，又一次成了黑马弄潮
儿。因为没有在epigentics领域混很久，加上zhang yi整天在外面给自己表功第一个发
现，很是吃亏的说. 摘了一次果子可以所是幸运，不过掏了两次，应该是有过人之处了
。不过rao很低调不喜功，稳打稳扎在tet2和淋巴癌的关联及genome-
wide mapping of 5hmc还是杠杠的。读她的文章会发现生化基础很过硬，方法手段比较
巧妙，行文纸斟句酌不僭越。好像前两年在san diego整了个大的筛选中心，不知道是
不是又在折腾什么新东西出来。不过整了这两个发现还是养活了不少人，给了好多博后
出路，pi有了可以忽悠的新方向。最近好像是因为nih钱拿的... 阅读全帖 |
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b*****n
发帖数: 4 | 27 有人问到这个，看看下面的介绍和八卦吧：
发现印度人做science很厉害的其实可能比华裔还略胜一筹。
引自下文
http://www.mitbbs.com/article_t/Biology/31762013.html
一开始起家的是做NFAT信号通路在免疫系统中的作用， 在90－00年代掀起小高潮，发
现了一个短肽可以抑制NFAT-Calcineurin作用，可惜没有做成药，但是基础性工作为后
来小分子cyclosporin等被用于临床来抑制免疫激活或者抑制排斥奠定基础，现在临川
上还在广泛用着。。
然后anjana rao实验室
最近几年一出手就是引领
一个潮流，先是运用大规模siRNA筛选换出orai钙离子通道，人家找了二十多年没有找
到，给她先第一个找到了，还
泄密给了其他实验，顺便让人家占了便宜；最近还连续出了nature，nsmb，nat
immunol 等一些列文章；这是一个经典佐证siRNA筛选成功的例子。这个通道和stim1一
起在最近这几年还在领着离子通道领域的热点之一。这
其中她的另外一半贡献了很多。。。
然后是开天辟地的tet， 和nih生物信息学家aravin... 阅读全帖 |
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z*t
发帖数: 863 | 28 话说differentiation therapy从Waxmann提起有一段时间了，目前真正的
differentiation therapy还是俺们中国人搞出来的ATRA+As2O3。不知比埃尔霍夫最近
注意到agios这家公司没，他们针对IDH2 mutation的inhibitor跟ATRA效果类似。我看
好differentiation therapy在leukemia里的前景哈。化疗另外的问题是副作用,拿
leukemia来说，骨髓本来就是容易受化疗药影响，结果往往是病人丧失了正常的免疫能
力，只能通过输血维持，导致感染死亡的概率大大增加。
不过话说回来leukemia里头epigenetic factor mutation非常常见，epigentic相关
inhibitor能够induce differentiation不奇怪，这点跟solid tumor还是有很大区别 |
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p*****c
发帖数: 116 | 29 FASEB Transcription，Epigenetics会议找室友， 男生。具体会议信息如下：
Transcription, Chromatin, and Epigenetics
June 28–July 3, 2015
West Palm Beach, Florida, USA
我的email：[email protected]
/* */, 谢谢！ |
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z*******6
发帖数: 679 | 32 路过帮顶一下，不过我一直很不明白为什么出去开会还有这么省？不都是系里或者老
板出钱吗？... |
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z*t
发帖数: 863 | 33 好问题，试着胡说几句
绝大多数translocation是cancer type specific的
两者似乎都有可能，case by case,后者比如AML中常见的Mll-AF9是通过epigentic增强
Hoxa9的expression，Hoxa9的overexpression本身可以driving AML的发生.不过很少听
到过Hoxa9 在其他tissue里过表达会引起tumor的。
ABL这个例子有点特殊，我更倾向于前者，因为ABL本身的activity对breast cancer的
增殖是必须的，不知道有没有人在breast tissue里overexpress abl看能不能
transform into breast cancer |
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发帖数: 1 | 34 本人美本刚毕业，申请了PhD，现入手offer 4枚，求大神指点如何选择offer
本人背景：美本化工，PhD毕业以后打算进入industry养家糊口。对于工作一点都不挑
剔，药厂，生物技术公司都可以。现有JHU BME （biomedical engineering) offer一
枚，化工offer 三枚 （卡耐基梅隆, Wisconsin, 明尼苏达）。 JHU 的offer 已经固
定教授，epigenetic方面的。所以基本属于纯生物。现在正在纠结是选化工类的还是
BME的。纠结的重点是我觉得epigentic的课题听上去好高大上，特别高级，和我的曾经
的想法很像，但是听说生物很多都是火坑，化工好找工作，尤其是CMU的optimization
方向。但是，我又觉得基因是朝阳产业，化工已经属于夕阳产业，不知道毕业以后是不
是还是一样的情况。
希望各位大神大大给我一点择校的建议。
谢谢各位大神 |
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