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全部话题 - 话题: cytosine
1 (共1页)
A*********0
发帖数: 144
1
请问版上有没有同胞们做过methyl cytosine dot blot,完全没有经验,做出来的是空
心圆,不是实心圆,不知道为什么。在做实验之前,nylon membrane 需要用相应的
buffer打湿吗,还是不要打湿。不知道哪个环节出现了问题。谢谢。
m******g
发帖数: 467
2
Science 14.04.18
推荐:
1. Ancient DNA Holds Clues to Gene Activity in Extinct Humans
Reconstructing the DNA Methylation Maps of the Neandertal and the Denisovan
harnessing the natural degradation processes
of methylated and unmethylated cytosines
unmethylated cytosines decay with time to uracils
methylated cytosines decay to thymines
小知识:
1. Sleep Tight, Fly
sleep pattern characteristic of youthful flies is critical to brain
development
2. Changing Assemblages
Assemblage Time Series Reveal Biodiv... 阅读全帖
b*******y
发帖数: 4304
3
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至毫... 阅读全帖
T*****n
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4
来自主题: LeisureTime版 - 说说中医
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
中国 北京 100871北京大学 1生命科学学院 2医学部
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至毫... 阅读全帖
l*****f
发帖数: 13466
5
来自主题: LeisureTime版 - 屠呦呦非主流 國內忽視國外獲獎 zz
这个报道有点标题党了。 饶毅那篇2011年的文章写的很详细的。注意引用文献里,有
张昌绍1948年在科学杂志发的文章。
http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-478156.html
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
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摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
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概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在... 阅读全帖
C********g
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6
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bullmoney (Monk Tang of Stock Market), 信区: Military
标 题: 饶毅雄文: 敬请毛轮批判第一段, 第一段以后不用看
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 12 15:51:27 2011, 美东)
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
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摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史... 阅读全帖
C********g
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7
【 以下文字转载自 Military 讨论区 】
发信人: bullmoney (Monk Tang of Stock Market), 信区: Military
标 题: 饶毅雄文: 敬请毛轮批判第一段, 第一段以后不用看
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Sep 12 15:51:27 2011, 美东)
中药的科学研究丰碑(修改版)
饶毅1 黎润红2 张大庆2
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摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
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p*****e
发帖数: 332
8
我想主要原因是因为有些ORF是反向的原因,所以那种定义就不太准了,后来慢慢
的就不太用watson和Crick了,这篇review写的相对比较清楚了,总的感觉是,w
atson是通常写法中的上链(5‘-3’),Crick是下链(3'-5'),而通常上链是
用来做转录模板的,便被定义成了了antisense了。共同进步,hand!
http://www.biology-direct.com/content/6/1/7
Definition Watson Crick
Original cytosine-poor cytosine-rich
Compositional pyrimidine-rich purine-rich
Transcriptional antisense sense
Replicational lagging leading
Arbitrary this that
Database top/plus ... 阅读全帖
n********y
发帖数: 187
9
http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-650567.html
研究中药的中医研究院研究员、中国工程院院士李连达发表文章,谈砒霜治疗白血病是
中国人的骄傲(http://blog.sciencenet.cn/blog-715370-650492.html
李连达的文章写道:“砒 霜制剂治疗白血病问题,早在两千年前我国已经对砒
霜的药用价值及毒性有一定认识,在古人经验基础上,近代科学家又进行了深入的研究
,发现砒霜(三氧化二 砷)及青黛、雄黄(二氧化二砷)组成的“青黄散”可以治疗
白血病,其后进一步将砒霜精制成三氧化二砷制剂,又经一系列制剂学、药理毒理学及
大量临床试验, 证实对白血病确实有疗效,陈竺院士及其夫人等专家对其作用机制作
了高水平的研究并有重大发现,得到国内外学术界的公认,使这个药在世界推广使用”
这样的说法,恐怕陈竺和陈赛娟都受不了。
我相信,陈竺和陈赛娟都不会认为自己是发现砒霜治疗白血病的最大功臣,他们肯定同
意我的写法(见http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-478156.h... 阅读全帖
M****o
发帖数: 4860
10
研究中药的中医研究院研究员、中国工程院院士李连达发表文章,谈砒霜治疗
白血病是中国人的骄傲(http://blog.sciencenet.cn/blog-715370-650492.html
李连达的文章写道:“砒 霜制剂治疗白血病问题,早在两千年前我国已经对砒
霜的药用价值及毒性有一定认识,在古人经验基础上,近代科学家又进行了深入的研究
,发现砒霜(三氧化二 砷)及青黛、雄黄(二氧化二砷)组成的“青黄散”可以治疗
白血病,其后进一步将砒霜精制成三氧化二砷制剂,又经一系列制剂学、药理毒理学及
大量临床试验, 证实对白血病确实有疗效,陈竺院士及其夫人等专家对其作用机制作
了高水平的研究并有重大发现,得到国内外学术界的公认,使这个药在世界推广使用”
这样的说法,恐怕陈竺和陈赛娟都受不了。
我相信,陈竺和陈赛娟都不会认为自己是发现砒霜治疗白血病的最大功臣,他们肯定同
意我的写法(见http://blog.sciencenet.cn/blog-2237-478156.html),毫无争议的最大功臣是:张亭栋。
如果到今天,连研究中药的李连达都不清楚事... 阅读全帖
z*t
发帖数: 863
11
来自主题: Biology版 - Oxford nanopore 要出USB sequencer了
这个不同的修饰蛮好玩的,pacbio当年对methylated A测得很好,但是对不同modified
的cytosine要靠DNA修饰处理才能很好的测定。nanopore测modified cytosine估计不会
比pacbio容易,如果用有一些修饰处理的手段应该会有不错的结果
z*t
发帖数: 863
12
来自主题: Biology版 - Oxford nanopore 要出USB sequencer了
这个不同的修饰蛮好玩的,pacbio当年对methylated A测得很好,但是对不同modified
的cytosine要靠DNA修饰处理才能很好的测定。nanopore测modified cytosine估计不会
比pacbio容易,如果用有一些修饰处理的手段应该会有不错的结果
l*******r
发帖数: 407
13
来自主题: Biology版 - 中药的科学研究丰碑-饶毅
http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=2237&do=blog&i
摘要
1970年代早期,多数中国科学家,在文化大革命中努力生存而无机会开展研究。两位年
轻的研究者屠呦呦和张亭栋,分别在发现抗疟新药青蒿素和揭示砒霜化学成分三氧化二
砷对白血病的治疗作用的过程中起了关键作用。回顾四十年前开始的历程,不乏曲折和
反讽。青蒿素工作源于中国帮助越南抵抗美国,三氧化二砷源于观察、验证和改进乡村
中医的实践。虽然他们的药物挽救了世界上很多生命,两位研究者迄今未获国内外充分
肯定,屠呦呦有争议、张亭栋基本默默无闻。相关的文献埋没于冷僻的杂志和一般不易
看到的内部会议资料。基于原始中文论文、文件和采访,我们在此呈现这些发现的历史
概貌。没有逃脱我们的注意,在古代和近现代中文文献及医疗实践中,可能还有尚待重
新发现的珍宝。
引言
在中国使用了上千年的传统药物,能否改善现代人类的健康?在中国,有些人不认为这
是问题,而在中国以外的世界,中药并非现代人类普遍使用药物的主要来源。
对中药有两种截然相反的看法:在现代医学进展到今天后中药意义很小,甚至... 阅读全帖
t******e
发帖数: 196
14
来自主题: Chemistry版 - ask help on two papers - Thank you!
1.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jps.2600610703/abstr
Solvolyses of cytosine and cytidine
Edward R. Garrett*, Josef TsauArticle first published online: 21 SEP 2006
DOI: 10.1002/jps.2600610703
Journal of Pharmaceutical Sciences
Volume 61, Issue 7, pages 1052–1061, July 1972
2.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jps.2600560703/abstr
A mechanism for the hydrolytic deamination of cytosine arabinoside in
aqueous buffer
Robert E. Notari†Article first published online: 21 SEP... 阅读全帖
d******r
发帖数: 16947
15
作者:紫霞狼
链接:https://www.zhihu.com/question/60058987/answer/171961719
来源:知乎
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权,非商业转载请注明出处。
用砒霜治病,中药有传统,西方也曾用过。含砷的中药有砒霜、砒石、雄黄、雌黄等。
北宋的《开宝详定本草》、明朝李时珍的《本草纲目》都记载了砒霜的药性。西方在十
九世纪和二十世纪三十年代也曾用三氧化二砷治疗白血病,但未获普遍接受。
在巡回医疗过程中,哈尔滨医科大学第一附属医院的药师韩太云从民间中医得知用砒
霜、轻粉(氯化亚汞)和蟾酥等治疗淋巴结核和癌症。1971年3月,韩太云将它们改制
水针剂,称"713"或"癌灵"注射液,通过肌肉注射,对某些肿瘤病例见效,曾在当地风
行一时,但因毒性太大而放弃。
哈尔滨医科大学附属第一医院中医科的张亭栋与韩太云合作继续此工作。1972年后,
张亭栋等一方面主要集中做白血病,而不是无选择地应用于很多疾病,另一方面他们分
别检测“癌灵”的组分,发现只要有砒霜就有效,而轻粉带来肾脏毒性、蟾酥带来升高
血压的副作用,后两者无治疗作用。
他们的第一篇论文... 阅读全帖
g********d
发帖数: 4174
16
来自主题: QueerNews版 - 验药成功的例子 (转载)
【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: toptip (土翁), 信区: Biology
标 题: 今日中国谁最该做院士?by饶毅
发信站: BBS 未名空间站 (Mon Aug 22 00:43:41 2011, 美东)
【说明
首先抱歉,标题是为了吸引眼球。而且,读者可以看到,本文介绍的工作并不适合用院
士与否来评价,所以题目应该被批判。本文作为非正规博文一周后,题目将改回以下正
文的标题。正文目前作为征求意见稿,也将适当修改后发表于正式刊物,这相反于我平
时一般先正式发表后请科学网置于博客的习惯。
在科学界,我有双重身份:正在实践的科学家和对历史与现实的评论员。第二身份包括
我对科学史的兴趣。以前以介绍其他人研究过的科学史为主,近年对感兴趣较长的中国
近代科学史,我通过和北大医学部张大庆老师和研究生黎润红的合作,获得了一些史料
、正在写文章。如何呈现本文要讲的工作,也得益于“GSK终身生命科学成就奖”评奖
委员会的同事们的讨论,他们是鲁白、傅新元、马红、王小凡。
因为最近我第一身份出现一些情况,引起了出乎我意料的关注,为了避免继续过度解读
,而将其中无意义的部... 阅读全帖
d*b
发帖数: 4184
17
来自主题: USANews版 - 里把肉们进来反驳吧
Leftist Lies Destroyed as Scientists Discover the Gene Which Causes Brain
Size and Intelligence
JULY 31, 2013 BY TNO STAFF— IN SCIENCE
Nearly 100 years of leftist lies and deception, which has claimed that
intelligence is not genetic, has been destroyed by the science of genetics.
According to a new study, just published in the University of California Los
Angeles (UCLA) newsroom, scientists have definitively found the genes which
control brain size and intelligence.
Even worse for liberals, ... 阅读全帖
f******I
发帖数: 769
18
来自主题: Medicine版 - 表哥乙肝大三阳

sorry to hear that,
in addition to the antiviral agent lamivudine, there are a bunch of other
antiviral medicines such as
adefovir which has advantage against lamivudine-resistent strains of hep b;
entecavir, telbivudine,tenofovir are other antiviral drugs,
there are some anti-viral drugs in trials, include emtricitabine,
famciclovir, clevudine, val-d-cytosine and valtorcitabine, alamifovir,
pradefovir, i didn't read into the details andnot sure if you could get
those in china, in general
c**c
发帖数: 2593
19
来自主题: SciFiction版 - 科幻背后的科学
嗯,好像作者实际上实现起来比四个字母要复杂,用的是氨基酸序列。作者特地做了如
下说明:
To keep to 'the spirit of the genome', I did the conversion, not from the
bases (adenine, cytosine, thymine, guanine), but from the 'codons'--the sets
of three bases that code for an amino acid. There are 64 (4X4X4) possible
codons and only 20 amino acids. Amino acids then, are represented by a
variable number of codons--from six down to one. I associated those amino
acids with the highest number of codon representations with the most common
notes of t... 阅读全帖
v****a
发帖数: 121
20
来自主题: Biology版 - Papers Help, Thank you
1 The title is: Strong enhancement of recombinant cytosine deaminase
activity in Bifidobacterium longum for tumor-targeting enzyme/prodrug
therapy
The link is: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17420581
2 The title is: Tumor-targeted Salmonella as a Novel Anticancer Vector
The link is: http://cancerres.aacrjournals.org/content/57/20/4537.abstract
Please send to c***[email protected]
Thanks.
j********8
发帖数: 21
21
讲的就是基因组印记?
要是这样岂不是将灌水发挥到了极至?
Paternally Induced Transgenerational
Environmental Reprogramming of
Metabolic Gene Expression inMammals
Epigenetic information can be inherited through the
mammalian germline and represents a plausible
transgenerational carrier of environmental information.
To test whether transgenerational inheritance
of environmental information occurs in mammals, we
carried out an expression profiling screen for genes
in mice that responded to paternal diet. Offspring
of males fed... 阅读全帖
y******y
发帖数: 107
22
来自主题: Biology版 - 求papar,非常感谢
在国内,查到几篇比较重要的文献,但是都不能获得全文,那位大哥大姐帮帮忙,非常
感谢。
1. Nat Chem Biol. 2009 Jun;5(6):400-2.
Cytosine-5-methyltransferases add aldehydes to DNA.
Liutkeviciute Z, Lukinavicius G, Masevicius V, Daujotyte D, Klimasauskas S.
Source
2. Epigenetics. 2011 May;6(5):560-5.
Determination of genomic 5-hydroxymethyl-2'-deoxycytidine in human DNA by
capillary electrophoresis with laser induced fluorescence.
Krais AM, Park YJ, Plass C, Schmeiser HH.
可以发到 y*****[email protected]
谢谢。
a********k
发帖数: 2273
23
来自主题: Biology版 - 饶毅在评院士的文章
搜了一下,觉得院士还行嘛,很多人引用都还不错。
科学院院士饶子和,工程院院士曹雪涛,科学院院士常文瑞,科学院院士杨焕明,科学
院院士张启发
饶同学:The crystal structures of severe acute respiratory syndrome virus
main protease and its complex with an inhibitor,引用297
曹同学:Splenic stroma drives mature dendritic cells to differentiate into
regulatory dendritic cells,引用222
常同学:Crystal structure of spinach major light-harvesting complex at 2. 72
resolution,引用617
杨同学有很多,不过估计有人不齿他:A draft sequence of the rice genome (Oryza
sativa L. ssp. indica)引
用1953
张同学也有很多,挑一个小paper吧:Pat... 阅读全帖
s******r
发帖数: 2876
24
来自主题: Biology版 - 饶毅在评院士的文章
那就是说饶毅还没有到一骑绝尘的地步,

搜了一下,觉得院士还行嘛,很多人引用都还不错。
科学院院士饶子和,工程院院士曹雪涛,科学院院士常文瑞,科学院院士杨焕明,科学
院院士张启发
饶同学:The crystal structures of severe acute respiratory syndrome virus
main protease and its complex with an inhibitor,引用297
曹同学:Splenic stroma drives mature dendritic cells to differentiate into
regulatory dendritic cells,引用222
常同学:Crystal structure of spinach major light-harvesting complex at 2. 72
resolution,引用617
杨同学有很多,不过估计有人不齿他:A draft sequence of the rice genome (Oryza
sativa L. ssp. indica)引
用1953
张同... 阅读全帖
t****p
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25
【说明
首先抱歉,标题是为了吸引眼球。而且,读者可以看到,本文介绍的工作并不适合用院
士与否来评价,所以题目应该被批判。本文作为非正规博文一周后,题目将改回以下正
文的标题。正文目前作为征求意见稿,也将适当修改后发表于正式刊物,这相反于我平
时一般先正式发表后请科学网置于博客的习惯。
在科学界,我有双重身份:正在实践的科学家和对历史与现实的评论员。第二身份包括
我对科学史的兴趣。以前以介绍其他人研究过的科学史为主,近年对感兴趣较长的中国
近代科学史,我通过和北大医学部张大庆老师和研究生黎润红的合作,获得了一些史料
、正在写文章。如何呈现本文要讲的工作,也得益于“GSK终身生命科学成就奖”评奖
委员会的同事们的讨论,他们是鲁白、傅新元、马红、王小凡。
因为最近我第一身份出现一些情况,引起了出乎我意料的关注,为了避免继续过度解读
,而将其中无意义的部分转化为较有意义的事情,我为本文加上目前对我博客感兴趣的
外界人士可能注意的标题。
本文主旨是希望中国重视一些在国内做出了杰出工作、而未获适当承认的科学家。本文
要介绍的两位人物年龄都较大,其中一位还在病中。他们做出的贡献,在我(作为科学
的评... 阅读全帖
t*******o
发帖数: 71
26
【写在前面的话】
首先抱歉,标题是为了吸引眼球。而且,读者可以看到,本文介绍的工作并不适合用院
士与否来评价,所以题目应该被批判。本文作为非正规博文一周后,题目将改回以下正
文的标题。正文目前作为征求意见稿,也将适当修改后发表于正式刊物,这相反于我平
时一般先正式发表后请科学网置于博客的习惯。

在科学界,我有双重身份:正在实践的科学家和对历史与现实的评论员。第二身份包括
我对科学史的兴趣。以前以介绍其他人研究过的科学史为主,近年对感兴趣较长的中国
近代科学史,我通过和北大医学部张大庆老师和研究生黎润红的合作,获得了一些史料
、正在写文章。如何呈现本文要讲的工作,也得益于“GSK终身生命科学成就奖”评奖
委员会的同事们的讨论,他们是鲁白、傅新元、马红、王小凡。

因为最近我第一身份出现一些情况,引起了出乎我意料的关注,为了避免继续过度解读
,而将其中无意义的部分转化为较有意义的事情,我为本文加上目前对我博客感兴趣的
外界人士可能注意的标题。

本文主旨是希望中国重视一些在国内做出了杰出工作、而未获适当承认的科学家。本文
要介绍的两位人物年龄都较大,其中一位还在病中。他们... 阅读全帖
s*********t
发帖数: 600
27
我需要合成一些5mC甲基化修饰的长DNA oligos。
长度在至少50 mer,甚至更长,定点的Cytosine被修饰成5mC。大概需要50-100 ug。
能否给推荐一家公司,价格便宜质量又好的。
非常感谢!
l**********1
发帖数: 5204
28
来自主题: Biology版 - What's called somatic mutation?
LZ pls try go to
//www.sanger.ac.uk/genetics/CGP/cosmic/
or Cell article:
by
Nik-Zainal S et al. and Stratton MR (2012)
Mutational processes molding the genomes of 21 breast cancers.
Cell. 149: 979-93.
Abstract
All cancers carry somatic mutations. The patterns of mutation in cancer
genomes reflect the DNA damage and repair processes to which cancer cells
and their precursors have been exposed. To explore these mechanisms further,
we generated catalogs of somatic mutation from 21 breast cancer... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
29
flowchat工程计算学已经进入了 Histone modification and cytosine methylation
of Genome, 新的交叉学科 系统人工基因组生物信息学 已经诞生了吧 Lol
pls refer
>XXX lab studys causal relationships between gene regulation and cellular >
behaviors, by developing computational and experimental methods on >network
modeling, stem cell engineering, epigenomic and single-cell >analyses.
>Cell, 149: 1381-1391
>http://bioinformatics.bioen.illinois.edu/index.html
l**********1
发帖数: 5204
30
flowchat工程计算学已经进入了 Histone modification and cytosine methylation
of Genome, 新的交叉学科 系统人工基因组生物信息学 已经诞生了吧 Lol
pls refer
>XXX lab studys causal relationships between gene regulation and cellular >
behaviors, by developing computational and experimental methods on >network
modeling, stem cell engineering, epigenomic and single-cell >analyses.
>Cell, 149: 1381-1391
>http://bioinformatics.bioen.illinois.edu/index.html
l**********1
发帖数: 5204
31
来自主题: Biology版 - Help: mouse genotyping by sequencing
GC contents of that P2 to AscI site if >65% DMSO 5% to buffer or try
Clontech GC rich kit
Cycle time 35 that is no problem
pls refer
GC-rich PCR concerns DNA templates with high GC content, which is defined as
the percentage of guanine-cytosine base pairs. When amplifying templates
with >60% GC content (i.e 5' ends of most mammalian cDNAs), the three
hydrogen bonds shared by GC pairs lead to enhanced thermostability, which is
problematic for un-optimized Taq polymerase systems.
http://www.clon... 阅读全帖
l**********t
发帖数: 5754
32

Nucleotide codes
A Adenine
G Guanine
C Cytosine
T Thymine
U Uracil
R Purine (A or G)
Y Pyrimidine (C or T)
N Any nucleotide
W Weak (A or T)
S Strong (G or C)
M Amino (A or C)
K Keto (G or T)
B Not A (G or C or T)
H Not G (A or C or T)
D Not C (A or G or T)
V Not T (A or G or C)
E**********t
发帖数: 56
33
Xuebiao Yao, Dasheng Li and Gang Pei recently wrote an essay to Nature
Review in MCB Which is entitled “In focus: molecular and cell biology
research in China”. Here is the link: http://www.nature.com/nrm/journal/v14/n9/full/nrm3638.html In this article, they discussed the past, present and future of molecular and cell biology research in China. One part which interested me is the key MCB discoveries in China. Although most of the work are nice and likely solid work, few of them are breakthrough... 阅读全帖
n**e
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来自主题: Biology版 - 人工DNA制造活细胞
2014年05月08日
《自然》(Nature)杂志网站上发表的这项研究是斯克里普斯研究院(Scripps Research
Institute)的科学家们开展的.该领域名为合成生物学(synthetic biology),涉及为特
定目的创建生物系统,目前还处于萌芽状态。
斯克里普斯研究院的研究人员使用化学方法,生成了两个新的核苷酸,称为X和Y。他们
把一对XY导入常见的大肠杆菌中。结果细菌可以正常地复制,虽然速度比平常稍慢一点
,但确实可以像复制天然的核苷酸一样复制X和Y。文章提到,在15小时里,只完成了大
约24次复制。
因此,这个细菌的遗传密码有六个字母,而不是原来的四个,而细菌生成的新的蛋白质
,可能会以完全不同于自然生成的蛋白质的方式发挥作用。研究人员还没有证实,人工
核苷酸可以真的被细胞用来生成蛋白质。那需要对细菌进行更多的遗传工程改造,尽管
其他人之前的研究显示这有可能办到。
由于植物中的叶绿体可以从周围组织导入核苷酸,而其他研究人员已经找到了控制这种
能力的基因,所以斯克里普斯研究所把一个海藻基因植入大肠杆菌,让细菌可以从它们
生长的培养基中吸取X和Y核苷酸。
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v**********8
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为什么cytosine methylation主要选择GC-rich sequence为载体而不是其他含C的
sequence?
CG-rich的序列在进化上有什么优势吗?更加稳定?更容易调控?还是说先有的特定识
别CG的甲基化酶以后,才有的CpG island?
epigenetics外行求轻拍。
v****a
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来自主题: Chemistry版 - Papers Help, Thank you
1 The title is: Strong enhancement of recombinant cytosine deaminase
activity in Bifidobacterium longum for tumor-targeting enzyme/prodrug
therapy
The link is: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17420581
2 The title is: Tumor-targeted Salmonella as a Novel Anticancer Vector
The link is: http://cancerres.aacrjournals.org/content/57/20/4537.abstract
Please send to c***[email protected]
Thanks.
w*q
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来自主题: Chemistry版 - Papers Help, Thank you
Strong enhancement of recombinant cytosine deaminase activity in
Bifidobacterium longum for tumor-targeting enzyme/prodrug therapy
http://www.sendspace.com/file/n9h4tc
v******0
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来自主题: Chemistry版 - 请教HILIC Column问题
Ok, but the peaks I got from bare silica on small molecules are also ugly.
But the molecules I tested until now are something people use 80%ACN as
isocratic to elute, such as uracil, cytosine, etc.
Is that because these are not retained well with my column, so I don't have
good peaks. If I goes for some other more hydrophilic small molecules, could
it be better?
The other question is since Silanol makes the peptide peak tailing, if I use
UV as detector, which doesn't require acid, could the resu... 阅读全帖
f**********8
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Structure-activity relations in the aminoacyl-4-aminohexosyl-cytosine group
of peptidyl transferase inhibitors
https://scifinder.cas.org/scifinder/view/scifinder/scifinderExplore.jsf
email: x*******[email protected]
Thank you so much~!!
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