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全部话题 - 话题: cyclin
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k****o
发帖数: 589
1
个人始终对Santa Cruz的质量不放心。50kDa的蛋白有很多,这个抗体有可能特异性不
好。
如果是post-translational modification的话,似乎只有SUMO能够吻合上两条带分子
量的差异。
公司的图片根本不可信,特别是Santa和Abcam的,为了卖东西什么都做得出来。
g*********3
发帖数: 177
2
来自主题: Biology版 - 关于磷酸化的学术问题
我google了你的问题:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10082518
Cyclin CTK2P
为什么问这个问题...
s******y
发帖数: 28562
3
来自主题: Biology版 - 关于磷酸化的学术问题
你举的这个例子貌似不太符合我的要求,虽然 Cyclin CTK2P磷酸化后迅速降解,
但是文章里好像没有说它的磷酸化对它的活性有什么影响。
M*****n
发帖数: 16729
4
来自主题: Biology版 - [请教] early mitosis marker
cyclin
s********s
发帖数: 67
5
来自主题: Biology版 - paper help
Autophagy. 2011 Oct;7(10):1199-211. Epub 2011 Oct 1.
cAMP induces autophagy via a novel pathway involving ERK, cyclin E and
Beclin 1.
Ugland H, Naderi S, Brech A, Collas P, Blomhoff HK.
帮忙发到:s********[email protected]
非常感谢!
l**********1
发帖数: 5204
6
请注意你的用词
>Xuemei又不做抗性和kinase
是"和"而不是"或"
then
what is this?
a)
her Vita:
19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
from
//www.plantbiology.ucr.edu/faculty/chen.html
and her review article:
b)
//www.springerlink.com/content/p22k662q1162kp07/
and this:
c)
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675573
Plant Cell. 2010 Jul;22(7):2156-
Orchestration of the f... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
7
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20023165
full text link:
//www.weigelworld.org/research/publications/2010/pdfs/Rodriguez%
20Development%202010.pdf
even Xue-mei Chen before 2010 never did Arabidopsis cyclin-dependent
kinases and microRNA
after 2011 she should noted that paper.
And You centuribob (Planta) from 2012 now still ignored it?
l**********1
发帖数: 5204
8
请注意你的用词
>Xuemei又不做抗性和kinase
是"和"而不是"或"
then
what is this?
a)
her Vita:
19. Wenming Wang and Xuemei Chen. HUA ENHANCER3 reveals a role for a
cyclin-dependent protein kinase in the specification of floral organ
identity in Arabidopsis. (2004) Development 131, 3147-
from
//www.plantbiology.ucr.edu/faculty/chen.html
and her review article:
b)
//www.springerlink.com/content/p22k662q1162kp07/
and this:
c)
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20675573
Plant Cell. 2010 Jul;22(7):2156-
Orchestration of the f... 阅读全帖
l**********1
发帖数: 5204
9
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20023165
full text link:
//www.weigelworld.org/research/publications/2010/pdfs/Rodriguez%
20Development%202010.pdf
even Xue-mei Chen before 2010 never did Arabidopsis cyclin-dependent
kinases and microRNA
after 2011 she should noted that paper.
And You centuribob (Planta) from 2012 now still ignored it?
a*****x
发帖数: 901
10
来自主题: Biology版 - 投稿请教?
几个比较重要的问题:
1.是否是已知通道(所通过电流和主要功能已知)?
2.是否已知其调节发育?
3.是否揭示了其调节cyclin水平的机制?就你的描述蛋白水平只是揭示了相互作用和表
达,没有完整清楚的机制。
每个问题都可能会影响所能投杂志的一个档次。
s*******a
发帖数: 78
11
来自主题: Biology版 - 投稿请教?
多谢大家回复。
是的。其实分子通道研究比较多了,但是我们研究的非通道功能至今没有报道。
是的。基因敲除小鼠模型已经建立了。但是机制未知。我们描述可一种可能的机制。
没有涉及cyclin,但是涉及到下游check point分子,which和我们研究的通道蛋白有相
互作用和表达上的关系。
多谢回复和提示!!
n***3
发帖数: 663
12
来自主题: Biology版 - 急求一篇paper!
J Genet Genomics. 2011 Oct 20;38(10):439-52. doi: 10.1016/j.jgg.2011.09.002.
Epub 2011 Sep 16.
Dysregulation of CDK8 and Cyclin C in tumorigenesis.
Please send the paper to e*********[email protected]
Thanks!!!
l**********1
发帖数: 5204
13
Please refer
Swedish Umeå Universitet. [2007] one PhD Dissertation
title:
Studies of phosphatidylinositol 3 kinase (PI3K) signaling pathway in
mammalian ovarian follicle activation and development
University dissertation from Umeå : Medicinsk kemi och biofysik
AUTHOR: Singareddy Rajareddy
KEYWORDS: oocyte; follicular development; P13K pathway; Medical Biochemistry
; medicinsk biokemi;
ABSTRACT: ignored and (iii) the overactivated follicles in p27-/- ovaries
are depleted in early adul... 阅读全帖
o**4
发帖数: 35028
14
代表性科研论文:
1. Song Y. and Lu B. Notch signaling modulator Numb's interaction with α-
Adaptin regulates endocytosis of Notch pathway components and cell fate
determination of neural stem cells. Journal of Biological Chemistry 2012,
287(21):17716-28.
2. Song Y. and Lu B. Regulation of cell growth by Notch signaling and its
differential requirement in normal vs. tumor-forming stem cells in
Drosophila. Genes & Development, 2011, 25(24):2644-2658.
3. Ouyang Y.*, Song Y.* and Lu B. p53 restrains ectopic... 阅读全帖
a*******a
发帖数: 4233
15
来自主题: Biology版 - 请教:cyclin D1
d1下调是block在g1后期的checkpoint上,有了足够的D1细胞内rb磷酸化推动细胞进去s期
你的数据可以这么解释
d1太多,导致不成熟的细胞提前进入s期,通不过s期检验点。
可能你首先需要做个同步化看看是不是加速进s期,rb磷酸化如何
然后看看dsb如何,s期检验点查什么东西。
b**********8
发帖数: 349
16
来自主题: Biology版 - 请教:cyclin D1
谢谢,你的意见对我很有启发,不知道你有没有可以参考的paper?

去s期
v*******e
发帖数: 11604
17
阶级斗争新动向,前者很常见,后者不常见!p-value有多小?
http://www.cell.com/molecular-cell/abstract/S1097-2765(14)00397
http://www.cell.com/molecular-cell/abstract/S1097-2765(14)00401
第一篇日本人做的,第二篇荷兰人做的,我来比较一下:日本人做的实验非常多,理论
是在G2时skip细胞分裂导致4倍体导致细胞老化;里面有实验证实G2时强制P53短暂表达
导致G2时skip细胞分裂导致4倍体导致细胞老化,用的复杂但是精确的方法强制表达,
当时我读到这个实验就眼睛一亮,在数十个实验里面这个我基本肯定是新结果。
荷兰人的实验,通篇研究的是射线破坏DNA和老化的关系,理论是射线破坏DNA导致P53
导致P21导致cyclin B1 retention in nuleus导致细胞老化。当然两个理论不是
mutually exclusive,而可能是互为补充。基本上实验都是在做射线破坏DNA,但是最
后也实验了强制P53短暂表达导致细胞老化,思路有转折,用的简单的药物... 阅读全帖
v*******e
发帖数: 11604
18
来自主题: Biology版 - 总结下细胞老化的最佳故事
看了一批文章,总结这个故事最make sense。
细胞在G2的时候,由于各种因素造成DNA损坏(过氧化,辐射,端粒太短等),或者癌
症基因例如RAS表达(此时没DNA损坏,这个效率比不上前面各种因素),都引起P53表
达,P53表达引起P21表达,P21的水平高到一定程度就会把cyclin B1关进细胞核不出来
,加上其他P21影响的其他途径(cdk1(次要), RB(比前者重要), 等)导致细胞跳
过M,直接进入G1。这样的细胞是4倍体,如果继续细胞周期则会先8倍体然后分裂;因
为多个centrosome或者其他原因会导致细胞染色体数目变化,癌变危险性大,所以有必
要制止这样的细胞继续细胞周期。这里P16就上场了,它通过RB等途径把细胞限制在G1
,不再进入S。这细胞就老化了。老化的细胞有分泌变化自我标记,等着免疫系统来清
除。人老了免疫系统变差,老化细胞越积越多(这一步暂缺因果关系),各种组织和器
官老化就都来了。
还有疑问的几步:
1. 看胚胎发育时候的老化细胞是不是4倍体(估计不是,因为没有P16表达)。虽然依
据SA-beta-Gal来判断他们是老化细胞,但是可能和成年细胞... 阅读全帖
v*******e
发帖数: 11604
19
来自主题: Biology版 - 总结下细胞老化的最佳故事
先申明一下,我不是业界大牛,只是因为感兴趣所以读了不少这个方面的文章。所以我
说的话都不一定是对的。
看了一批文章,总结这个故事最make sense。修改下不准确的地方。加reference。
细胞在G2的时候,由于各种因素造成DNA损坏(过氧化,辐射,端粒太短,某些致癌基
因表达导致SSB或者DSB等),引起P53表达,P53表达引起P21表达,P21的水平高到一定
程度就会把cyclin B1关进细胞核不出来【Krenning 2014】,加上其他P21影响的其他
途径(cdk1(次要), RB(比前者重要), 等)导致细胞跳过M,直接进入G1【Ye
2013, Johmura 2014】或者某些别的致癌基因表达,虽然没有DNA损坏,但是只要引起
DDR,也可以导致细胞跳过M,直接进入G1。或者,强制引起P53表达,或者强制P21表达
,或者什么别的原因导致细胞跳过M,直接进入G1
【Krenning 2014, Johmura 2014, Sussman 2014】。这样的细胞是4倍体,如果继续细
胞周期则会先8倍体然后分裂;因为多个centrosome或者其他原因会导致细胞染... 阅读全帖
c*********r
发帖数: 1312
20
求内行科普一下,做3D genome,测序样本制备需要多少细胞或者细胞核?需要哪些好
的抗体?还需要哪些关键试剂或者方法?
我问这些问题是因为之前和一哥们儿聊过一些。他做AP后其中一个方向研究细胞周期中
的3D genome变化。需要找一个实验模型,要至少几个million的细胞,而且是高度同步
的。虽然使用物理和化学方法可以是培养的细胞同步,但是我总觉得会不会有一些
artifact。
我倒是有个很好的系统,某种动物胚胎发育过程中,前3个细胞周期天然高度同步,而
且从一个个体就可以拿到几个million个胚胎,关于cyclin的诺奖甚至都是在该物种里
最早发现的,可见很适合研究细胞周期。这种动物的进化地位其实比果蝇线虫更接近人
。但是问题在于这个系统不是主流模式生物,genome虽然在06年就发表了,后来也有不
断改进,但是很不完善。而且很多抗体估计都没有人在这个物种里开发和尝试过。考虑
到种种风险,我的同学决定还是上保险靠谱的动物,先做老鼠和人的细胞吧,就没有跟
进了。
各位评价一下这样的系统是否可以用来研究3D genome在细胞周期中的变化?

发帖数: 1
21
xenopus吧 百万细胞可以啊
上Hi-C不要抗体啊
推荐你做targeted 这样测序只要几百个million reads
像liebermann那样一下测几个billion 测序量惊人 计算也很困难
[在 cellcreator (cellcreator) 的大作中提到:]
:求内行科普一下,做3D genome,测序样本制备需要多少细胞或者细胞核?需要哪些好
:的抗体?还需要哪些关键试剂或者方法?
:我问这些问题是因为之前和一哥们儿聊过一些。他做AP后其中一个方向研究细胞周期
中的3D genome变化。需要找一个实验模型,要至少几个million的细胞,而且是高度同
步的。虽然使用物理和化学方法可以是培养的细胞同步,但是我总觉得会不会有一些
:artifact。
:我倒是有个很好的系统,某种动物胚胎发育过程中,前3个细胞周期天然高度同步,而
:且从一个个体就可以拿到几个million个胚胎,关于cyclin的诺奖甚至都是在该物种里
:最早发现的,可见很适合研究细胞周期。这种动物的进化地位其实比果蝇线虫更接近
人。但是问题在于这个系统不是主流模式生物,genome虽然在06年... 阅读全帖
y*****t
发帖数: 264
22
来自主题: MedicalCareer版 - Finally it comes, I do make it!
Just got the CS result , I passed after second attempt! All the suffers in
the past 10 months gone with wind. This moment , I only want to cry.
Thanks for all the help from this forum. Thanks cyclin MM and LUZM and my
kaplan couse roomate( I need to try to find your ID first.) and other IDs( I
should figure out ID first). You raise me up!
In the past 10 days, I try to calm my nerves and write some Qs and As
according to recent Qs from this forum. hopefull it help. Definitely I will
write some u
d**d
发帖数: 28
23
来自主题: Nursing版 - 考经补充
个人觉得Saunders Comprehensive Review for the NCLEX-RN Examination 每章后面
的习题非常有用,我没时间看完整本书,但把每道题都做了,考试时遇到过类似的题。
里面的应考技巧也很管用。还有,我觉得Pharmacology最重要的是记住药名的后缀,就
能联想到Action和Side Effects了。
比如:-cillin Penicillin
-olol Beta Antagonist
-oxin Cardiac Glycoside
-terol Beta 2 Agonist
-cycline Antibiotics
-azole Anti-fungal
-barbital Barbiturate
-pril ACE Inhibitor
-navir Protease Inhibitor
-trophin Pituitary Hormone
-i
c*******3
发帖数: 48
24
来自主题: Pharmaceutical版 - help for 2 paper, urgent! Thanks!
Yuan, X., Yao, Z., Wu, J., et al.
G1 phase cell cycle arrest induced by SARS-CoV 3a protein via the Cyclin D3/
pRb pathway
American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology 37 (1), pp. 9-19,
2007
Evangelou, A., Gortzak-Uzan, L., Jurisica, I., et al.
Mass spectrometry, proteomics, data mining strategies and their applications
in infectious disease research
Anti-Infective Agents in Medicinal Chemistry 6 (2), pp. 89-105, 2007
n***********[email protected]
W********g
发帖数: 610
25
来自主题: _pennystock版 - ASTX也不错
税收五年一直处于增长状态...cash充足,我觉得风险相对于BPAX小一些
James S. J. Manuso
Thank you, Tim. Good afternoon, and thank you for joining us for Astex
Pharmaceuticals 2012 First Quarter Conference Call. During the quarter, we
made considerable operational progress on many fronts in discovery, research
and in the clinical and regulatory development of our drugs. Our balance
sheet remains sound and our financial performance was excellent. We ended
the quarter with $126 million in cash and marketable securities and we
po... 阅读全帖
j***l
发帖数: 100
26
赞! 并期待lz的笔记,呵呵
同时关注两篇文章, 有兴趣者一起讨论
1) Periodic Cyclin-Cdk Activity Entrains an Autonomous Cdc14 Release
Oscillator
by Ying Lu and Fred Cross
http://www.cell.com/abstract/S0092-8674%2810%2900294-1
2) Cis-interactions between Notch and Delta generate mutually exclusive
signalling states
by Michael Elowitz
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature08959.html
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