请教一下microarray的分析 - Statistics版 - 未名存档

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Statistics版 - 请教一下microarray的分析

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● Bioinformatics Position in a Genomics Center in a University in the Southern California	● 这种情况到底是用apply还是loop（R)
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相关话题的讨论汇总
话题: microarray话题: 分析话题: genes

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Y******Y 发帖数: 8753	1 比方说我有6万个genes,对每个gene都要fit a mixed model,如果在sas里面做，是不是要自己写 loop做6万次呀？sas会爆掉么？还是R做比较好？有没有现成的package可以一下子做不用自己写loop? bioconductor里面有么？谢谢！
d*******e 发帖数: 1649	2 there are no 60000 genes... 【在 Y******Y 的大作中提到】 : 比方说我有6万个genes,对每个gene都要fit a mixed model,如果在sas里面做，是不是 : 要自己写 : loop做6万次呀？sas会爆掉么？ : 还是R做比较好？有没有现成的package可以一下子做不用自己写loop? bioconductor里 : 面有么？ : 谢谢！
d**********r 发帖数: 24123	3 6万个SNP吧。
w*****n 发帖数: 375	4 use the "by" statement. 【在 Y******Y 的大作中提到】 : 比方说我有6万个genes,对每个gene都要fit a mixed model,如果在sas里面做，是不是 : 要自己写 : loop做6万次呀？sas会爆掉么？ : 还是R做比较好？有没有现成的package可以一下子做不用自己写loop? bioconductor里 : 面有么？ : 谢谢！
Y******Y 发帖数: 8753	5 明白啦！非常感谢！【在 w*****n 的大作中提到】 : use the "by" statement.

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