y*********s
发帖数: 24 | 1 希望高人指点:
做MULTI TESTS,需要得出ADJUSTED P-VALUES, 想用FDR PROCEDURE(B-H algorithm).
R 里有两个PACKAGES, multtest and FDR-AME, 可以做.
问题是:
1 在INSTALL LIST 里(R2.11.1)找不到FDR-AME;
2 DOWNLOAD multtest后, R 需要Biobase? 又找不到Biobase;
3 用这两个PACKAGES 得出的结论不太一样, 而它们用的方法是一样的,
都是B-H algorithm, 该怎么看呢?
4 若有example codes 就更好了;
谢谢! | s**c
发帖数: 1247 | 2 source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("multtest")
可以用p.adjust命令
和multtest的结果一样
不用装multtest
【在 y*********s 的大作中提到】
: 希望高人指点:
: 做MULTI TESTS,需要得出ADJUSTED P-VALUES, 想用FDR PROCEDURE(B-H algorithm).
: R 里有两个PACKAGES, multtest and FDR-AME, 可以做.
: 问题是:
: 1 在INSTALL LIST 里(R2.11.1)找不到FDR-AME;
: 2 DOWNLOAD multtest后, R 需要Biobase? 又找不到Biobase;
: 3 用这两个PACKAGES 得出的结论不太一样, 而它们用的方法是一样的,
: 都是B-H algorithm, 该怎么看呢?
: 4 若有example codes 就更好了;
: 谢谢!
| g********r
发帖数: 8017 | | y*********s
发帖数: 24 | 4 谢谢谢谢
【在 s**c 的大作中提到】
: source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
: biocLite("multtest")
: 可以用p.adjust命令
: 和multtest的结果一样
: 不用装multtest
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