由买买提看人间百态

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Military版 - GISAID提供alignment之后的sequences吗?还是只提供raw fastq?如果只提供raw fastq,做alignment对于10 million的covid genomes大概需
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D******s
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GISAID提供alignment之后的sequences吗?还是只提供raw fastq?如果只提供raw
fastq,做alignment对于10 million的covid genomes大概需要多久?
D******s
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MSA full0608 (1164 MB)
MSA codon0611 (1177 MB)
MSA unmasked0613 (672 MB)
MSA masked0613 (646 MB)
其中 第二个不包含非编码区,标号会有问题,第三个和第四个是他们用来构建最大的
那颗进化树用的文件
y******m
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如果你看到fastq文件,基本就是raw data;一般不在本机跑,在各大数据库跑,基本1-
2小时
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