x******8
发帖数: 350 | 1 安装了Fedora 20，想找找类似DNASTAR、Bioedit类的软件，结果还不太好找。各位，
麻烦给我推荐几款类似Windows下用的生物学软件啊。
目前找到了Cluster X, MUSCLE。就是类似上面的2款还没有找到，愁
求指点 |
x******8
发帖数: 350 | |
W*****x
发帖数: 684 | |
n******7
发帖数: 12463 | 4 你这几个软件主要是给纯生物的人用的
bioinfo的人不用
bioinfo的人用的工具不可能没有linux版
或者说，基本就是linux版 |
x******8
发帖数: 350 | 5 谢谢回答啊，我没有bioinfo背景，正在学习哈。
知道的话告诉几个呗 |
n******7
发帖数: 12463 | 6 你要干嘛
【在 x******8 的大作中提到】
: 谢谢回答啊，我没有bioinfo背景，正在学习哈。
: 知道的话告诉几个呗
|
x******8
发帖数: 350 | 7
用啊，大侠
【在 n******7 的大作中提到】
: 你要干嘛
|
n******7
发帖数: 12463 | 8 。。。你要干什么用
【在 x******8 的大作中提到】
:
: 用啊，大侠
|
x******8
发帖数: 350 | 9 主要处理测序峰图，几次测序后进行序列组装（较长单个片段的组装）、去除载体接头
序列、设计引物等等 |
n******7
发帖数: 12463 | 10 果然是低通量实验用的
1. 测序峰图我不看的，找了一下，有个java的工具，academic free
http://www.codoncode.com/TraceViewer/
2. Sanger 片段的组装刚好我做过
经典工具是Phrap，但是我测试CAP3在我的data上更好
3. 去除载体引物
我用的Phrap里面的cross match
2和3都没有GUI，估计你会有些郁闷
【在 x******8 的大作中提到】
: 主要处理测序峰图，几次测序后进行序列组装（较长单个片段的组装）、去除载体接头
: 序列、设计引物等等
|
x******8
发帖数: 350 | 11
谢谢！不处理海量数据，主要是少量数据处理用的。
【在 n******7 的大作中提到】
: 果然是低通量实验用的
: 1. 测序峰图我不看的，找了一下，有个java的工具，academic free
: http://www.codoncode.com/TraceViewer/
: 2. Sanger 片段的组装刚好我做过
: 经典工具是Phrap，但是我测试CAP3在我的data上更好
: 3. 去除载体引物
: 我用的Phrap里面的cross match
: 2和3都没有GUI，估计你会有些郁闷
|
n******7
发帖数: 12463 | 12 我感觉你这种桌面用户，又小众需求的，linux下面的工具是少很多
看峰值图的软件win和osx下面都很多
做序列alignment，我给你的这些都是适合自动批量处理的，我估计你希望找个可视化
的工具来做吧
我要是软件公司的，肯定也优先出win/osx平台软件，因为大部分生物人桌面还是win或
者osx
给你两个其他方案：
1. 虚拟机。 你搜virtualbox，可能fedora的源里面也有，然后装个windows或者osx。
2. wine这种模拟windows API的工具。
https://appdb.winehq.org/
这里可以查软件支持
小众软件可能没有
【在 x******8 的大作中提到】
:
: 谢谢！不处理海量数据，主要是少量数据处理用的。
|
x******8
发帖数: 350 | 13 我已经安装了双系统，打算不行就去Windows下面了。谢谢哈 |
