c*********r
发帖数: 1312 | 1 现在需要一台式机，不玩游戏，主要做一些测序数据分析，数据量比较大。犹豫了一周
了，不知道是继续等dell outlet的coupon然后选一个XPS 8300然后升级，还是选择自
己装机。
自己装机的话，准备上i7或者i5 CPU，内存越大越好，16G到32G。
关键是主板、电源、风扇、机箱等选择不在行，不知道这怎么搭配比较合理，还请版上
高手多多推荐一下。
预算$800到1000，显示器可能就去dell outlet淘一个。
附近没有MC，主要配件可能都在newegg、tiger target或者amazon等网站买了。附近也
有CompUSA可以买配件，似乎大家没怎么提起过。
多谢！^_^ |
d**********t
发帖数: 20415 | 2 不打游戏dell outlet淘高级CPU+大内存的XPS应该是最便宜的
【在 c*********r 的大作中提到】
: 现在需要一台式机，不玩游戏，主要做一些测序数据分析，数据量比较大。犹豫了一周
: 了，不知道是继续等dell outlet的coupon然后选一个XPS 8300然后升级，还是选择自
: 己装机。
: 自己装机的话，准备上i7或者i5 CPU，内存越大越好，16G到32G。
: 关键是主板、电源、风扇、机箱等选择不在行，不知道这怎么搭配比较合理，还请版上
: 高手多多推荐一下。
: 预算$800到1000，显示器可能就去dell outlet淘一个。
: 附近没有MC，主要配件可能都在newegg、tiger target或者amazon等网站买了。附近也
: 有CompUSA可以买配件，似乎大家没怎么提起过。
: 多谢！^_^
|
l*******3
发帖数: 1074 | 3 不超频的话，最经济的组合是：
i5 2400
GIGABYTE GA-Z68MA-D2H-B3(支持32Gb)
16gb
等以后内存便宜了，再上32Gb吧 |
c*********r
发帖数: 1312 | 4 多谢回复，dell outlet的XPS都是4 DIMMs，内存大小从4GB到12GB，没有16GB的。所以
可能需要选个高级CPU+12GB或者高级CPU+4GB，然后自己升级内存到16GB。
【在 d**********t 的大作中提到】
: 不打游戏dell outlet淘高级CPU+大内存的XPS应该是最便宜的
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c*********r
发帖数: 1312 | 5 多谢回复，现在的单根8GB的内存确实好贵啊。
顺便问一下，现在的主流个人电脑主板都是支持4 DIMMs，最大32GB吗？支持更多DIMMs
的主板是不是很贵？
【在 l*******3 的大作中提到】
: 不超频的话，最经济的组合是：
: i5 2400
: GIGABYTE GA-Z68MA-D2H-B3(支持32Gb)
: 16gb
: 等以后内存便宜了，再上32Gb吧
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c*********r
发帖数: 1312 | 6 GIGABYTE GA-Z68MA-D2H-B3
这个主板也支持i7，配i7-2600k如何？怎么看超频什么的是否支持？电源、风扇、
heatsink什么的怎么搭配？以前没装过机，虚心学习了。^_^
【在 l*******3 的大作中提到】
: 不超频的话，最经济的组合是：
: i5 2400
: GIGABYTE GA-Z68MA-D2H-B3(支持32Gb)
: 16gb
: 等以后内存便宜了，再上32Gb吧
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t****t
发帖数: 6806 | 7 800~1000 you can with high-end board+2600K. but if you want to do serious
calculation, better don't overclock. then you don't need 2600K.
if you want over >16G ram, you probably have to go i7-9XX with X58. those
can have 6 dimm slots. P67/Z68 usually have 4 dimm slots, if you don't buy
8G stick you are limited to 16G.
【在 c*********r 的大作中提到】
: 现在需要一台式机，不玩游戏，主要做一些测序数据分析，数据量比较大。犹豫了一周
: 了，不知道是继续等dell outlet的coupon然后选一个XPS 8300然后升级，还是选择自
: 己装机。
: 自己装机的话，准备上i7或者i5 CPU，内存越大越好，16G到32G。
: 关键是主板、电源、风扇、机箱等选择不在行，不知道这怎么搭配比较合理，还请版上
: 高手多多推荐一下。
: 预算$800到1000，显示器可能就去dell outlet淘一个。
: 附近没有MC，主要配件可能都在newegg、tiger target或者amazon等网站买了。附近也
: 有CompUSA可以买配件，似乎大家没怎么提起过。
: 多谢！^_^
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d**********t
发帖数: 20415 | 8 这板子是最廉价的Z68，可以超频，稳定性就不知道了...配i7至少配个150以上的板子
吧，不然对不起这个CPU啊，Z68和P67都是可以超频的，H67和H61都不能超
电源因为你不要显卡，搞个300-400w评价好点的电源就足够了，散热器最好自己配一个
，CM的212+物美价廉，20左右就能搞到
【在 c*********r 的大作中提到】
: GIGABYTE GA-Z68MA-D2H-B3
: 这个主板也支持i7，配i7-2600k如何？怎么看超频什么的是否支持？电源、风扇、
: heatsink什么的怎么搭配？以前没装过机，虚心学习了。^_^
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d*******e
发帖数: 1649 | 9 测序的一部分资源消耗在硬盘的读写上，最好用IO比较快的硬盘。如果长期做大量分析
的话，还是在cluster上比较好，单机还是比较慢。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 现在需要一台式机，不玩游戏，主要做一些测序数据分析，数据量比较大。犹豫了一周
: 了，不知道是继续等dell outlet的coupon然后选一个XPS 8300然后升级，还是选择自
: 己装机。
: 自己装机的话，准备上i7或者i5 CPU，内存越大越好，16G到32G。
: 关键是主板、电源、风扇、机箱等选择不在行，不知道这怎么搭配比较合理，还请版上
: 高手多多推荐一下。
: 预算$800到1000，显示器可能就去dell outlet淘一个。
: 附近没有MC，主要配件可能都在newegg、tiger target或者amazon等网站买了。附近也
: 有CompUSA可以买配件，似乎大家没怎么提起过。
: 多谢！^_^
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d**********t
发帖数: 20415 | 10 为啥超频不利于搞计算？稳定性？
【在 t****t 的大作中提到】
: 800~1000 you can with high-end board+2600K. but if you want to do serious
: calculation, better don't overclock. then you don't need 2600K.
: if you want over >16G ram, you probably have to go i7-9XX with X58. those
: can have 6 dimm slots. P67/Z68 usually have 4 dimm slots, if you don't buy
: 8G stick you are limited to 16G.
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t****t
发帖数: 6806 | 11 yes, you want correct result. if you run it for 5 mins, most probably it's
correct; even if it is not, you waste 5 mins.
if you run it for weeks, one glitch in weeks will ruin all the works for
weeks.
【在 d**********t 的大作中提到】
: 为啥超频不利于搞计算？稳定性？
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d**********t
发帖数: 20415 | 12 学习了~thx
【在 t****t 的大作中提到】
: yes, you want correct result. if you run it for 5 mins, most probably it's
: correct; even if it is not, you waste 5 mins.
: if you run it for weeks, one glitch in weeks will ruin all the works for
: weeks.
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c*********r
发帖数: 1312 | 13 多谢建议！
X58好贵啊。这个组合如何？
http://www.tigerdirect.com/applications/SearchTools/item-detail
如果用i7-9xx的话，又有个问题，第一代和第二代i core性能上差别有多大？为了多两
个内存插槽用第一代好呢还是用新的第二代CPU好呢？ 好纠结。。。
【在 t****t 的大作中提到】
: 800~1000 you can with high-end board+2600K. but if you want to do serious
: calculation, better don't overclock. then you don't need 2600K.
: if you want over >16G ram, you probably have to go i7-9XX with X58. those
: can have 6 dimm slots. P67/Z68 usually have 4 dimm slots, if you don't buy
: 8G stick you are limited to 16G.
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c*********r
发帖数: 1312 | 14 我在找找。多谢！^_^
【在 d**********t 的大作中提到】
: 这板子是最廉价的Z68，可以超频，稳定性就不知道了...配i7至少配个150以上的板子
: 吧，不然对不起这个CPU啊，Z68和P67都是可以超频的，H67和H61都不能超
: 电源因为你不要显卡，搞个300-400w评价好点的电源就足够了，散热器最好自己配一个
: ，CM的212+物美价廉，20左右就能搞到
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c*********r
发帖数: 1312 | 15 没有考虑过这一点，学习了！
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822145520
这个硬盘怎么样？ IO怎么看啊，SATA 6.0Gb/s？7200 RPM？
系里有cluster，打听打听看怎么的使用法，如果有自己的用当然最方便，不过系里的
cluster更强大就是了。多谢！^_^
【在 d*******e 的大作中提到】
: 测序的一部分资源消耗在硬盘的读写上，最好用IO比较快的硬盘。如果长期做大量分析
: 的话，还是在cluster上比较好，单机还是比较慢。
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t****t
发帖数: 6806 | 16 this depends on your application, i have no idea. 2600K is about the same
level with 960 or 970. however 1366 has roughly 50% more raw memory
bandwidth than 1155/1156. but 1155 support AVX instruction and better GPU
support if your application supports it.
if as dreamfrog said your application heavily depends on disk I/O, then
these don't matter at all.
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢建议！
: X58好贵啊。这个组合如何？
: http://www.tigerdirect.com/applications/SearchTools/item-detail
: 如果用i7-9xx的话，又有个问题，第一代和第二代i core性能上差别有多大？为了多两
: 个内存插槽用第一代好呢还是用新的第二代CPU好呢？ 好纠结。。。
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t****t
发帖数: 6806 | 17 mechanical hard drive don't need SATA6G.
you better do a resource profile first, check which one is the bottleneck.
【在 c*********r 的大作中提到】
: 没有考虑过这一点，学习了！
: http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822145520
: 这个硬盘怎么样？ IO怎么看啊，SATA 6.0Gb/s？7200 RPM？
: 系里有cluster，打听打听看怎么的使用法，如果有自己的用当然最方便，不过系里的
: cluster更强大就是了。多谢！^_^
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d*******e
发帖数: 1649 | 18 ft...i am dreamdate...
【在 t****t 的大作中提到】
: this depends on your application, i have no idea. 2600K is about the same
: level with 960 or 970. however 1366 has roughly 50% more raw memory
: bandwidth than 1155/1156. but 1155 support AVX instruction and better GPU
: support if your application supports it.
: if as dreamfrog said your application heavily depends on disk I/O, then
: these don't matter at all.
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n*******e
发帖数: 4894 | 19 。。。
【在 d*******e 的大作中提到】
: ft...i am dreamdate...
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d*******e
发帖数: 1649 | 20 如果能用系里的cluster最好了，这取决于你要分析的数据的多少。比如以后要处理几
百个全基因组测序的数据，单机是万万不行的。你可以先在cluster上运行一下，有了
直观感觉再根据需要装机。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 没有考虑过这一点，学习了！
: http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822145520
: 这个硬盘怎么样？ IO怎么看啊，SATA 6.0Gb/s？7200 RPM？
: 系里有cluster，打听打听看怎么的使用法，如果有自己的用当然最方便，不过系里的
: cluster更强大就是了。多谢！^_^
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p**********r
发帖数: 1693 | 21 Check evga b shock, x58 as low as $80
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢建议！
: X58好贵啊。这个组合如何？
: http://www.tigerdirect.com/applications/SearchTools/item-detail
: 如果用i7-9xx的话，又有个问题，第一代和第二代i core性能上差别有多大？为了多两
: 个内存插槽用第一代好呢还是用新的第二代CPU好呢？ 好纠结。。。
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s****c
发帖数: 11300 | 22 等以后内存便宜了。。。
现在就挺便宜的 关键是单条8G的还是挺贵的
【在 l*******3 的大作中提到】
: 不超频的话，最经济的组合是：
: i5 2400
: GIGABYTE GA-Z68MA-D2H-B3(支持32Gb)
: 16gb
: 等以后内存便宜了，再上32Gb吧
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t****t
发帖数: 6806 | 23 cha bu duo!
【在 d*******e 的大作中提到】
: ft...i am dreamdate...
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p******n
发帖数: 874 | 24 干这事情还是用学校的cluster吧，一个文件100G，自己机器搞太累了。 |
B*G
发帖数: 13438 | 25 2600k的话，我会买个至少是黑板的主板，做工和可靠性好很多。
【在 d**********t 的大作中提到】
: 这板子是最廉价的Z68，可以超频，稳定性就不知道了...配i7至少配个150以上的板子
: 吧，不然对不起这个CPU啊，Z68和P67都是可以超频的，H67和H61都不能超
: 电源因为你不要显卡，搞个300-400w评价好点的电源就足够了，散热器最好自己配一个
: ，CM的212+物美价廉，20左右就能搞到
|
n*******e
发帖数: 4894 | 26 我觉得也是
用着MX-UD4，比ud2h手感好很多，哈哈
【在 B*G 的大作中提到】
: 2600k的话，我会买个至少是黑板的主板，做工和可靠性好很多。
|
g*******g
发帖数: 9753 | 27 楼上说的都不靠谱
你要搞低价高性能，唯一的选择是：
E3+C202/204+ECC+SAS
千万别忘了你到底想干嘛
去newegg配一下吧 |
n***s
发帖数: 294 | 28 Buget很足，又不需显卡
建议上Intel 2600K + Z68 + 16G DDR3-1600 RAM + Crucial M4 128G SSD
系统和主要应用装SSD上。
Dell outlet里的xps配置还不如等deal买配件自己装。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 现在需要一台式机，不玩游戏，主要做一些测序数据分析，数据量比较大。犹豫了一周
: 了，不知道是继续等dell outlet的coupon然后选一个XPS 8300然后升级，还是选择自
: 己装机。
: 自己装机的话，准备上i7或者i5 CPU，内存越大越好，16G到32G。
: 关键是主板、电源、风扇、机箱等选择不在行，不知道这怎么搭配比较合理，还请版上
: 高手多多推荐一下。
: 预算$800到1000，显示器可能就去dell outlet淘一个。
: 附近没有MC，主要配件可能都在newegg、tiger target或者amazon等网站买了。附近也
: 有CompUSA可以买配件，似乎大家没怎么提起过。
: 多谢！^_^
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c*********r
发帖数: 1312 | 29 多谢楼上各位的建议，现在下决心自己装了，麻烦是麻烦一些，但可以更好的满足需要
。不过装一台符合自己要求的机器还真是折腾啊，要做好多工作。
刚才和系里的一个做测序分析的聊了一下，他用iMac，i7,256G SSD+1T hard drive,
16 G 1333 RAM。他感觉瓶颈在于RAM，可能i5就够了，SSD很重要，就像 dreamdate
提到的，硬盘读写速度很消耗资源。
所以现在计划可能是
CPU: i5 2500 或者i7 2600
内存：16G DDR3 1333/1600 RAM
硬盘：120/128G SSD+1TB~2TB Drive
比较了一下CUP，2500 vs 2500K，2600 vs 2600K 似乎差别不大，主要在graphics处理
能力上？不过价格差别也不大。
i5和i7最大的差别在于缓存吗？6M vs 8M。不知道这个2M的差别在性能上有多大的提升
。因为添加了SSD会影响预算比较多，如果i5适当超频够用而且稳定的话，可能就上i5
了。
如果用i5的话，适当的超频，要稳定，加上SSD和HDD硬盘，哪些主板比较搭配？要考虑哪些参数？最发愁的就是这个主板的选择了。
【在 n***s 的大作中提到】
: Buget很足，又不需显卡
: 建议上Intel 2600K + Z68 + 16G DDR3-1600 RAM + Crucial M4 128G SSD
: 系统和主要应用装SSD上。
: Dell outlet里的xps配置还不如等deal买配件自己装。
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c*********r
发帖数: 1312 | 30 很同意你说的“千万别忘了你到底想干嘛”，现在正在和多个有经验的人士了解到底需
要干什么，什么样的配置能合理的解决问题。^_^
E3+C202/204+ECC+SAS？这个缩写对我有点难了，能给个全名吗？多谢！
【在 g*******g 的大作中提到】
: 楼上说的都不靠谱
: 你要搞低价高性能，唯一的选择是：
: E3+C202/204+ECC+SAS
: 千万别忘了你到底想干嘛
: 去newegg配一下吧
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c*********r
发帖数: 1312 | 31 谢谢回复，做过相关分析的人都告诉我RAM是瓶颈。听说CPU慢的话，最多用时间长一些
；但是RAM太小的话，程序会停止运行。
【在 t****t 的大作中提到】
: mechanical hard drive don't need SATA6G.
: you better do a resource profile first, check which one is the bottleneck.
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c*********r
发帖数: 1312 | 32 evga b stock吗？ 这是个什么东东？
【在 p**********r 的大作中提到】
: Check evga b shock, x58 as low as $80
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c*********r
发帖数: 1312 | 33 系里有一个8核的机器，但内存太小。有一个64+4核的cluster？没有具体的信息，还得
等IT staff度假回来了才能了解到。。。
我的数据量可能没那么大，目前单个文件不到1G。测序一个样本大概10到20 million
100bp read。不知道这个数据量算不算很大。
【在 p******n 的大作中提到】
: 干这事情还是用学校的cluster吧，一个文件100G，自己机器搞太累了。
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a*******t
发帖数: 1356 | 34
dreamdate
K版不锁倍频，容易超频
i5
i7有HT，4核心8线程
i5没HT，4核心4线程
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢楼上各位的建议，现在下决心自己装了，麻烦是麻烦一些，但可以更好的满足需要
: 。不过装一台符合自己要求的机器还真是折腾啊，要做好多工作。
: 刚才和系里的一个做测序分析的聊了一下，他用iMac，i7,256G SSD+1T hard drive,
: 16 G 1333 RAM。他感觉瓶颈在于RAM，可能i5就够了，SSD很重要，就像 dreamdate
: 提到的，硬盘读写速度很消耗资源。
: 所以现在计划可能是
: CPU: i5 2500 或者i7 2600
: 内存：16G DDR3 1333/1600 RAM
: 硬盘：120/128G SSD+1TB~2TB Drive
: 比较了一下CUP，2500 vs 2500K，2600 vs 2600K 似乎差别不大，主要在graphics处理
|
w****e
发帖数: 536 | 35 ebay上淘个exon L5640 es，大概400美金以下
Corsair XMS3 12GB ( 3 x 4GB )
Gigabyte LGA 1366 Intel X58 USB 3.0 ATX Intel Motherboard (GA-X58-USB3)
其他随便。 |
k**0
发帖数: 19737 | 36 i7 2nd gen
motherboard supports SATA 3.0 (6GHZ)
SATA 3.0 SSD
+ 3 通道 ram 12G+ |
c*********r
发帖数: 1312 | 37 查了一下，这个英特尔超线程技术看来对多核CPU效率提升有很大帮助啊。看来还是有
必要上i7。。。
【在 a*******t 的大作中提到】
:
: dreamdate
: K版不锁倍频，容易超频
: i5
: i7有HT，4核心8线程
: i5没HT，4核心4线程
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d**********t
发帖数: 20415 | 38 2代i7不能三通道...
【在 k**0 的大作中提到】
: i7 2nd gen
: motherboard supports SATA 3.0 (6GHZ)
: SATA 3.0 SSD
: + 3 通道 ram 12G+
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c*********r
发帖数: 1312 | 39 多谢推荐，ebay上这个exon L5640 es要bid吧？
12GB RAM对我的应用稍小了一些。
【在 w****e 的大作中提到】
: ebay上淘个exon L5640 es，大概400美金以下
:
: Corsair XMS3 12GB ( 3 x 4GB )
:
: Gigabyte LGA 1366 Intel X58 USB 3.0 ATX Intel Motherboard (GA-X58-USB3)
: 其他随便。
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d********e
发帖数: 1468 | 40 看来你要作的功课很多，他说的是上一代LGA 1366平台上的东西，跟现在的LGA 1155的
不通用。而且，ES代表是engineering sample，工程样品，这玩意自己玩玩还行，搞严
肃计算而且预算足的情况下严重不推荐。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢推荐，ebay上这个exon L5640 es要bid吧？
: 12GB RAM对我的应用稍小了一些。
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d********e
发帖数: 1468 | 41 三通道没有理论上那么神。现实的情况是二代上内存双通道的性能秒一代三通道几条街。
【在 d**********t 的大作中提到】
: 2代i7不能三通道...
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d**********t
发帖数: 20415 | 42 我就是说2代i7不要上3通道...
街。
【在 d********e 的大作中提到】
: 三通道没有理论上那么神。现实的情况是二代上内存双通道的性能秒一代三通道几条街。
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d********e
发帖数: 1468 | 43 E3是二代sandy bridge服务器CPU的总称了。其中E3-1230似乎比较火。c202/204是芯片
组，相当于消费市场的p67/z68。ECC是纠错内存，一般用于服务器上。SAS硬盘同样是
用在服务器上比较多。
这样一套的配置显然是用来构建服务器的，至于是否符合你的计算环境，还是自己定夺
了。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 很同意你说的“千万别忘了你到底想干嘛”，现在正在和多个有经验的人士了解到底需
: 要干什么，什么样的配置能合理的解决问题。^_^
: E3+C202/204+ECC+SAS？这个缩写对我有点难了，能给个全名吗？多谢！
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c*********r
发帖数: 1312 | 44 我需要做的功课太多了，毕竟不是专业搞硬件的。
现在做个生物实验都恨不得把计算机硬件搞精通了来装机，软件编程学了来做
bioinformatics；要是能懂点光学和物理，自己组装一台高分辨率显微镜并且做后期图
像分析处理就更牛了。。。呵呵
做实验间隙埋头学习中，过一会再上来骚扰版上牛人们。^_^
【在 d********e 的大作中提到】
: 看来你要作的功课很多，他说的是上一代LGA 1366平台上的东西，跟现在的LGA 1155的
: 不通用。而且，ES代表是engineering sample，工程样品，这玩意自己玩玩还行，搞严
: 肃计算而且预算足的情况下严重不推荐。
|
c*********r
发帖数: 1312 | 45 服务器级别的配置其实也有人用，但是肯定超我的预算。我就计划搞个性能高一些的PC
，做些相对大运算量的数据分析。更大数据量的分析就交给specialist做吧，现在已经
够折腾的了。^_^
【在 d********e 的大作中提到】
: E3是二代sandy bridge服务器CPU的总称了。其中E3-1230似乎比较火。c202/204是芯片
: 组，相当于消费市场的p67/z68。ECC是纠错内存，一般用于服务器上。SAS硬盘同样是
: 用在服务器上比较多。
: 这样一套的配置显然是用来构建服务器的，至于是否符合你的计算环境，还是自己定夺
: 了。
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c*********r
发帖数: 1312 | 46 对比了一下i7-2600k, i5-2500k和E3-1230，其实发现这个E3 1230还很不错。
http://ark.intel.com/compare/52214,52210,52271
和i5-2500K类似的价格，graphics方面差一些，GPU其实我并不需要。但是和i7一样的
8M缓存，HTT。3.2MHz也不赖。
值得考虑！^_^
【在 d********e 的大作中提到】
: E3是二代sandy bridge服务器CPU的总称了。其中E3-1230似乎比较火。c202/204是芯片
: 组，相当于消费市场的p67/z68。ECC是纠错内存，一般用于服务器上。SAS硬盘同样是
: 用在服务器上比较多。
: 这样一套的配置显然是用来构建服务器的，至于是否符合你的计算环境，还是自己定夺
: 了。
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d********e
发帖数: 1468 | 47 小心1230没有集显，你要单独再买显卡。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 对比了一下i7-2600k, i5-2500k和E3-1230，其实发现这个E3 1230还很不错。
: http://ark.intel.com/compare/52214,52210,52271
: 和i5-2500K类似的价格，graphics方面差一些，GPU其实我并不需要。但是和i7一样的
: 8M缓存，HTT。3.2MHz也不赖。
: 值得考虑！^_^
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c*********r
发帖数: 1312 | 48 那推荐几个和E3-1230搭配的主板吧，最好有集显的，能适当超频的。多谢！
我也找找。
【在 d********e 的大作中提到】
: 小心1230没有集显，你要单独再买显卡。
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c*********r
发帖数: 1312 | 49 http://www.tigerdirect.com/applications/SearchTools/item-detail
这个不错，但需要独立显卡是吧？Xeon最好适合C202/204芯片组什么的配在一起还是可
以和desktop的主板搭配啊？
【在 d********e 的大作中提到】
: 小心1230没有集显，你要单独再买显卡。
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c*********r
发帖数: 1312 | 50 多谢推荐！刚刚看了一下E3系列的CPU，确实很符合要求，因为我并不需要很强大的图
像处理能力。学习了！^_^
【在 g*******g 的大作中提到】
: 楼上说的都不靠谱
: 你要搞低价高性能，唯一的选择是：
: E3+C202/204+ECC+SAS
: 千万别忘了你到底想干嘛
: 去newegg配一下吧
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n***s
发帖数: 294 | 51 i5: no HyperThreading, 4 core, 6MB L3 cache
i7: 4 core, HyperThreading (8core), 8MB L3cache
如果你的app能利用多线程，上i7值得，也就多$100。有k的CPU没有锁倍频，超频好办
。i7 2600k超到4.2G不是什么问题，买个一般的heatsink就行，性能没得说。
主板可以考虑Asrock，GigaByte的主流z68，$150左右，经常有跟cpu的combo deal，还
能便宜几十。buget不够上大的SSD，可以考虑用Z68的Rapid Response storage，买个$
100左右的20,30G的SSD做hard drive cache。
dreamdate
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢楼上各位的建议，现在下决心自己装了，麻烦是麻烦一些，但可以更好的满足需要
: 。不过装一台符合自己要求的机器还真是折腾啊，要做好多工作。
: 刚才和系里的一个做测序分析的聊了一下，他用iMac，i7,256G SSD+1T hard drive,
: 16 G 1333 RAM。他感觉瓶颈在于RAM，可能i5就够了，SSD很重要，就像 dreamdate
: 提到的，硬盘读写速度很消耗资源。
: 所以现在计划可能是
: CPU: i5 2500 或者i7 2600
: 内存：16G DDR3 1333/1600 RAM
: 硬盘：120/128G SSD+1TB~2TB Drive
: 比较了一下CUP，2500 vs 2500K，2600 vs 2600K 似乎差别不大，主要在graphics处理
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n***s
发帖数: 294 | 52 $1000能搞定？怀疑。
【在 d********e 的大作中提到】
: E3是二代sandy bridge服务器CPU的总称了。其中E3-1230似乎比较火。c202/204是芯片
: 组，相当于消费市场的p67/z68。ECC是纠错内存，一般用于服务器上。SAS硬盘同样是
: 用在服务器上比较多。
: 这样一套的配置显然是用来构建服务器的，至于是否符合你的计算环境，还是自己定夺
: 了。
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p**********r
发帖数: 1693 | 53 EVGA自己卖的返修货，基本没质保，就一个优点，可以很便宜
【在 c*********r 的大作中提到】
: evga b stock吗？ 这是个什么东东？
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g*******g
发帖数: 9753 | 54 i7+Z68的配置是给台式机玩的，你要是搞高性能计算，特别是长时间高负载运转，是不
行的。你必须得用ECC内存，这样就得上E3+C202/204了
给你配一下，你自己调整
E3-1230，240刀
ASUS P8B-X 190刀
Kingston 2*4GB ECC内存75刀（两套150刀）
硬盘买两块做个Raid1
再加上机箱电源，1000刀肯定够了
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢推荐！刚刚看了一下E3系列的CPU，确实很符合要求，因为我并不需要很强大的图
: 像处理能力。学习了！^_^
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g*******g
发帖数: 9753 | 55 非也，这是工作站的标准配置，呵呵
上个C206，就可以有声卡和SAS控制器了，纯计算的话202就够了
大部分C202/204有板载显卡，所以用E3-1230即可，无需1235
【在 d********e 的大作中提到】
: E3是二代sandy bridge服务器CPU的总称了。其中E3-1230似乎比较火。c202/204是芯片
: 组，相当于消费市场的p67/z68。ECC是纠错内存，一般用于服务器上。SAS硬盘同样是
: 用在服务器上比较多。
: 这样一套的配置显然是用来构建服务器的，至于是否符合你的计算环境，还是自己定夺
: 了。
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d********e
发帖数: 1468 | 56 强烈推荐，这个显然是最合理的配置了。
【在 g*******g 的大作中提到】
: i7+Z68的配置是给台式机玩的，你要是搞高性能计算，特别是长时间高负载运转，是不
: 行的。你必须得用ECC内存，这样就得上E3+C202/204了
: 给你配一下，你自己调整
: E3-1230，240刀
: ASUS P8B-X 190刀
: Kingston 2*4GB ECC内存75刀（两套150刀）
: 硬盘买两块做个Raid1
: 再加上机箱电源，1000刀肯定够了
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d********e
发帖数: 1468 | 57 受教了。有点想当然以为跟消费市场的板子一样没有板载显卡。
【在 g*******g 的大作中提到】
: 非也，这是工作站的标准配置，呵呵
: 上个C206，就可以有声卡和SAS控制器了，纯计算的话202就够了
: 大部分C202/204有板载显卡，所以用E3-1230即可，无需1235
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d********e
发帖数: 1468 | 58 这个是1366平台，显然不行。看上面goldenegg的推荐吧。
另外，板子可以看看这个open box的ASUS P8B WS：
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813131725
【在 c*********r 的大作中提到】
: http://www.tigerdirect.com/applications/SearchTools/item-detail
: 这个不错，但需要独立显卡是吧？Xeon最好适合C202/204芯片组什么的配在一起还是可
: 以和desktop的主板搭配啊？
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c*********r
发帖数: 1312 | 59 碰到大牛+好人了！多谢多谢！
昨天查了一下ECC纠错内存、Z68、P67、H67、H61，又学习了。
这种测序分析确实会长时间运行，有时候一个分析跑一两天。用来构建复杂的进化树更
要时间长。所以稳定性和运算能力都不能差。
我在好好做做功课，真长知识啊！
【在 g*******g 的大作中提到】
: i7+Z68的配置是给台式机玩的，你要是搞高性能计算，特别是长时间高负载运转，是不
: 行的。你必须得用ECC内存，这样就得上E3+C202/204了
: 给你配一下，你自己调整
: E3-1230，240刀
: ASUS P8B-X 190刀
: Kingston 2*4GB ECC内存75刀（两套150刀）
: 硬盘买两块做个Raid1
: 再加上机箱电源，1000刀肯定够了
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c*********r
发帖数: 1312 | 60 看大牛们交流，如沐春风啊。
【在 d********e 的大作中提到】
: 受教了。有点想当然以为跟消费市场的板子一样没有板载显卡。
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c*********r
发帖数: 1312 | 61 多谢推荐！我争取下午列两个单子，i7-2600k vs E3-1230，贴上来给大家讨论讨论哪
个更合适。
个$
【在 n***s 的大作中提到】
: i5: no HyperThreading, 4 core, 6MB L3 cache
: i7: 4 core, HyperThreading (8core), 8MB L3cache
: 如果你的app能利用多线程，上i7值得，也就多$100。有k的CPU没有锁倍频，超频好办
: 。i7 2600k超到4.2G不是什么问题，买个一般的heatsink就行，性能没得说。
: 主板可以考虑Asrock，GigaByte的主流z68，$150左右，经常有跟cpu的combo deal，还
: 能便宜几十。buget不够上大的SSD，可以考虑用Z68的Rapid Response storage，买个$
: 100左右的20,30G的SSD做hard drive cache。
:
: dreamdate
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s9
发帖数: 1192 | 62 测序分析的瓶颈大部分在File I/O上。买两个240G的SSD做计算的Raid。再卖几个T的硬
盘做存储。
此外，CPU的频率越高越好，Mem最好32G，否则很多东西根本做不了。
个人经验。
【在 c*********r 的大作中提到】
: 现在需要一台式机，不玩游戏，主要做一些测序数据分析，数据量比较大。犹豫了一周
: 了，不知道是继续等dell outlet的coupon然后选一个XPS 8300然后升级，还是选择自
: 己装机。
: 自己装机的话，准备上i7或者i5 CPU，内存越大越好，16G到32G。
: 关键是主板、电源、风扇、机箱等选择不在行，不知道这怎么搭配比较合理，还请版上
: 高手多多推荐一下。
: 预算$800到1000，显示器可能就去dell outlet淘一个。
: 附近没有MC，主要配件可能都在newegg、tiger target或者amazon等网站买了。附近也
: 有CompUSA可以买配件，似乎大家没怎么提起过。
: 多谢！^_^
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c*********r
发帖数: 1312 | 63 遇到内行了！
多谢指点！这两个ssd加上一个hdd估计就超预算了，虽然预算可以适当追加。。。
我们系有PI用clc genomics workbench软件。硬件是iMac i7，16G RAM，256 SSD + 2T HDD。系统在SSD上的，但软件和数据都在HDD上，230 million 2X100bp short reads，de novo assembly需要4、5个小时。不过序列的trimming要好久。。。
我目前的数据量是这样子的：单个文件不到2G（不知道是raw data还是经过一两步的处理的数据），测序一个样本大概10到20 million 100bp reads，会有4到10个样，都是transcriptome样本，不知道这个数据量算不算很大。还好不是做人或老鼠等复杂动物的whole genome，不然我也自己玩不起啊。。。
鉴于我的数据量小一些，以后暂时不会有更大的，所以想装个类似配置的机器玩一玩，应该够用吧。
多谢了！^_^
【在 s9 的大作中提到】
: 测序分析的瓶颈大部分在File I/O上。买两个240G的SSD做计算的Raid。再卖几个T的硬
: 盘做存储。
: 此外，CPU的频率越高越好，Mem最好32G，否则很多东西根本做不了。
: 个人经验。
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a***e
发帖数: 27968 | 64 2600k of course.
【在 c*********r 的大作中提到】
: 多谢推荐！我争取下午列两个单子，i7-2600k vs E3-1230，贴上来给大家讨论讨论哪
: 个更合适。
:
: 个$
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n*****t
发帖数: 834 | 65 内存能配多大就配多大，这个的确很重要，尽量争取往32G上吧
不过应该也不是所有的步骤都要用那么大的内存的，如果真正到时候还是不行，可以想
办法用cluster
CPU 现在的i5,i7对你的使用应该基本没多少差别，有的时候也要看程序本身对于多线
程的支持怎么样的 |
c*********r
发帖数: 1312 | 66 配置1（i7-2600k+P67）vs 配置2（Xeon E3-1230+C202/C204/C206）。硬盘考虑用120
SSD+1TB/2TBHDD; goldenegg建议硬盘买两块做个Raid1，不知道这个是否只需两个HDD
即可；RAID1数据安全性高，但是我担心运算速度会太慢。新手第一次装机，请大家多
多指教。^_^
配置1.
CPU: Intel Core i7-2600K; $315 (With GPU, 不需要显卡？)
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16819115070
SSD: Intel 510 120GB SATA III; $277; 最好搭配SATA 6Gb/s
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16820167042
HDD:
Choice 1. Seagate Barracuda 1TB 7200 RPM 32MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare Drive;
$55
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822148697
Choice 2. Western Digital Caviar Black 1TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s
Bare Drive; $80
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822136533
Choice 3: Seagate Barracuda XT 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare
Drive; $130
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822148506
Choice 4: HITACHI Deskstar 7K3000 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare
Drive; $120
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822145473
内存:
Choice 1. G.SKILL Ripjaws Series 16GB (4 x 4GB) 240-Pin DDR3 SDRAM DDR3 1600
; $115
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16820231315
Choice 2. G.SKILL Ripjaws X Series 16GB (4 x 4GB) 240-Pin DDR3 SDRAM DDR3
1866; $170 (-40)
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16820231456
主板: 3个选择，这里没选Z68主要是考虑CPU集合了GPU，就不需要额外的显卡了；当然
如果有划算的Z68主板也可以考虑。
http://www.newegg.com/Product/Productcompare.aspx?Submit=ENE&N=
Choice 1: MSI P67A-C43 (B3) LGA 1155 Intel P67 SATA 6Gb/s USB 3.0 ATX Intel
Motherboard; $110.
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813130571
Choice 2: Intel BOXDP67BGB3 LGA 1155 Intel P67 SATA 6Gb/s USB 3.0 ATX Intel
Motherboard; $180
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813121511
Choice 3: GIGABYTE GA-P67A-UD4-B3 LGA 1155 Intel P67 SATA 6Gb/s USB 3.0 ATX
Intel Motherboard; $180
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813128478
显卡: 无独立显卡；CPU集显。
电源: ？
风扇: ？
散热: ？
机箱: ？
光驱: ？
配置2.
CPU: Intel Xeon E3-1230; $240
SSD: Intel 510 120GB SATA III; $277; 最好搭配SATA 6Gb/s
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16820167042
HDD:
Choice 1. Seagate Barracuda 1TB 7200 RPM 32MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare Drive;
$55
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822148697
Choice 2. Western Digital Caviar Black 1TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s
Bare Drive; $80
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822136533
Choice 3: Seagate Barracuda XT 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare
Drive; $130
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822148506
Choice 4: HITACHI Deskstar 7K3000 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare
Drive; $120
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822145473
内存: ECC内存
Kingston ValueRAM 4GB 240-Pin DDR3 SDRAM ECC Unbuffered DDR3 1333 Server
Memory Model KVR1333D3E9S/4G; $43x4=$152
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16820139077
主板: 3个选择，其中C206贵一些，但是比较想要SATA 6.0Gb/s和USB3.0。大家觉得有
没有必要？
http://www.newegg.com/Product/Productcompare.aspx?Submit=ENE&N=
Choice 1. ASUS P8B-X LGA 1155 Intel C202 ATX Intel Xeon E3 Server
Motherboard; $190
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813131722&Tpk=ASUS%20P8B-X
Choice 2. SUPERMICRO MBD-X9SCM-F-O LGA 1155 Intel C204 Micro ATX Intel Xeon
E3 Server Motherboard; $200
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813182253
Choice 3. ASUS P8B WS LGA 1155 Intel C206 ATX Intel Xeon E3 Server/
Workstation Motherboard; $230
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813131725
显卡: 无独立显卡；主板集显。
电源: ？
风扇: ？
散热: ？
机箱: ？？？服务器机箱还是普通台式机机箱？？？
光驱: ？
大家先评价一下搭配是否合理？有些配件列出多个选项的该如何选择？是否有其它更好
方案？能否满足运算要求？有哪些是瓶颈？搭配合理以及性能够用是我优先考虑的因素。
接下来就是考虑预算问题了：
不算电源、风扇、散热、机箱和光驱，不考虑任何coupon打折cashback和税，配置1要$
870+ 到1030+，配置2要$910+到$1020+。
电源、风扇、散热、机箱和光驱要多少预算？$200~$300?
这样算下来要$1100至$1300左右（税前以及未使用任何coupon等）。
多谢大家指点！
【在 g*******g 的大作中提到】
: i7+Z68的配置是给台式机玩的，你要是搞高性能计算，特别是长时间高负载运转，是不
: 行的。你必须得用ECC内存，这样就得上E3+C202/204了
: 给你配一下，你自己调整
: E3-1230，240刀
: ASUS P8B-X 190刀
: Kingston 2*4GB ECC内存75刀（两套150刀）
: 硬盘买两块做个Raid1
: 再加上机箱电源，1000刀肯定够了
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c*********r
发帖数: 1312 | 67 “摘要”
配置1（i7-2600k+P67）vs 配置2（Xeon E3-1230+C202/C204/C206）。硬盘考虑用120
SSD+1TB/2TBHDD; goldenegg建议硬盘买两块做个Raid1，不知道这个是否只需两个HDD
即可；RAID1数据安全性高，但是我担心运算速度会太慢。
配置1.
CPU: Intel Core i7-2600K; $315 (With GPU, 不需要显卡？)
SSD: Intel 510 120GB SATA III; $277; requires SATA III 6Gb/s
HDD: Choice 1. Seagate Barracuda 1TB 7200 RPM 32MB Cache SATA 6.0Gb/s
Bare Drive; $55
Choice 2. Western Digital Caviar Black 1TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.
0Gb/s Bare Drive; $80
Choice 3: Seagate Barracuda XT 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare
Drive; $130
Choice 4: HITACHI Deskstar 7K3000 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s
Bare Drive; $120
内存: Choice 1. G.SKILL Ripjaws Series 16GB (4 x 4GB) 240-Pin DDR3 SDRAM
DDR3 1600; $115
Choice 2. G.SKILL Ripjaws X Series 16GB (4 x 4GB) 240-Pin DDR3 SDRAM
DDR3 1866; $170 (-40)
主板: 3个选择，这里没选Z68主要是考虑CPU集合了GPU，就不需要额外的显卡了；当然
如果有划算的Z68主板也可以考虑。
Choice 1: MSI P67A-C43 (B3) LGA 1155 Intel P67 SATA 6Gb/s USB 3.0 ATX
Intel Motherboard; $110.
Choice 2: Intel BOXDP67BGB3 LGA 1155 Intel P67 SATA 6Gb/s USB 3.0 ATX
Intel Motherboard; $180
Choice 3: GIGABYTE GA-P67A-UD4-B3 LGA 1155 Intel P67 SATA 6Gb/s USB 3.0
ATX Intel Motherboard; $180
显卡: 无独立显卡；CPU集显。
电源: ？
风扇: ？
散热: ？
机箱: ？
光驱: ？
配置2.
CPU: Intel Xeon E3-1230; $240
SSD: Intel 510 120GB SATA III; $277; 最好搭配SATA 6Gb/s
HDD: Choice 1. Seagate Barracuda 1TB 7200 RPM 32MB Cache SATA 6.0Gb/s
Bare Drive; $55
Choice 2. Western Digital Caviar Black 1TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.
0Gb/s Bare Drive; $80
Choice 3: Seagate Barracuda XT 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s Bare
Drive; $130
Choice 4: HITACHI Deskstar 7K3000 2TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.0Gb/s
Bare Drive; $120
内存: ECC内存Kingston ValueRAM 4GB 240-Pin DDR3 SDRAM ECC Unbuffered DDR3
1333 Server Memory Model KVR1333D3E9S/4G; $43x4=$152
主板: 3个选择，其中C206贵一些，但是比较想要SATA 6.0Gb/s和USB3.0。大家觉得有
没有必要？
Choice 1. ASUS P8B-X LGA 1155 Intel C202 ATX Intel Xeon E3 Server
Motherboard; $190
Choice 2. SUPERMICRO MBD-X9SCM-F-O LGA 1155 Intel C204 Micro ATX Intel
Xeon E3 Server Motherboard; $200
Choice 3. ASUS P8B WS LGA 1155 Intel C206 ATX Intel Xeon E3 Server/
Workstation Motherboard; $230
显卡: 无独立显卡；主板集显。
电源: ？
风扇: ？
散热: ？
机箱: ？？？服务器机箱还是普通台式机机箱？？？
光驱: ？
大家先评价一下搭配是否合理？有些配件列出多个选项的该如何选择？是否有其它更好
方案？能否满足运算要求？有哪些是瓶颈？搭配合理以及性能够用是我优先考虑的因素。
接下来就是考虑预算问题了：
不算电源、风扇、散热、机箱和光驱，不考虑任何coupon打折cashback和税，配置1要$
870+ 到1030+，配置2要$910+到$1020+。
电源、风扇、散热、机箱和光驱要多少预算？$200~$300?
这样算下来要$1100至$1300左右（税前以及未使用任何coupon等）。
多谢大家指点！ |
c*********r
发帖数: 1312 | 68 忘了说了，配置一里2600K可以超频，配置二主要特点是稳定。你们大家觉得一下哪个更适合使用要求。
配置二忘了选SAS硬盘了，现在去看看。 |
c*********r
发帖数: 1312 | 69 SAS硬盘都好贵，而且评价也不多。不知道这个希捷的盘怎么样：
Seagate Constellation ES ST3500414SS 500GB 7200 RPM 16MB Cache SAS 6Gb/s 3.5
" Internal Hard Drive -Bare Drive
$125
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822148631 |
d********e
发帖数: 1468 | 70 你上边的配置一还是有错误，CPU里的GPU核心要通过Z68才能发挥作用，所以一定要采
用Z68主板。
目前最强的SSD还是Crucial的M4/C400，也不贵，$200左右。
硬盘作RAID一般性能会提高一倍左右，正好跟你的理解相反。不过既然选择了SSD 就不
用RAID了。
个人还是倾向于方案二，毕竟数据还是要在保证正确的前提下考虑速度。
E3-1230/Asus P8B WS/Kingston ECC 4x4/Crucial M4 120GB/Hitachi 2TB我看行。 |
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g*******g
发帖数: 9753 | 71 RAID1的读性能提高接近一倍，写性能会略降一点，看楼主对此是否看重了
SAS硬盘的读写速率不比SATA强多少，但IO要高很多，但楼主想上SAS的话还得找个带
SAS控制器的主板，否则单买SAS卡那可就老贵了
楼主的方案二没啥问题，就是内存买8G的套装可以便宜个10刀左右吧
【在 d********e 的大作中提到】
: 你上边的配置一还是有错误，CPU里的GPU核心要通过Z68才能发挥作用，所以一定要采
: 用Z68主板。
: 目前最强的SSD还是Crucial的M4/C400，也不贵，$200左右。
: 硬盘作RAID一般性能会提高一倍左右，正好跟你的理解相反。不过既然选择了SSD 就不
: 用RAID了。
: 个人还是倾向于方案二，毕竟数据还是要在保证正确的前提下考虑速度。
: E3-1230/Asus P8B WS/Kingston ECC 4x4/Crucial M4 120GB/Hitachi 2TB我看行。
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l*******3
发帖数: 1074 | 72 我做生物信息，CPU不重要，内存和硬盘是瓶颈，尤其是内存！
如果你用velvet做de novo assembly，请计算一下你需要多少内存，比如：
http://denovoutils.appspot.com/velvetmem
我的机器16gb，昨天用20 cov的mate-pair reads做hg_chr14(107m bp)的assembly，内
存就已经不够了（略大于16gb），无奈只能用15 cov的做。
现在单条8gb的太贵，建议用x58的板子，上24gb内存，至于cpu，上一代i7就已经可以
了，比如920/960等等。
ssd当然可以考虑，不过不是必须。 |
c*********r
发帖数: 1312 | 73 集成了SAS controller的主板找了半天在new egg上只找到一个，有点贵而且没有USB 3
.0：
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813151247
有没有其它的既有SAS控制器，又有SATA 6G/s和USB3.0的主板。如果用这个主板的话，
硬盘该怎么配置？
可以一个SSD+一个SAS HDD吗？系统和主要的应用软件以及待分析的数据在SSD,其它的
在HDD。还是要装两个HDD搞RAID什么的？
版上有前辈推荐不需要SSD：
http://www.mitbbs.com/article/Hardware/31568857_0.html
所以硬盘这一块真不知道该怎么折腾。多谢！
【在 g*******g 的大作中提到】
: RAID1的读性能提高接近一倍，写性能会略降一点，看楼主对此是否看重了
: SAS硬盘的读写速率不比SATA强多少，但IO要高很多，但楼主想上SAS的话还得找个带
: SAS控制器的主板，否则单买SAS卡那可就老贵了
: 楼主的方案二没啥问题，就是内存买8G的套装可以便宜个10刀左右吧
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c*********r
发帖数: 1312 | 74 多谢回复！我做sea urchin的转录组，它的基因组略小于1Gb，转录组应该更小一些。
我目前的data是小于20Million的100bp paired-end reads，不知道这个需要多大的内
存？
至于transcriptome有多大，我得找个人问问先。
【在 l*******3 的大作中提到】
: 我做生物信息，CPU不重要，内存和硬盘是瓶颈，尤其是内存！
: 如果你用velvet做de novo assembly，请计算一下你需要多少内存，比如：
: http://denovoutils.appspot.com/velvetmem
: 我的机器16gb，昨天用20 cov的mate-pair reads做hg_chr14(107m bp)的assembly，内
: 存就已经不够了（略大于16gb），无奈只能用15 cov的做。
: 现在单条8gb的太贵，建议用x58的板子，上24gb内存，至于cpu，上一代i7就已经可以
: 了，比如920/960等等。
: ssd当然可以考虑，不过不是必须。
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c*********r
发帖数: 1312 | 75 可以用虚拟内存吗？
【在 l*******3 的大作中提到】
: 我做生物信息，CPU不重要，内存和硬盘是瓶颈，尤其是内存！
: 如果你用velvet做de novo assembly，请计算一下你需要多少内存，比如：
: http://denovoutils.appspot.com/velvetmem
: 我的机器16gb，昨天用20 cov的mate-pair reads做hg_chr14(107m bp)的assembly，内
: 存就已经不够了（略大于16gb），无奈只能用15 cov的做。
: 现在单条8gb的太贵，建议用x58的板子，上24gb内存，至于cpu，上一代i7就已经可以
: 了，比如920/960等等。
: ssd当然可以考虑，不过不是必须。
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c*********r
发帖数: 1312 | 76 看来我真得好好考虑考虑一代的Core i了，毕竟相应的主板支持6条内存。我在仔细研
究研究！多谢了！^_^
【在 l*******3 的大作中提到】
: 我做生物信息，CPU不重要，内存和硬盘是瓶颈，尤其是内存！
: 如果你用velvet做de novo assembly，请计算一下你需要多少内存，比如：
: http://denovoutils.appspot.com/velvetmem
: 我的机器16gb，昨天用20 cov的mate-pair reads做hg_chr14(107m bp)的assembly，内
: 存就已经不够了（略大于16gb），无奈只能用15 cov的做。
: 现在单条8gb的太贵，建议用x58的板子，上24gb内存，至于cpu，上一代i7就已经可以
: 了，比如920/960等等。
: ssd当然可以考虑，不过不是必须。
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l*******3
发帖数: 1074 | 77 你用我提供的网页计算一下内存, 虚拟doesn't work on velvet.
【在 c*********r 的大作中提到】
: 可以用虚拟内存吗？
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c*********r
发帖数: 1312 | 78 我不知道具体的transcriptome的大小。但是如果10%-20%的genome转录的话，100bp
paired-end reads，10 million reads的话，内存需要14 到23GB左右。（2X100bp这个
是按照100bp read size算还是200bp read size算？）
那个K值是什么？似乎不影响内存计算。
我还在等做这方面分析的人士给我一个准确的transcriptome大小的数值。
BTW，Velvet方便使用吗？你有没有用过CLC genomics workbench？
多谢！^_^
【在 l*******3 的大作中提到】
: 你用我提供的网页计算一下内存, 虚拟doesn't work on velvet.
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l*******3
发帖数: 1074 | 79 k is the length of k-mers used for building the de Brain graph. I've never
used CLC genomics workbench before.
x58 motherboard has a drawback that it only supports a maximal memory of
24gb. It looks like your research will reach this bottle neck soon. So x58
may not be the best solution.
A single 8gb ddr3 is not that expensive as I think, such as kingston has one
for $85 @ newegg.com.
http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16820139280
I don't know whether this product can be installed on the z68 motherboard
that supports a maximal memory of 32gb (8x4). It seems 32gb can handle most
medium scale assembly tasks and the new hardware platform might be a better
choice.
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g*******g
发帖数: 9753 | 80 这也太贵了，那就算了吧，不要纠结SAS了
3
【在 c*********r 的大作中提到】
: 集成了SAS controller的主板找了半天在new egg上只找到一个，有点贵而且没有USB 3
: .0：
: http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16813151247
: 有没有其它的既有SAS控制器，又有SATA 6G/s和USB3.0的主板。如果用这个主板的话，
: 硬盘该怎么配置？
: 可以一个SSD+一个SAS HDD吗？系统和主要的应用软件以及待分析的数据在SSD,其它的
: 在HDD。还是要装两个HDD搞RAID什么的？
: 版上有前辈推荐不需要SSD：
: http://www.mitbbs.com/article/Hardware/31568857_0.html
: 所以硬盘这一块真不知道该怎么折腾。多谢！
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B*G
发帖数: 13438 | 81 有E1235用干嘛要阉割版的1230？为了省电么
120
HDD
【在 c*********r 的大作中提到】
: “摘要”
: 配置1（i7-2600k+P67）vs 配置2（Xeon E3-1230+C202/C204/C206）。硬盘考虑用120
: SSD+1TB/2TBHDD; goldenegg建议硬盘买两块做个Raid1，不知道这个是否只需两个HDD
: 即可；RAID1数据安全性高，但是我担心运算速度会太慢。
: 配置1.
: CPU: Intel Core i7-2600K; $315 (With GPU, 不需要显卡？)
: SSD: Intel 510 120GB SATA III; $277; requires SATA III 6Gb/s
: HDD: Choice 1. Seagate Barracuda 1TB 7200 RPM 32MB Cache SATA 6.0Gb/s
: Bare Drive; $55
: Choice 2. Western Digital Caviar Black 1TB 7200 RPM 64MB Cache SATA 6.
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g*******g
发帖数: 9753 | 82 1235的CPU与GPU共用内存控制器，所以对性能有一定影响
另外，板子上已经有集成显卡了，买1235岂不是多此一举
【在 B*G 的大作中提到】
: 有E1235用干嘛要阉割版的1230？为了省电么
:
: 120
: HDD
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B*G
发帖数: 13438 | 83 没注意他下面换服务器主板了。
【在 g*******g 的大作中提到】
: 1235的CPU与GPU共用内存控制器，所以对性能有一定影响
: 另外，板子上已经有集成显卡了，买1235岂不是多此一举
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n***s
发帖数: 294 | 84 SSD is much faster in read/write performance than SAS. Better go with SSD.
.5
【在 c*********r 的大作中提到】
: SAS硬盘都好贵，而且评价也不多。不知道这个希捷的盘怎么样：
: Seagate Constellation ES ST3500414SS 500GB 7200 RPM 16MB Cache SAS 6Gb/s 3.5
: " Internal Hard Drive -Bare Drive
: $125
: http://www.newegg.com/Product/Product.aspx?Item=N82E16822148631
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g*******g
发帖数: 9753 | 85 你见过哪个服务器厂用SSD的么？呵呵
知道为啥么？
【在 n***s 的大作中提到】
: SSD is much faster in read/write performance than SAS. Better go with SSD.
:
: .5
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