求个histone ChIP检测DNA protocol - Biology版

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Biology版 - 求个histone ChIP检测DNA protocol

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R****n
发帖数: 708

最近有个项目要检测H3 modification和DNA modification的关系，做一些前期的试验
。准备pulldown histone, reversecrolink, 收集DNA做Dot blot.
直到SONICATION这一步都行,Chromatin reverse crosslink后 DNA在agar gel H3 在
page gel上都有信号。但是pulldown后没有信号。主要基于 Farnham protocol。
他的ChIP buffer就是RIPA,beads也没有block,这个没问题么？有些别的protocol用
salmon DNA block beads,salmon DNA的methylation会影响 DNA methylation dot
blot结果吧？

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