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Biology版 - please transfer to Biology. RE:Ng-Ago 重复 (转载)
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Math of Image Compression for the pictures in Dr. Han's pa免疫大虾,请教一个细胞表面分子marker的问题
急问,什么nuclease只笑话dsDNA,而不是ssDNA?ssDNA to dsDNA conversion
Help me !!!DNase I hypersensitive assay请教1 Ligation reaction question
问个基础的问题, 一般酶保存和反应buffer里面的EDTA的作用是什么?Zinc Finger Nuclease或者TALE 能用来做Knockin么?
有没有人科普一下genome editing?CRISPR Less Reliable Than Alternatives
国内科研水平不得了了,河北科技大学在Nature Biotechnoligy发(转载)关于Genome edit这方面
技术问题:DNase-free, RNase-free water?哪位大神用crisper/CAS9 做过single point mutation的KI?
求教:如何去除蛋白中的nulcease污染??请教CRISPR行家-HDR Template Design
相关话题的讨论汇总
话题: dna话题: ph话题: stranded话题: mg
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1 (共1页)
m****a
发帖数: 270
1
【 以下文字转载自 WaterWorld 讨论区 】
发信人: gluestic (), 信区: WaterWorld
标 题: please transfer to Biology. RE:Ng-Ago 重复
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Jun 28 19:07:03 2016, 美东)
Single stranded DNA is much more difficult compared to double-stranded
plasmid DNA in terms of transformation.
Try these single stranded DNA transformation tricks.
1) transformation done at a low pH of ~6. Low pH significantly reduces the
nuclease activity of cutting single stranded DNA.
2) increase Mg++ to 1 mM. Mg is a conformation stabilizer of DNA and RNA.
3) No EDTA in the transformation system because it deprives Mg++ from the
buffer.
Han is a seasoned scientist with expertise on nucleic acid research. He
knows all of these tricks and may not disclose all of them.
Good luck to all.
m****a
发帖数: 270
2
刚搜到的,这位新注册的gluestic同学居然上个月在水版发了一个这么牛逼的帖子,
此人要么就是韩春雨,要么就是和韩春雨关系密切的人,或者是已经重复出实验的高手。
就我一人注意到了么?我靠!
d*****w
发帖数: 124
3
这24小时斗争很激烈
m****a
发帖数: 270
4
重新看了一下paper的supplemental method, 文章里明确得说明了
5’-phosphorylated ssDNA guides are dissolved to 100 ng/μl in 0.5x TE
buffer (PH 8.0)....and are diluted in 50 μl Opti-MEM (Gibco).
这与gluestic所说的pH 6,无EDTA 完全矛盾,
事实上不加EDTA,加Mg2+ 会增加Dnase活性,让DNA更容易降解?
如果是真的,那么韩春雨就是在误导大家。如果是假的,那么gluestic就是来这里捣浑
水的。
假的可能性更大。
c********6
发帖数: 693
5
还无法定论,这个韩春雨真的让人搞不懂,明明一句话就能搞明白的事情,还搞得那么
复杂,故弄玄虚,打太极,跟他在河北科技大学当教授的老爹学的吧

【在 m****a 的大作中提到】
: 重新看了一下paper的supplemental method, 文章里明确得说明了
: 5’-phosphorylated ssDNA guides are dissolved to 100 ng/μl in 0.5x TE
: buffer (PH 8.0)....and are diluted in 50 μl Opti-MEM (Gibco).
: 这与gluestic所说的pH 6,无EDTA 完全矛盾,
: 事实上不加EDTA,加Mg2+ 会增加Dnase活性,让DNA更容易降解?
: 如果是真的,那么韩春雨就是在误导大家。如果是假的,那么gluestic就是来这里捣浑
: 水的。
: 假的可能性更大。

F****8
发帖数: 289
6
这三个高超技巧应该反着理解吗?
1)pH应该大于6,因为低pH降低切酶活性。
2)Mg++应该小于1nM,因为Mg++使DNA/RNA更稳定。
3)实验应该加EDTA,可以络合镁离子。

【在 m****a 的大作中提到】
: 重新看了一下paper的supplemental method, 文章里明确得说明了
: 5’-phosphorylated ssDNA guides are dissolved to 100 ng/μl in 0.5x TE
: buffer (PH 8.0)....and are diluted in 50 μl Opti-MEM (Gibco).
: 这与gluestic所说的pH 6,无EDTA 完全矛盾,
: 事实上不加EDTA,加Mg2+ 会增加Dnase活性,让DNA更容易降解?
: 如果是真的,那么韩春雨就是在误导大家。如果是假的,那么gluestic就是来这里捣浑
: 水的。
: 假的可能性更大。

Z***L
发帖数: 9
7
NgAgo 在韩的文章里,它是不能切单链dna的啊,本来就没活性啊?
每次韩的回复,总会引起更大的困惑。
醉了,醉了
b****s
发帖数: 872
8
这还不简单,因为有商业价值,他不想告诉所有步骤,隐瞒一些关键的东西,所以要打
太极。
韩春雨不用对其他人负责,其他人想不出关键步骤,不能重复和他无关。发表文章也没
说一定要把所有步骤都写出来,有商业价值的东西,都是隐瞒关键步骤的
韩春雨只要对他的学校负责就够了,他的学校不认为他造假就够了。

【在 c********6 的大作中提到】
: 还无法定论,这个韩春雨真的让人搞不懂,明明一句话就能搞明白的事情,还搞得那么
: 复杂,故弄玄虚,打太极,跟他在河北科技大学当教授的老爹学的吧

s*********y
发帖数: 292
9
呵呵,我就看看这事到最后怎么收场
D*a
发帖数: 6830
10
所以CRISPR都隐瞒了啥?

【在 b****s 的大作中提到】
: 这还不简单,因为有商业价值,他不想告诉所有步骤,隐瞒一些关键的东西,所以要打
: 太极。
: 韩春雨不用对其他人负责,其他人想不出关键步骤,不能重复和他无关。发表文章也没
: 说一定要把所有步骤都写出来,有商业价值的东西,都是隐瞒关键步骤的
: 韩春雨只要对他的学校负责就够了,他的学校不认为他造假就够了。

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S**********e
发帖数: 620
11
说你是河北科大的人还真像
到底这三个秘籍是不是靠谱的?纯学术问题,好奇一下

【在 b****s 的大作中提到】
: 这还不简单,因为有商业价值,他不想告诉所有步骤,隐瞒一些关键的东西,所以要打
: 太极。
: 韩春雨不用对其他人负责,其他人想不出关键步骤,不能重复和他无关。发表文章也没
: 说一定要把所有步骤都写出来,有商业价值的东西,都是隐瞒关键步骤的
: 韩春雨只要对他的学校负责就够了,他的学校不认为他造假就够了。

m****a
发帖数: 270
12
这里说的是转染,不是切割。

【在 Z***L 的大作中提到】
: NgAgo 在韩的文章里,它是不能切单链dna的啊,本来就没活性啊?
: 每次韩的回复,总会引起更大的困惑。
: 醉了,醉了

Z***L
发帖数: 9
13

看一下第一条,明明说的是ph值能影响切割单链dna的活性。

【在 m****a 的大作中提到】
: 这里说的是转染,不是切割。
Z***L
发帖数: 9
14

看一下第一条,明明说的是ph值能影响切割单链dna的活性。

【在 m****a 的大作中提到】
: 这里说的是转染,不是切割。
m****a
发帖数: 270
15
哥,这里的single strand DNA 是指 guide DNA 不是 target.
意思是降低ph能防止潜在的Dnase降解ssDNA.
发这三条所谓tricks的Gluestic与其说是韩的水军,不如说是韩的高级黑,
这个帖子被好事者当成韩春雨的建议发到了google group,
立马被专业人士喷成了筛子,最确切的评价就是"not even wrong".

【在 Z***L 的大作中提到】
:
: 看一下第一条,明明说的是ph值能影响切割单链dna的活性。

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