k*****n
发帖数: 323 | 1 大家有试过哪些靠谱的protocol么?最少能做多少细胞?谢谢啦 |
m******5
发帖数: 1383 | 2 Active motif high sensitivity Chip kit
Library construction 是瓶颈 |
k*****n
发帖数: 323 | 3
最少能做多少细胞
【在 m******5 的大作中提到】
: Active motif high sensitivity Chip kit
: Library construction 是瓶颈
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s******s
发帖数: 13035 | 4 chip能不能做出来主要取决于你的蛋白和抗体，又不是rnaseq
【在 k*****n 的大作中提到】
: 大家有试过哪些靠谱的protocol么?最少能做多少细胞?谢谢啦
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k*****n
发帖数: 323 | 5 我知道哇，那你pol ii和h3好的抗体最少能做多少细胞?
【在 s******s 的大作中提到】
: chip能不能做出来主要取决于你的蛋白和抗体，又不是rnaseq
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k*****n
发帖数: 323 | 6 我做Pol II 2*10e5就开始掉peak了，有些信号就没了，现在做少量组织的，想知道大
家怎么搞
的。有些paper说是可以做500-1000个细胞，不知道靠不靠谱啊
【在 s******s 的大作中提到】
: chip能不能做出来主要取决于你的蛋白和抗体，又不是rnaseq
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f*********9
发帖数: 258 | 7 如果做histone marker，做过三万的组织细胞核，做了H3K9 用的是diagenode 的kit，
测序完了，结果不错 |
y*********1
发帖数: 46 | 8 可以试一试ChIPmentation protocol, 文章发表在十月份的 Nature Methods 上. 就
是在ChIP-Seq 中加一步Tagmentation, 用Illumina的Nextera kit. 5万个细胞应该够
了. |
k*****n
发帖数: 323 | 9 Thanks, going to try it.
;)
【在 y*********1 的大作中提到】
: 可以试一试ChIPmentation protocol, 文章发表在十月份的 Nature Methods 上. 就
: 是在ChIP-Seq 中加一步Tagmentation, 用Illumina的Nextera kit. 5万个细胞应该够
: 了.
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k*****n
发帖数: 323 | 10 Thanks a lot for your input.
【在 f*********9 的大作中提到】
: 如果做histone marker，做过三万的组织细胞核，做了H3K9 用的是diagenode 的kit，
: 测序完了，结果不错
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