m********m
发帖数: 263 | 1 本人想根据一些已有的cilinical database分析两个基因表达的是否有相关性，但是，
却苦于没有信息
学方面的技术，特来请教本版牛人指教， 是否有一些网站可以提供这方面的分析（例如
，Oncomine可以提供database和方法分析特定基因的在不同cancer中的表达情况等）？
多谢！ |
z*******6
发帖数: 679 | 2 我们这有个实验室专门做这个的，写算法，做coexpression，我还正跟他们合作呢，仅
供参考... |
K**4
发帖数: 1015 | 3 BioGPS应该可以了
例如
【在 m********m 的大作中提到】
: 本人想根据一些已有的cilinical database分析两个基因表达的是否有相关性，但是，
: 却苦于没有信息
: 学方面的技术，特来请教本版牛人指教， 是否有一些网站可以提供这方面的分析（例如
: ，Oncomine可以提供database和方法分析特定基因的在不同cancer中的表达情况等）？
: 多谢！
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G******n
发帖数: 289 | 4 cBioPortal
TCGA
if u r in cancer |
y*******1
发帖数: 164 | 5 试试String （http://string-db.org/）
不是专门的coexpression的网站，但是有很多基因/蛋白相互关联的信息，包括
coexpression的信息
例如
【在 m********m 的大作中提到】
: 本人想根据一些已有的cilinical database分析两个基因表达的是否有相关性，但是，
: 却苦于没有信息
: 学方面的技术，特来请教本版牛人指教， 是否有一些网站可以提供这方面的分析（例如
: ，Oncomine可以提供database和方法分析特定基因的在不同cancer中的表达情况等）？
: 多谢！
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c********e
发帖数: 598 | 6
例如
You should try to get raw data first. None of these database are reliable.
【在 m********m 的大作中提到】
: 本人想根据一些已有的cilinical database分析两个基因表达的是否有相关性，但是，
: 却苦于没有信息
: 学方面的技术，特来请教本版牛人指教， 是否有一些网站可以提供这方面的分析（例如
: ，Oncomine可以提供database和方法分析特定基因的在不同cancer中的表达情况等）？
: 多谢！
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p*******n
发帖数: 129 | 7 貌似excel就可以做简单的相关性分析吧，不一定要用到那么高大上的生物信息学分析
技术
例如
【在 m********m 的大作中提到】
: 本人想根据一些已有的cilinical database分析两个基因表达的是否有相关性，但是，
: 却苦于没有信息
: 学方面的技术，特来请教本版牛人指教， 是否有一些网站可以提供这方面的分析（例如
: ，Oncomine可以提供database和方法分析特定基因的在不同cancer中的表达情况等）？
: 多谢！
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Z******5
发帖数: 435 | 8 关键要会统计算法才可以，Pearson Correlation，Spearman Correlation，这些鬼东
西想想都头痛，所以最好还是找个会这些统计算法又会编程的，帮你写个傻瓜程序，你
到时候直接输入数据用就好了~~~
【在 p*******n 的大作中提到】
: 貌似excel就可以做简单的相关性分析吧，不一定要用到那么高大上的生物信息学分析
: 技术
:
: 例如
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w*******e
发帖数: 100 | 9 你们可以试试下面这几个online web server，可以计算pearson correlation,
spearman correlation
http://plantgrn.noble.org/GPLEXUS
http://plantgrn.noble.org/DeGNServer
【在 Z******5 的大作中提到】
: 关键要会统计算法才可以，Pearson Correlation，Spearman Correlation，这些鬼东
: 西想想都头痛，所以最好还是找个会这些统计算法又会编程的，帮你写个傻瓜程序，你
: 到时候直接输入数据用就好了~~~
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