s**2
发帖数: 1287 | 1 大学学的数学和编程早还给体育老师了。
现在想自学点编程和以便 bioinformatician 更有效地合作，
有人说学 Python，有人说学 R。
我自己是两眼一抹黑，请版上各位指点一二。
多谢！ |
s*****j
发帖数: 6435 | 2 同问.
【在 s**2 的大作中提到】
: 大学学的数学和编程早还给体育老师了。
: 现在想自学点编程和以便 bioinformatician 更有效地合作，
: 有人说学 Python，有人说学 R。
: 我自己是两眼一抹黑，请版上各位指点一二。
: 多谢！
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D*a
发帖数: 6830 | 3 这不简单，问你合作那个bioinformatician |
l***y
发帖数: 638 | 4 用啥学啥
一天python，一天R，不冲突
【在 s**2 的大作中提到】
: 大学学的数学和编程早还给体育老师了。
: 现在想自学点编程和以便 bioinformatician 更有效地合作，
: 有人说学 Python，有人说学 R。
: 我自己是两眼一抹黑，请版上各位指点一二。
: 多谢！
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l********8
发帖数: 197 | 5 如果是做bioinf，那R用的多的，还有perl，C/C++应该也有用的。Phython的好处是上
手容易，而且很多CS的位置都在用，你可以找出了bioinf以外的位置。学学很快的，一
般一周就可以上手一种语言。学语言要快点上手，然后多写。。。 |
s**2
发帖数: 1287 | 6 合作者说 R。我一个朋友也是 bioinformatician，做 NGS 分析的，
说建议学 Python。
当然也可能是我朋友比较了解我，觉得我这么笨，学 Python 容易一些。:)
主要是因为和 bioinformatician 讨论问题的时候，能明显感觉到之间的 gap，相互不
能理解对方的问题，导致研究不够深入，所以想自学一点他们的思维方式。
【在 D*a 的大作中提到】
: 这不简单，问你合作那个bioinformatician
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s**2
发帖数: 1287 | 7 多谢建议。
前面有个帖子提到他的老板要求不能用现成的模块，script都必须自己写，看来也是多
写多练的意思。
【在 l********8 的大作中提到】
: 如果是做bioinf，那R用的多的，还有perl，C/C++应该也有用的。Phython的好处是上
: 手容易，而且很多CS的位置都在用，你可以找出了bioinf以外的位置。学学很快的，一
: 般一周就可以上手一种语言。学语言要快点上手，然后多写。。。
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M***7
发帖数: 2420 | 8 两个一起来吧。
有空再把Java看个大概，算法撸一遍，齐活了。
【在 s**2 的大作中提到】
: 大学学的数学和编程早还给体育老师了。
: 现在想自学点编程和以便 bioinformatician 更有效地合作，
: 有人说学 Python，有人说学 R。
: 我自己是两眼一抹黑，请版上各位指点一二。
: 多谢！
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s**2
发帖数: 1287 | 9 擦，捋一遍吧？
【在 M***7 的大作中提到】
: 两个一起来吧。
: 有空再把Java看个大概，算法撸一遍，齐活了。
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w***g
发帖数: 5958 | 10 我的经验是都得会一点，偶尔还需要用matlab。
要啥都不会的话先学python吧。R的应用出不了统计。Python学好了，图像分析，机器
学习，做网站，基本上啥都可以做了，码工的大门就想你敞开了。R的套路跟主流编程
语言差得很远，感觉比较排外。python要开放得多。
【在 s**2 的大作中提到】
: 大学学的数学和编程早还给体育老师了。
: 现在想自学点编程和以便 bioinformatician 更有效地合作，
: 有人说学 Python，有人说学 R。
: 我自己是两眼一抹黑，请版上各位指点一二。
: 多谢！
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D*a
发帖数: 6830 | 11 既然你首要是为了跟合作者交流，那先学R吧。
从我外行的感觉，初级入门，生搬硬套，R和python都差不多。再往上可能思路有区别。
再说了，你学个入门R，跟合作者交流交流说不定层次就上去了，你学个入门python，
还是不能跟合作者讨论具体技术问题。
【在 s**2 的大作中提到】
: 合作者说 R。我一个朋友也是 bioinformatician，做 NGS 分析的，
: 说建议学 Python。
: 当然也可能是我朋友比较了解我，觉得我这么笨，学 Python 容易一些。:)
: 主要是因为和 bioinformatician 讨论问题的时候，能明显感觉到之间的 gap，相互不
: 能理解对方的问题，导致研究不够深入，所以想自学一点他们的思维方式。
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D*a
发帖数: 6830 | 12 这两个，edx和coursra上一堆课，挑个看看就是了。 |
s******8
发帖数: 2131 | 13 都是比较简单的script language，两个都学学 |
s******y
发帖数: 17729 | 14 Java
【在 s**2 的大作中提到】
: 大学学的数学和编程早还给体育老师了。
: 现在想自学点编程和以便 bioinformatician 更有效地合作，
: 有人说学 Python，有人说学 R。
: 我自己是两眼一抹黑，请版上各位指点一二。
: 多谢！
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y****i
发帖数: 4109 | 15 只是分析NGS,不需要事先学python 或者R，自己先把linux装起来，然后学会一些基本
的软件安装，基本的shell语句。 真正碰到需要处理文本的时候再去学习python perl
或者R或者上网搜索别人的script,自己改改。 如果统计分析的话，基本都是用R的包
的， 但需要一定的统计基础，要理解统计概念，以及什么情况用什么测试，比程序语
言难多了 |
p*******r
发帖数: 4048 | 16 R is only useful for statistics.
Python is better overall. Many things that you used to do in R, you can use
a package to do in python now.
【在 s**2 的大作中提到】
: 合作者说 R。我一个朋友也是 bioinformatician，做 NGS 分析的，
: 说建议学 Python。
: 当然也可能是我朋友比较了解我，觉得我这么笨，学 Python 容易一些。:)
: 主要是因为和 bioinformatician 讨论问题的时候，能明显感觉到之间的 gap，相互不
: 能理解对方的问题，导致研究不够深入，所以想自学一点他们的思维方式。
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s**2
发帖数: 1287 | |
n******7
发帖数: 12463 | 18 你初学当然上python
通用性比R强太多
你入门初期肯定是跑pipe line 做data processing，这也是python的强项
你学会
python+numpy+scipy+pandas+matlibplot+scikit-learn
基本就齐活了
另外，虽然都是脚本语言，python整体比R快一个数量级
学起来也容易
R原本是作为一个统计软件开发的
不过R有几个特别的优势
1.几乎所有你能想到的统计分析，都有R的实现
2.画2D静态图，R是最好的，没有之一
3.bioconductor很好很强大 |
s**2
发帖数: 1287 | 19 这个回帖很好很专业！拜谢！
【在 n******7 的大作中提到】
: 你初学当然上python
: 通用性比R强太多
: 你入门初期肯定是跑pipe line 做data processing，这也是python的强项
: 你学会
: python+numpy+scipy+pandas+matlibplot+scikit-learn
: 基本就齐活了
: 另外，虽然都是脚本语言，python整体比R快一个数量级
: 学起来也容易
: R原本是作为一个统计软件开发的
: 不过R有几个特别的优势
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v********a
发帖数: 646 | |
s********n
发帖数: 2939 | |
