这里有人用过over expression transcription factor做过chip seq么？ - Biology版 - 未名存档

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档，一周内的贴子最多显示50字，超过一周显示500字访问原贴

Biology版 - 这里有人用过over expression transcription factor做过chip seq么？

相关主题
● 打听一个PI,mit whitehead istitute的Richard YOUNG人怎么样？	● Transcription factor, Promoter分析软件
● 包子贴：有什么好的软件或者网页方便设计chip assay的primer吗？	● 哪家的ChiP kit最好用？谢谢。
● 版上有人做过histon和别的蛋白的co iP么？	● ChIP-qPCR primer设计
● 关于chip assay的一个疑问	● 问一下，大家都用哪个chip Protocol或者Chip kit做表达量不高的transcription factor 的Chip/Chip-SEq
● 大侠们做chip是用sonicator还是用MNase digest？	● ChIP 中的sonication 导致蛋白降解
● 请做CHIP的前辈指教，对照IgG有很弱的带	● Sensitive的ChIP Kit for ChIP-seq
● 怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙	● 再问个chip-seq的问题
● 求助：请牛人指点 Chip－Seq ！！！	● 请教做过chip on chip的实验室一个问题

相关话题的讨论汇总
话题: chip话题: seq话题: expression话题: factor

进入Biology版参与讨论

1

(共1页)

m******5 发帖数: 1383	1 如题，结果靠谱么？如果cell line选得有道理。另外，chip dna产量是不是会很大？
D***a 发帖数: 516	2 guideline上说用可以这么做。但要保证跟endogenous的蛋白表达水平差不多。过高的话会有问题，结合到本来不该结合的位置。
d****7 发帖数: 109	3 这个还真不好说，一般来讲不建议这么做可以看看这篇文章，induce myc，然后myc chipseq http://www.cell.com/abstract/S0092-8674(12)01057-4 【在 m******5 的大作中提到】 : 如题，结果靠谱么？如果cell line选得有道理。 : 另外，chip dna产量是不是会很大？
m******5 发帖数: 1383	4 endogenoua 表达量太低出此下策，今天做了一把惊呆了，产出300ng DNA. 【在 d****7 的大作中提到】 : 这个还真不好说，一般来讲不建议这么做 : 可以看看这篇文章，induce myc，然后myc chipseq : http://www.cell.com/abstract/S0092-8674(12)01057-4

1

(共1页)

进入Biology版参与讨论

相关主题
● 请教做过chip on chip的实验室一个问题	● 大侠们做chip是用sonicator还是用MNase digest？
● 有人用anti-flag做过ChIP吗？	● 请做CHIP的前辈指教，对照IgG有很弱的带
● Question regarding cloning.	● 怎么从本质上确定一个蛋白确实是一个transcription factor? 跪求大牛帮忙
● 怎么估计不同chromosome上的相对transcription level?	● 求助：请牛人指点 Chip－Seq ！！！
● 打听一个PI,mit whitehead istitute的Richard YOUNG人怎么样？	● Transcription factor, Promoter分析软件
● 包子贴：有什么好的软件或者网页方便设计chip assay的primer吗？	● 哪家的ChiP kit最好用？谢谢。
● 版上有人做过histon和别的蛋白的co iP么？	● ChIP-qPCR primer设计
● 关于chip assay的一个疑问	● 问一下，大家都用哪个chip Protocol或者Chip kit做表达量不高的transcription factor 的Chip/Chip-SEq

相关话题的讨论汇总
话题: chip话题: seq话题: expression话题: factor

未名新帖统计// 7月16日

#	版面	帖数(主题数)
-	全站	4871 (796)
1	Military	3777 (569)
2	Stock	341 (51)
3	Joke	117 (17)
4	History	116 (3)
5	Automobile	100 (9)
6	USANews	55 (9)
7	Midlife	45 (1)
8	Headline	41 (41)
9	Dreamer	33 (13)
10	FleaMarket	32 (20)
11	Living	30 (7)

* 这里只显示发帖超过25的版面，努力灌水吧:-)