由买买提看人间百态

boards

本页内容为未名空间相应帖子的节选和存档,一周内的贴子最多显示50字,超过一周显示500字 访问原贴
Biology版 - 一个外行评施一公的成果
相关主题
施一公还有什么颜某某的结构生物学的意义: 就像奥运会里的举重冠军,中国包揽,但是没人关注AD新靶点Gamma-secretase activating protein
匹兹堡大学cryoEM方向postdoc opening跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义
哪儿可以做Cryo-TEMCEM Microwave Digestion System 的耗材
施一公和王晓东给中国生医带来的严重同质化的灾难[合集] 怎么用Photoshop计算显微照片的局部荧光强度?
腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的新人报到
施一公课题组招聘副研和博士后第一站博后,新老板,还是有很多人的牛老板
请帮忙找篇文章/thankscryo-EM是不是最近几年热起来的?
Eli Lilly Halts Alzheimer's Drug Trial生物公司基因剔除职位
相关话题的讨论汇总
话题: 蛋白体话题: 施一公话题: formula话题: cem话题: 结构
进入Biology版参与讨论
1 (共1页)
a***m
发帖数: 174
1
以下是我分析了http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13567.htmlhttp://epaper.gmw.cn/gmrb/html/2014-07/04/nw.D110000gmrb_20140704_1-06.htm得到的。
可能比较难的地方:
在于提取活性γ分泌酶蛋白体,γ分泌酶蛋白体难于从人类大脑中获取,于是尝试
从微生物中取样,最终选择从哺乳动物中产生大量γ分泌酶蛋白体,获取纯度高的γ-
secretase蛋白结构体样本。
工具:cryo-electron-microscopy single-particle analysis
冷却电子显微单个微粒分析技术
电子显微上个世纪二十年代就产生了,继又产生了TEM, CEM。施一公用的是CEM工
具。
本质:
买了一台CEM机器,然后在某哺乳动物中培养出γ-secretase多蛋白复合体,在CEM
下分析采集数据,用计算机构图可视化出来三维结构。实验了数十上百次,综合每次3d
构图,找出共性,选几张认为最好的图,修改一下,最终形成3维蛋白体结构。
问题:
这个机构,是否能写出γ-secretase蛋白体的分子式?
这个3d结构的准确性如何?

结论:这个研究提供了一个γ分泌酶蛋白体的3维表示,但应该不能写出分子式?
没有什么创新性,都是应用成熟的技术,买一个机器测出一个大致的结构表达。
如果说这是施一公科学生涯里的最璀璨的成果,我只是想说,施一公的智商极限
终于秀出来了,施的头脑里真的没什么货,(我曾经以为他有什么货)
当然,不排除在实验中产生其它的突破。但就这一个东西来说,如果提供同样昂
贵的设备和实验条件,我想一个本科生也能做,也许能做得更好。
w****6
发帖数: 169
2
开始看题目以为是结构生物学的外行。看正文应该是没学过生物?蛋白质分子式?是说
蛋白一级序列么?那早在这个结构之前就知道了。正是因为知道了这个序列一公才能在
不同系统里尝试表达。所以这篇文章的关键不是一级序列(分子式),而是三级结构。

【在 a***m 的大作中提到】
: 以下是我分析了http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13567.htmlhttp://epaper.gmw.cn/gmrb/html/2014-07/04/nw.D110000gmrb_20140704_1-06.htm得到的。
: 可能比较难的地方:
: 在于提取活性γ分泌酶蛋白体,γ分泌酶蛋白体难于从人类大脑中获取,于是尝试
: 从微生物中取样,最终选择从哺乳动物中产生大量γ分泌酶蛋白体,获取纯度高的γ-
: secretase蛋白结构体样本。
: 工具:cryo-electron-microscopy single-particle analysis
: 冷却电子显微单个微粒分析技术
: 电子显微上个世纪二十年代就产生了,继又产生了TEM, CEM。施一公用的是CEM工
: 具。
: 本质:

w******l
发帖数: 67
3
都说外行了 当然包括没学过生物。。。

【在 w****6 的大作中提到】
: 开始看题目以为是结构生物学的外行。看正文应该是没学过生物?蛋白质分子式?是说
: 蛋白一级序列么?那早在这个结构之前就知道了。正是因为知道了这个序列一公才能在
: 不同系统里尝试表达。所以这篇文章的关键不是一级序列(分子式),而是三级结构。

m***y
发帖数: 627
4
对lz无语
a***m
发帖数: 174
5
不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
formula rather than molecular formula。
原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
算出来。
需要用工具测试出来。
如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
践而已。
就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
原来发现一个3为机构就可以上nature说

【在 w****6 的大作中提到】
: 开始看题目以为是结构生物学的外行。看正文应该是没学过生物?蛋白质分子式?是说
: 蛋白一级序列么?那早在这个结构之前就知道了。正是因为知道了这个序列一公才能在
: 不同系统里尝试表达。所以这篇文章的关键不是一级序列(分子式),而是三级结构。

b******k
发帖数: 2321
6
不懂就老老实实看帖 或者老老实实提问 tmd上来就宏文一篇 你是生怕别人不知道你愚
蠢么

【在 a***m 的大作中提到】
: 不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
: formula rather than molecular formula。
: 原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
: 既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
: 算出来。
: 需要用工具测试出来。
: 如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
: 践而已。
: 就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
: 原来发现一个3为机构就可以上nature说

s*****c
发帖数: 5202
7
这年头,没学过生物的在这里满口胡言,大千世界无奇不有啊

【在 a***m 的大作中提到】
: 以下是我分析了http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13567.htmlhttp://epaper.gmw.cn/gmrb/html/2014-07/04/nw.D110000gmrb_20140704_1-06.htm得到的。
: 可能比较难的地方:
: 在于提取活性γ分泌酶蛋白体,γ分泌酶蛋白体难于从人类大脑中获取,于是尝试
: 从微生物中取样,最终选择从哺乳动物中产生大量γ分泌酶蛋白体,获取纯度高的γ-
: secretase蛋白结构体样本。
: 工具:cryo-electron-microscopy single-particle analysis
: 冷却电子显微单个微粒分析技术
: 电子显微上个世纪二十年代就产生了,继又产生了TEM, CEM。施一公用的是CEM工
: 具。
: 本质:

s*******e
发帖数: 1389
8
服了

【在 a***m 的大作中提到】
: 不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
: formula rather than molecular formula。
: 原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
: 既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
: 算出来。
: 需要用工具测试出来。
: 如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
: 践而已。
: 就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
: 原来发现一个3为机构就可以上nature说

h*****4
发帖数: 1158
9
lz真懂真黑
b**z
发帖数: 1351
10


列推
的实

【在 b******k 的大作中提到】
: 不懂就老老实实看帖 或者老老实实提问 tmd上来就宏文一篇 你是生怕别人不知道你愚
: 蠢么

相关主题
施一公课题组招聘副研和博士后AD新靶点Gamma-secretase activating protein
请帮忙找篇文章/thanks跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义
Eli Lilly Halts Alzheimer's Drug TrialCEM Microwave Digestion System 的耗材
进入Biology版参与讨论
a*******a
发帖数: 4233
11
mit也有暑假党啊?

【在 a***m 的大作中提到】
: 不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
: formula rather than molecular formula。
: 原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
: 既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
: 算出来。
: 需要用工具测试出来。
: 如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
: 践而已。
: 就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
: 原来发现一个3为机构就可以上nature说

x******h
发帖数: 838
12
牛人。充分说明生物是如何臭大街,任何人可以来踩一脚

【在 a***m 的大作中提到】
: 不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
: formula rather than molecular formula。
: 原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
: 既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
: 算出来。
: 需要用工具测试出来。
: 如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
: 践而已。
: 就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
: 原来发现一个3为机构就可以上nature说

D*a
发帖数: 6830
13
楼主可以去玩玩foldit
a******k
发帖数: 1190
14
你说的有一定道理,但是你要知道有了protein's chemical formula和molecular
formula
还是远远不够啊,要分析3维结构,还要知道protein's physical formula和atomic
formula
甚至很多关键的拓扑连接关系还要知道protein's quantum formula
甚至在地球克服自身引力升上太空的过程中,还需要考虑该蛋白的eigen formula,
prime formula,
matroid formula, transformer's formula, etc,这个就很难了

【在 a***m 的大作中提到】
: 不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
: formula rather than molecular formula。
: 原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
: 既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
: 算出来。
: 需要用工具测试出来。
: 如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
: 践而已。
: 就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
: 原来发现一个3为机构就可以上nature说

t******k
发帖数: 599
15
呵呵

【在 a***m 的大作中提到】
: 以下是我分析了http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13567.htmlhttp://epaper.gmw.cn/gmrb/html/2014-07/04/nw.D110000gmrb_20140704_1-06.htm得到的。
: 可能比较难的地方:
: 在于提取活性γ分泌酶蛋白体,γ分泌酶蛋白体难于从人类大脑中获取,于是尝试
: 从微生物中取样,最终选择从哺乳动物中产生大量γ分泌酶蛋白体,获取纯度高的γ-
: secretase蛋白结构体样本。
: 工具:cryo-electron-microscopy single-particle analysis
: 冷却电子显微单个微粒分析技术
: 电子显微上个世纪二十年代就产生了,继又产生了TEM, CEM。施一公用的是CEM工
: 具。
: 本质:

f**e
发帖数: 2160
16
TEM, CEM
haha
c**********r
发帖数: 138
17
上nature不一定非得很创新。有广泛应用,有热点炒作,有创新,有牛人支撑等都单独
可以作为nature发表的原因。蛋白结构本来就是一个民工活。但是呢又特别重要。所以
属于广泛应用的一类。

不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
formula rather than molecular formula。原来che........

【在 a***m 的大作中提到】
: 不好意思,弄混了,就学了高中生物化学那点东西,我是指protein's chemical
: formula rather than molecular formula。
: 原来chemical formula序列已经知道了(如何发现蛋白质的序列应该比较难吧),
: 既然序列已知,看来氨基酸与氨基酸(原子与原子间)的拓扑连接关系并不能由序列推
: 算出来。
: 需要用工具测试出来。
: 如果找到一个蛋白体,有了CEM, 分析3维结构应该不算创新吧,不过一个应用过程的实
: 践而已。
: 就凭用一个工具找到其3维结构,施一公这样一篇文章怎么够级别上nature呢?
: 原来发现一个3为机构就可以上nature说

G***G
发帖数: 16778
18
right.

【在 a***m 的大作中提到】
: 以下是我分析了http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature13567.htmlhttp://epaper.gmw.cn/gmrb/html/2014-07/04/nw.D110000gmrb_20140704_1-06.htm得到的。
: 可能比较难的地方:
: 在于提取活性γ分泌酶蛋白体,γ分泌酶蛋白体难于从人类大脑中获取,于是尝试
: 从微生物中取样,最终选择从哺乳动物中产生大量γ分泌酶蛋白体,获取纯度高的γ-
: secretase蛋白结构体样本。
: 工具:cryo-electron-microscopy single-particle analysis
: 冷却电子显微单个微粒分析技术
: 电子显微上个世纪二十年代就产生了,继又产生了TEM, CEM。施一公用的是CEM工
: 具。
: 本质:

1 (共1页)
进入Biology版参与讨论
相关主题
生物公司基因剔除职位腰斩王晓东施一公晶体信号学科是必然的
不要八卦,来点纯学术的吧施一公课题组招聘副研和博士后
order一个试剂的"盐酸盐"还是"非盐酸盐"请帮忙找篇文章/thanks
单分子显微技术有解决细胞的自身荧光问题吗?Eli Lilly Halts Alzheimer's Drug Trial
施一公还有什么颜某某的结构生物学的意义: 就像奥运会里的举重冠军,中国包揽,但是没人关注AD新靶点Gamma-secretase activating protein
匹兹堡大学cryoEM方向postdoc opening跟风请帮忙解读11公γ-分泌酶复合物的意义
哪儿可以做Cryo-TEMCEM Microwave Digestion System 的耗材
施一公和王晓东给中国生医带来的严重同质化的灾难[合集] 怎么用Photoshop计算显微照片的局部荧光强度?
相关话题的讨论汇总
话题: 蛋白体话题: 施一公话题: formula话题: cem话题: 结构