T*****n
发帖数: 897 | 1 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
标 题: Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？-诚心求教！！！
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 5 20:19:07 2013, 美东)
问一下，Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？刚刚回到
一个做这方面的领域，感觉挺喜欢的，但自己没这方面的经验，不知道怎么分析。老板
只是打击我，不肯指导我。现在很郁闷，诚心求教！！！ |
j******n
发帖数: 941 | 2 看你想分析什么了 如果只是找hit 那就计算下ratio, fold change，或者z score然后
画个threshold就行了 一般excel就可以做完 Metacore可以辅助完成这个工作 还可以
看具体的化合物靶点信息啥的 Spotfire可以在数据本身方面做一些分析 |
C******n
发帖数: 504 | 3 How would you calculate fold change? Thanks!
【在 j******n 的大作中提到】
: 看你想分析什么了 如果只是找hit 那就计算下ratio, fold change，或者z score然后
: 画个threshold就行了 一般excel就可以做完 Metacore可以辅助完成这个工作 还可以
: 看具体的化合物靶点信息啥的 Spotfire可以在数据本身方面做一些分析
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R****n
发帖数: 708 | 4 Where is the database?
教！！！
【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标 题: Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？-诚心求教！！！
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 5 20:19:07 2013, 美东)
: 问一下，Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？刚刚回到
: 一个做这方面的领域，感觉挺喜欢的，但自己没这方面的经验，不知道怎么分析。老板
: 只是打击我，不肯指导我。现在很郁闷，诚心求教！！！
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j******n
发帖数: 941 | 5
实验点数据除以control的数据 如果大于1那就是fold change 小于1求负倒数（0.5的
Fold change=-2)
【在 C******n 的大作中提到】
: How would you calculate fold change? Thanks!
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s****l
发帖数: 513 | 6 简单的分析hit rate，选top hit的话，用excel就够了（把positive control设置为
100%response， 把你的DMSO(negative control)设置为0%response）。
不过最好联系你做screen的center，他们都有informatic scientist，他们有专业软件
可以做其他的深入分析，你也可以问一下可不可以让你学习使用一下，很多其实蛮简单
的。
教！！！
【在 T*****n 的大作中提到】
: 【 以下文字转载自 Postdoc 讨论区 】
: 发信人: Tonyvan (Tony), 信区: Postdoc
: 标 题: Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？-诚心求教！！！
: 发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 5 20:19:07 2013, 美东)
: 问一下，Drug discovery 的high throughput screening data怎么分析呢？刚刚回到
: 一个做这方面的领域，感觉挺喜欢的，但自己没这方面的经验，不知道怎么分析。老板
: 只是打击我，不肯指导我。现在很郁闷，诚心求教！！！
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