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Biology版 - 粗读乙肝病毒受体论文
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话题: ntcp话题: protein话题: receptor话题: ms话题: 受体
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1 (共1页)
g*****n
发帖数: 250
1
吃完火鸡,没事干,瞄了瞄惊动世界科学的乙肝病毒受体论文。总的感觉是,证据不确
凿。方法不合适。 简单地说,用photo-cross-linking拉下来一堆蛋白,选了最厚的那
条带。就是它了。以后的证实都没有说服力。方法用的也不对。
s******r
发帖数: 2876
2
吃太多火鸡了吧,
没有说服力,怎么过的review,还有其他实验室的follow up.

【在 g*****n 的大作中提到】
: 吃完火鸡,没事干,瞄了瞄惊动世界科学的乙肝病毒受体论文。总的感觉是,证据不确
: 凿。方法不合适。 简单地说,用photo-cross-linking拉下来一堆蛋白,选了最厚的那
: 条带。就是它了。以后的证实都没有说服力。方法用的也不对。

g*****n
发帖数: 250
3
过了review就赢了。
论文中基本是在人为条件下观察的现象,photo-cross-linking (强行绑架),
transfection (高量表达)。没有生理条件下的观察,没有证据证明那个蛋白是受体。
g********0
发帖数: 6201
4
所有被retract的论文纷纷表示他们当初都过了review。
这篇文章就是噱头大,过一段时间看就是个JBC的档次。

【在 s******r 的大作中提到】
: 吃太多火鸡了吧,
: 没有说服力,怎么过的review,还有其他实验室的follow up.

m*********n
发帖数: 91
5
新(烂?)杂志 +外行评审人也算?
那些拒收的杂志咋说?

【在 s******r 的大作中提到】
: 吃太多火鸡了吧,
: 没有说服力,怎么过的review,还有其他实验室的follow up.

F*Q
发帖数: 3259
6
我没太多兴趣读文章,不过这么被推崇的尤其是被大陆一号高手推崇的工作,我不相信
它只有JBC的水平。当然,话说回来,HIV的受体以及其它很多严重威胁人类健康的病毒
的受体的发现似乎都没被这么吹捧过。因此,这么吹捧一个工作难免不让人怀疑其动机。
还是那句话,钱可以堆出文章,还是堆不出炸药奖的。
m*********n
发帖数: 91
7
大陆一号高手? 饶?王?懂病毒吗?just propaganda.

机。

【在 F*Q 的大作中提到】
: 我没太多兴趣读文章,不过这么被推崇的尤其是被大陆一号高手推崇的工作,我不相信
: 它只有JBC的水平。当然,话说回来,HIV的受体以及其它很多严重威胁人类健康的病毒
: 的受体的发现似乎都没被这么吹捧过。因此,这么吹捧一个工作难免不让人怀疑其动机。
: 还是那句话,钱可以堆出文章,还是堆不出炸药奖的。

g********0
发帖数: 6201
8
嗯嗯,还是您老眼光厉害,我说JBC确实有点低了,因为他的工作量比一般的JBC多好多
,所以我决定把他的档次提高到MCB的水平。抱歉,再高就不能给了。
至于此文为何受到吹捧,有人要靠他捞钱,有人要靠他捞政治资本,但这超出本版讨论
范围,就不细说了。

机。

【在 F*Q 的大作中提到】
: 我没太多兴趣读文章,不过这么被推崇的尤其是被大陆一号高手推崇的工作,我不相信
: 它只有JBC的水平。当然,话说回来,HIV的受体以及其它很多严重威胁人类健康的病毒
: 的受体的发现似乎都没被这么吹捧过。因此,这么吹捧一个工作难免不让人怀疑其动机。
: 还是那句话,钱可以堆出文章,还是堆不出炸药奖的。

C********4
发帖数: 308
9
首先,HBV受体是这个领域几十年来都想找到而找不到的,而HIV受体没那么难
另外,这个文章的point不在受体,而在于体外感染体系的建立,以后可以做small
molecule screen了

机。

【在 F*Q 的大作中提到】
: 我没太多兴趣读文章,不过这么被推崇的尤其是被大陆一号高手推崇的工作,我不相信
: 它只有JBC的水平。当然,话说回来,HIV的受体以及其它很多严重威胁人类健康的病毒
: 的受体的发现似乎都没被这么吹捧过。因此,这么吹捧一个工作难免不让人怀疑其动机。
: 还是那句话,钱可以堆出文章,还是堆不出炸药奖的。

m*********n
发帖数: 91
10
这更是笑话了。文章的名字叫啥?还POINT不是受体呢?
建立体外感染体系?能发nature biotechnology吗?

【在 C********4 的大作中提到】
: 首先,HBV受体是这个领域几十年来都想找到而找不到的,而HIV受体没那么难
: 另外,这个文章的point不在受体,而在于体外感染体系的建立,以后可以做small
: molecule screen了
:
: 机。

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李文辉乙肝受体论文的致命漏洞好多grad student发CNS啊
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11g肯定在解乙肝病毒受体的结构了吧。。从NIBS今年的PI候选人看,NIBS目前水准太低
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n********y
发帖数: 187
11
可不,这题目和证据发CNS确实让搞病毒的专家们下不来台

【在 m*********n 的大作中提到】
: 这更是笑话了。文章的名字叫啥?还POINT不是受体呢?
: 建立体外感染体系?能发nature biotechnology吗?

T****u
发帖数: 424
12
看你帖子的水准
连我一外行人都看不下去了
真是火鸡吃多了

【在 g*****n 的大作中提到】
: 吃完火鸡,没事干,瞄了瞄惊动世界科学的乙肝病毒受体论文。总的感觉是,证据不确
: 凿。方法不合适。 简单地说,用photo-cross-linking拉下来一堆蛋白,选了最厚的那
: 条带。就是它了。以后的证实都没有说服力。方法用的也不对。

g*****n
发帖数: 250
13
I am 外行人, too. Let me try to convince you.
How did they pick NTCP? They incubated cells with a high concentration (200
nM) of viral protein baits, photo-cross-linked, and immunoprecipitated the
protein complexes. They saw a thick band at 60 kDa. They ran another gel and
cut the band at that position and did MS. NTCP showed up. They believed
that that was the one.
Here are the problems. (1) With a high concentration of baits and cross-
linking, you would pull down a lot of proteins. They admitted that there
were smears. The thick bands may represent the real receptor or the abundant
protein on the cell surface. It turned out the latter is possible. NTCP is
a liver-specific protein and very abundant on the surface of hepatocytes.
(2) After they saw NTCP in the MS assay, they should've gone back to strip
those blots and reprobed with an antibody against NTCP to confirm that that
protein was present in the complex. The reasons why they did not do it are
an open question.
(3) With little doubt, there was more than one type of protein in the gel
slices that they cut and ran MS. How did they determine that NTCP was the
candidate for further examinations? They did not give a rationale or
evidence. The logic guess is that NTCP is a liver protein,membrane protein,
and fits well with the idea of being a receptor.
The later attempts to confirm that NTCP is the receptor are not convincing
and were done using wrong methods.
n********y
发帖数: 187
14
非常具体的技术细节---如果文辉没有提及确实给了CNS太多的疑问
感觉NIBS这方面的专业户还太少.

(200
the
and
abundant
is

【在 g*****n 的大作中提到】
: I am 外行人, too. Let me try to convince you.
: How did they pick NTCP? They incubated cells with a high concentration (200
: nM) of viral protein baits, photo-cross-linked, and immunoprecipitated the
: protein complexes. They saw a thick band at 60 kDa. They ran another gel and
: cut the band at that position and did MS. NTCP showed up. They believed
: that that was the one.
: Here are the problems. (1) With a high concentration of baits and cross-
: linking, you would pull down a lot of proteins. They admitted that there
: were smears. The thick bands may represent the real receptor or the abundant
: protein on the cell surface. It turned out the latter is possible. NTCP is

T****u
发帖数: 424
15
看来你真是外行。
当我们听说NTCP的时候,it makes so much sense.
正如前几天juzbox在帖子提到的他的同事发现以前他们的一个小分子是作用在NTCP上一
样。在临床上,牛黄熊去氧胆酸胶囊一直被一些临床医生用于乙肝治疗及防止复发。牛
黄熊去氧胆酸正是NTCP天然的ligand.这些作为chemical genetics的data可以进一步来
support NTCP.
你提到另外的一些问题几乎都不是问题,
If 你听过Wenhui的talk
当你发现一个PI never hide negative data的时候,你知道他的data是可信的。
or
If你知道NIBS core facility中有一个玩质谱如神一样的人物-陈涉的话,你就不会对
任何NIBS文章的proteomics data提出质疑了。
If你知道Wenhui的太太是做什么research的话,你也许也不会再有这些疑问了。
你就可以想见他应该还有其他一些什么reagents或data.
你认为NTCP is the most strong band, then they showed it.
其实恰恰相反,NTCP几乎是鉴定出来的蛋白中几乎是最弱的,而且只有一条还是两条
peptide出现了。
其他的一些鉴定出来的蛋白以及历史上曾经被报道过的receptor,Wenhui同志都一一做
了验证。None of then has strong effect compared to NTCP.
甚至为什么质谱鉴定出来的peptide数目那么少,他们都进一步地做了分析。当看到
NTCP序列的时候,一切都清楚了。从序列上来看NTCP中有很多K,在trypsin切的时候,
大部分切出来的都是very short peptide which can not be assigned to proteins.
很多同志纠结于CNS的问题和PNAS的问题。
据我了解,CNS遇到同一个reviewer,全部被turn down
很多同志说晓东自家的PNAS,我不得不告你连PNAS也被直接turn down。
理由是no significance.谁是负责的editor不得而知。
但PNAS主编Inder M. Verma同志事后懊悔不已,表示毫不知情。
有人的地方就有江湖,现实也是残酷的。
在Wenhui同志的文章被接受后,开始拜山头,某些大牛就直接发过来in press的paper
说,"我们也发现了!yeah!看我们的文章也在in press".多牛b啊。如果没有Elife,我
相信wenhui同志可能只能直接发人民日报或者发NIBS学报了。
作为一个外行人,我实在看不下去,怕你和我这个外行一样在confusion中越走越远。

200
and
abundant
is

【在 g*****n 的大作中提到】
: I am 外行人, too. Let me try to convince you.
: How did they pick NTCP? They incubated cells with a high concentration (200
: nM) of viral protein baits, photo-cross-linked, and immunoprecipitated the
: protein complexes. They saw a thick band at 60 kDa. They ran another gel and
: cut the band at that position and did MS. NTCP showed up. They believed
: that that was the one.
: Here are the problems. (1) With a high concentration of baits and cross-
: linking, you would pull down a lot of proteins. They admitted that there
: were smears. The thick bands may represent the real receptor or the abundant
: protein on the cell surface. It turned out the latter is possible. NTCP is

T****u
发帖数: 424
16
对于你,我就不说啥了
你是NIBS黑,饶毅黑,还有好多黑
我也搞不清楚你什么mentality
发帖发言缺乏公正性
我都懒得批,就然你晒在bbs上

【在 n********y 的大作中提到】
: 可不,这题目和证据发CNS确实让搞病毒的专家们下不来台
n********y
发帖数: 187
17
你这些IFs都是和具体的细节无关,倒是和CIA头头的小4妹妹找将军们来法庭佐证抢孩子
一样离奇.
另外你说的WENHUI做的那么多的排除工作为什么不列在SUPPLEMENT里面?

【在 T****u 的大作中提到】
: 看来你真是外行。
: 当我们听说NTCP的时候,it makes so much sense.
: 正如前几天juzbox在帖子提到的他的同事发现以前他们的一个小分子是作用在NTCP上一
: 样。在临床上,牛黄熊去氧胆酸胶囊一直被一些临床医生用于乙肝治疗及防止复发。牛
: 黄熊去氧胆酸正是NTCP天然的ligand.这些作为chemical genetics的data可以进一步来
: support NTCP.
: 你提到另外的一些问题几乎都不是问题,
: If 你听过Wenhui的talk
: 当你发现一个PI never hide negative data的时候,你知道他的data是可信的。
: or

d**j
发帖数: 240
18
我觉得吧,是唱赞美诗的外行少说几句为妙.
怎么总喜欢造神啊.神一般的陈涉只在致谢里出现.而很多别的NIBS文章,陈涉同志在作
者里.
人家太太怎么招惹你了,非要把人也扯出来?

【在 T****u 的大作中提到】
: 看来你真是外行。
: 当我们听说NTCP的时候,it makes so much sense.
: 正如前几天juzbox在帖子提到的他的同事发现以前他们的一个小分子是作用在NTCP上一
: 样。在临床上,牛黄熊去氧胆酸胶囊一直被一些临床医生用于乙肝治疗及防止复发。牛
: 黄熊去氧胆酸正是NTCP天然的ligand.这些作为chemical genetics的data可以进一步来
: support NTCP.
: 你提到另外的一些问题几乎都不是问题,
: If 你听过Wenhui的talk
: 当你发现一个PI never hide negative data的时候,你知道他的data是可信的。
: or

T****u
发帖数: 424
19

你就是看看文章就得出这么多结论?
陈涉同志一定要在author里面吗?人家是高风亮节。
陈涉自从升成Senior investigator之后就不轻易挂名了,人家也没有这必要,通讯作
者的Science都发了。
"神一样的陈涉",不是我说,那是N个US-based Professor说的,我只是给你通俗化了
一下。
要不,你去读读Robert Tjian 2011年的Cell paper, 看看里面的Proteomics work是谁
做的?以Bob在UC Berkeley及美国的影响力,你觉得他在美国找一个Proteomics
facility难吗?为什么他要舍近求远呢?
另外你再去读读James Chen的paper,看看那些Proteomics是谁做的?James Chen甚至
自己都有一台Mass Spectrometry.
不要光看表面文章。
关于李博士的太太,你不会去读文章吗?她不就在author list里面吗,还需要我扯吗?
同志,要调整心态。
我建议啊,大家还是都讨论点科学问题,尤其是对于还在做生物研究的同志们。

【在 d**j 的大作中提到】
: 我觉得吧,是唱赞美诗的外行少说几句为妙.
: 怎么总喜欢造神啊.神一般的陈涉只在致谢里出现.而很多别的NIBS文章,陈涉同志在作
: 者里.
: 人家太太怎么招惹你了,非要把人也扯出来?

d**j
发帖数: 240
20
算了,我们都知道李太太在文章里。

【在 T****u 的大作中提到】
:
: 你就是看看文章就得出这么多结论?
: 陈涉同志一定要在author里面吗?人家是高风亮节。
: 陈涉自从升成Senior investigator之后就不轻易挂名了,人家也没有这必要,通讯作
: 者的Science都发了。
: "神一样的陈涉",不是我说,那是N个US-based Professor说的,我只是给你通俗化了
: 一下。
: 要不,你去读读Robert Tjian 2011年的Cell paper, 看看里面的Proteomics work是谁
: 做的?以Bob在UC Berkeley及美国的影响力,你觉得他在美国找一个Proteomics
: facility难吗?为什么他要舍近求远呢?

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李文辉受体的进一步工作HBV病毒受体新进展之我见
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g*****n
发帖数: 250
21
" 你认为NTCP is the most strong band, then they showed it.
其实恰恰相反,NTCP几乎是鉴定出来的蛋白中几乎是最弱的,而且只有一条还是两条
peptide出现了。
其他的一些鉴定出来的蛋白以及历史上曾经被报道过的receptor,Wenhui同志都一一做
了验证。None of then has strong effect compared to NTCP. "
No. It is not I who says the thickest band is NTCP. It is they who described
in the paper. Read it. By the way, they show no evidence that the thickest
bands contain NTCP.

【在 T****u 的大作中提到】
: 看来你真是外行。
: 当我们听说NTCP的时候,it makes so much sense.
: 正如前几天juzbox在帖子提到的他的同事发现以前他们的一个小分子是作用在NTCP上一
: 样。在临床上,牛黄熊去氧胆酸胶囊一直被一些临床医生用于乙肝治疗及防止复发。牛
: 黄熊去氧胆酸正是NTCP天然的ligand.这些作为chemical genetics的data可以进一步来
: support NTCP.
: 你提到另外的一些问题几乎都不是问题,
: If 你听过Wenhui的talk
: 当你发现一个PI never hide negative data的时候,你知道他的data是可信的。
: or

m*b
发帖数: 1421
22
还不如直接投cell research
党生同志估计一天就给你online了
涨涨CR的经验值也好啊
l****y
发帖数: 398
23
I am very curious what else were identified by MS from that band. but i can
't find the protein list from the supplement.
does anyone else see the list?

【在 g*****n 的大作中提到】
: 吃完火鸡,没事干,瞄了瞄惊动世界科学的乙肝病毒受体论文。总的感觉是,证据不确
: 凿。方法不合适。 简单地说,用photo-cross-linking拉下来一堆蛋白,选了最厚的那
: 条带。就是它了。以后的证实都没有说服力。方法用的也不对。

l*******i
发帖数: 153
24
哇,牛人啊!
能详细说说他们的方法为什么不对吗?如果您做这个课题,应该设计哪些实验、用哪些
方法?

【在 g*****n 的大作中提到】
: 吃完火鸡,没事干,瞄了瞄惊动世界科学的乙肝病毒受体论文。总的感觉是,证据不确
: 凿。方法不合适。 简单地说,用photo-cross-linking拉下来一堆蛋白,选了最厚的那
: 条带。就是它了。以后的证实都没有说服力。方法用的也不对。

a*******e
发帖数: 245
25
就一片文章能整出这么多故事来,真nb阿
至于吗,过犹不及。我觉得提出批评意见的,不管是中肯不中肯,都应该给予鼓励,要
允许不同的意见和声音
真理愈变愈明。

【在 T****u 的大作中提到】
:
: 你就是看看文章就得出这么多结论?
: 陈涉同志一定要在author里面吗?人家是高风亮节。
: 陈涉自从升成Senior investigator之后就不轻易挂名了,人家也没有这必要,通讯作
: 者的Science都发了。
: "神一样的陈涉",不是我说,那是N个US-based Professor说的,我只是给你通俗化了
: 一下。
: 要不,你去读读Robert Tjian 2011年的Cell paper, 看看里面的Proteomics work是谁
: 做的?以Bob在UC Berkeley及美国的影响力,你觉得他在美国找一个Proteomics
: facility难吗?为什么他要舍近求远呢?

g*********s
发帖数: 350
26
全文都在努力证明NTCP有助于HBV的感染。但如何证明NTCP是Receptor呢
p**t
发帖数: 160
27
What you listed are not direct evidences to support NTCP is the
receptor.

【在 T****u 的大作中提到】
: 看来你真是外行。
: 当我们听说NTCP的时候,it makes so much sense.
: 正如前几天juzbox在帖子提到的他的同事发现以前他们的一个小分子是作用在NTCP上一
: 样。在临床上,牛黄熊去氧胆酸胶囊一直被一些临床医生用于乙肝治疗及防止复发。牛
: 黄熊去氧胆酸正是NTCP天然的ligand.这些作为chemical genetics的data可以进一步来
: support NTCP.
: 你提到另外的一些问题几乎都不是问题,
: If 你听过Wenhui的talk
: 当你发现一个PI never hide negative data的时候,你知道他的data是可信的。
: or

p**t
发帖数: 160
28
Yeah, this is the point!

【在 g*********s 的大作中提到】
: 全文都在努力证明NTCP有助于HBV的感染。但如何证明NTCP是Receptor呢
n********y
发帖数: 187
29
可不,他象TG的家宝和西来,就列些作者神一样的伟光正,和LZ所列这篇文章的技术疑点
没有关系

【在 p**t 的大作中提到】
: What you listed are not direct evidences to support NTCP is the
: receptor.

r****a
发帖数: 329
30
我也觉得这篇文章没有达到CNS的水准
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帮朋友问一个选实验室的问题关于乙肝病毒受体,饶毅的感情重于理智
NIBS几个做得好的年轻PI已经升到associate了zz-记中国科学家发现乙肝病毒受体:五年“钓鱼”
接着读乙肝病毒受体论文ZZ北生所李文辉团队:新发现比发论文更重要
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n********y
发帖数: 187
31
当然是CNS的正常以上水平
要非那CNS里混进去的20%来比还是不错的.
比如说前不久吵得热闹的NASA砷DNA

【在 r****a 的大作中提到】
: 我也觉得这篇文章没有达到CNS的水准
1 (共1页)
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HBV病毒受体新进展之我见李文辉乙肝受体论文的致命漏洞
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NIBS几个做得好的年轻PI已经升到associate了11g肯定在解乙肝病毒受体的结构了吧。。
接着读乙肝病毒受体论文好多grad student发CNS啊
关于乙肝病毒受体,饶毅的感情重于理智其实乙肝受体文章发表在JV上大家都不会有意见了
zz-记中国科学家发现乙肝病毒受体:五年“钓鱼”从NIBS今年的PI候选人看,NIBS目前水准太低
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