l********n
发帖数: 260 | 1 请教各位老师，
下图的pathway分析怎么做的？ |
l********n
发帖数: 260 | 2
【在 l********n 的大作中提到】
: 请教各位老师，
: 下图的pathway分析怎么做的？
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X******n
发帖数: 914 | 3 这图做的太差了吧，试一下cytoscape吧
【在 l********n 的大作中提到】
: 请教各位老师，
: 下图的pathway分析怎么做的？
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c*******0
发帖数: 190 | |
Z******5
发帖数: 435 | 5 PathwayArchitect 这个貌似也可以 |
l**********1
发帖数: 5204 | 6 Mark.
plus
Network analysis
I)
Visant Network visualization and analysis http://visant.bu.edu/
II)
Pajek Network visualization and analysis http://pajek.imfm.si/
III)
Vanted Network visualization and analysis http://vanted.ipk-gatersleben.de/
IV)
Biotapestry Network visualization and analysis http://www.biotapestry.org/
V)
TYNA/Topnet Network analysis http://tyna.gersteinlab.org/tyna/
VI)
Bioconductor Network visualization and analysis http://www.bioconductor.org/
NB: all contents already shown on LX or LXX now already excluded.
Reference:
van Hijum SA, Medema MH, Kuipers OP. (2009)
Mechanisms and evolution of control logic in prokaryotic transcriptional
regulation.
Microbiol Mol Biol Rev. 73: 481-509
link:
//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19721087
【在 c*******0 的大作中提到】
: 试试biogrid上的Osprey...
: http://biodata.mshri.on.ca/osprey/servlet/Index
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G*******d
发帖数: 359 | |
